More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A9601_18331 on replicon NC_008816
Organism: Prochlorococcus marinus str. AS9601



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008816  A9601_18331  single-stranded DNA-binding protein  100 
 
 		 123 aa  249  8.000000000000001e-66  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18151  single-stranded DNA-binding protein  91.13 
 
 		 124 aa  213  7e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.472056  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1716  single-stranded DNA-binding protein  90.32 
 
 		 133 aa  212  9.999999999999999e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18121  single-stranded DNA-binding protein  86.18 
 
 		 123 aa  207  3e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  hitchhiker  0.00558651  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17491  single-stranded DNA-binding protein  74.8 
 
 		 127 aa  195  2.0000000000000003e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.932532  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20751  single-stranded DNA-binding protein  72.87 
 
 		 129 aa  191  2e-48  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.156801  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1200  single-stranded DNA-binding protein  72.87 
 
 		 129 aa  191  2e-48  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01781  single-stranded DNA-binding protein  66.41 
 
 		 128 aa  184  3e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0104  single-stranded DNA-binding protein  69.6 
 
 		 125 aa  184  3e-46  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0148  single-stranded DNA-binding protein  67.19 
 
 		 125 aa  181  4.0000000000000006e-45  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0301  single-stranded DNA-binding protein  63.89 
 
 		 120 aa  155  2e-37  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4171  single-strand binding protein  57.85 
 
 		 122 aa  154  5.0000000000000005e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000225771  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4131  single-strand binding protein  57.85 
 
 		 122 aa  154  5.0000000000000005e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1149  single-stranded DNA-binding protein  57.26 
 
 		 119 aa  152  1e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00499901 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3392  single-strand binding protein  57.39 
 
 		 123 aa  149  1e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.196775 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0865  single-strand-binding protein  57.8 
 
 		 120 aa  142  1e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0459658  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1462  single-stranded DNA-binding protein  55.96 
 
 		 120 aa  139  9e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.0000000000000299636  hitchhiker  0.000565917 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1469  single-strand binding protein  57.94 
 
 		 121 aa  139  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.254699  normal  1 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5420  single-strand binding protein  48.74 
 
 		 135 aa  115  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0119  single-strand binding protein  43.7 
 
 		 127 aa  115  1.9999999999999998e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_16725  predicted protein  40 
 
 		 115 aa  97.4  5e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3710  single-strand binding protein  37.17 
 
 		 242 aa  90.5  7e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000568362  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0535  single-strand binding protein  37.04 
 
 		 220 aa  89  2e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000686084  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4025  single-strand binding protein  37.04 
 
 		 231 aa  88.2  3e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000941126  unclonable  0.000000000110243 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0640  single-strand binding protein  36.11 
 
 		 225 aa  87  7e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000164603  unclonable  0.0000000189971 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3926  single-strand binding protein  37.74 
 
 		 156 aa  85.1  3e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3865  single-strand binding protein  37.74 
 
 		 161 aa  84.3  5e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.672811  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3808  single-strand binding protein  37.74 
 
 		 163 aa  84.3  5e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.39281  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3951  single-strand binding protein  37.74 
 
 		 161 aa  84.3  5e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.290115  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1964  single-strand binding protein  32.33 
 
 		 166 aa  83.6  8e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0586806  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1260  single-strand binding protein  31.15 
 
 		 161 aa  82.8  0.000000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0616311  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0114  single-stranded DNA-binding protein (SSB)  37.9 
 
 		 149 aa  83.2  0.000000000000001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0817  single-strand binding protein  36.7 
 
 		 188 aa  81.6  0.000000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.517323  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1771  single-strand binding protein  35.11 
 
 		 138 aa  81.6  0.000000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0689148  normal  0.0680563 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2200  single-strand binding protein  33.61 
 
 		 157 aa  80.9  0.000000000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.886044 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2626  single-strand binding protein  37.61 
 
 		 176 aa  80.5  0.000000000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.377428  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2151  single-strand binding protein  29.77 
 
 		 139 aa  80.1  0.00000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0255  single-strand binding protein  29.77 
 
 		 139 aa  79.3  0.00000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0438  single-strand binding protein  35.19 
 
 		 157 aa  79.7  0.00000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.367584 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0223  single-strand binding protein  33.64 
 
 		 172 aa  79.3  0.00000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5984  single-strand binding protein  33.64 
 
 		 171 aa  80.1  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.933717 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0242  single-stranded DNA-binding protein (SSB) (helix-destabilizingprotein)  36.61 
 
 		 206 aa  79.7  0.00000000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.916441  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_10587  predicted protein  34.23 
 
 		 120 aa  79.3  0.00000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0851904  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0571  single-strand binding protein  35.96 
 
 		 222 aa  79  0.00000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00000000499632  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1132  single-stranded DNA-binding protein  35.61 
 
 		 209 aa  79  0.00000000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3117  single-strand binding protein  34.29 
 
 		 146 aa  78.2  0.00000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2223  single-strand binding protein  34.29 
 
 		 164 aa  78.2  0.00000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.000000351539  normal  0.108037 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1569  single-strand binding protein  33.33 
 
 		 164 aa  78.6  0.00000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.285989  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2815  single-stranded DNA-binding protein  36.28 
 
 		 177 aa  78.2  0.00000000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2049  single-strand binding protein  34.35 
 
 		 138 aa  78.2  0.00000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2149  single-strand binding protein  32.28 
 
 		 165 aa  78.2  0.00000000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0325  single-strand binding protein  36.11 
 
 		 160 aa  78.2  0.00000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0327  single-strand binding protein  33.05 
 
 		 201 aa  78.2  0.00000000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00747942  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0640  single-strand binding protein  33.9 
 
 		 236 aa  77.4  0.00000000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.021198  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0581  single-strand binding protein  33.9 
 
 		 234 aa  77.4  0.00000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00543875  normal  0.0620215 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0461  single-stranded DNA-binding protein  37.17 
 
 		 183 aa  77.8  0.00000000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0556  single-strand binding protein  33.9 
 
 		 234 aa  77.4  0.00000000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00736875  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3753  single-strand binding protein  33.9 
 
 		 234 aa  77.4  0.00000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000011541  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0200  single-strand binding protein  29.01 
 
 		 139 aa  77.8  0.00000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2617  single-strand binding protein  31.73 
 
 		 224 aa  77.4  0.00000000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000158869  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0587  single-strand binding protein  33.9 
 
 		 236 aa  77.4  0.00000000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0173283  normal  0.785333 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0362  single-strand binding protein  34.29 
 
 		 147 aa  77  0.00000000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000141012  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4713  single-strand binding protein  35.45 
 
 		 187 aa  77  0.00000000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4028  single-strand binding protein  35.14 
 
 		 238 aa  77  0.00000000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4062  single-strand binding protein  30.14 
 
 		 148 aa  77  0.00000000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3313  single-strand binding protein  31.5 
 
 		 231 aa  77  0.00000000000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0358843  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2539  single-strand binding protein  35 
 
 		 150 aa  77  0.00000000000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000000217555  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2690  single-strand binding protein  34.91 
 
 		 172 aa  76.3  0.0000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0960941  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0620  single-stranded DNA-binding protein  34.13 
 
 		 182 aa  76.6  0.0000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.210142  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0483  single-strand binding protein  34.62 
 
 		 156 aa  76.6  0.0000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3401  single-strand binding protein  31.09 
 
 		 151 aa  76.3  0.0000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.413025  normal  0.54881 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0261  single-strand binding protein  29.37 
 
 		 163 aa  76.3  0.0000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0918801  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4565  single-strand binding protein  34.55 
 
 		 162 aa  76.3  0.0000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.111222 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0107  single-strand binding protein  31.82 
 
 		 165 aa  76.6  0.0000000000001  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.0655467  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1124  single-strand binding protein  33.33 
 
 		 156 aa  76.3  0.0000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.228328  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0379  single-strand binding protein  35.78 
 
 		 184 aa  76.3  0.0000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.806317  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1081  single-stranded DNA-binding protein  34.26 
 
 		 148 aa  76.3  0.0000000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000000301398  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2388  single-strand binding protein  31.82 
 
 		 138 aa  75.5  0.0000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.875154 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0140  single-strand binding protein  33.33 
 
 		 164 aa  75.9  0.0000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2466  single-strand binding protein  34.29 
 
 		 156 aa  75.5  0.0000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.34674  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2845  single-strand binding protein  34.29 
 
 		 156 aa  75.5  0.0000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.101348  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0484  single-strand binding protein  33.59 
 
 		 176 aa  75.5  0.0000000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000000759205  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2303  single-strand binding protein  31.82 
 
 		 171 aa  75.9  0.0000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0375599  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0746  single-strand binding protein  33.33 
 
 		 161 aa  75.9  0.0000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.00000000549741  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03931  single-strand DNA-binding protein  34.51 
 
 		 178 aa  74.7  0.0000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0479609  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3933  single-strand binding protein  34.51 
 
 		 178 aa  74.7  0.0000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4611  single-stranded DNA-binding protein  34.51 
 
 		 178 aa  74.7  0.0000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3968  single-stranded DNA-binding protein  34.51 
 
 		 178 aa  74.7  0.0000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0530108 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4397  single-strand binding protein  30.48 
 
 		 149 aa  75.1  0.0000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000143406  n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6278  single-stranded DNA-binding protein  33.64 
 
 		 190 aa  75.1  0.0000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03891  hypothetical protein  34.51 
 
 		 178 aa  74.7  0.0000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0417311  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4301  single-stranded DNA-binding protein  34.51 
 
 		 178 aa  74.7  0.0000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5562  single-stranded DNA-binding protein  34.51 
 
 		 178 aa  74.7  0.0000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.214992  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0455  single-strand binding protein  31.53 
 
 		 174 aa  75.1  0.0000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00934995  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0008  single-stranded DNA-binding protein  38.98 
 
 		 172 aa  75.1  0.0000000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000612973  hitchhiker  0.0000000000172856 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4521  single-stranded DNA-binding protein  34.51 
 
 		 178 aa  74.7  0.0000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3307  single-strand binding protein  32.74 
 
 		 167 aa  74.7  0.0000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.358097  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0516  single-strand binding protein  35.64 
 
 		 234 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.490928  normal  0.543357 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3975  single-strand binding protein  29.86 
 
 		 146 aa  75.1  0.0000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000000156614  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03522  Single-strand binding protein (SSB) (Helix-destabilizing protein)  33.04 
 
 		 161 aa  74.7  0.0000000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.721181  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>