17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AFE_0066 on replicon NC_011761
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011761  AFE_0066  TolA protein  100 
 
 
317 aa  603  1e-172  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.231101  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0067  protein TolA  100 
 
 
317 aa  603  1e-172  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0897  hypothetical protein  27.33 
 
 
341 aa  54.3  3e-06  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  8.12436e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0174  protein TolA  29.77 
 
 
273 aa  51.6  2e-05  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.877426  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3994  protein TolA  31.85 
 
 
358 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.513554  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2019c  TolA  28.84 
 
 
271 aa  46.6  0.0006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.957522  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0801  TonB family protein  42.55 
 
 
351 aa  44.7  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1067  TolA protein  23.77 
 
 
346 aa  45.1  0.002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.251769  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0770  protein TolA  42.55 
 
 
351 aa  44.3  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0734059  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4197  protein TolA  30.95 
 
 
372 aa  44.7  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0318  TonB-like  42.55 
 
 
351 aa  44.7  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.782104  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1250  Tol-Pal system, TolA  30.95 
 
 
372 aa  45.1  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.202899  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1221  biopolymer transport protein TolA  30.95 
 
 
372 aa  45.1  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.882269  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3890  TonB/TolA-like protein  42.55 
 
 
351 aa  43.5  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3980  signal recognition particle-docking protein FtsY  39.13 
 
 
643 aa  43.9  0.004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00176908  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1453  hypothetical protein  30.8 
 
 
332 aa  43.5  0.004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1530  hypothetical protein  29.6 
 
 
332 aa  43.1  0.007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>