More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AFE_0047 on replicon NC_011761
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011761  AFE_0047  hypothetical protein  100 
 
 
165 aa  336  9e-92  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.147207  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0048  Redoxin domain protein  100 
 
 
172 aa  336  1e-91  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0534182  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0190  Redoxin domain protein  27.78 
 
 
186 aa  93.2  1e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.968687  normal  0.596413 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0284  putative transmembrane protein  30.88 
 
 
178 aa  92  3e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2412  Redoxin domain protein  32.88 
 
 
167 aa  90.5  9e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0196  Redoxin domain protein  31.09 
 
 
185 aa  90.5  1e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0104775 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0181  alkyl hydroperoxide reductase  35.61 
 
 
183 aa  87.8  6e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0243778  normal  0.461108 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1221  peroxiredoxin-like protein  35.11 
 
 
173 aa  87  9e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0333  putative transmembrane protein  30.25 
 
 
213 aa  87  9e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.847937  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0475  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  32.64 
 
 
173 aa  86.7  1e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0233  thioredoxin-like protein  27.78 
 
 
179 aa  86.3  2e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0530  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  38.21 
 
 
168 aa  84  9e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.120927  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0451  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxins-like  35.37 
 
 
180 aa  83.6  1e-15  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4046  redoxin domain-containing protein  31.25 
 
 
166 aa  83.6  1e-15  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.05313e-08 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2431  putative thioredoxin  29.84 
 
 
164 aa  83.2  1e-15  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0247  Redoxin domain protein  29.93 
 
 
165 aa  82.4  2e-15  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.549118  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5686  redoxin domain-containing protein  33.83 
 
 
186 aa  81.6  5e-15  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.131775 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0432  redoxin domain-containing protein  31.06 
 
 
169 aa  80.5  9e-15  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0116447 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1898  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  32.48 
 
 
166 aa  80.1  1e-14  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  2.77693e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0433  redoxin domain-containing protein  28.68 
 
 
179 aa  79.7  1e-14  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3028  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  35 
 
 
174 aa  80.5  1e-14  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4194  putative thiol-disulfide isomerase and thioredoxins  28.24 
 
 
176 aa  79.3  2e-14  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.462178 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2881  redoxin domain-containing protein  28.68 
 
 
178 aa  79.3  2e-14  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2925  redoxin domain-containing protein  28.68 
 
 
178 aa  79.3  2e-14  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2618  Redoxin domain protein  35 
 
 
174 aa  79.3  2e-14  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.548372 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1278  redoxin domain-containing protein  30.17 
 
 
167 aa  79.3  2e-14  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3927  thioredoxin-like  32.43 
 
 
174 aa  79.7  2e-14  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.298512  normal  0.186192 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6212  Thiol-disulfide isomerase/thioredoxin-like  28.68 
 
 
194 aa  79  3e-14  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0318  hypothetical protein  26.62 
 
 
166 aa  78.6  3e-14  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0164115  normal  0.0202423 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0547  peroxiredoxin-like protein  35.25 
 
 
168 aa  79  3e-14  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2870  redoxin domain-containing protein  28.68 
 
 
178 aa  78.6  4e-14  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0218082  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2256  redoxin  28.68 
 
 
178 aa  78.6  4e-14  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.087584  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1358  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  37.29 
 
 
179 aa  78.2  4e-14  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000315647  hitchhiker  3.56135e-06 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0292  redoxin domain-containing protein  26.81 
 
 
167 aa  78.2  5e-14  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  1.02715e-05 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0287  Redoxin domain protein  26.81 
 
 
167 aa  78.2  5e-14  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.610229  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2787  redoxin domain-containing protein  27.94 
 
 
178 aa  78.2  5e-14  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.787444  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0228  redoxin domain-containing protein  28.15 
 
 
174 aa  78.2  5e-14  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.454071  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0402  hypothetical protein  28.68 
 
 
178 aa  77.8  6e-14  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0350  redoxin domain-containing protein  27.34 
 
 
168 aa  77.8  7e-14  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00112402 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1898  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  34.45 
 
 
187 aa  77.4  8e-14  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0521  Redoxin domain protein  26.52 
 
 
176 aa  77.4  9e-14  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.037804  normal  0.85402 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3298  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  31.97 
 
 
191 aa  77.4  9e-14  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.61408  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2819  hypothetical protein  28.68 
 
 
178 aa  77.4  9e-14  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0479  putative thiol-disulfide oxidoreductase  28.68 
 
 
178 aa  77.4  9e-14  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0459  putative thiol-disulfide oxidoreductase  28.68 
 
 
178 aa  77.4  9e-14  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1393  hypothetical protein  28.68 
 
 
178 aa  77.4  9e-14  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3225  hypothetical protein  28.68 
 
 
178 aa  77.4  9e-14  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0200  hypothetical protein  28.68 
 
 
178 aa  77.4  9e-14  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0643  resA domain-containing protein  28.68 
 
 
178 aa  77.4  9e-14  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.826532  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0868  Redoxin domain protein  34.85 
 
 
469 aa  77  1e-13  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4431  Redoxin domain protein  36 
 
 
193 aa  75.9  2e-13  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1911  redoxin domain-containing protein  33.59 
 
 
184 aa  76.3  2e-13  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.58722  normal  0.231287 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3227  redoxin family protein  29.6 
 
 
297 aa  75.1  4e-13  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0399  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  27.16 
 
 
171 aa  75.1  4e-13  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.689513  normal  0.928423 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0405  redoxin domain-containing protein  27.59 
 
 
203 aa  74.7  5e-13  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1170  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  32.12 
 
 
596 aa  74.7  6e-13  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.623408 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0760  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  38.05 
 
 
228 aa  74.3  6e-13  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.173874 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1851  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  31.3 
 
 
409 aa  74.3  7e-13  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1890  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  28.91 
 
 
171 aa  74.3  7e-13  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.326681  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0243  redoxin domain-containing protein  31.25 
 
 
184 aa  73.9  8e-13  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.487537  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4901  Redoxin domain protein  25.86 
 
 
165 aa  73.9  8e-13  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.273187  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2734  Redoxin domain protein  39.1 
 
 
204 aa  73.9  8e-13  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0627049  normal  0.0544448 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2145  Redoxin domain protein  29.92 
 
 
172 aa  73.9  9e-13  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.765284  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1356  thiol-disulfide oxidoreductase  26.19 
 
 
173 aa  73.6  1e-12  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2010  redoxin domain-containing protein  33.33 
 
 
178 aa  73.2  1e-12  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0340  hypothetical protein  36.8 
 
 
192 aa  73.6  1e-12  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1598  thiol-disulfide oxidoreductase  26.19 
 
 
173 aa  73.6  1e-12  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.966744  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1239  thiol-disulfide isomerase and thioredoxins-like protein  25.93 
 
 
422 aa  73.6  1e-12  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.502856  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3292  redoxin domain-containing protein  34.17 
 
 
200 aa  73.6  1e-12  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3317  AhpC/TSA family protein  30.83 
 
 
191 aa  73.2  1e-12  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5424  redoxin domain-containing protein  32.61 
 
 
604 aa  73.6  1e-12  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3551  thiol:disulfide interchange protein DsbE, putative  34.15 
 
 
173 aa  73.6  1e-12  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.571735 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1981  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  29.46 
 
 
171 aa  73.6  1e-12  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0214492  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3911  hypothetical protein  32.33 
 
 
189 aa  72.4  2e-12  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0190  cytochrome c biogenesis protein, putative  28.57 
 
 
201 aa  72.8  2e-12  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.648376  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3632  ahpC/TSA family protein  30.83 
 
 
191 aa  72.8  2e-12  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0183092  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3405  ahpC/TSA family protein  30.83 
 
 
191 aa  72.8  2e-12  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3367  AhpC/TSA family protein  30.83 
 
 
191 aa  72.8  2e-12  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0144546  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3623  ahpC/TSA family protein  30.83 
 
 
191 aa  72.8  2e-12  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.31744e-05 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0274  cytochrome c biogenesis protein, putative  28.57 
 
 
194 aa  72.8  2e-12  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0525  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  26.67 
 
 
178 aa  73.2  2e-12  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  1.36072e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2397  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  34.71 
 
 
173 aa  72.8  2e-12  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1257  resA domain-containing protein  26.06 
 
 
165 aa  72.8  2e-12  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0539  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  27.14 
 
 
435 aa  73.2  2e-12  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3674  ahpC/TSA family protein  30.83 
 
 
191 aa  72.8  2e-12  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.309572  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3536  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  33.05 
 
 
186 aa  72  3e-12  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6264  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  33.05 
 
 
173 aa  72.4  3e-12  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.92814  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0814  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  35.16 
 
 
589 aa  72  3e-12  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0629136  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2682  thioredoxin  32.8 
 
 
183 aa  72.4  3e-12  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2803  putative thioredoxin  34.34 
 
 
172 aa  71.2  5e-12  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.482325  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3720  ahpC/TSA family protein  30 
 
 
191 aa  71.6  5e-12  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0240  Redoxin domain protein  28.57 
 
 
188 aa  71.6  5e-12  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0721  cytochrome C biogenesis protein  30.58 
 
 
403 aa  71.2  5e-12  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0206  Redoxin domain protein  26.5 
 
 
167 aa  71.2  5e-12  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1234  redoxin domain-containing protein  31.09 
 
 
167 aa  71.2  5e-12  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2245  redoxin domain-containing protein  34.19 
 
 
165 aa  71.2  6e-12  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3951  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxins-like protein  28.57 
 
 
188 aa  71.2  6e-12  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.337329 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0270  putative transmembrane protein  25 
 
 
174 aa  71.2  6e-12  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0212  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  32.81 
 
 
175 aa  71.2  6e-12  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3638  ahpC/TSA family protein  30 
 
 
191 aa  71.2  6e-12  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00315479  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>