More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AFE_0071 on replicon NC_011761
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011206  Lferr_0072  peptidoglycan-associated lipoprotein  100 
 
 
192 aa  388  1e-107  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.524746  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0071  peptidoglycan-associated lipoprotein, putative  100 
 
 
192 aa  388  1e-107  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2228  Outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)protein-like protein  33.88 
 
 
181 aa  116  2e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1854  OmpA/MotB  40.65 
 
 
177 aa  114  9e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2132  peptidoglycan-associated lipoprotein  52.04 
 
 
175 aa  113  2e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.250962  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0165  peptidoglycan-associated lipoprotein  46 
 
 
174 aa  111  6e-24  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2925  OmpA/MotB  41.35 
 
 
175 aa  110  9e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.407293  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0676  OmpA/MotB domain-containing protein  34.76 
 
 
169 aa  110  1e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.306493  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2588  peptidoglycan-associated lipoprotein  36.07 
 
 
176 aa  109  2e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0918  peptidoglycan-associated lipoprotein  34.81 
 
 
170 aa  109  3e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3583  peptidoglycan-associated lipoprotein  33 
 
 
200 aa  108  3e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1545  OmpA/MotB family outer membrane protein  33.33 
 
 
163 aa  108  4e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.342429  normal  0.720458 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0857  peptidoglycan-associated lipoprotein  41.8 
 
 
155 aa  108  4e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  5.23751e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0693  peptidoglycan-associated lipoprotein  34.22 
 
 
169 aa  108  5e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.017916  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2218  OmpA/MotB domain-containing protein  33.54 
 
 
208 aa  108  5e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.906577  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2456  peptidoglycan-associated lipoprotein  36.17 
 
 
169 aa  108  7e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.37691  normal  0.956035 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3257  OmpA family outer membrane protein  46.6 
 
 
170 aa  107  8e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1950  peptidoglycan-associated outer-membrane lipoprotein  46.6 
 
 
170 aa  107  8e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.931309  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2082  OmpA family outer membrane protein  46.6 
 
 
170 aa  107  8e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3242  peptidoglycan-associated outer-membrane lipoprotein  46.6 
 
 
170 aa  107  8e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.676059  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3204  peptidoglycan-associated outer-membrane lipoprotein  46.6 
 
 
170 aa  107  8e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4203  peptidoglycan-associated lipoprotein  34.46 
 
 
163 aa  107  8e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.381253  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2660  peptidoglycan-associated outer-membrane lipoprotein  46.6 
 
 
170 aa  107  8e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.305676  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0826  peptidoglycan-associated outer-membrane lipoprotein  46.6 
 
 
170 aa  107  8e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0752  peptidoglycan-associated lipoprotein  47.06 
 
 
169 aa  107  1e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  8.00754e-10  normal  0.153168 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1372  OmpA family outer membrane protein  45.63 
 
 
170 aa  107  1e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3921  OmpA/MotB family outer membrane protein  44.66 
 
 
169 aa  107  1e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.315585  hitchhiker  0.00726573 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0758  peptidoglycan-associated lipoprotein  44.66 
 
 
169 aa  107  1e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.620729  normal  0.624777 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0316  OmpA/MotB  44.66 
 
 
170 aa  106  2e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00135962  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0799  OmpA-like protein  44.66 
 
 
170 aa  106  2e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00766515  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2305  peptidoglycan-associated lipoprotein  44.12 
 
 
187 aa  106  2e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6571  OmpA/MotB family outer membrane protein  35.23 
 
 
167 aa  106  2e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0768  peptidoglycan-associated lipoprotein  44.66 
 
 
170 aa  106  2e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0396571  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3949  OmpA/MotB  32.58 
 
 
163 aa  105  3e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.595149  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0950  peptidoglycan-associated lipoprotein  40.48 
 
 
179 aa  105  3e-22  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.660653  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4417  OmpA/MotB domain-containing protein  32.58 
 
 
163 aa  105  3e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.157406  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5888  peptidoglycan-associated lipoprotein  32.58 
 
 
163 aa  105  3e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.471283  normal  0.347557 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1486  OmpA/MotB  34.83 
 
 
187 aa  105  4e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.00178508  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1069  outer membrane protein P6 precursor  39.68 
 
 
178 aa  105  5e-22  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.427526  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3888  OmpA/MotB family outer membrane protein  43.69 
 
 
170 aa  104  8e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2195  peptidoglycan-associated lipoprotein  41.75 
 
 
192 aa  104  1e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.203407  normal  0.247452 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4309  peptidoglycan-associated lipoprotein  33.53 
 
 
163 aa  103  1e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0691285  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1397  OmpA/MotB  37.37 
 
 
176 aa  103  1e-21  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0466  OmpA/MotB domain-containing protein  45.37 
 
 
203 aa  102  2e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.651077 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1210  peptidoglycan-associated lipoprotein  41.38 
 
 
158 aa  103  2e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.240268  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2593  peptidoglycan-associated lipoprotein  31.05 
 
 
176 aa  102  2e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  1.55055e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0751  peptidoglycan-associated lipoprotein  46.08 
 
 
153 aa  103  2e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  1.45376e-11  normal  0.0872971 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3849  OmpA/MotB domain-containing protein  33.53 
 
 
163 aa  103  2e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3499  OmpA/MotB  31.96 
 
 
194 aa  103  2e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01565  outer membrane protein P6  34.39 
 
 
148 aa  102  4e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.406166  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5488  peptidoglycan-associated lipoprotein  41.12 
 
 
172 aa  102  4e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.429117  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1428  peptidoglycan-associated lipoprotein  33.87 
 
 
172 aa  101  5e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  1.58382e-15  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0202  OmpA/MotB domain-containing protein  32.26 
 
 
194 aa  101  6e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  1.81939e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1899  peptidoglycan-associated lipoprotein precursor  35.87 
 
 
185 aa  101  6e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.640623  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0685  peptidoglycan-associated lipoprotein  42.72 
 
 
173 aa  101  7e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.163413  normal  0.289483 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3514  peptidoglycan-associated lipoprotein  32.18 
 
 
199 aa  101  7e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  6.85011e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0695  OmpA/MotB  34.86 
 
 
165 aa  101  8e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3622  peptidoglycan-associated lipoprotein  42.45 
 
 
177 aa  100  9e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.595111  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0781  peptidoglycan-associated lipoprotein  34.38 
 
 
170 aa  100  1e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.224558  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2867  peptidoglycan-associated outer membrane lipoprotein  37.04 
 
 
168 aa  100  1e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  6.8592e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1280  peptidoglycan-associated outer membrane lipoprotein  41.27 
 
 
171 aa  100  1e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  1.37851e-10  hitchhiker  2.38774e-05 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2955  peptidoglycan-associated outer membrane lipoprotein  37.04 
 
 
168 aa  100  1e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  8.83314e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0591  OmpA/MotB family outer membrane protein  32.54 
 
 
241 aa  100  1e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2338  OmpA/MotB  44.76 
 
 
180 aa  100  1e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  2.945e-09  normal  0.0598095 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0736  peptidoglycan-associated lipoprotein precursor  43.69 
 
 
172 aa  100  1e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.947366 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0729  peptidoglycan-associated lipoprotein  42.72 
 
 
173 aa  100  1e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0152345  normal  0.212711 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3086  peptidoglycan-associated outer membrane lipoprotein  39.23 
 
 
169 aa  99.8  2e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  1.03923e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1398  peptidoglycan-associated outer membrane lipoprotein  37.04 
 
 
168 aa  99.8  2e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  3.75397e-06  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0519  OmpA/MotB domain-containing protein  33.67 
 
 
199 aa  100  2e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1250  peptidoglycan-associated outer membrane lipoprotein  39.23 
 
 
169 aa  99.8  2e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  4.41417e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1698  OmpA/MotB domain-containing protein  37.96 
 
 
189 aa  100  2e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.000544254  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2974  peptidoglycan-associated lipoprotein  35.82 
 
 
190 aa  99.4  3e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.113547  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4426  peptidoglycan-associated lipoprotein  38.06 
 
 
185 aa  99.4  3e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.651872 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01611  hypothetical protein  39.5 
 
 
173 aa  99.4  3e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1095  OmpA/MotB  45.45 
 
 
161 aa  99.4  3e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.159839  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1695  Pal family lipoprotein  39.62 
 
 
168 aa  99  4e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5389  peptidoglycan-associated lipoprotein  41.12 
 
 
170 aa  99  4e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1911  OmpA domain-containing protein  37.04 
 
 
205 aa  98.6  4e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1638  outer membrane lipoprotein Omp16 (minor outer membraneprotein omp16) (16 kDa OMP) (16.5 kDa minor OMP)  39.62 
 
 
168 aa  99  4e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1220  peptidoglycan-associated lipoprotein  39.62 
 
 
168 aa  99  4e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.427658  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1239  peptidoglycan-associated outer membrane lipoprotein  36.48 
 
 
173 aa  98.6  4e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000216334  normal  0.113587 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2674  OmpA/MotB  34.78 
 
 
169 aa  98.6  5e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0267041  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3405  OmpA domain-containing protein  33.68 
 
 
181 aa  98.2  6e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.725588 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1395  OmpA/MotB  32.62 
 
 
178 aa  98.2  6e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  2.29219e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3541  OmpA/MotB  32.83 
 
 
193 aa  98.2  7e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  1.09094e-16  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0796  OmpA/MotB  41.75 
 
 
170 aa  98.2  7e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.53166  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0616  peptidoglycan-associated lipoprotein  42.16 
 
 
171 aa  97.8  8e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0805483  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1463  OmpA/MotB domain-containing protein  38.28 
 
 
178 aa  97.8  8e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  1.46392e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4843  peptidoglycan-associated lipoprotein  41.12 
 
 
170 aa  97.8  9e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.678153  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0146  OmpA/MotB  33.7 
 
 
187 aa  97.8  9e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5311  peptidoglycan-associated lipoprotein  41.12 
 
 
170 aa  97.8  9e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2713  OmpA/MotB  35.33 
 
 
175 aa  97.8  9e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.202213  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2364  OmpA/MotB  42.99 
 
 
167 aa  97.8  9e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.550372 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4748  OmpA/MotB  37.04 
 
 
166 aa  97.4  1e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2021  peptidoglycan-associated lipoprotein precursor (19 kDa surface antigen) (PPL)  33.88 
 
 
176 aa  97.4  1e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3199  peptidoglycan-associated lipoprotein  35.91 
 
 
177 aa  97.1  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2026  peptidoglycan-associated lipoprotein precursor (19 kDa surface antigen) (PPL)  33.88 
 
 
176 aa  97.4  1e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1157  peptidoglycan-associated outer membrane lipoprotein  40.71 
 
 
168 aa  97.4  1e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2901  peptidoglycan-associated outer membrane lipoprotein  40.71 
 
 
168 aa  97.4  1e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  1.25837e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003912  OmpA precursor  39.34 
 
 
174 aa  97.1  1e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0204489  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>