62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AFE_0078 on replicon NC_011761
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011206  Lferr_0081  glycosyl transferase family 2  99.69 
 
 
340 aa  674  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0078  glycosyl transferase, group 2 family protein  100 
 
 
327 aa  674  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.780673  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0770  glycosyl transferase, group 2 family protein  43.5 
 
 
333 aa  280  3e-74  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3445  glycosyl transferase, group 2 family protein  39.94 
 
 
333 aa  252  8e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.867023  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3227  glycosyl transferase family protein  39.63 
 
 
333 aa  248  9e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.549163 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2179  glycosyl transferase family protein  30.92 
 
 
355 aa  122  1e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.209398  hitchhiker  0.000230453 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4543  glycosyl transferase family protein  30.09 
 
 
332 aa  79.7  7e-14  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.503703 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0057  putative glycosyltransferase  27.3 
 
 
337 aa  74.7  2e-12  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.395036  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2546  glycosyl transferase family 2  27.67 
 
 
341 aa  73.6  4e-12  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.708363  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1180  glycosyltransferase, group 2 family protein  24.34 
 
 
322 aa  71.2  2e-11  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1400  glycosyl transferase family protein  25.51 
 
 
306 aa  69.3  9e-11  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2651  glycosyl transferase family protein  22.56 
 
 
303 aa  68.9  1e-10  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.216407  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1395  glycosyltransferase  27.39 
 
 
300 aa  68.2  2e-10  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.438596  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2743  glycosyl transferase family 2  25 
 
 
297 aa  65.1  1e-09  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4001  hypothetical protein  23.98 
 
 
320 aa  64.3  3e-09  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.891502  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1399  glycosyl transferase family protein  29.24 
 
 
315 aa  63.5  4e-09  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2023  family 2 glycosyl transferase  25.33 
 
 
292 aa  62.4  1e-08  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2933  family 2 glycosyl transferase  28 
 
 
284 aa  62  1e-08  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.593138  normal  0.360179 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0821  glycosyltransferase, group 2 family protein  24.84 
 
 
344 aa  61.6  2e-08  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1125  glycosyl transferase family 2  24.22 
 
 
329 aa  61.6  2e-08  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1638  glycosyl transferase family protein  25.63 
 
 
322 aa  58.5  2e-07  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.769148 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1625  family 2 glycosyl transferase  25 
 
 
293 aa  57  4e-07  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1742  glycosyltransferase  24.24 
 
 
306 aa  56.2  7e-07  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3185  glycosyl transferase family protein  21.74 
 
 
297 aa  56.2  8e-07  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0127  glycosyl transferase family 2  24.65 
 
 
299 aa  56.2  8e-07  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2177  rhamnosyltransferase  24.09 
 
 
323 aa  55.5  1e-06  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2996  rhamnosyltransferase  23.38 
 
 
321 aa  55.8  1e-06  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.230677  normal  0.325796 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2884  glycosyl transferase family protein  25.35 
 
 
298 aa  55.1  2e-06  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00723047 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2615  glycosyl transferase family protein  28.38 
 
 
298 aa  55.1  2e-06  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.106045  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3033  glycosyl transferase family protein  23.12 
 
 
308 aa  55.1  2e-06  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.244321  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1593  glycosyl transferase family protein  22.94 
 
 
317 aa  53.9  3e-06  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4361  glycosyl transferase family 2  22.55 
 
 
302 aa  53.5  4e-06  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.972233 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1328  glycosyl transferase family protein  25.38 
 
 
332 aa  53.5  5e-06  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1497  glycosyltransferase  24.22 
 
 
304 aa  52.4  1e-05  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.041756  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0288  glycosyl transferase family protein  25.83 
 
 
329 aa  51.6  2e-05  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2104  glycosyl transferase family protein  25.24 
 
 
302 aa  50.8  3e-05  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4605  glycosyl transferase family protein  24.78 
 
 
318 aa  50.8  3e-05  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.151832  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2574  glycosyltransferase-like protein  24.04 
 
 
656 aa  50.4  4e-05  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0061  glycosyl transferase family 2  23.53 
 
 
298 aa  50.1  5e-05  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0353  glycosyl transferase family 2  26.39 
 
 
317 aa  50.1  6e-05  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0313  rhamnosyl transferase related protein  24.71 
 
 
342 aa  49.7  6e-05  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0691397 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2102  glycosyl transferase family protein  22.83 
 
 
489 aa  50.1  6e-05  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3203  glycosyl transferase family protein  26.63 
 
 
328 aa  48.9  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0338  glycosyl transferase family 2  24.76 
 
 
288 aa  48.9  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.378739 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01490  predicted glycosyltransferase  27.54 
 
 
303 aa  48.9  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.731654  normal  0.0270435 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08750  predicted glycosyltransferase  25.36 
 
 
313 aa  48.5  0.0001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0987948  normal  0.572933 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2264  glycosyl transferase family 2  25.44 
 
 
270 aa  48.5  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.503819  normal  0.135779 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2305  glycosyl transferase family 2  24.49 
 
 
722 aa  47.8  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0138852  normal  0.273361 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0630  glycosyl transferase family 2  29 
 
 
315 aa  47.8  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0541  rhamnosyltransferase  25.75 
 
 
300 aa  47.4  0.0003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.524826  normal  0.174898 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1694  glycosyl transferase family protein  24.85 
 
 
340 aa  47.4  0.0004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.128471  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0132  glycosyl transferase family 2  27.5 
 
 
298 aa  46.2  0.0007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0850  glycosyl transferase family 2  23.89 
 
 
323 aa  46.2  0.0008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0377  glycosyl transferase family protein  22.94 
 
 
314 aa  45.8  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.359383  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0471  glycosyl transferase family 2  28.07 
 
 
246 aa  45.8  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20870  predicted glycosyltransferase  27.27 
 
 
334 aa  45.4  0.001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1169  glycosyl transferase family 2  24.71 
 
 
615 aa  45.1  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.390036  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5619  glycosyl transferase family protein  26.71 
 
 
313 aa  44.3  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.800046 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3217  glycosyl transferase family 2  22.37 
 
 
455 aa  43.9  0.004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0837  glycosyl transferase family protein  26.32 
 
 
330 aa  43.1  0.006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0843  hypothetical protein  23.66 
 
 
339 aa  42.7  0.009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0818  hypothetical protein  23.66 
 
 
339 aa  42.4  0.01  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>