17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AFE_0080 on replicon NC_011761
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011761  AFE_0080  hypothetical protein  100 
 
 
426 aa  846  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0141112  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0083  hypothetical protein  100 
 
 
426 aa  846  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0937751  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4165  hypothetical protein  29.02 
 
 
418 aa  106  7e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4201  hypothetical protein  29.02 
 
 
418 aa  106  7e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.375006 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3315  major facilitator superfamily permease  28.93 
 
 
403 aa  105  2e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.099137  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0396  hypothetical protein  28.5 
 
 
447 aa  101  2e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1527  hypothetical protein  27.68 
 
 
425 aa  100  5e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1248  hypothetical protein  27.68 
 
 
447 aa  99.8  7e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1085  hypothetical protein  27.68 
 
 
447 aa  99.8  7e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0087  hypothetical protein  27.68 
 
 
447 aa  99.8  7e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2837  major facilitator superfamily permease  27.68 
 
 
456 aa  99.4  1e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2686  hypothetical protein  27.68 
 
 
456 aa  99.4  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0104  hypothetical protein  27.53 
 
 
403 aa  98.6  2e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3563  hypothetical protein  27.65 
 
 
448 aa  88.2  3e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.714091 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5086  hypothetical protein  23.35 
 
 
412 aa  87.4  4e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5545  hypothetical protein  25.55 
 
 
433 aa  85.5  1e-15  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0773  hypothetical protein  26 
 
 
427 aa  80.1  6e-14  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>