More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A9601_17041 on replicon NC_008816
Organism: Prochlorococcus marinus str. AS9601



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008816  A9601_17041  ribonuclease E/G  100 
 
 		 606 aa  1214    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.925066  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16921  ribonuclease E/G  87.95 
 
 		 602 aa  1053    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.987709  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16811  ribonuclease E/G  71.64 
 
 		 608 aa  845    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1067  RNAse E  60.52 
 
 		 640 aa  643    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.232877  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2029  ribonuclease E and G  57.04 
 
 		 646 aa  637    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19421  ribonuclease E/G  57.51 
 
 		 640 aa  645    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.839153  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0313  RNAse E  52.89 
 
 		 646 aa  644    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1593  ribonuclease  87.79 
 
 		 605 aa  1036    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.435522  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16241  ribonuclease E/G  56.59 
 
 		 624 aa  643    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23721  ribonuclease E/G  70.47 
 
 		 647 aa  625  1e-178  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.134422 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3404  ribonuclease, Rne/Rng family  63.73 
 
 		 669 aa  561  1e-158  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1281  ribonuclease E and G  63.64 
 
 		 687 aa  554  1e-156  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000695712  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0668  ribonuclease, Rne/Rng family  63.39 
 
 		 713 aa  551  1e-156  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0878  ribonuclease  61.89 
 
 		 808 aa  551  1e-155  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00232207 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0483  ribonuclease  62.41 
 
 		 682 aa  550  1e-155  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.582828  normal  0.888288 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0042  ribonuclease, Rne/Rng family  50.89 
 
 		 645 aa  551  1e-155  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.754542 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1064  ribonuclease, Rne/Rng family  49.91 
 
 		 653 aa  542  1e-153  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1093  ribonuclease, Rne/Rng family  49.91 
 
 		 653 aa  542  1e-153  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2536  ribonuclease  40.14 
 
 		 559 aa  296  8e-79  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00011944  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3326  ribonuclease, Rne/Rng family  40.38 
 
 		 564 aa  289  8e-77  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4339  ribonuclease, Rne/Rng family  37.66 
 
 		 411 aa  276  6e-73  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000260891  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0755  ribonuclease G  38.85 
 
 		 702 aa  276  1.0000000000000001e-72  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2183  ribonuclease E and G  39.6 
 
 		 908 aa  275  2.0000000000000002e-72  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0295776  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0556  ribonuclease G  37.83 
 
 		 562 aa  273  5.000000000000001e-72  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3381  ribonuclease, Rne/Rng family  37.91 
 
 		 1007 aa  272  1e-71  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1614  ribonuclease E and G  36.01 
 
 		 476 aa  269  1e-70  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0133634  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18280  ribonuclease, Rne/Rng family  39.4 
 
 		 952 aa  268  2e-70  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0683615  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5498  ribonuclease, Rne/Rng family  35.37 
 
 		 543 aa  266  8e-70  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.490736 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1319  ribonuclease, Rne/Rng family  37.78 
 
 		 494 aa  264  3e-69  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.199233  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1453  ribonuclease  41.76 
 
 		 416 aa  263  4.999999999999999e-69  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000141125  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1546  ribonuclease, Rne/Rng family  37.84 
 
 		 1041 aa  263  6e-69  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.31372  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11530  RNAse G  39.36 
 
 		 959 aa  261  4e-68  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0250639  normal  0.313443 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12490  ribonuclease, Rne/Rng family  34.98 
 
 		 1093 aa  261  4e-68  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1502  ribonuclease, Rne/Rng family  38.93 
 
 		 1080 aa  260  6e-68  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.69502  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0180  ribonuclease G  33.87 
 
 		 483 aa  259  8e-68  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.377075  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1587  ribonuclease, Rne/Rng family  40.34 
 
 		 1048 aa  259  8e-68  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0101858  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1200  ribonuclease, Rne/Rng family  35.56 
 
 		 496 aa  258  2e-67  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7272  Ribonuclease E  38.21 
 
 		 922 aa  258  2e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.159287 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1218  ribonuclease  38.1 
 
 		 1194 aa  258  3e-67  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.993223 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3452  ribonuclease G  41.03 
 
 		 1070 aa  257  4e-67  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3267  ribonuclease G  33.92 
 
 		 489 aa  257  5e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2071  ribonuclease  34.08 
 
 		 489 aa  256  6e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.446321  normal  0.265186 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2129  ribonuclease, Rne/Rng family  38.52 
 
 		 571 aa  256  1.0000000000000001e-66  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0190807  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5262  ribonuclease  37.7 
 
 		 1427 aa  256  1.0000000000000001e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.266118  normal  0.176556 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2461  ribonuclease, Rne/Rng family  37.74 
 
 		 990 aa  256  1.0000000000000001e-66  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.384924  normal  0.18702 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2147  ribonuclease, Rne/Rng family  38.99 
 
 		 1151 aa  255  2.0000000000000002e-66  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000101232 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1294  ribonuclease, Rne/Rng family  33.7 
 
 		 489 aa  255  2.0000000000000002e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.229063  normal  0.0967279 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2567  ribonuclease, Rne/Rng family  33.47 
 
 		 496 aa  255  2.0000000000000002e-66  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.894494  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2954  ribonuclease, Rne/Rng family  33.47 
 
 		 496 aa  255  2.0000000000000002e-66  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1186  ribonuclease, Rne/Rng family  38.52 
 
 		 974 aa  254  3e-66  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2058  ribonuclease, Rne/Rng family  36.88 
 
 		 1123 aa  253  6e-66  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1224  S1 RNA binding domain protein  34.47 
 
 		 1093 aa  252  1e-65  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000769273 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7273  ribonuclease, Rne/Rng family  37.47 
 
 		 1334 aa  251  2e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.584689  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0301  ribonuclease  36.88 
 
 		 503 aa  252  2e-65  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000158312  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14130  ribonuclease, Rne/Rng family  39 
 
 		 489 aa  251  3e-65  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000124696  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1615  ribonuclese G and E  35.26 
 
 		 1022 aa  250  4e-65  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1618  ribonuclease, Rne/Rng family  37.68 
 
 		 944 aa  250  6e-65  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.127332  normal  0.810349 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3188  RNAse G  35.09 
 
 		 492 aa  250  7e-65  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2393  ribonuclease  37.28 
 
 		 1113 aa  249  8e-65  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.380654  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0193  ribonuclease G  37.6 
 
 		 512 aa  249  9e-65  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0692985  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0409  ribonuclease  33.11 
 
 		 497 aa  249  1e-64  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.748202  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11390  ribonuclease, Rne/Rng family  36.67 
 
 		 1265 aa  249  1e-64  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.320924  hitchhiker  0.00951871 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1472  ribonuclease, Rne/Rng family  39.84 
 
 		 1040 aa  249  2e-64  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.800895  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0470  ribonuclease G (cytoplasmic axial filament protein)  33.11 
 
 		 497 aa  248  3e-64  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0285908  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0159  ribonuclease, Rne/Rng family  37.24 
 
 		 496 aa  247  4e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.125882  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2284  ribonuclease, Rne/Rng family  36.88 
 
 		 1117 aa  247  4e-64  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.436718  hitchhiker  0.00140455 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0409  ribonuclease G  32.81 
 
 		 492 aa  247  4e-64  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.416814  normal  0.138989 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0142  ribonuclease, Rne/Rng family  37.24 
 
 		 496 aa  247  4.9999999999999997e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5481  ribonuclease Rne/Rng family  36.8 
 
 		 717 aa  246  6e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0824918  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3239  ribonuclease G  36.22 
 
 		 531 aa  245  9.999999999999999e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0328342  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4433  ribonuclease, Rne/Rng family  35.15 
 
 		 520 aa  245  1.9999999999999999e-63  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.320456  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2663  ribonuclease, Rne/Rng family  35.86 
 
 		 636 aa  245  1.9999999999999999e-63  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.127764 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0541  ribonuclease, Rne/Rng family  35.09 
 
 		 515 aa  245  1.9999999999999999e-63  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.353694 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0187  ribonuclease G  36.1 
 
 		 487 aa  243  6e-63  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0293  ribonuclease  33.49 
 
 		 525 aa  243  6e-63  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.806151 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1375  ribonuclease  34 
 
 		 483 aa  242  1e-62  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2657  ribonuclease E and G  34.48 
 
 		 490 aa  243  1e-62  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.121341  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2137  ribonuclease  37.74 
 
 		 482 aa  243  1e-62  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2584  RNase EG  34.03 
 
 		 503 aa  241  2.9999999999999997e-62  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000677215  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2266  ribonuclease, Rne/Rng family  36.56 
 
 		 1043 aa  241  2.9999999999999997e-62  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.454961  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0482  ribonuclease  34.93 
 
 		 528 aa  239  8e-62  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.000399886  normal  0.164924 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5979  ribonuclease, Rne/Rng family  34.02 
 
 		 520 aa  239  1e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.62206  normal  0.425632 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3458  ribonuclease, Rne/Rng family  37.7 
 
 		 1244 aa  238  2e-61  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2622  ribonuclease  35.88 
 
 		 495 aa  238  2e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.134326  normal  0.0714876 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3689  ribonuclease G  34.67 
 
 		 535 aa  238  2e-61  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2271  ribonuclease G  35.87 
 
 		 493 aa  238  3e-61  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0487  RNAse G  34.69 
 
 		 528 aa  237  4e-61  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.258598  normal  0.0128564 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0756  ribonuclease, Rne/Rng family  33.64 
 
 		 741 aa  237  6e-61  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000069675  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3527  ribonuclease  34.56 
 
 		 515 aa  236  8e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.255196  normal  0.0164409 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3624  ribonuclease  38.07 
 
 		 991 aa  236  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3861  ribonuclease  36.46 
 
 		 1058 aa  236  1.0000000000000001e-60  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00688294 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1719  ribonuclease, Rne/Rng family  34.47 
 
 		 495 aa  236  1.0000000000000001e-60  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2437  RNAse G  36.56 
 
 		 483 aa  236  1.0000000000000001e-60  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3196  ribonuclease G  34 
 
 		 517 aa  236  1.0000000000000001e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1736  ribonuclease, Rne/Rng family  34.75 
 
 		 496 aa  235  1.0000000000000001e-60  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3551  ribonuclease  38.07 
 
 		 991 aa  236  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.788341  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3556  ribonuclease  38.07 
 
 		 987 aa  236  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0805889  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3482  ribonuclease  36.46 
 
 		 1024 aa  236  1.0000000000000001e-60  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10100  ribonuclease, Rne/Rng family  36.91 
 
 		 1091 aa  235  2.0000000000000002e-60  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3947  ribonuclease  36.95 
 
 		 961 aa  235  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.735698  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>