More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AFE_0020 on replicon NC_011761
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011761  AFE_0020  methionyl-tRNA formyltransferase  100 
 
 
313 aa  618  1e-176  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0021  methionyl-tRNA formyltransferase  100 
 
 
313 aa  618  1e-176  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.223082 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0192  methionyl-tRNA formyltransferase  52.08 
 
 
312 aa  305  5e-82  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0042  methionyl-tRNA formyltransferase  53.02 
 
 
311 aa  303  3e-81  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0355  methionyl-tRNA formyltransferase  50.67 
 
 
313 aa  301  1e-80  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.36252  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0178  methionyl-tRNA formyltransferase  52.06 
 
 
314 aa  298  7e-80  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0016  methionyl-tRNA formyltransferase  52.7 
 
 
319 aa  298  1e-79  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000109798  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0083  methionyl-tRNA formyltransferase  52.58 
 
 
310 aa  297  2e-79  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.417966  decreased coverage  6.11556e-15 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0054  methionyl-tRNA formyltransferase  53.33 
 
 
314 aa  296  3e-79  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4512  methionyl-tRNA formyltransferase  51.15 
 
 
314 aa  295  7e-79  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.017466  hitchhiker  0.000185831 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0083  methionyl-tRNA formyltransferase  51.94 
 
 
310 aa  294  1e-78  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.217446 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4610  methionyl-tRNA formyltransferase  50.49 
 
 
315 aa  293  2e-78  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0267184  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0438  methionyl-tRNA formyltransferase  49.35 
 
 
313 aa  294  2e-78  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0067  methionyl-tRNA formyltransferase  51.94 
 
 
310 aa  293  2e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.196453  unclonable  4.39837e-07 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0086  methionyl-tRNA formyltransferase  51.94 
 
 
310 aa  293  3e-78  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.2251  hitchhiker  9.86218e-08 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3672  methionyl-tRNA formyltransferase  50.49 
 
 
315 aa  293  3e-78  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03089  hypothetical protein  50.49 
 
 
315 aa  293  4e-78  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.633166  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0426  methionyl-tRNA formyltransferase  50.49 
 
 
315 aa  293  4e-78  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.459204  hitchhiker  0.00147266 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03138  methionyl-tRNA formyltransferase  50.49 
 
 
315 aa  293  4e-78  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.511897  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0426  methionyl-tRNA formyltransferase  50.49 
 
 
315 aa  293  4e-78  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3770  methionyl-tRNA formyltransferase  50.16 
 
 
315 aa  292  4e-78  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0147386  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3481  methionyl-tRNA formyltransferase  50.49 
 
 
315 aa  293  4e-78  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000745387  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3584  methionyl-tRNA formyltransferase  54.64 
 
 
307 aa  291  1e-77  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0019  methionyl-tRNA formyltransferase  53.55 
 
 
310 aa  291  1e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.107334  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3583  methionyl-tRNA formyltransferase  50.49 
 
 
315 aa  290  2e-77  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.291651  normal  0.0987748 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0018  methionyl-tRNA formyltransferase  51.75 
 
 
314 aa  289  5e-77  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00190  methionyl-tRNA formyltransferase  53.65 
 
 
314 aa  288  6e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.767541  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2844  methionyl-tRNA formyltransferase  53.51 
 
 
308 aa  288  1e-76  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002056  methionyl-tRNA formyltransferase  49.36 
 
 
315 aa  286  4e-76  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2474  methionyl-tRNA formyltransferase  49 
 
 
315 aa  286  4e-76  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0143  methionyl-tRNA formyltransferase  50.97 
 
 
312 aa  285  5e-76  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0856282  normal  0.608581 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00392  methionyl-tRNA formyltransferase  50.67 
 
 
315 aa  285  5e-76  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0196  methionyl-tRNA formyltransferase  52.24 
 
 
318 aa  285  8e-76  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00869838  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0094  methionyl-tRNA formyltransferase  53.44 
 
 
320 aa  284  1e-75  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.922112  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00021  methionyl-tRNA formyltransferase  48.22 
 
 
312 aa  283  2e-75  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3774  methionyl-tRNA formyltransferase  49.84 
 
 
315 aa  283  2e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3603  methionyl-tRNA formyltransferase  49.84 
 
 
315 aa  283  3e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.109792  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3711  methionyl-tRNA formyltransferase  49.84 
 
 
315 aa  283  3e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.734888  normal  0.143925 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3676  methionyl-tRNA formyltransferase  49.84 
 
 
315 aa  283  3e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3604  methionyl-tRNA formyltransferase  49.84 
 
 
315 aa  283  3e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.575944 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0074  methionyl-tRNA formyltransferase  47.74 
 
 
321 aa  282  4e-75  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3883  methionyl-tRNA formyltransferase  48.85 
 
 
315 aa  282  5e-75  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00162165  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0315  methionyl-tRNA formyltransferase  48.85 
 
 
315 aa  282  5e-75  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0614  methionyl-tRNA formyltransferase  48.85 
 
 
315 aa  282  5e-75  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00549944  normal  0.0281332 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3719  methionyl-tRNA formyltransferase  47.87 
 
 
315 aa  282  7e-75  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.236435  hitchhiker  0.00730816 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1928  methionyl-tRNA formyltransferase  52.81 
 
 
307 aa  280  2e-74  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04056  methionyl-tRNA formyltransferase  52.98 
 
 
307 aa  279  3e-74  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1864  methionyl-tRNA formyltransferase  52.15 
 
 
307 aa  279  5e-74  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00160  methionyl-tRNA formyltransferase  53.33 
 
 
325 aa  279  5e-74  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0020  methionyl-tRNA formyltransferase  47.37 
 
 
322 aa  277  1e-73  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3969  methionyl-tRNA formyltransferase  47.87 
 
 
315 aa  277  1e-73  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.483115  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3737  methionyl-tRNA formyltransferase  51.33 
 
 
324 aa  277  2e-73  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00219855 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3790  methionyl-tRNA formyltransferase  47.87 
 
 
315 aa  275  7e-73  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.243321  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2647  hypothetical protein  46.69 
 
 
314 aa  272  5e-72  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3015  methionyl-tRNA formyltransferase  49.2 
 
 
323 aa  271  8e-72  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0023  methionyl-tRNA formyltransferase  49.67 
 
 
318 aa  269  4e-71  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0023  methionyl-tRNA formyltransferase  49.83 
 
 
319 aa  269  5e-71  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0031  methionyl-tRNA formyltransferase  49.67 
 
 
318 aa  269  6e-71  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0026  methionyl-tRNA formyltransferase  48.67 
 
 
318 aa  268  6e-71  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0905739 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0034  methionyl-tRNA formyltransferase  49 
 
 
318 aa  268  6e-71  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  2.57015e-05 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0028  methionyl-tRNA formyltransferase  49 
 
 
318 aa  268  7e-71  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.709441  hitchhiker  0.00475764 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0079  methionyl-tRNA formyltransferase  47.19 
 
 
316 aa  268  7e-71  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0022  methionyl-tRNA formyltransferase  48.05 
 
 
307 aa  267  1e-70  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.402535 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2517  hypothetical protein  46.03 
 
 
314 aa  267  2e-70  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2272  methionyl-tRNA formyltransferase  53.36 
 
 
320 aa  267  2e-70  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00775496 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2084  methionyl-tRNA formyltransferase  50.17 
 
 
311 aa  266  5e-70  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.198796  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0831  methionyl-tRNA formyltransferase  48.9 
 
 
327 aa  265  6e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0030  methionyl-tRNA formyltransferase  48.67 
 
 
318 aa  265  1e-69  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  1.88499e-06 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0031  methionyl-tRNA formyltransferase  48.67 
 
 
318 aa  264  2e-69  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0030  methionyl-tRNA formyltransferase  48.67 
 
 
318 aa  264  2e-69  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00109779 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0026  methionyl-tRNA formyltransferase  48.33 
 
 
318 aa  263  4e-69  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0030  methionyl-tRNA formyltransferase  47.46 
 
 
321 aa  262  5e-69  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0023  methionyl-tRNA formyltransferase  49 
 
 
318 aa  261  7e-69  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0635  methionyl-tRNA formyltransferase  47.08 
 
 
318 aa  261  9e-69  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0157901  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0090  methionyl-tRNA formyltransferase  46.49 
 
 
314 aa  261  1e-68  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0186427  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0649  methionyl-tRNA formyltransferase  46.75 
 
 
318 aa  261  1e-68  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.95229e-24 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2096  methionyl-tRNA formyltransferase  46.49 
 
 
314 aa  261  1e-68  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.156857  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0034  methionyl-tRNA formyltransferase  47.46 
 
 
329 aa  260  2e-68  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0590691 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3852  methionyl-tRNA formyltransferase  45 
 
 
320 aa  259  3e-68  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3354  methionyl-tRNA formyltransferase  47.35 
 
 
327 aa  259  3e-68  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3677  methionyl-tRNA formyltransferase  47.35 
 
 
327 aa  260  3e-68  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3217  methionyl-tRNA formyltransferase  45.45 
 
 
316 aa  258  1e-67  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.163749  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3398  methionyl-tRNA formyltransferase  47.96 
 
 
323 aa  257  2e-67  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.726388  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4053  methionyl-tRNA formyltransferase  47.96 
 
 
323 aa  256  2e-67  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3339  methionyl-tRNA formyltransferase  45.6 
 
 
311 aa  257  2e-67  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.376602  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1439  methionyl-tRNA formyltransferase  44.19 
 
 
314 aa  256  3e-67  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0022  methionyl-tRNA formyltransferase  48.1 
 
 
315 aa  256  3e-67  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3407  methionyl-tRNA formyltransferase  48.11 
 
 
331 aa  256  4e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.667416  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3123  methionyl-tRNA formyltransferase  48.12 
 
 
327 aa  255  7e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.760657  normal  0.204185 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0040  methionyl-tRNA formyltransferase  47.45 
 
 
317 aa  255  7e-67  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0819  methionyl-tRNA formyltransferase  46.1 
 
 
313 aa  255  8e-67  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0310  methionyl-tRNA formyltransferase  47.4 
 
 
328 aa  254  1e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0037  methionyl-tRNA formyltransferase  46.78 
 
 
320 aa  254  1e-66  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.553222 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0415  methionyl-tRNA formyltransferase  43.39 
 
 
311 aa  253  2e-66  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.467918  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2627  methionyl-tRNA formyltransferase  54.46 
 
 
314 aa  254  2e-66  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.640895  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0186  methionyl-tRNA formyltransferase  46.82 
 
 
308 aa  253  3e-66  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000823971 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0151  methionyl-tRNA formyltransferase  47.98 
 
 
327 aa  253  4e-66  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6477  methionyl-tRNA formyltransferase  47.81 
 
 
327 aa  253  4e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.79537 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0160  methionyl-tRNA formyltransferase  47.98 
 
 
327 aa  253  4e-66  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.701485  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0130  methionyl-tRNA formyltransferase  44.16 
 
 
317 aa  252  6e-66  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>