More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AFE_0064 on replicon NC_011761
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011206  Lferr_0065  protein TolQ  100 
 
 
233 aa  479  1e-134  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.566643  normal  0.905632 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0064  TolQ protein  100 
 
 
233 aa  479  1e-134  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0296877  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3200  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  52.47 
 
 
225 aa  231  9e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.949255  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3238  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  52.47 
 
 
225 aa  231  9e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.923457  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0830  tolQ protein  52.47 
 
 
225 aa  231  9e-60  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2078  tolQ protein  52.47 
 
 
225 aa  231  9e-60  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2664  tolQ protein  52.47 
 
 
225 aa  231  9e-60  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1946  tolQ protein  52.47 
 
 
225 aa  231  9e-60  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3253  tolQ protein  52.47 
 
 
262 aa  230  1e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1376  tolQ protein  51.8 
 
 
225 aa  230  2e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0482994  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4056  MotA/TolQ/ExbB proton channel  50.89 
 
 
225 aa  224  1e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2584  protein TolQ  52.91 
 
 
225 aa  223  1e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.922054  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0320  MotA/TolQ/ExbB proton channel  53.36 
 
 
225 aa  223  2e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3892  MotA/TolQ/ExbB proton channel  53.36 
 
 
246 aa  223  2e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0697  protein TolQ  52.25 
 
 
225 aa  223  2e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.772794  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0772  protein TolQ  53.36 
 
 
225 aa  223  2e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.265235  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0803  MotA/TolQ/ExbB proton channel  53.36 
 
 
225 aa  223  2e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.424281  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0680  MotA/TolQ/ExbB proton channel  52.25 
 
 
242 aa  222  4e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.646362  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1412  MotA/TolQ/ExbB proton channel  50.89 
 
 
231 aa  219  2e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0108204  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3975  tolQ protein  50.89 
 
 
231 aa  219  2e-56  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0234616  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1274  MotA/TolQ/ExbB proton channel  51.34 
 
 
231 aa  219  3e-56  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.232758  normal  0.304845 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4405  MotA/TolQ/ExbB proton channel  53.52 
 
 
221 aa  219  4e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0344768  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1219  biopolymer transport protein TolQ  50.89 
 
 
231 aa  218  5e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.712744  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1248  Tol-Pal system, TolQ  50.89 
 
 
231 aa  218  5e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.216384  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3996  protein TolQ  50.89 
 
 
231 aa  218  5e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.523638  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0681  protein TolQ  49.57 
 
 
230 aa  218  5e-56  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.458824  normal  0.677661 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0725  protein TolQ  49.57 
 
 
230 aa  218  5e-56  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.750364  normal  0.0773075 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4199  protein TolQ  50.89 
 
 
231 aa  218  5e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.40323  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1728  tolQ protein  49.31 
 
 
228 aa  217  1e-55  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3917  biopolymer MotA/TolQ/ExbB proton channel family transporter  54.05 
 
 
225 aa  217  2e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.22506  normal  0.159351 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2209  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  49.14 
 
 
231 aa  216  4e-55  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00714084 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2452  protein TolQ  53.6 
 
 
225 aa  215  5e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0762  protein TolQ  53.81 
 
 
225 aa  214  7e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.167492  normal  0.258035 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0245  MotA/TolQ/ExbB proton channel  51.39 
 
 
235 aa  214  8e-55  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4539  TolQ protein  49.13 
 
 
231 aa  214  9e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51750  TolQ protein  49.13 
 
 
231 aa  214  9e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.438505  hitchhiker  2.23597e-05 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2232  TolQ protein  48.43 
 
 
228 aa  213  2e-54  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2942  MotA/TolQ/ExbB proton channel  52.76 
 
 
236 aa  212  4e-54  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  1.53109e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1702  MotA/TolQ/ExbB proton channel  52.53 
 
 
229 aa  212  5e-54  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0354123  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02687  tolQ protein  51.38 
 
 
229 aa  211  7e-54  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000858548  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1276  colicin uptake protein TolQ  51.42 
 
 
224 aa  211  1e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000244479  hitchhiker  0.000166082 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0533  protein TolQ  51.61 
 
 
225 aa  210  2e-53  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.331397  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01607  hypothetical protein  49.31 
 
 
232 aa  209  4e-53  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2922  MotA/TolQ/ExbB proton channel  46.9 
 
 
230 aa  208  5e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.835722  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1235  colicin uptake protein TolQ  50.94 
 
 
227 aa  208  7e-53  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0719257  normal  0.246715 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1604  MotA/TolQ/ExbB proton channel  46.85 
 
 
228 aa  208  7e-53  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00156809  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0413  TolQ  46.15 
 
 
237 aa  207  1e-52  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0635098  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2534  MotA/TolQ/ExbB proton channel  46.4 
 
 
228 aa  207  1e-52  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  1.01898e-05  normal  0.114902 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2443  MotA/TolQ/ExbB proton channel  46.4 
 
 
228 aa  207  1e-52  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  8.58501e-05  normal  0.237078 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2191  Tol-Pal system TolQ  48.62 
 
 
226 aa  207  1e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000779627  normal  0.358656 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2342  MotA/TolQ/ExbB proton channel  48.2 
 
 
224 aa  207  1e-52  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.348836  normal  0.105576 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1782  protein TolQ  46.4 
 
 
228 aa  207  1e-52  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  9.21899e-08  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2541  protein TolQ  46.4 
 
 
228 aa  207  1e-52  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  2.45733e-06  hitchhiker  3.09411e-06 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1739  Tol-Pal system TolQ  46.4 
 
 
228 aa  207  1e-52  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  2.43293e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1761  TolQ protein  46.15 
 
 
237 aa  207  1e-52  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1895  TolQ protein, inner membrane component  47.93 
 
 
228 aa  206  2e-52  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2371  MotA/TolQ/ExbB proton channel  46.4 
 
 
228 aa  207  2e-52  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00211275  normal  0.155674 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2227  MotA/TolQ/ExbB proton channel  47.3 
 
 
233 aa  205  4e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.260682  hitchhiker  0.000349255 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1743  MotA/TolQ/ExbB proton channel  45.95 
 
 
228 aa  205  4e-52  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  9.15639e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2941  protein TolQ  48.42 
 
 
236 aa  205  4e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2717  MotA/TolQ/ExbB proton channel  46.4 
 
 
228 aa  205  4e-52  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.169266  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1391  MotA/TolQ/ExbB proton channel  46.08 
 
 
229 aa  205  5e-52  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  7.87618e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1394  colicin uptake protein TolQ  50 
 
 
228 aa  205  6e-52  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00123539  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2959  colicin uptake protein TolQ  50 
 
 
225 aa  205  6e-52  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0410151  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2871  colicin uptake protein TolQ  50 
 
 
228 aa  205  6e-52  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  1.8196e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2751  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  45.95 
 
 
228 aa  204  1e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36670  TolQ proton channel  49.55 
 
 
231 aa  204  1e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0994349  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0724  MotA/TolQ/ExbB proton channel  48.58 
 
 
227 aa  204  1e-51  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.49682  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0563  protein TolQ  50.23 
 
 
230 aa  203  1e-51  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.533269  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2734  protein TolQ  45.16 
 
 
229 aa  203  2e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.252045  hitchhiker  0.000106629 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0785  protein TolQ  49.77 
 
 
222 aa  203  2e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0555571  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2532  peptidase A8, signal peptidase II  48.66 
 
 
231 aa  203  2e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00489789  normal  0.411252 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1226  tolQ protein  48.85 
 
 
225 aa  202  3e-51  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.369592  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1432  tolQ protein  49.32 
 
 
227 aa  202  3e-51  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  1.36252e-15  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2214  MotA/TolQ/ExbB proton channel  48.62 
 
 
232 aa  202  4e-51  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0732  TOLQ-like transport transmembrane protein  50.22 
 
 
230 aa  202  4e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.682761 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2463  protein TolQ  47.11 
 
 
234 aa  202  5e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0263661  normal  0.458025 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2567  Tol-Pal system TolQ  45.16 
 
 
229 aa  201  6e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  5.76197e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2905  colicin uptake protein TolQ  49.08 
 
 
228 aa  201  8e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.045905  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1153  colicin uptake protein TolQ  50 
 
 
228 aa  201  9e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1524  MotA/TolQ/ExbB proton channel  45.41 
 
 
229 aa  201  1e-50  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0123133  normal  0.884869 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1854  MotA/TolQ/ExbB proton channel  45.16 
 
 
229 aa  201  1e-50  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0235502  normal  0.794171 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3090  colicin uptake protein TolQ  49.53 
 
 
228 aa  199  2e-50  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0237739  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1246  colicin uptake protein TolQ  49.53 
 
 
228 aa  199  3e-50  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0152271  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2890  MotA/TolQ/ExbB proton channel  46.9 
 
 
230 aa  198  6e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.229588 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003916  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  50.76 
 
 
211 aa  198  6e-50  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0542858  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1459  MotA/TolQ/ExbB proton channel  45.16 
 
 
229 aa  198  6e-50  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00757308  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2954  transmembrane protein/ biopolymer transport  47.79 
 
 
227 aa  198  8e-50  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0172322  normal  0.721905 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2678  MotA/TolQ/ExbB proton channel  50 
 
 
227 aa  196  2e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1451  hypothetical protein  45.19 
 
 
224 aa  197  2e-49  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1532  hypothetical protein  45.19 
 
 
224 aa  197  2e-49  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0278  MotA/TolQ/ExbB proton channel  49.77 
 
 
218 aa  196  2e-49  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.145562  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0792  MotA/TolQ/ExbB proton channel  49.56 
 
 
227 aa  196  4e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2918  colicin uptake protein TolQ  50.94 
 
 
227 aa  194  7e-49  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  4.15186e-05  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0760  colicin uptake protein TolQ  50.94 
 
 
230 aa  194  7e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  1.15881e-05  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0659  colicin uptake protein TolQ  50.94 
 
 
230 aa  194  7e-49  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  6.56356e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0790  colicin uptake protein TolQ  50.94 
 
 
230 aa  194  7e-49  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  3.94875e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00686  hypothetical protein  50.94 
 
 
230 aa  194  7e-49  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  8.28113e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0840  colicin uptake protein TolQ  50.94 
 
 
230 aa  194  7e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  2.48692e-09  normal  0.940018 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0766  colicin uptake protein TolQ  50.94 
 
 
230 aa  194  7e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  5.89791e-10  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>