52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A9601_18511 on replicon NC_008816
Organism: Prochlorococcus marinus str. AS9601



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008816  A9601_18511  transcription regulator  100 
 
 		 143 aa  296  5e-80  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.630467  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18321  transcription regulator  96.5 
 
 		 143 aa  287  3e-77  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1734  transcription regulator-like  89.51 
 
 		 143 aa  278  2e-74  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.24686  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18301  transcription regulator  79.02 
 
 		 143 aa  254  2e-67  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0784  transcription regulator  59.71 
 
 		 141 aa  190  5e-48  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0106274  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16341  hypothetical protein  59.71 
 
 		 141 aa  190  7e-48  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.832148  normal  0.369821 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0949  transcriptional regulator  57.34 
 
 		 147 aa  184  4e-46  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1046  transcriptional regulator  56.83 
 
 		 148 aa  182  1.0000000000000001e-45  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0546  hypothetical protein  30.99 
 
 		 156 aa  70.5  0.000000000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000563714  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5879  hypothetical protein  29.46 
 
 		 134 aa  60.8  0.000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.701907  normal  0.17996 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4737  hypothetical protein  27.34 
 
 		 140 aa  61.2  0.000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.870255  normal  0.255411 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0636  putative transcriptional regulator  26.28 
 
 		 142 aa  57.8  0.00000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000220026  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1070  hypothetical protein  27.97 
 
 		 140 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003865  putative transcriptional regulator  31.86 
 
 		 139 aa  55.5  0.0000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00111474  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0229  hypothetical protein  24.79 
 
 		 146 aa  55.1  0.0000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.532688 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0464  hypothetical protein  27.42 
 
 		 148 aa  55.5  0.0000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0960  hypothetical protein  28.95 
 
 		 140 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01814  hypothetical protein  30.77 
 
 		 139 aa  54.3  0.0000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1120  hypothetical protein  28.95 
 
 		 140 aa  53.9  0.0000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1330  hypothetical protein  25.37 
 
 		 140 aa  51.6  0.000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.522262  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1480  hypothetical protein  26 
 
 		 147 aa  51.6  0.000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1399  hypothetical protein  23.33 
 
 		 148 aa  51.2  0.000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6103  hypothetical protein  25.2 
 
 		 152 aa  50.8  0.000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0493798  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3171  hypothetical protein  24.41 
 
 		 140 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0218513  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1060  protein of unknown function DUF1486  21.93 
 
 		 159 aa  49.7  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.148569  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1381  hypothetical protein  30.33 
 
 		 153 aa  48.9  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.202098  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0014  hypothetical protein  29.7 
 
 		 130 aa  48.9  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.51836  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1888  hypothetical protein  23.48 
 
 		 144 aa  48.1  0.00004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1310  transcriptional regulator-related protein  26.67 
 
 		 148 aa  48.1  0.00004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3053  transcriptional regulator-related protein  26.67 
 
 		 148 aa  48.1  0.00004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1483  hypothetical protein  28.23 
 
 		 156 aa  47  0.00008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3372  hypothetical protein  27.54 
 
 		 143 aa  47  0.00008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3015  hypothetical protein  25.42 
 
 		 140 aa  47  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1166  transcriptional regulator-related protein  29.2 
 
 		 148 aa  46.6  0.0001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2738  hypothetical protein  25.42 
 
 		 140 aa  47  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.264165  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3383  transcriptional regulator-related protein  24.44 
 
 		 148 aa  46.2  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0812  transcriptional regulator-related protein  24.64 
 
 		 167 aa  45.8  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2470  ketosteroid isomerase-related protein, cystatin fold  26.32 
 
 		 147 aa  45.4  0.0003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.4042  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3210  transcriptional regulator-related protein  27.68 
 
 		 148 aa  45.4  0.0003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.821326 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1237  transcriptional regulator-related protein  28.32 
 
 		 148 aa  45.1  0.0003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1167  transcriptional regulator-related protein  28.32 
 
 		 148 aa  45.1  0.0003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3067  transcriptional regulator-related protein  26.05 
 
 		 148 aa  44.7  0.0004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2100  hypothetical protein  24.58 
 
 		 140 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2096  hypothetical protein  25 
 
 		 159 aa  44.7  0.0004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.364867  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1456  hypothetical protein  25.21 
 
 		 150 aa  44.3  0.0006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2713  transcriptional regulator-related protein  28.18 
 
 		 145 aa  43.9  0.0008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2390  hypothetical protein  23.01 
 
 		 162 aa  43.5  0.001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2776  hypothetical protein  21.37 
 
 		 143 aa  42.7  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.857433  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0469  hypothetical protein  26.45 
 
 		 149 aa  42  0.003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4074  hypothetical protein  21.77 
 
 		 149 aa  42  0.003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.29566  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3035  hypothetical protein  24.79 
 
 		 167 aa  41.6  0.004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.21304  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01435  hypothetical protein  29.51 
 
 		 146 aa  40.8  0.007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>