More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AFE_0045 on replicon NC_011761
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011761  AFE_0045  sulfur/pyrite/thiosulfate/sulfide-induced protein  100 
 
 
215 aa  451  1e-126  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.972938  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0046  Rhodanese domain protein  100 
 
 
215 aa  451  1e-126  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.100616  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1543  Rhodanese domain protein  45.95 
 
 
138 aa  64.3  1e-09  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.973949  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4180  putative rhodanese-related sulfurtransferase  42.86 
 
 
141 aa  63.5  2e-09  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0535  Rhodanese domain protein  40 
 
 
141 aa  63.9  2e-09  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0162  Rhodanese domain protein  36.45 
 
 
108 aa  63.2  3e-09  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.963879  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1937  rhodanese domain-containing protein  37.84 
 
 
269 aa  62  7e-09  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0286726  hitchhiker  9.17613e-09 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2364  rhodanese-like domain protein  36.49 
 
 
141 aa  61.6  9e-09  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1997  Rhodanese domain protein  36.49 
 
 
141 aa  61.6  9e-09  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.885175  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0267  rhodanese domain-containing protein  40 
 
 
161 aa  61.2  1e-08  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.968437  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2962  rhodanese domain-containing protein  39.19 
 
 
145 aa  61.2  1e-08  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0611  rhodanese-like protein  41.77 
 
 
141 aa  60.5  2e-08  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2630  Rhodanese domain protein  40 
 
 
112 aa  60.5  2e-08  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2577  Rhodanese domain protein  38.46 
 
 
113 aa  59.3  4e-08  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  1.8103e-06  decreased coverage  2.78243e-05 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3913  rhodanese-like protein  37.66 
 
 
132 aa  58.9  5e-08  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.103396  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0229  Rhodanese domain protein  41.56 
 
 
140 aa  58.9  6e-08  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.479162  hitchhiker  0.0025446 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2894  rhodanese domain-containing protein  38.36 
 
 
113 aa  58.5  7e-08  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.127379  normal  0.672082 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1502  rhodanese domain-containing protein  41.33 
 
 
113 aa  58.2  8e-08  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.184229  normal  0.558017 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3835  rhodanese domain-containing protein  29.23 
 
 
113 aa  58.5  8e-08  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3735  rhodanese domain-containing protein  40.79 
 
 
113 aa  58.5  8e-08  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00254792 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0210  Rhodanese domain protein  41.56 
 
 
140 aa  57.8  1e-07  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.158606 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0257  beta-lactamase domain protein  34.51 
 
 
397 aa  58.2  1e-07  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4261  beta-lactamase domain protein  28.83 
 
 
369 aa  56.6  3e-07  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0714  putative transmembrane protein  39.47 
 
 
138 aa  56.2  4e-07  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.274241  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0928  rhodanese domain-containing protein  37.18 
 
 
128 aa  55.8  5e-07  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.585499  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0020  Rhodanese domain-containing protein  29.36 
 
 
119 aa  55.8  5e-07  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.529293  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4842  beta-lactamase-like  33.77 
 
 
346 aa  55.5  7e-07  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2827  Rhodanese domain protein  38.46 
 
 
135 aa  55.1  7e-07  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2852  Rhodanese domain-containing protein  36.62 
 
 
113 aa  55.5  7e-07  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1814  rhodanese domain-containing protein  35.9 
 
 
135 aa  55.1  8e-07  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.315882  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0354  hypothetical protein  40.26 
 
 
151 aa  54.7  9e-07  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.842496  normal  0.122714 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0320  thiamine biosynthesis protein ThiI  33.82 
 
 
484 aa  55.1  9e-07  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3207  rhodanese-like domain-containing protein  37.66 
 
 
135 aa  54.7  1e-06  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0417  rhodanese-like domain-containing protein  37.66 
 
 
135 aa  54.7  1e-06  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.764861  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2857  rhodanese domain-containing protein  36.08 
 
 
173 aa  54.7  1e-06  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.871228  normal  0.0137642 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0479  rhodanese domain-containing protein  37.66 
 
 
135 aa  54.7  1e-06  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0498  rhodanese domain-containing protein  37.66 
 
 
135 aa  54.7  1e-06  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0180  rhodanese-like domain-containing protein  37.66 
 
 
135 aa  54.7  1e-06  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2839  rhodanese-like domain-containing protein  37.66 
 
 
135 aa  54.7  1e-06  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1412  rhodanese-like domain-containing protein  37.66 
 
 
135 aa  54.7  1e-06  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0039  rhodanese domain-containing protein  37.18 
 
 
135 aa  54.3  1e-06  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.861184  normal  0.831321 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0663  rhodanese-like domain-containing protein  37.66 
 
 
135 aa  54.7  1e-06  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3838  rhodanese domain-containing protein  34.25 
 
 
127 aa  53.5  2e-06  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3857  rhodanese domain-containing protein  35.9 
 
 
135 aa  53.9  2e-06  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.848576  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0893  sulphate transporter  33.33 
 
 
711 aa  52.8  3e-06  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0524393 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0429  uncharacterized NAD(FAD)-dependent dehydrogenase  30.13 
 
 
820 aa  53.1  3e-06  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  6.01829e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2720  Rhodanese domain protein  33.75 
 
 
113 aa  52.8  4e-06  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  7.9592e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1310  rhodanese-like protein  39.47 
 
 
135 aa  52  6e-06  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.649013  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0088  rhodanese domain-containing protein  42.25 
 
 
153 aa  52.4  6e-06  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00487418 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1703  Rhodanese domain protein  41.67 
 
 
167 aa  52  6e-06  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.69251e-08 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0334  rhodanese-like protein  40.54 
 
 
137 aa  52  7e-06  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.206424  normal  0.623131 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67750  rhodanese-like domain-containing protein  36.49 
 
 
139 aa  51.6  9e-06  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0121316  normal  0.782302 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5864  hypothetical protein  36.49 
 
 
139 aa  51.6  9e-06  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.352414  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2633  Rhodanese domain protein  36.84 
 
 
123 aa  51.6  9e-06  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.728751  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2941  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
222 aa  50.8  1e-05  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2179  ArsR family transcriptional regulator  37.18 
 
 
124 aa  51.2  1e-05  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2038  rhodanese domain-containing protein  37.18 
 
 
124 aa  51.2  1e-05  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2911  rhodanese domain-containing protein  34.67 
 
 
140 aa  51.2  1e-05  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2773  rhodanese domain-containing protein  34.67 
 
 
140 aa  51.2  1e-05  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0447  rhodanese domain-containing protein  36 
 
 
140 aa  51.2  1e-05  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.185748  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2867  rhodanese domain-containing protein  34.67 
 
 
140 aa  50.8  1e-05  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.758649 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2856  rhodanese domain-containing protein  34.67 
 
 
140 aa  50.8  1e-05  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2242  rhodanese-like protein  34.67 
 
 
140 aa  50.8  1e-05  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.98062  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4316  beta-lactamase domain protein  28.97 
 
 
397 aa  50.1  2e-05  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.558515  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3515  rhodanese domain-containing protein  32.89 
 
 
140 aa  50.4  2e-05  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00152607 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4402  rhodanese domain-containing protein  33.33 
 
 
141 aa  50.8  2e-05  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3702  Rhodanese domain protein  32 
 
 
397 aa  50.4  2e-05  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.418788  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2851  Rhodanese domain-containing protein  34.62 
 
 
220 aa  50.4  2e-05  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1508  Rhodanese domain protein  27.45 
 
 
352 aa  50.8  2e-05  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.018848  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3386  beta-lactamase domain protein  30.97 
 
 
428 aa  50.8  2e-05  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1392  rhodanese-like domain-containing protein  26.37 
 
 
144 aa  50.4  2e-05  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2399  rhodanese-like protein  32.43 
 
 
138 aa  50.1  2e-05  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2422  beta-lactamase domain protein  32.32 
 
 
400 aa  50.4  2e-05  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3468  transcriptional activator domain-containing protein  35.53 
 
 
223 aa  50.1  2e-05  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5106  rhodanese domain-containing protein  39.19 
 
 
137 aa  49.7  3e-05  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2753  rhodanese-like protein  24.53 
 
 
140 aa  50.1  3e-05  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4102  Rhodanese domain protein  35.44 
 
 
138 aa  50.1  3e-05  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.25625  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2629  Rhodanese domain protein  34.62 
 
 
216 aa  50.1  3e-05  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.770931  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1173  rhodanese-like domain protein  27.81 
 
 
148 aa  49.7  3e-05  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6185  rhodanese-like protein  33.33 
 
 
140 aa  49.3  4e-05  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0833  rhodanese-like domain protein  40.91 
 
 
119 aa  49.7  4e-05  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00574407  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5669  rhodanese domain-containing protein  36.25 
 
 
113 aa  49.3  4e-05  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.192192  hitchhiker  0.00438713 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2736  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
227 aa  49.3  4e-05  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.635873  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0207  Rhodanese domain protein  35.63 
 
 
171 aa  49.7  4e-05  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  4.60889e-09  normal  0.712093 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0382  ArsR family transcriptional regulator  34.94 
 
 
224 aa  49.3  5e-05  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1758  ArsR family transcriptional regulator  34.94 
 
 
224 aa  49.3  5e-05  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.99053  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2737  rhodanese domain-containing protein  30.59 
 
 
125 aa  49.3  5e-05  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.909386  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0226  Rhodanese domain protein  34.57 
 
 
113 aa  49.3  5e-05  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0425  ArsR family transcriptional regulator  35.37 
 
 
230 aa  48.9  5e-05  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2862  ArsR family transcriptional regulator  34.94 
 
 
224 aa  49.3  5e-05  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1571  ArsR family transcriptional regulator  34.94 
 
 
224 aa  49.3  5e-05  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.543844  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0047  rhodanese-like protein  32.5 
 
 
139 aa  48.9  6e-05  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1222  ArsR family transcriptional regulator  34.94 
 
 
224 aa  48.9  6e-05  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0213  Rhodanese domain protein  32.88 
 
 
109 aa  48.9  6e-05  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0124  Rhodanese-related sulfurtransferase-like protein  35.14 
 
 
110 aa  48.9  6e-05  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.112087  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4928  rhodanese domain-containing protein  37.84 
 
 
137 aa  48.5  7e-05  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.84511  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4704  Rhodanese domain protein  24 
 
 
114 aa  48.5  7e-05  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.930099  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0787  Rhodanese domain protein  34.67 
 
 
154 aa  48.5  7e-05  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.403999  normal  0.138616 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5055  rhodanese domain-containing protein  37.84 
 
 
137 aa  48.5  8e-05  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.162705  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2853  Rhodanese domain-containing protein  34.25 
 
 
116 aa  48.5  8e-05  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>