82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AFE_0053 on replicon NC_011761
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011206  Lferr_0054  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  100 
 
 
352 aa  681  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0689897  normal  0.802997 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0053  hypothetical protein  100 
 
 
344 aa  682  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.101016  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3682  putative membrane protein of unknown function with YeeE/YedE motives  36.63 
 
 
180 aa  103  4e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.137172  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1214  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  41.84 
 
 
100 aa  94  4e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0826897  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3345  hypothetical protein  47.5 
 
 
192 aa  93.6  4e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1835  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  34.68 
 
 
177 aa  89  1e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2311  YeeE/YedE family protein  36.2 
 
 
185 aa  87.4  3e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.248702  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0176  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  42.15 
 
 
174 aa  86.7  5e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000820343 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3014  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  41.18 
 
 
175 aa  87  5e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2856  hypothetical protein  38.89 
 
 
175 aa  86.7  5e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1696  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  34.81 
 
 
185 aa  86.7  6e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.39516e-05 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1156  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  38.1 
 
 
407 aa  84.7  2e-15  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.643231  normal  0.0925546 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1695  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  34.91 
 
 
181 aa  83.6  5e-15  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000630724 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0175  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  38.62 
 
 
176 aa  82.8  7e-15  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00121367 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2804  hypothetical protein  33.53 
 
 
180 aa  82.8  8e-15  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1977  hypothetical protein  41.18 
 
 
175 aa  82.4  9e-15  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.52467  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0625  YeeE/YedE family protein  41.8 
 
 
186 aa  82  1e-14  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1597  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  41.73 
 
 
170 aa  81.3  2e-14  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1868  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  32.48 
 
 
180 aa  80.5  4e-14  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.212789  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1169  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  36.03 
 
 
197 aa  79  1e-13  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2310  YeeE/YedE family protein  34.52 
 
 
173 aa  78.2  2e-13  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.996502  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1978  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  35.33 
 
 
174 aa  77  4e-13  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.248725  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1172  hypothetical protein  25.34 
 
 
373 aa  75.9  9e-13  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  1.26927e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3344  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  38.12 
 
 
177 aa  75.5  1e-12  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1628  YeeE/YedE family protein  40.34 
 
 
185 aa  75.5  1e-12  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.303699 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0812  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  40 
 
 
462 aa  74.7  2e-12  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2969  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  34.75 
 
 
172 aa  72.8  8e-12  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1867  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  36.52 
 
 
176 aa  71.2  3e-11  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.340851  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0624  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  34.15 
 
 
175 aa  70.1  6e-11  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1629  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  33.52 
 
 
175 aa  69.3  8e-11  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.301211 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3683  hypothetical protein  36.44 
 
 
186 aa  67.8  3e-10  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.133459  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4308  hypothetical protein  37.72 
 
 
174 aa  65.5  1e-09  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.219797 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3774  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  26.1 
 
 
374 aa  63.5  5e-09  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4309  hypothetical protein  35.65 
 
 
205 aa  63.5  6e-09  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.376273 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0801  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  31.21 
 
 
171 aa  62.8  9e-09  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.897087  normal  0.163376 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1170  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  27.4 
 
 
368 aa  62.4  1e-08  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.100634  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1462  rhodanese domain-containing protein  32.08 
 
 
419 aa  62  1e-08  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0511  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  24.2 
 
 
330 aa  62  1e-08  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  4.13537e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0348  hypothetical protein  38.84 
 
 
189 aa  61.6  2e-08  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.176837  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1366  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  32.17 
 
 
182 aa  61.2  3e-08  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2595  hypothetical protein  35.25 
 
 
237 aa  61.2  3e-08  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.100646 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2857  hypothetical protein  38.64 
 
 
175 aa  60.5  4e-08  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0511  rhodanese domain-containing protein  30.33 
 
 
647 aa  59.7  7e-08  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1168  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  39.33 
 
 
172 aa  59.3  9e-08  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.709858  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1759  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  23.91 
 
 
332 aa  58.9  1e-07  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  1.12803e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2803  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  43.94 
 
 
183 aa  55.5  1e-06  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4107  hypothetical protein  31.03 
 
 
399 aa  55.1  2e-06  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.159801  normal  0.215319 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3015  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  32.48 
 
 
133 aa  53.1  6e-06  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1596  hypothetical protein  42.57 
 
 
173 aa  53.1  6e-06  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2970  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  33.12 
 
 
175 aa  52.4  1e-05  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0557  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  34.17 
 
 
218 aa  51.6  2e-05  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  3.11209e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2716  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  36 
 
 
171 aa  51.2  2e-05  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.653376  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2811  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  36.24 
 
 
171 aa  51.2  2e-05  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.647947  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0171  YeeE/YedE  39.39 
 
 
162 aa  50.8  3e-05  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.96637  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0512  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  38.64 
 
 
176 aa  51.2  3e-05  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0802  YeeE/YedE family protein  38.6 
 
 
185 aa  49.7  7e-05  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.161542 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2173  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  24.1 
 
 
419 aa  48.9  0.0001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000368304  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1463  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  30.77 
 
 
165 aa  48.9  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4882  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  36.89 
 
 
187 aa  48.5  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.437819  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0789  rhodanese domain-containing protein  29.19 
 
 
189 aa  49.3  0.0001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.259144  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2608  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  33.9 
 
 
186 aa  46.2  0.0007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.104048 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4250  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  25.48 
 
 
363 aa  46.2  0.0008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.778498  normal  0.233136 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11778  hypothetical protein  49.02 
 
 
185 aa  45.8  0.001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2630  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  38.89 
 
 
171 aa  45.8  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.671855  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0269  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  27.98 
 
 
187 aa  46.2  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1494  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  30.67 
 
 
151 aa  45.1  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3453  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  27.68 
 
 
371 aa  44.7  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0449  hypothetical protein  28.09 
 
 
394 aa  44.7  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0951  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  29.71 
 
 
415 aa  45.1  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4366  hypothetical protein  25.1 
 
 
363 aa  44.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4545  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  24.71 
 
 
407 aa  45.1  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0891031  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4041  YeeE/YedE  24.18 
 
 
367 aa  44.3  0.003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2996  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  41.51 
 
 
138 aa  44.3  0.003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.270822  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2715  hypothetical protein  49.09 
 
 
218 aa  43.9  0.004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2810  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  49.09 
 
 
218 aa  43.9  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.151764  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1834  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  30.3 
 
 
180 aa  43.1  0.006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2671  hypothetical protein  24.18 
 
 
371 aa  42.7  0.008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00350575  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0760  hypothetical protein  36.14 
 
 
145 aa  42.7  0.008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0788  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  28.89 
 
 
175 aa  42.7  0.008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0768937  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71670  hypothetical protein  26.92 
 
 
404 aa  42.7  0.008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.786799  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1028  hypothetical protein  42.42 
 
 
185 aa  42.7  0.009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.637792  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2820  YeeE/YedE  33.01 
 
 
170 aa  42.7  0.01  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>