More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AFE_0032 on replicon NC_011761
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011761  AFE_0032  inner membrane protein, 60 kDa  100 
 
 
528 aa  1077  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0033  60 kDa inner membrane insertion protein  100 
 
 
528 aa  1077  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.401707 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3087  60 kDa inner membrane insertion protein  43.36 
 
 
545 aa  422  1e-117  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.863197  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2411  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family domain containing  41.52 
 
 
570 aa  421  1e-116  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.705473  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4485  60 kDa inner membrane insertion protein  39.86 
 
 
551 aa  406  1e-112  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00386094  hitchhiker  2.60158e-09 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1230  60 kDa inner membrane insertion protein  42.24 
 
 
550 aa  403  1e-111  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0120976  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3098  putative inner membrane protein translocase component YidC  40.04 
 
 
550 aa  395  1e-109  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  1.13724e-05 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4014  protein translocase subunit yidC  39.03 
 
 
557 aa  396  1e-109  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.308779 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52450  putative inner membrane protein translocase component YidC  41.22 
 
 
557 aa  392  1e-108  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3895  putative inner membrane protein translocase component YidC  38.28 
 
 
567 aa  395  1e-108  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.676329  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2882  protein translocase subunit yidC  40.55 
 
 
562 aa  390  1e-107  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.208936  normal  0.460711 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2776  60 kDa inner membrane insertion protein  40.32 
 
 
569 aa  391  1e-107  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.395944  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0003  putative inner membrane protein translocase component YidC  40.29 
 
 
541 aa  388  1e-106  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0110357  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3316  putative inner membrane protein translocase component YidC  39.09 
 
 
575 aa  387  1e-106  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.783784  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5743  putative inner membrane protein translocase component YidC  40.36 
 
 
560 aa  382  1e-105  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00528765  normal  0.582095 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4063  60 kDa inner membrane insertion protein  39.82 
 
 
542 aa  385  1e-105  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000239208  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0006  putative inner membrane protein translocase component YidC  40.18 
 
 
560 aa  380  1e-104  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  3.87778e-05 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2144  putative inner membrane protein translocase component YidC  38.73 
 
 
565 aa  380  1e-104  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00651842  unclonable  1.65557e-06 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4380  60 kDa inner membrane insertion protein  39.67 
 
 
541 aa  379  1e-104  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  6.4378e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3235  putative inner membrane protein translocase component YidC  40.22 
 
 
557 aa  380  1e-104  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.627922  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4325  YidC translocase/secretase  39.67 
 
 
541 aa  379  1e-104  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  6.79014e-05  unclonable  4.86692e-12 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4521  60 kDa inner membrane insertion protein  39.85 
 
 
541 aa  380  1e-104  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  3.05334e-05  hitchhiker  0.000938862 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3037  inner membrane protein, 60 kDa  42.14 
 
 
545 aa  382  1e-104  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4379  60 kDa inner membrane insertion protein  39.67 
 
 
541 aa  379  1e-104  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  3.22788e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2197  60 kDa inner membrane insertion protein  39.93 
 
 
551 aa  380  1e-104  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.297594  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5309  putative inner membrane protein translocase component YidC  40 
 
 
560 aa  378  1e-103  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.910149  normal  0.0868042 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3318  protein translocase subunit YidC  41.37 
 
 
557 aa  376  1e-103  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4032  protein translocase subunit yidC  39.96 
 
 
541 aa  375  1e-103  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  1.58142e-05  hitchhiker  0.000218645 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5213  putative inner membrane protein translocase component YidC  39.64 
 
 
560 aa  375  1e-103  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4620  putative inner membrane protein translocase component YidC  39.21 
 
 
581 aa  375  1e-103  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0004  putative inner membrane protein translocase component YidC  40.07 
 
 
553 aa  378  1e-103  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.9905  normal  0.344368 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_4002  60 kDa inner membrane insertion protein  39.53 
 
 
541 aa  374  1e-102  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  3.55464e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3099  putative inner membrane protein translocase component YidC  38.46 
 
 
554 aa  374  1e-102  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.462896  normal  0.0227553 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3215  putative inner membrane protein translocase component YidC  38.28 
 
 
554 aa  373  1e-102  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.15042  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3940  protein translocase subunit yidC  39.78 
 
 
541 aa  374  1e-102  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  3.01662e-07  unclonable  6.40431e-11 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0006  protein translocase subunit yidC  39.45 
 
 
541 aa  372  1e-102  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  1.01193e-05  unclonable  8.73101e-11 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5444  putative inner membrane protein translocase component YidC  39.64 
 
 
560 aa  374  1e-102  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2758  protein translocase subunit yidC  38.98 
 
 
552 aa  374  1e-102  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.174551  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2844  putative inner membrane protein translocase component YidC  39.23 
 
 
558 aa  375  1e-102  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.110043  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0004  inner membrane protein, 60 kDa  39.34 
 
 
541 aa  373  1e-102  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3550  putative inner membrane protein translocase component YidC  39.23 
 
 
558 aa  375  1e-102  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2241  putative inner membrane protein translocase component YidC  39.23 
 
 
558 aa  375  1e-102  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0107  putative inner membrane protein translocase component YidC  39.23 
 
 
558 aa  375  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5134  putative inner membrane protein translocase component YidC  39.53 
 
 
563 aa  375  1e-102  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0304  putative inner membrane protein translocase component YidC  39.23 
 
 
558 aa  375  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3866  60 kDa inner membrane insertion protein  39.7 
 
 
542 aa  373  1e-102  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000155519  unclonable  3.98144e-06 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5612  inner membrane protein, 60 kDa  39.5 
 
 
562 aa  375  1e-102  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0093  putative inner membrane protein translocase component YidC  39.23 
 
 
558 aa  375  1e-102  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3397  putative inner membrane protein translocase component YidC  39.23 
 
 
558 aa  375  1e-102  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3757  putative inner membrane protein translocase component YidC  38.83 
 
 
554 aa  371  1e-101  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3986  putative inner membrane protein translocase component YidC  38.25 
 
 
552 aa  370  1e-101  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4466  putative inner membrane protein translocase component YidC  38.27 
 
 
552 aa  372  1e-101  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.111062 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73410  putative inner membrane protein translocase component YidC  38.5 
 
 
578 aa  369  1e-101  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.431479  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp3074  hypothetical protein  38.03 
 
 
556 aa  370  1e-101  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00436  putative inner membrane protein translocase component YidC  40.26 
 
 
540 aa  371  1e-101  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0002  60 kDa inner membrane insertion protein  39.27 
 
 
544 aa  369  1e-101  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  1.35714e-06  unclonable  1.55498e-10 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0028  putative inner membrane protein translocase component YidC  37.04 
 
 
545 aa  372  1e-101  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.15409  normal  0.0935166 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4257  60 kDa inner membrane insertion protein  39.26 
 
 
545 aa  369  1e-101  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  6.06394e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0133  putative inner membrane protein translocase component YidC  38.24 
 
 
541 aa  369  1e-101  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0580569  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3458  putative inner membrane protein translocase component YidC  38.64 
 
 
554 aa  370  1e-101  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2388  putative inner membrane protein translocase component YidC  36.33 
 
 
566 aa  367  1e-100  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00758023  hitchhiker  1.20585e-06 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002016  OxaI/YidC membrane insertion protein  39.96 
 
 
540 aa  367  1e-100  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  8.29805e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4929  60 kDa inner membrane insertion protein  39.52 
 
 
544 aa  368  1e-100  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  7.71873e-07  unclonable  1.353e-08 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6369  putative inner membrane protein translocase component YidC  38.5 
 
 
578 aa  368  1e-100  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2930  hypothetical protein  37.68 
 
 
556 aa  366  1e-100  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2600  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  39.72 
 
 
567 aa  367  1e-100  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.417089 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2514  putative inner membrane protein translocase component YidC  39.23 
 
 
541 aa  365  1e-99  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  1.30871e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4264  putative inner membrane protein translocase component YidC  36.2 
 
 
543 aa  364  2e-99  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00254597  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2473  putative inner membrane protein translocase component YidC  38.8 
 
 
564 aa  365  2e-99  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000743267 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0009  inner membrane protein, 60 kDa  39.53 
 
 
541 aa  363  4e-99  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  9.42032e-06  hitchhiker  0.000799802 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3775  60 kDa inner membrane insertion protein  38.4 
 
 
541 aa  360  4e-98  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  1.06175e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2549  putative inner membrane protein translocase component YidC  41.08 
 
 
552 aa  359  5e-98  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.157228  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3163  putative inner membrane protein translocase component YidC  41.08 
 
 
552 aa  359  5e-98  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.133827  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3613  putative inner membrane protein translocase component YidC  38.18 
 
 
555 aa  359  6e-98  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2331  60 kDa inner membrane insertion protein  39.64 
 
 
552 aa  359  7e-98  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4201  protein translocase subunit yidC  37.77 
 
 
547 aa  358  9e-98  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.017626 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4616  putative inner membrane protein translocase component YidC  35.47 
 
 
543 aa  358  1e-97  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.159313  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3611  60 kDa inner membrane insertion protein  41.12 
 
 
566 aa  358  1e-97  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4312  60 kDa inner membrane insertion protein  37.41 
 
 
543 aa  358  1e-97  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.301696  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3154  putative inner membrane protein translocase component YidC  40.43 
 
 
553 aa  358  2e-97  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  6.38548e-06 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4233  putative inner membrane protein translocase component YidC  36.98 
 
 
548 aa  357  4e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.11489  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2122  inner membrane protein oxaA  39.05 
 
 
566 aa  357  4e-97  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4176  putative inner membrane protein translocase component YidC  36.98 
 
 
548 aa  357  4e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0201  60 kDa inner membrane protein  39.05 
 
 
566 aa  357  4e-97  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4069  putative inner membrane protein translocase component YidC  36.98 
 
 
548 aa  356  5e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00340238  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4054  putative inner membrane protein translocase component YidC  36.98 
 
 
548 aa  356  5e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0899835  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2825  protein translocase subunit yidC  39.03 
 
 
546 aa  356  5e-97  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3181  putative inner membrane protein translocase component YidC  40.65 
 
 
553 aa  356  5e-97  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.118061 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4157  putative inner membrane protein translocase component YidC  36.5 
 
 
546 aa  356  7e-97  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  1.13128e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4182  putative inner membrane protein translocase component YidC  36.5 
 
 
546 aa  356  7e-97  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  7.73413e-10  normal  0.0773458 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4293  putative inner membrane protein translocase component YidC  35.1 
 
 
544 aa  356  7e-97  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.016276  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4246  putative inner membrane protein translocase component YidC  36.5 
 
 
546 aa  356  7e-97  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  1.42375e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2085  60 kDa inner membrane insertion protein  36.22 
 
 
557 aa  355  8e-97  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.39067  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5135  putative inner membrane protein translocase component YidC  37.16 
 
 
548 aa  354  2e-96  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00207092  normal  0.0616185 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3919  putative inner membrane protein translocase component YidC  37.16 
 
 
548 aa  354  2e-96  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00313921  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03589  inner membrane protein translocase component YidC  37.16 
 
 
548 aa  354  2e-96  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.75257  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4261  YidC translocase/secretase  37.16 
 
 
548 aa  354  2e-96  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03533  hypothetical protein  37.16 
 
 
548 aa  354  2e-96  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.534027  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4220  putative inner membrane protein translocase component YidC  37.16 
 
 
548 aa  354  2e-96  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.118855  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4072  putative inner membrane protein translocase component YidC  37.16 
 
 
548 aa  354  2e-96  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.131417  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>