91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AFE_0008 on replicon NC_011761
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011206  Lferr_0009  Spore coat U domain protein  100 
 
 
154 aa  304  3e-82  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.164066  hitchhiker  0.00841458 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0008  spore coat protein  100 
 
 
154 aa  304  3e-82  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2472  spore coat U domain-containing protein  43.33 
 
 
331 aa  85.1  3e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.169797  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1272  Spore coat U domain protein  45.16 
 
 
175 aa  85.1  3e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.723665 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2338  spore coat U domain-containing protein  43.33 
 
 
331 aa  84  7e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.156142 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0303  putative lipoprotein  35.4 
 
 
170 aa  83.6  9e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0341  putative lipoprotein  41.73 
 
 
122 aa  83.2  1e-15  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.615172  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2696  signal peptide protein  42.55 
 
 
167 aa  82.4  2e-15  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.376208 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2056  putative lipoprotein  36.67 
 
 
175 aa  82.8  2e-15  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.017923  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0777  spore coat U domain-containing protein  36.88 
 
 
156 aa  82  3e-15  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2994  hypothetical protein  38.46 
 
 
164 aa  80.9  6e-15  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.212407  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1064  spore coat protein  38.46 
 
 
172 aa  80.9  6e-15  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0538  spore coat U domain-containing protein  34.59 
 
 
153 aa  80.9  6e-15  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.269476  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1223  spore coat protein U precursor  38.46 
 
 
185 aa  80.9  6e-15  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.174119  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2291  hypothetical protein  38.46 
 
 
164 aa  80.9  6e-15  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1605  hypothetical protein  38.46 
 
 
164 aa  80.9  6e-15  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1071  pilus biogenesis protein  38.46 
 
 
172 aa  80.5  7e-15  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2695  signal peptide protein  43.48 
 
 
167 aa  80.5  8e-15  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.35651 
 
 
-
 
NC_003296  RS03044  lipoprotein signal peptide  39.71 
 
 
325 aa  79.3  2e-14  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0900773  normal  0.662509 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1270  Spore coat U domain protein  40.85 
 
 
174 aa  78.6  3e-14  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.248061  normal  0.0373463 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4394  putative secreted pili protein involved in motility and biofilm formation  41.91 
 
 
320 aa  78.6  3e-14  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.991106  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1267  Spore coat U domain protein  44.12 
 
 
318 aa  78.2  4e-14  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0483759  normal  0.279584 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0868  putative lipoprotein  43.54 
 
 
372 aa  75.5  2e-13  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.236755  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5756  secreted pili protein involved in motility and biofilm formation  41.18 
 
 
333 aa  75.9  2e-13  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.488818 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1066  putative lipoprotein  44.85 
 
 
336 aa  75.1  3e-13  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1072  putative lipoprotein  43.28 
 
 
345 aa  75.5  3e-13  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1604  putative lipoprotein  43.28 
 
 
336 aa  75.1  3e-13  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.957713  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2995  putative lipoprotein  43.28 
 
 
336 aa  75.1  3e-13  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2290  hypothetical protein  43.28 
 
 
336 aa  75.1  3e-13  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0724  putative lipoprotein  43.28 
 
 
329 aa  75.1  4e-13  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0341007  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1224  putative lipoprotein  43.28 
 
 
336 aa  74.7  4e-13  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0971862  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2692  signal peptide protein  37.58 
 
 
169 aa  73.9  7e-13  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.208318 
 
 
-
 
NC_003296  RS03041  signal peptide protein  36.69 
 
 
173 aa  73.9  8e-13  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.667718  normal  0.239165 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0537  spore coat U domain-containing protein  34.51 
 
 
153 aa  72  3e-12  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.547245  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0867  spore coat protein U domain-contain protein  39.86 
 
 
172 aa  71.2  4e-12  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0464513  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01135  spore Coat Protein U domain family  37.07 
 
 
344 aa  71.6  4e-12  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0663503  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0005  spore coat protein  42.22 
 
 
170 aa  70.9  7e-12  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.177415  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0006  Spore coat U domain protein  42.22 
 
 
170 aa  70.9  7e-12  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00295786  hitchhiker  0.0018193 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4397  putative secreted pili protein involved in motility and biofilm formation  37.41 
 
 
165 aa  70.1  9e-12  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.239263  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0780  spore coat U domain-containing protein  34.75 
 
 
163 aa  67.4  7e-11  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3601  spore coat U  34.97 
 
 
160 aa  67  9e-11  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.666843  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3667  Spore coat U domain protein  37.68 
 
 
160 aa  66.2  1e-10  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.60302  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01138  protein U  35.95 
 
 
156 aa  66.6  1e-10  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0616572  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3742  Spore coat U domain protein  36.92 
 
 
124 aa  65.1  3e-10  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3668  Spore coat U domain protein  34.81 
 
 
164 aa  64.3  6e-10  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0306  spore coat protein, late developmental, putative  38.03 
 
 
181 aa  63.2  1e-09  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.86749  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3743  Spore coat U domain protein  36.57 
 
 
164 aa  62.8  2e-09  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2339  spore coat U domain-containing protein  31.47 
 
 
178 aa  62.4  2e-09  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.206881 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5757  uncharacterized secreted protein-like  33.33 
 
 
178 aa  62.4  2e-09  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.447633 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2473  spore coat U domain-containing protein  30.77 
 
 
178 aa  62.4  2e-09  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.241559  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4690  spore coat U domain-containing protein  36.43 
 
 
165 aa  62.8  2e-09  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3602  spore coat U  30.6 
 
 
165 aa  58.5  3e-08  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5299  hypothetical protein  35.54 
 
 
182 aa  58.2  4e-08  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1665  hypothetical protein  36.44 
 
 
194 aa  55.8  2e-07  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.528385  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1776  spore coat U domain-containing protein  36.44 
 
 
185 aa  56.2  2e-07  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0368617  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0143  spore coat U domain-containing protein  32.92 
 
 
175 aa  55.5  3e-07  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.294291  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61520  hypothetical protein  33.88 
 
 
180 aa  55.5  3e-07  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.201355 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1269  Spore coat U domain protein  35.15 
 
 
339 aa  54.7  5e-07  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.484388 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2112  spore coat U domain-containing protein  34.31 
 
 
179 aa  53.1  1e-06  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00656518 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1777  spore coat U domain-containing protein  32.81 
 
 
176 aa  52.4  2e-06  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0475012  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1666  hypothetical protein  32.81 
 
 
163 aa  52  3e-06  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.607535  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2668  hypothetical protein  32.81 
 
 
163 aa  52  3e-06  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.641514  normal  0.0539014 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001219  sigma-fimbriae tip adhesin  31.01 
 
 
323 aa  50.1  1e-05  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2110  spore coat U domain-containing protein  34.17 
 
 
184 aa  49.7  1e-05  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00656518 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2111  spore coat U domain-containing protein  31.45 
 
 
167 aa  48.5  3e-05  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00660787 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1923  Spore coat U domain protein  36.3 
 
 
168 aa  47.8  5e-05  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3335  spore coat U domain-containing protein  31.82 
 
 
167 aa  47.4  7e-05  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.416044  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1448  Spore coat U domain protein  31.78 
 
 
178 aa  47.4  7e-05  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0146  spore coat U domain-containing protein  32 
 
 
228 aa  46.6  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.296083  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4603  spore coat U domain-containing protein  31.65 
 
 
324 aa  47  0.0001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.348761  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2817  Spore coat U domain protein  35 
 
 
178 aa  45.8  0.0002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2360  spore coat U domain protein  31.82 
 
 
167 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.255553  normal  0.490058 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1960  spore coat U domain-containing protein  30 
 
 
167 aa  45.1  0.0004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.139904 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1829  putative signal peptide protein  35.14 
 
 
172 aa  44.3  0.0005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1667  hypothetical protein  32.2 
 
 
184 aa  44.7  0.0005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.239373  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1778  spore coat U domain-containing protein  32.2 
 
 
184 aa  44.7  0.0005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0793064  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1794  type 1 pili protein CsuE  30.83 
 
 
321 aa  42.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2676  spore coat protein U domain-contain protein  30.08 
 
 
321 aa  42.7  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0877  hypothetical protein  30.83 
 
 
313 aa  42.7  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3668  spore coat U  37.8 
 
 
323 aa  42.4  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00126552  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61510  hypothetical protein  28.57 
 
 
177 aa  42.4  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.200762 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0683  hypothetical protein  30.83 
 
 
321 aa  43.1  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1638  putative type 1 pili protein CsuE  30.83 
 
 
321 aa  42.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.628737  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1616  type 1 pili protein CsuE  30.83 
 
 
321 aa  42.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0475  hypothetical protein  30.83 
 
 
321 aa  43.1  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.912815  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1401  hypothetical protein  30.83 
 
 
321 aa  43.1  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1798  spore coat U domain-containing protein  33.04 
 
 
178 aa  42  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.280086 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2358  spore coat U domain protein  29.2 
 
 
178 aa  40.8  0.006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.488322 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5298  hypothetical protein  29.81 
 
 
171 aa  40.4  0.008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1791  hypothetical protein  30.63 
 
 
174 aa  40  0.01  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1612  spore coat protein U domain-contain protein  30.63 
 
 
174 aa  40  0.01  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>