242 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A9601_17731 on replicon NC_008816
Organism: Prochlorococcus marinus str. AS9601



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007577  PMT9312_1658  UDP-galactopyranose mutase  95.41 
 
 		 501 aa  992    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17731  phytoene dehydrogenase  100 
 
 		 501 aa  1031    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17531  phytoene dehydrogenase  77.45 
 
 		 501 aa  814    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17571  phytoene dehydrogenase and related protein  90.62 
 
 		 501 aa  929    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.274386  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16851  phytoene dehydrogenase and related protein  55.22 
 
 		 503 aa  581  1e-164  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20111  phytoene dehydrogenase and related proteins  56.45 
 
 		 505 aa  578  1e-164  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.428487  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1137  UDP-galactopyranose mutase  56.05 
 
 		 505 aa  572  1.0000000000000001e-162  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22931  phytoene dehydrogenase  51.35 
 
 		 503 aa  516  1.0000000000000001e-145  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0386  phytoene dehydrogenase related enzyme  51.01 
 
 		 500 aa  511  1e-143  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1944  phytoene dehydrogenase related enzyme  50.71 
 
 		 495 aa  496  1e-139  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4273  C-3',4' desaturase CrtD  45.62 
 
 		 499 aa  416  9.999999999999999e-116  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.938391 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3374  C-3',4' desaturase CrtD  46.98 
 
 		 499 aa  415  1e-114  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2737  C-3',4' desaturase CrtD  46.57 
 
 		 499 aa  411  1e-113  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000928862  unclonable  0.00000000408673 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2342  amine oxidase  45.27 
 
 		 505 aa  406  1.0000000000000001e-112  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4343  amine oxidase  43.92 
 
 		 517 aa  400  9.999999999999999e-111  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1027  C-3',4' desaturase CrtD  44.8 
 
 		 504 aa  390  1e-107  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3330  C-3',4' desaturase CrtD  44.21 
 
 		 510 aa  391  1e-107  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0970  phytoene dehydrogenase-like  42.86 
 
 		 523 aa  375  1e-102  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.354104  normal  0.67541 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1711  FAD dependent oxidoreductase  29.13 
 
 		 501 aa  190  4e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000831031  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0346  amine oxidase  29.52 
 
 		 494 aa  167  5e-40  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0319  amine oxidase  28.72 
 
 		 489 aa  166  8e-40  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.354274 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0245  amine oxidase  26.42 
 
 		 491 aa  134  3e-30  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0933  phytoene dehydrogenase and related proteins-like  27.46 
 
 		 474 aa  130  4.0000000000000003e-29  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3446  phytoene dehydrogenase  25.76 
 
 		 489 aa  127  4.0000000000000003e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.503543  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05841  putative carotenoid isomerase  26.3 
 
 		 516 aa  127  4.0000000000000003e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.515676  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1161  FAD dependent oxidoreductase  24.8 
 
 		 500 aa  127  5e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0155951  normal  0.294938 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_10011  putative carotenoid isomerase  24.67 
 
 		 520 aa  120  4.9999999999999996e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.243247 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1385  FAD dependent oxidoreductase  26.43 
 
 		 492 aa  119  9.999999999999999e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0115639 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0305  amine oxidase  28.66 
 
 		 492 aa  116  1.0000000000000001e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2640  amine oxidase  25.79 
 
 		 495 aa  113  7.000000000000001e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0760  FAD dependent oxidoreductase  24.9 
 
 		 503 aa  113  8.000000000000001e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.522072 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2816  FAD dependent oxidoreductase  20.72 
 
 		 530 aa  112  2.0000000000000002e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1681  carotenoid isomerase  23.28 
 
 		 518 aa  109  1e-22  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.157771  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1701  amine oxidase  25.48 
 
 		 503 aa  106  1e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00066646 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0636  putative carotenoid isomerase  24.76 
 
 		 520 aa  104  4e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2192  FAD dependent oxidoreductase  25.54 
 
 		 532 aa  103  5e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.285502 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14681  putative carotenoid isomerase  24.95 
 
 		 520 aa  103  9e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.314761  normal  0.880307 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2254  carotene isomerase  24.18 
 
 		 506 aa  102  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000347702 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2151  amine oxidase  24.61 
 
 		 508 aa  101  2e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0626  carotenoid isomerase, putative  23.76 
 
 		 507 aa  100  6e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2330  carotene isomerase  23.91 
 
 		 508 aa  100  6e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1126  putative carotenoid isomerase  26.38 
 
 		 514 aa  98.2  3e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.777729  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12061  putative carotenoid isomerase  25.2 
 
 		 514 aa  97.8  4e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.809432  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1423  carotenoid isomerase  22.96 
 
 		 518 aa  96.7  9e-19  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1246  carotene isomerase  23.53 
 
 		 504 aa  96.7  9e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000000176287  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1308  carotene isomerase  22.7 
 
 		 512 aa  95.5  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12211  putative carotenoid isomerase  25.05 
 
 		 514 aa  95.9  2e-18  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12221  putative carotenoid isomerase  25.05 
 
 		 514 aa  95.5  2e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1336  carotene isomerase  22.7 
 
 		 512 aa  95.5  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0735245  hitchhiker  0.00100943 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3112  FAD dependent oxidoreductase  23.38 
 
 		 506 aa  94  6e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.270711  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03731  hypothetical protein  25.38 
 
 		 938 aa  92.4  1e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.968761 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0845  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  23.58 
 
 		 740 aa  89  2e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1209  conserved hypothetical protein, FAD-binding domain protein  24.85 
 
 		 502 aa  88.6  2e-16  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0766  amine oxidase  23.37 
 
 		 522 aa  87.8  5e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1888  carotenoid isomerase, putative  23.27 
 
 		 505 aa  85.9  0.000000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0874  amine oxidase  23.02 
 
 		 503 aa  84.3  0.000000000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3602  FAD dependent oxidoreductase  23.2 
 
 		 497 aa  80.9  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0345  phytoene dehydrogenase  24.15 
 
 		 509 aa  77.4  0.0000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03711  phytoene dehydrogenase  24.11 
 
 		 509 aa  77  0.0000000000008  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0577  All-trans-retinol 13,14-reductase  23.83 
 
 		 542 aa  75.5  0.000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9210  CRTISO5 carotenoid isomerase 5,phytoene dehydrogenase-related protein  22.2 
 
 		 530 aa  73.9  0.000000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2665  putative phytoene dehydrogenase  22.09 
 
 		 495 aa  73.6  0.000000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2512  FAD dependent oxidoreductase  22.61 
 
 		 497 aa  73.2  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.224928  normal  0.507466 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1995  All-trans-retinol 13,14-reductase  21.29 
 
 		 499 aa  71.6  0.00000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03701  phytoene dehydrogenase  22.82 
 
 		 509 aa  71.6  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0640229  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1874  All-trans-retinol 13,14-reductase  23.15 
 
 		 501 aa  68.9  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2820  phytoene desaturase  20.79 
 
 		 498 aa  68.2  0.0000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1598  phytoene desaturase  21.25 
 
 		 505 aa  67.4  0.0000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1077  all-trans-retinol 13,14-reductase  40.79 
 
 		 505 aa  66.6  0.000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3278  FAD dependent oxidoreductase  21.26 
 
 		 502 aa  65.1  0.000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.312837 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1069  FAD dependent oxidoreductase  22.58 
 
 		 496 aa  64.7  0.000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.302171  hitchhiker  0.00376489 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4146  All-trans-retinol 13,14-reductase  22.18 
 
 		 562 aa  62  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.559453  decreased coverage  0.00452261 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4976  FAD dependent oxidoreductase  46.77 
 
 		 515 aa  62.4  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1684  phytoene desaturase  21.54 
 
 		 506 aa  61.2  0.00000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.127101  normal  0.929667 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0425  All-trans-retinol 13,14-reductase  38.04 
 
 		 511 aa  60.8  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0436  All-trans-retinol 13,14-reductase  38.04 
 
 		 511 aa  61.2  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.601478 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0635  FAD dependent oxidoreductase  24.3 
 
 		 516 aa  61.2  0.00000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.470789 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03825  hypothetical protein  37.14 
 
 		 508 aa  60.8  0.00000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5031  phytoene desaturase  22.12 
 
 		 509 aa  58.9  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_51868  carotenoid isomerase  21.47 
 
 		 633 aa  58.2  0.0000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0318  FAD dependent oxidoreductase  38.89 
 
 		 547 aa  58.5  0.0000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1174  All-trans-retinol 13,14-reductase  21.73 
 
 		 522 aa  58.2  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0544  amine oxidase  31.13 
 
 		 525 aa  57.8  0.0000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00189501  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2970  phytoene desaturase  42.62 
 
 		 493 aa  57.4  0.0000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000576965 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2032  FAD dependent oxidoreductase  22.74 
 
 		 520 aa  57  0.0000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.756687 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3011  All-trans-retinol 13,14-reductase  29.41 
 
 		 544 aa  56.6  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2268  phytoene desaturase  21.99 
 
 		 497 aa  56.2  0.000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5620  phytoene desaturase  46.3 
 
 		 497 aa  55.5  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.476172 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3095  hypothetical protein  22.19 
 
 		 500 aa  55.5  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04430  phytoene desaturase  46.15 
 
 		 548 aa  55.8  0.000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5970  FAD dependent oxidoreductase  40.85 
 
 		 534 aa  55.8  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.633554  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3228  Zeta-phytoene desaturase  24 
 
 		 519 aa  55.8  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.285222  normal  0.0185992 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1046  phytoene dehydrogenase  20.94 
 
 		 494 aa  55.8  0.000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.586405  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2002  FAD dependent oxidoreductase  32.89 
 
 		 510 aa  55.5  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39472  predicted protein  43.08 
 
 		 645 aa  55.5  0.000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000845209  normal  0.555705 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2672  amine oxidase  21.16 
 
 		 513 aa  55.1  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1898  hypothetical protein  38.71 
 
 		 511 aa  55.1  0.000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.405447  normal  0.754346 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1053  all-trans-retinol 13,14-reductase  36.99 
 
 		 501 aa  55.1  0.000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0671242 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3827  phytoene desaturase  48.08 
 
 		 489 aa  54.7  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.47122  normal  0.0454978 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3745  phytoene desaturase  21.99 
 
 		 512 aa  54.3  0.000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>