75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AFE_0088 on replicon NC_011761
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011206  Lferr_0090  plasmid maintenance system killer  100 
 
 
91 aa  194  3e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0088  plasmid maintenance system killer protein  100 
 
 
91 aa  194  3e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.167827  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2525  plasmid maintenance system killer  54.95 
 
 
91 aa  122  2e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0385554  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4746  plasmid maintenance system killer  52.75 
 
 
90 aa  108  3e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.675106  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1591  plasmid maintenance system killer  53.26 
 
 
92 aa  108  3e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0593652  normal  0.994697 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0438  plasmid maintenance system killer  40.22 
 
 
92 aa  81.6  3e-15  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.275617  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2183  plasmid maintenance system killer  39.56 
 
 
91 aa  79.3  1e-14  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.454111  unclonable  2.58126e-07 
 
 
-
 
NC_013733  Slin_6999  plasmid maintenance system killer  40.43 
 
 
94 aa  77  9e-14  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.17446  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2470  plasmid maintenance system killer  40.22 
 
 
92 aa  73.6  9e-13  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3084  plasmid maintenance system killer  40.22 
 
 
92 aa  73.6  9e-13  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2890  plasmid maintenance system killer  35.87 
 
 
92 aa  72  2e-12  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.320919  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0570  plasmid maintenance system killer  36.96 
 
 
92 aa  70.9  6e-12  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1143  proteic killer suppression protein  35.48 
 
 
93 aa  70.5  7e-12  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0404  proteic killer suppression protein  35.48 
 
 
93 aa  70.5  7e-12  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0360  plasmid maintenance system killer  35.48 
 
 
93 aa  70.5  8e-12  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6434  plasmid maintenance system killer  35.87 
 
 
92 aa  66.6  1e-10  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.281041 
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3837  plasmid maintenance system killer  34.78 
 
 
92 aa  65.5  2e-10  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5381  plasmid maintenance system killer  35.87 
 
 
101 aa  65.5  3e-10  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0821109  hitchhiker  0.0023513 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3242  plasmid maintenance system killer  33.7 
 
 
92 aa  63.9  7e-10  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0235263  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0423  proteic killer protein, putative  35.87 
 
 
92 aa  63.2  1e-09  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4450  plasmid maintenance system killer  35.87 
 
 
92 aa  63.2  1e-09  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1124  plasmid maintenance system killer  36.96 
 
 
92 aa  63.2  1e-09  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  9.91255e-12  normal  0.581141 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03904  plasmid maintenance system killer protein  31.18 
 
 
93 aa  60.5  8e-09  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.462774  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0273  plasmid maintenance system killer  34.41 
 
 
95 aa  58.5  3e-08  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.1826 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1106  plasmid maintenance system killer  32.26 
 
 
95 aa  58.2  4e-08  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.458841  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4499  plasmid maintenance system killer  32.97 
 
 
111 aa  57.4  7e-08  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.538782 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1061  plasmid maintenance system killer  32.26 
 
 
93 aa  57  8e-08  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  7.20973e-05 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2429  plasmid maintenance system killer  35.87 
 
 
94 aa  56.2  1e-07  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.110388  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42010  hypothetical protein  38.36 
 
 
81 aa  55.5  3e-07  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3644  plasmid maintenance system killer  33.71 
 
 
108 aa  55.1  4e-07  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.018062  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2694  plasmid maintenance system killer  32.26 
 
 
99 aa  54.7  4e-07  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1907  plasmid maintenance system killer  29.03 
 
 
93 aa  52.8  2e-06  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  1.93605e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1454  plasmid maintenance system killer  32.61 
 
 
114 aa  52  3e-06  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.046849  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3764  plasmid maintenance system killer  33.33 
 
 
61 aa  50.1  1e-05  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3184  plasmid maintenance system killer  36.96 
 
 
104 aa  50.1  1e-05  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0349858  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0044  plasmid maintenance system killer  31.18 
 
 
92 aa  49.3  2e-05  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3425  plasmid maintenance system killer  25.81 
 
 
105 aa  48.5  3e-05  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.835038  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2424  plasmid maintenance system killer  36.56 
 
 
96 aa  48.5  3e-05  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0413  plasmid maintenance system killer  26.88 
 
 
93 aa  48.1  4e-05  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2941  plasmid maintenance system killer  29.03 
 
 
94 aa  47.8  6e-05  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00442539  hitchhiker  0.00124461 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2928  plasmid maintenance system killer  29.03 
 
 
93 aa  47.4  7e-05  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.133815  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2504  plasmid maintenance system killer  28.26 
 
 
92 aa  46.2  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000281555  normal  0.853623 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1586  killer protein, putative  29.03 
 
 
92 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.315858 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27680  Plasmid maintenance system killer protein  30.11 
 
 
93 aa  46.6  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1668  plasmid maintenance system killer  29.03 
 
 
92 aa  45.4  0.0003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.856327 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2973  plasmid maintenance system killer  29.03 
 
 
92 aa  45.1  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4827  plasmid maintenance system killer  29.03 
 
 
92 aa  44.3  0.0005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0534  AAA family ATPase  27.96 
 
 
112 aa  44.7  0.0005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.943308  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4147  plasmid maintenance system killer  27.96 
 
 
92 aa  44.3  0.0006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.813098  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2020  plasmid maintenance system killer  29.03 
 
 
93 aa  44.3  0.0006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0223  plasmid maintenance system killer  29.03 
 
 
92 aa  43.9  0.0007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.642238  normal  0.270748 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1124  plasmid maintenance system killer  29.79 
 
 
93 aa  43.9  0.0007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.178606 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1092  hypothetical protein  25.81 
 
 
93 aa  43.9  0.0007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2762  plasmid maintenance system killer  30.11 
 
 
92 aa  43.9  0.0007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0607  plasmid maintenance system killer  27.96 
 
 
93 aa  43.5  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3069  plasmid maintenance system killer  31.25 
 
 
92 aa  43.5  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.67304  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2424  plasmid maintenance system killer  33.33 
 
 
95 aa  43.1  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.228875  normal  0.182498 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2830  plasmid maintenance system killer  30.11 
 
 
95 aa  43.5  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0714148  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3226  plasmid maintenance system killer  29.03 
 
 
95 aa  42.7  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.189579 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1488  hypothetical protein  26.88 
 
 
93 aa  42.7  0.002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  unclonable  9.64732e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4917  plasmid maintenance system killer  25.81 
 
 
93 aa  42.4  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.131575 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0022  plasmid maintenance system toxin protein HigB  27.17 
 
 
101 aa  42.4  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  hitchhiker  0.00990261  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0020  plasmid maintenance system killer  32.26 
 
 
92 aa  42.4  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.184323  normal  0.0200834 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3242  plasmid maintenance system killer  29.79 
 
 
94 aa  41.6  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0554672  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2880  plasmid maintenance system killer  25.81 
 
 
93 aa  42  0.003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.474042  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0643  hypothetical protein  24.73 
 
 
94 aa  41.6  0.003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  1.01357e-07  normal  0.456148 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3069  plasmid maintenance system killer  26.88 
 
 
93 aa  42  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1215  plasmid maintenance system killer  25.81 
 
 
93 aa  42  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2763  plasmid maintenance system killer  27.96 
 
 
95 aa  41.6  0.004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.686339  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4677  plasmid maintenance system killer  29.03 
 
 
93 aa  41.6  0.004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0978715  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4191  plasmid maintenance system killer  26.88 
 
 
92 aa  41.2  0.005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0717347  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0213  proteic killer protein, putative  29.03 
 
 
92 aa  41.2  0.005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.359466  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1257  plasmid maintenance system killer  32.53 
 
 
98 aa  41.2  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0146502 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1670  plasmid maintenance system killer protein  25.81 
 
 
105 aa  40.8  0.006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.137882  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1376  plasmid maintenance system killer  26.88 
 
 
93 aa  40.4  0.009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>