More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AFE_0057 on replicon NC_011761
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011761  AFE_0057  quinolinate synthetase  100 
 
 
360 aa  742  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0058  quinolinate synthetase  99.72 
 
 
365 aa  741  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.000714365  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0605  quinolinate synthetase  64.62 
 
 
366 aa  499  1e-140  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3645  quinolinate synthetase  65 
 
 
366 aa  496  1e-139  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2381  quinolinate synthetase  62.78 
 
 
379 aa  490  1e-137  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0376  quinolinate synthetase  66.38 
 
 
389 aa  485  1e-136  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0303  quinolinate synthetase  64.47 
 
 
365 aa  484  1e-136  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.527359  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3766  quinolinate synthetase  63.66 
 
 
365 aa  483  1e-135  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0837533 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1626  quinolinate synthetase  63.9 
 
 
365 aa  467  1e-130  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1289  quinolinate synthetase  58 
 
 
375 aa  419  1e-116  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0340709  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4317  quinolinate synthetase  55.3 
 
 
370 aa  404  1e-111  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.381105  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0241  quinolinate synthetase  55.12 
 
 
426 aa  395  1e-109  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0291672  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15680  quinolinate synthetase  57.06 
 
 
442 aa  397  1e-109  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.373722  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3149  quinolinate synthetase  56.11 
 
 
394 aa  387  1e-106  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.322606  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2297  quinolinate synthetase  56.55 
 
 
433 aa  387  1e-106  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.88657e-05 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2776  quinolinate synthetase  57.02 
 
 
425 aa  387  1e-106  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.12125 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3557  quinolinate synthetase  55.34 
 
 
430 aa  386  1e-106  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00755021  normal  0.140147 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2560  quinolinate synthetase  54.6 
 
 
441 aa  385  1e-106  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.267986  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03750  quinolinate synthetase  54.95 
 
 
435 aa  383  1e-105  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.01  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0350  quinolinate synthetase complex, A subunit  53.48 
 
 
421 aa  376  1e-103  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.54036  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3306  quinolinate synthetase  55.87 
 
 
400 aa  375  1e-103  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.448369 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3083  quinolinate synthetase complex, A subunit  55.08 
 
 
388 aa  370  1e-101  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0542584  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1284  quinolinate synthetase complex subunit A  55.08 
 
 
386 aa  367  1e-100  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.778177  normal  0.539077 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3538  quinolinate synthetase  55.79 
 
 
399 aa  364  1e-99  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.306663  hitchhiker  0.000931017 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2664  quinolinate synthetase complex, A subunit  53.65 
 
 
384 aa  363  2e-99  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.240142  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0917  quinolinate synthetase  52.99 
 
 
360 aa  363  2e-99  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  4.24051e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1458  quinolinate synthetase  55.21 
 
 
383 aa  360  2e-98  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.570432  normal  0.648645 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4148  quinolinate synthetase complex, A subunit  54.42 
 
 
388 aa  358  8e-98  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0298748 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2529  quinolinate synthetase  50.14 
 
 
367 aa  357  2e-97  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0919  quinolinate synthetase  50.84 
 
 
367 aa  356  4e-97  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3143  quinolinate synthetase  50.14 
 
 
368 aa  355  9e-97  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2086  quinolinate synthetase complex, A subunit  52.99 
 
 
412 aa  354  1e-96  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0193365  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4660  quinolinate synthetase  49.28 
 
 
368 aa  354  2e-96  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00639812  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4325  quinolinate synthetase  49.28 
 
 
368 aa  354  2e-96  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4508  quinolinate synthetase  49 
 
 
368 aa  352  4e-96  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0362709 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4162  quinolinate synthetase  49 
 
 
368 aa  352  4e-96  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4561  quinolinate synthetase  49 
 
 
368 aa  352  4e-96  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0689  quinolinate synthetase  48.71 
 
 
368 aa  351  1e-95  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.416009  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4546  quinolinate synthetase  48.42 
 
 
368 aa  350  2e-95  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0260713  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4173  quinolinate synthetase  48.42 
 
 
368 aa  349  3e-95  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1661  quinolinate synthetase  53.41 
 
 
397 aa  350  3e-95  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.495114  normal  0.0794019 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4274  quinolinate synthetase  49 
 
 
368 aa  349  4e-95  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0106233  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4513  quinolinate synthetase  48.42 
 
 
368 aa  348  1e-94  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15580  quinolinate synthetase A  53.35 
 
 
400 aa  343  3e-93  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.546828  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1796  quinolinate synthetase  52.8 
 
 
395 aa  333  2e-90  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.574289 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3122  quinolinate synthetase  54.44 
 
 
407 aa  329  6e-89  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.174663  normal  0.85949 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2253  quinolinate synthetase complex, A subunit  46.52 
 
 
356 aa  311  1e-83  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00564626 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1579  quinolinate synthetase  46.44 
 
 
372 aa  300  2e-80  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.8831  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2922  quinolinate synthetase complex, A subunit  45.33 
 
 
377 aa  287  2e-76  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0530  quinolinate synthetase complex, A subunit  44.19 
 
 
377 aa  285  6e-76  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1497  quinolinate synthetase  44.02 
 
 
373 aa  280  3e-74  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.611574  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1372  quinolinate synthetase  45.77 
 
 
346 aa  272  7e-72  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.32551  normal  0.474505 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0687  quinolinate synthetase  44.19 
 
 
337 aa  259  6e-68  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1830  quinolinate synthetase  40.88 
 
 
346 aa  249  5e-65  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0525  quinolinate synthetase  42.73 
 
 
349 aa  248  9e-65  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.472845 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0807  quinolinate synthetase  38.7 
 
 
348 aa  230  3e-59  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1352  quinolinate synthetase  37.54 
 
 
358 aa  228  1e-58  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.186437  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0667  quinolinate synthetase  34.29 
 
 
332 aa  202  9e-51  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0757  quinolinate synthetase  34.93 
 
 
337 aa  201  2e-50  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.0012496  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0238  quinolinate synthetase complex, A subunit  36.05 
 
 
330 aa  193  3e-48  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1874  quinolinate synthetase complex, A subunit  37.54 
 
 
307 aa  180  4e-44  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0104  quinolinate synthetase  35.24 
 
 
303 aa  177  3e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00620  quinolinate synthetase complex, A subunit  34.2 
 
 
301 aa  177  3e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0424  quinolinate synthetase complex, A subunit  37.54 
 
 
324 aa  176  6e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0685168  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0121  quinolinate synthetase complex, A subunit  36.23 
 
 
303 aa  175  9e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.65603  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07311  quinolinate synthetase  34.48 
 
 
304 aa  175  1e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.708071  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1757  quinolinate synthetase complex, A subunit  38.29 
 
 
303 aa  173  5e-42  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.114115  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0013  quinolinate synthetase complex, A subunit  35.5 
 
 
332 aa  173  5e-42  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07331  quinolinate synthetase  33.43 
 
 
304 aa  173  5e-42  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.269483  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1865  quinolinate synthetase  34.38 
 
 
304 aa  172  9e-42  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.210788 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0754  quinolinate synthetase complex, A subunit  33.13 
 
 
298 aa  172  1e-41  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0678  quinolinate synthetase  33.43 
 
 
304 aa  172  1e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.657173  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2119  quinolinate synthetase complex, A subunit  34.94 
 
 
302 aa  171  2e-41  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.825722  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07511  quinolinate synthetase  33.63 
 
 
304 aa  170  3e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15631  quinolinate synthetase  38.8 
 
 
333 aa  171  3e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.798596 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0021  quinolinate synthetase  35.21 
 
 
304 aa  170  3e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0447928  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0105  quinolinate synthetase  35.69 
 
 
322 aa  170  4e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1456  quinolinate synthetase  35.85 
 
 
310 aa  169  7e-41  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.129815 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3494  quinolinate synthetase complex, A subunit  34.33 
 
 
343 aa  167  2e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.499841  normal  0.252503 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2356  quinolinate synthetase A  32.86 
 
 
304 aa  168  2e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000244014  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4715  quinolinate synthetase  35.51 
 
 
348 aa  167  2e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0705171  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1548  quinolinate synthetase complex, A subunit  34.66 
 
 
317 aa  167  3e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0467  quinolinate synthetase  35.59 
 
 
329 aa  166  6e-40  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3586  quinolinate synthetase  35.33 
 
 
305 aa  165  9e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00023844  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2767  quinolinate synthetase complex, A subunit  37.13 
 
 
357 aa  165  1e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0866463  normal  0.426331 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0832  quinolinate synthetase  31.78 
 
 
447 aa  165  1e-39  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3427  quinolinate synthetase  35.38 
 
 
334 aa  165  1e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1727  quinolinate synthetase  34.77 
 
 
306 aa  165  1e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.08382e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0199  quinolinate synthetase  34.5 
 
 
304 aa  164  2e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  1.96344e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0742  quinolinate synthetase complex, A subunit  33.62 
 
 
334 aa  164  2e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0225103 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3346  quinolinate synthetase  35.65 
 
 
334 aa  164  2e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.816323  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3491  quinolinate synthetase  35.38 
 
 
334 aa  164  3e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0376  quinolinate synthetase  34.39 
 
 
301 aa  163  4e-39  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1991  quinolinate synthetase  37.63 
 
 
324 aa  163  4e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5463  quinolinate synthetase complex, A subunit  36.23 
 
 
338 aa  162  6e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.222387  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3413  quinolinate synthetase  35.93 
 
 
334 aa  162  6e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.235688  normal  0.127536 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0861  quinolinate synthetase  31.7 
 
 
447 aa  162  7e-39  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4733  quinolinate synthetase complex, A subunit  35.54 
 
 
331 aa  162  7e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.975521  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2907  quinolinate synthetase complex subunit A  37.5 
 
 
320 aa  161  1e-38  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0089  quinolinate synthetase  34.76 
 
 
332 aa  161  1e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>