267 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AFE_0082 on replicon NC_011761
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011206  Lferr_0085  glycosyl transferase family 2  100 
 
 
308 aa  631  1e-180  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0285695  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0082  O antigen biosynthesis rhamnosyltransferase, putative  100 
 
 
308 aa  631  1e-180  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.19572  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2210  putative O antigen biosynthesis rhamnosyltransferase  50 
 
 
314 aa  316  4e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00149934  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2313  putative O antigen biosynthesis rhamnosyltransferase  48.03 
 
 
314 aa  304  1e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0276977 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2424  putative O antigen biosynthesis rhamnosyltransferase  48.03 
 
 
314 aa  304  1e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.126367  hitchhiker  0.000645643 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2311  putative O antigen biosynthesis rhamnosyltransferase  48.03 
 
 
314 aa  304  1e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0283502  normal  0.0363291 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3560  glycosyl transferase family protein  48.84 
 
 
306 aa  283  2e-75  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.480294  normal  0.632112 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2354  glycosyl transferase, group 2 family protein  47.54 
 
 
308 aa  282  4e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.218636  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2138  glycosyl transferase family protein  47.54 
 
 
308 aa  279  4e-74  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.177505  normal  0.63081 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2189  glycosyl transferase, group 2 family protein  41.86 
 
 
303 aa  274  2e-72  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  1.6555e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1578  glycosyl transferase family 2  44.41 
 
 
305 aa  269  3e-71  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0841  glycosyl transferase family protein  44.92 
 
 
306 aa  263  3e-69  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.913833  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4286  glycosyl transferase family protein  46.69 
 
 
303 aa  262  6e-69  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.131233 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4927  glycosyl transferase family 2  43.56 
 
 
309 aa  250  2e-65  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.640418  normal  0.791087 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2861  glycosyl transferase family 2  44.77 
 
 
305 aa  249  4e-65  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.826481  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3008  glycosyl transferase  45.36 
 
 
303 aa  239  6e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.895358  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4142  glycosyl transferase family 2  36.84 
 
 
313 aa  215  6e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  2.21538e-06 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3103  glycosyl transferase family protein  31.48 
 
 
322 aa  171  1e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.532387  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0596  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.71 
 
 
304 aa  121  1e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.300556  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2036  lipopolysaccharide biosynthesis protein-like  30.43 
 
 
1162 aa  87.4  3e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2745  glycosyl transferase family protein  29.1 
 
 
1267 aa  86.7  4e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.636531  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2677  glycosyl transferase family protein  33.19 
 
 
1267 aa  85.5  9e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4437  glycosyl transferase family protein  28.51 
 
 
1061 aa  80.9  3e-14  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2839  glycosyl transferase family protein  26.74 
 
 
314 aa  77  3e-13  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0441317  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0633  lipopolysaccharide biosynthesis protein-like  28.26 
 
 
1161 aa  74.3  3e-12  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0047  glycosyl transferase family 2  27.73 
 
 
327 aa  73.9  3e-12  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0045  glycosyl transferase family 2  27.73 
 
 
327 aa  73.9  3e-12  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.288326  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3546  glycosyl transferase family protein  29.02 
 
 
924 aa  73.6  4e-12  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0426  glycosyl transferase family protein  33.48 
 
 
366 aa  72.4  9e-12  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0815896  normal  0.721825 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3109  glycosyl transferase family protein  31.22 
 
 
327 aa  72  1e-11  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3553  glycosyl transferase family protein  27.27 
 
 
477 aa  68.6  1e-10  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5865  glycosyl transferase family 2  27.15 
 
 
292 aa  65.9  8e-10  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2441  glycosyl transferase family protein  27.1 
 
 
290 aa  65.1  1e-09  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5481  glycosyl transferase family protein  29.21 
 
 
310 aa  65.1  2e-09  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.495581  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4464  glycosyl transferase family 2  27.2 
 
 
335 aa  64.3  3e-09  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4204  glycosyl transferase family 2  24.74 
 
 
305 aa  63.2  5e-09  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2759  glycosyl transferase family 2  26.37 
 
 
337 aa  62  1e-08  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3933  glycosyl transferase family 2  30.24 
 
 
423 aa  61.6  2e-08  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3641  glycosyl transferase family protein  29.76 
 
 
423 aa  61.6  2e-08  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.144986  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2884  glycosyl transferase family protein  29.26 
 
 
298 aa  61.6  2e-08  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00723047 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5097  glycosyl transferase family protein  26.98 
 
 
340 aa  60.8  3e-08  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.912612  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2305  glycosyl transferase family 2  27.27 
 
 
291 aa  60.1  5e-08  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.064621 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4770  glycosyl transferase family protein  28.51 
 
 
324 aa  60.1  5e-08  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19050  glycosyl transferase  27.49 
 
 
411 aa  59.7  7e-08  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.251167  normal  0.140209 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5500  glycosyl transferase family 2  32.65 
 
 
308 aa  59.3  9e-08  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.359708  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2938  glycosyl transferase family 2  28.12 
 
 
332 aa  58.9  9e-08  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1225  family 2 glycosyl transferase  28.16 
 
 
236 aa  58.5  1e-07  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0235  glycosyl transferase  24.47 
 
 
320 aa  58.5  1e-07  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000204956  normal  0.587039 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1595  polysaccharide deacetylase  29.9 
 
 
1101 aa  58.5  1e-07  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1427  glycosyl transferase, group 2 family protein  26.91 
 
 
338 aa  58.5  1e-07  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3773  glycosyl transferase family 2  24.88 
 
 
268 aa  57.4  3e-07  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3795  glycosyl transferase family protein  26.59 
 
 
337 aa  57  4e-07  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4195  glycosyl transferase family 2  23.92 
 
 
345 aa  56.6  5e-07  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.859941 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1256  glycosyl transferase family protein  25.32 
 
 
240 aa  56.6  5e-07  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000223583  normal  0.193996 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4271  glycosyl transferase family 2  26.5 
 
 
528 aa  56.6  5e-07  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2023  family 2 glycosyl transferase  33.94 
 
 
292 aa  56.2  6e-07  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0982  glucosaminyltransferase  26 
 
 
461 aa  56.2  6e-07  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0669944  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0169  glycosyl transferase  29.52 
 
 
291 aa  56.6  6e-07  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.571999 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0119  glycosyl transferase family protein  25.9 
 
 
232 aa  56.2  7e-07  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2362  glycosyl transferase family 2  33.02 
 
 
335 aa  55.8  8e-07  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00826975 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3347  glycosyl transferase family protein  27.9 
 
 
308 aa  55.8  9e-07  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1244  glycosyl transferase family 2  23.71 
 
 
328 aa  55.5  1e-06  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.161463 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1214  glycosyl transferase family 2  23.71 
 
 
328 aa  55.5  1e-06  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1368  glycosyl transferase family protein  25.73 
 
 
324 aa  55.1  1e-06  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.537191  normal  0.711331 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0256  glycosyl transferase family 2  24.51 
 
 
279 aa  55.1  1e-06  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0907  glycosyl transferase family protein  30.34 
 
 
415 aa  55.5  1e-06  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00249013  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1005  putative glycosyl transferase, group 2 family protein  28.5 
 
 
328 aa  55.5  1e-06  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.626376 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3289  glycosyl transferase family 2  23.74 
 
 
328 aa  54.7  2e-06  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3023  polysaccharide deacetylase  27.62 
 
 
1120 aa  54.7  2e-06  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3077  glycosyl transferase family protein  23.18 
 
 
313 aa  55.1  2e-06  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.243281 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1854  glycosyl transferase family 2  26.05 
 
 
307 aa  54.7  2e-06  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1813  glycosyl transferase family protein  25.45 
 
 
362 aa  53.9  3e-06  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2281  glycosyl transferase family 2  25.66 
 
 
282 aa  54.3  3e-06  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.733627  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2397  glycosyl transferase family protein  28.86 
 
 
332 aa  53.9  3e-06  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1301  glycosyl transferase family 2  31.61 
 
 
637 aa  54.3  3e-06  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0863  b-glycosyltransferase  27.1 
 
 
345 aa  53.1  5e-06  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.740124  normal  0.0682028 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1920  glucosaminyltransferase  23.27 
 
 
403 aa  53.1  6e-06  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.807733 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4608  N-glycosyltransferase  29.7 
 
 
442 aa  52.8  7e-06  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2689  glycosyl transferase family protein  28.07 
 
 
331 aa  52.4  9e-06  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0468436  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4734  glycosyl transferase family protein  26.69 
 
 
294 aa  52  1e-05  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3181  glycosyl transferase family 2  30.43 
 
 
345 aa  52  1e-05  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.255598  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1959  glycosyl transferase family 2  28.39 
 
 
321 aa  52.4  1e-05  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.65795 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3358  glycosyl transferase family protein  24.58 
 
 
294 aa  52  1e-05  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.499645 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2444  glycosyl transferase family protein  26.82 
 
 
320 aa  52  1e-05  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.181475  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0149  cell wall biosynthesis glycosyltransferase  24.2 
 
 
397 aa  52.4  1e-05  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.15168  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3563  glycosyl transferase family 2  29.15 
 
 
242 aa  52  1e-05  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.365642  normal  0.553979 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3275  glycosyl transferase family 2  27.86 
 
 
509 aa  52  1e-05  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3646  glycosyl transferase family protein  30.11 
 
 
507 aa  52  1e-05  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00027326 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0801  glycosyl transferase family 2  28.03 
 
 
313 aa  51.2  2e-05  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0584  glycosyl transferase family protein  26.77 
 
 
481 aa  51.2  2e-05  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2879  glycosyl transferase family protein  27.17 
 
 
328 aa  51.6  2e-05  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00677444 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1063  glycosyl transferase family 2  25.75 
 
 
305 aa  51.2  2e-05  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.862808  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001813  putative two-domain glycosyltransferase  28.45 
 
 
267 aa  51.6  2e-05  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.735917  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1825  glycosyl transferase family protein  25.51 
 
 
324 aa  51.2  2e-05  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0300  glycosyl transferase family protein  23.31 
 
 
322 aa  51.2  2e-05  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2451  glycosyl transferase family 2  39.62 
 
 
222 aa  50.8  3e-05  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0353  glycosyl transferase family 2  21.74 
 
 
312 aa  50.8  3e-05  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  4.39981e-05  normal  0.42611 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0472  glycosyl transferase family protein  28.19 
 
 
365 aa  50.8  3e-05  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2074  glycosyl transferase family 2  24.05 
 
 
286 aa  50.4  4e-05  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5475  glycosyl transferase family protein  26.89 
 
 
509 aa  50.4  4e-05  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>