More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A9601_17071 on replicon NC_008816
Organism: Prochlorococcus marinus str. AS9601



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008816  A9601_17071  chorismate mutase-prephenate dehydratase  100 
 
 
281 aa  566  1e-160  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.530579  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16951  chorismate mutase-prephenate dehydratase  92.53 
 
 
281 aa  530  1e-150  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1596  chorismate mutase-prephenate dehydratase  92.53 
 
 
281 aa  516  1.0000000000000001e-145  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16841  chorismate mutase-prephenate dehydratase  82.21 
 
 
281 aa  478  1e-134  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16271  chorismate mutase-prephenate dehydratase  63.12 
 
 
281 aa  363  2e-99  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.763625  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1070  chorismate mutase-prephenate dehydratase  61.29 
 
 
276 aa  351  7e-96  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.330771  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23691  chorismate mutase-prephenate dehydratase  55.52 
 
 
304 aa  332  5e-90  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0614249 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19451  chorismate mutase-prephenate dehydratase  62.01 
 
 
276 aa  327  1.0000000000000001e-88  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0316  prephenate dehydratase  55.4 
 
 
291 aa  314  9.999999999999999e-85  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.51764  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2026  prephenate dehydratase  54.95 
 
 
282 aa  307  1.0000000000000001e-82  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.713159  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0881  prephenate dehydratase  43.72 
 
 
291 aa  213  2.9999999999999995e-54  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00114823 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1067  Prephenate dehydratase  39.72 
 
 
288 aa  200  3e-50  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1096  Prephenate dehydratase  39.72 
 
 
288 aa  199  3.9999999999999996e-50  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0480  prephenate dehydratase  38.78 
 
 
296 aa  193  2e-48  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0463972  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0665  prephenate dehydratase  42.97 
 
 
293 aa  193  3e-48  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.27815  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1284  prephenate dehydratase  39.86 
 
 
295 aa  192  6e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000630901  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3487  prephenate dehydratase  38.55 
 
 
379 aa  184  2.0000000000000003e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1334  prephenate dehydratase  41.8 
 
 
280 aa  181  2e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000128945  normal  0.202615 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0046  Prephenate dehydratase  39.75 
 
 
287 aa  177  1e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4418  prephenate dehydratase  41.18 
 
 
284 aa  171  1e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.299443 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1153  Prephenate dehydratase  38.49 
 
 
276 aa  169  3e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1749  prephenate dehydratase  35.51 
 
 
418 aa  166  2.9999999999999998e-40  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2809  prephenate dehydratase  36.13 
 
 
372 aa  162  5.0000000000000005e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.433236  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1424  prephenate dehydratase  38.17 
 
 
274 aa  160  3e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000368391  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0078  prephenate dehydratase  36.98 
 
 
280 aa  158  9e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0545378  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0878  Prephenate dehydratase  39.26 
 
 
277 aa  157  1e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.583651  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5270  Prephenate dehydratase  34.64 
 
 
315 aa  157  2e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.271199  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0937  prephenate dehydratase  36.93 
 
 
272 aa  157  2e-37  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0905  Prephenate dehydratase  36.23 
 
 
386 aa  157  3e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000067938  hitchhiker  0.00000000600467 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1779  prephenate dehydratase  38.52 
 
 
277 aa  155  5.0000000000000005e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.490374  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2061  Prephenate dehydratase  37.3 
 
 
277 aa  155  7e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.152541  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2153  Prephenate dehydratase  37.3 
 
 
277 aa  155  7e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0806  prephenate dehydratase  39.92 
 
 
284 aa  155  8e-37  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2475  chorismate mutase  35.27 
 
 
391 aa  154  1e-36  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.248764  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2039  prephenate dehydratase  37.75 
 
 
275 aa  154  2e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00402041 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0116  chorismate mutase  34.55 
 
 
377 aa  154  2e-36  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0336  chorismate mutase  33.9 
 
 
419 aa  153  2.9999999999999998e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1594  prephenate dehydratase  37.6 
 
 
311 aa  152  4e-36  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01900  Prephenate dehydratase  32.88 
 
 
303 aa  151  1e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6401  Prephenate dehydratase  32.52 
 
 
305 aa  149  5e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0174  chorismate mutase  34.73 
 
 
361 aa  148  1.0000000000000001e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0282  Prephenate dehydratase  33.57 
 
 
326 aa  148  1.0000000000000001e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.209842 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0138  prephenate dehydratase  34.05 
 
 
327 aa  147  2.0000000000000003e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1641  prephenate dehydratase  37.09 
 
 
356 aa  146  3e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00696734  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3039  chorismate mutase  35.8 
 
 
355 aa  145  6e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1552  prephenate dehydratase  33.09 
 
 
279 aa  145  7.0000000000000006e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0248162  normal  0.310445 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0495  chorismate mutase  34.36 
 
 
359 aa  144  2e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0778684  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1904  prephenate dehydratase  32.93 
 
 
372 aa  143  3e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0916421  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1418  chorismate mutase/prephenate dehydratase  35.51 
 
 
362 aa  143  3e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1376  chorismate mutase  33.59 
 
 
364 aa  142  6e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3053  prephenate dehydratase  32.98 
 
 
315 aa  142  6e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4076  prephenate dehydratase  34.36 
 
 
364 aa  142  6e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000787581  normal  0.246318 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1964  prephenate dehydratase  32.37 
 
 
279 aa  140  1.9999999999999998e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.221167 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2583  prephenate dehydratase  30.4 
 
 
372 aa  140  1.9999999999999998e-32  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1360  chorismate mutase  33.2 
 
 
364 aa  140  3e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0302882 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1769  chorismate mutase  33.2 
 
 
367 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.653886  normal  0.431896 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3945  chorismate mutase  33.2 
 
 
364 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.117888  normal  0.0191313 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3260  chorismate mutase  35.25 
 
 
359 aa  139  3.9999999999999997e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1887  chorismate mutase-P and prephenate dehydratase  33.33 
 
 
360 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000192693  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0961  chorismate mutase  33.69 
 
 
374 aa  139  3.9999999999999997e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0047  prephenate dehydratase  34.67 
 
 
269 aa  139  4.999999999999999e-32  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1336  chorismate mutase  32.87 
 
 
413 aa  139  7e-32  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1747  chorismate mutase/prephenate dehydratase  33.72 
 
 
364 aa  138  7.999999999999999e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0966339  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1313  chorismate mutase  34.36 
 
 
359 aa  138  1e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  hitchhiker  2.21838e-16 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3645  chorismate mutasea  33.2 
 
 
364 aa  138  1e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0734175  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2485  prephenate dehydratase  31.9 
 
 
349 aa  138  1e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.402692 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1686  chorismate mutase / prephenate dehydratase  34.41 
 
 
355 aa  138  1e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0776  prephenate dehydratase  34.69 
 
 
269 aa  137  1e-31  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.351833  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01130  prephenate dehydratase  34.69 
 
 
316 aa  137  2e-31  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0990  chorismate mutase  34.53 
 
 
359 aa  137  2e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1244  prephenate dehydratase / chorismate mutase  34.31 
 
 
371 aa  137  2e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0482068  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0269  chorismate mutase/prephenate dehydratase  34.35 
 
 
358 aa  137  2e-31  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6846  chorismate mutase  29.29 
 
 
397 aa  137  2e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.235672 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0841  prephenate dehydratase  33.58 
 
 
268 aa  136  3.0000000000000003e-31  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0499  prephenate dehydratase  36.29 
 
 
278 aa  136  3.0000000000000003e-31  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0926  chorismate mutase / prephenate dehydratase  33.46 
 
 
367 aa  137  3.0000000000000003e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15830  chorismate mutase  33.33 
 
 
365 aa  136  3.0000000000000003e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.351764  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0097  Prephenate dehydratase  36.61 
 
 
306 aa  136  4e-31  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4445  prephenate dehydratase  31.75 
 
 
274 aa  136  4e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0268  Prephenate dehydratase  31.41 
 
 
311 aa  135  6.0000000000000005e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1930  prephenate dehydratase  34.86 
 
 
311 aa  135  7.000000000000001e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.898282 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2166  chorismate mutase / prephenate dehydratase  32.92 
 
 
373 aa  135  7.000000000000001e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0178196  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2260  prephenate dehydratase  33.88 
 
 
278 aa  135  7.000000000000001e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1950  prephenate dehydratase  34.06 
 
 
366 aa  135  7.000000000000001e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5032  prephenate dehydratase  30.69 
 
 
318 aa  135  8e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0575455 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3187  Prephenate dehydratase  31.12 
 
 
322 aa  135  9e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.32144  normal  0.019372 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0741  chorismate mutase  35.68 
 
 
360 aa  135  9e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0951  chorismate mutase / prephenate dehydratase  32.8 
 
 
365 aa  134  9.999999999999999e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.356586  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1142  prephenate dehydratase  33.95 
 
 
269 aa  134  9.999999999999999e-31  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1589  transcription termination factor NusA  33.46 
 
 
359 aa  134  9.999999999999999e-31  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1244  Prephenate dehydratase  32.61 
 
 
283 aa  134  9.999999999999999e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1850  prephenate dehydratase  32.69 
 
 
364 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0140857  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4522  prephenate dehydratase  29.96 
 
 
318 aa  134  1.9999999999999998e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2192  chorismate mutase  32.94 
 
 
355 aa  134  1.9999999999999998e-30  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0121  Prephenate dehydratase  32.14 
 
 
305 aa  133  3e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0008  Prephenate dehydratase  35.94 
 
 
279 aa  133  3e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1666  P-protein  33.08 
 
 
359 aa  132  5e-30  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0097  Prephenate dehydratase  35.74 
 
 
314 aa  132  6e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0315701 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3006  chorismate mutase  36.63 
 
 
360 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.224868  normal  0.0525817 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2241  prephenate dehydratase / chorismate mutase  34.8 
 
 
370 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>