25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AFE_0075 on replicon NC_011761
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011206  Lferr_0077  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 
123 aa  244  3e-64  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0075  hypothetical protein  100 
 
 
119 aa  244  4e-64  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.492239  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0358  transcriptional regulator, MarR family  60 
 
 
105 aa  136  8e-32  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0798  AsnC family transcriptional regulator  53.85 
 
 
106 aa  121  4e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1236  hypothetical protein  53.54 
 
 
134 aa  116  8e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.82618  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2316  AsnC family transcriptional regulator  50 
 
 
125 aa  107  4e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.153749 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1145  hypothetical protein  51.96 
 
 
126 aa  102  2e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1570  transcriptional regulator, MarR family  45.19 
 
 
119 aa  100  9e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.587855  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0758  MarR family transcriptional regulator  44.76 
 
 
124 aa  97.8  5e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.663702  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1794  AsnC family transcriptional regulator  44.44 
 
 
111 aa  77  8e-14  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3340  sulfate adenylyltransferase  41.67 
 
 
690 aa  65.1  3e-10  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.10273  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2656  bifunctional sulfate adenylyltransferase subunit 1/adenylylsulfate kinase protein  36.67 
 
 
691 aa  64.7  4e-10  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3514  transcriptional regulator, MarR family  35.71 
 
 
203 aa  62.4  2e-09  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.74673e-09 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3448  transcriptional regulator, MarR family  34.82 
 
 
201 aa  62  3e-09  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3791  regulatory protein, MarR  50.72 
 
 
204 aa  61.2  4e-09  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0756  MarR family transcriptional regulator  47.46 
 
 
77 aa  60.5  8e-09  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.58096  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0625  hypothetical protein  46.15 
 
 
212 aa  59.7  1e-08  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0892  hypothetical protein  38.27 
 
 
198 aa  57.4  7e-08  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.656766  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1123  hypothetical protein  38.27 
 
 
191 aa  57  9e-08  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1291  regulatory protein MarR  36 
 
 
170 aa  55.8  2e-07  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2889  hypothetical protein  41.46 
 
 
202 aa  55.8  2e-07  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0208213 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0934  MarR family transcriptional regulator  36.49 
 
 
167 aa  53.1  1e-06  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1283  AsnC family transcriptional regulator  31.63 
 
 
192 aa  53.5  1e-06  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2752  regulatory protein, MarR  35.96 
 
 
205 aa  41.6  0.004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2284  transcriptional regulator  36.36 
 
 
214 aa  40.8  0.006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.123055 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>