More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A9601_16901 on replicon NC_008816
Organism: Prochlorococcus marinus str. AS9601



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008816  A9601_16901  TatD family deoxyribonuclease  100 
 
 
264 aa  541  1e-153  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16771  TatD family deoxyribonuclease  92.02 
 
 
264 aa  505  9.999999999999999e-143  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1579  putative deoxyribonuclease, TatD family  90.49 
 
 
264 aa  496  1e-139  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16661  TatD family deoxyribonuclease  77.57 
 
 
264 aa  437  9.999999999999999e-123  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16081  TatD family deoxyribonuclease  56.92 
 
 
261 aa  322  4e-87  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1017  putative deoxyribonuclease, TatD family  57.83 
 
 
263 aa  318  6e-86  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18871  TatD family deoxyribonuclease  57.83 
 
 
263 aa  318  6e-86  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2068  TatD-related deoxyribonuclease  56.08 
 
 
262 aa  318  6e-86  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04351  putative deoxyribonuclease, TatD family  56.47 
 
 
277 aa  315  3e-85  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0604  TatD-related deoxyribonuclease  55.69 
 
 
262 aa  315  4e-85  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1752  hydrolase, TatD family  48.85 
 
 
265 aa  275  4e-73  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1779  hydrolase, TatD family  48.85 
 
 
265 aa  275  4e-73  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2940  Sec-independent protein translocase TatD  51.33 
 
 
273 aa  275  5e-73  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.355408  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1521  Sec-independent protein translocase TatD  48.25 
 
 
265 aa  261  1e-68  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0926881 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0740  hydrolase, TatD family  49.42 
 
 
270 aa  261  1e-68  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0489  hydrolase, TatD family  47.89 
 
 
281 aa  259  4e-68  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.868901 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4206  Sec-independent protein translocase TatD  49.43 
 
 
261 aa  257  2e-67  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1018  TatD family hydrolase  45.98 
 
 
261 aa  245  6e-64  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.195274  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0044  hydrolase, TatD family  40.31 
 
 
256 aa  202  4e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1826  TatD-related deoxyribonuclease  42.02 
 
 
259 aa  199  3.9999999999999996e-50  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2114  hydrolase, TatD family  42.44 
 
 
261 aa  198  9e-50  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.167709  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1120  TatD family deoxyribonuclease  40.54 
 
 
255 aa  195  8.000000000000001e-49  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2547  hydrolase, TatD family  40.77 
 
 
265 aa  194  1e-48  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000234305  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1106  hydrolase, TatD family  38.04 
 
 
257 aa  193  2e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2224  putative metallodependent hydrolase  40.77 
 
 
265 aa  194  2e-48  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000510394  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0992  hydrolase, TatD family  38.04 
 
 
257 aa  193  2e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.313199  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1615  putative metallodependent hydrolase  41.15 
 
 
264 aa  194  2e-48  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.0000000236116  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0049  TatD-related deoxyribonuclease  42.41 
 
 
256 aa  194  2e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000233797 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21920  hydrolase, TatD family  39.23 
 
 
257 aa  194  2e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01096  predicted metallodependent hydrolase  40.77 
 
 
265 aa  192  3e-48  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0276018  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2501  putative metallodependent hydrolase  40.77 
 
 
265 aa  192  3e-48  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0673622  unclonable  0.0000000127791 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3114  TatD family hydrolase  39.76 
 
 
268 aa  193  3e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.677659  normal  0.341817 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01104  hypothetical protein  40.77 
 
 
265 aa  192  3e-48  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0293758  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1222  putative metallodependent hydrolase  40.77 
 
 
265 aa  192  3e-48  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000128858  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1479  putative metallodependent hydrolase  40.77 
 
 
265 aa  192  4e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000171284  hitchhiker  0.0000000124971 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2167  putative metallodependent hydrolase  41.83 
 
 
265 aa  192  4e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.337997  hitchhiker  0.000000000251924 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1301  putative metallodependent hydrolase  41.83 
 
 
265 aa  192  4e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0214431  hitchhiker  0.0000000000156726 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1316  putative metallodependent hydrolase  41.83 
 
 
265 aa  192  4e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.211046  hitchhiker  0.00000000025238 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1221  putative metallodependent hydrolase  40.77 
 
 
265 aa  192  4e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000193485  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2027  putative metallodependent hydrolase  40.77 
 
 
265 aa  192  4e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000000195857  hitchhiker  0.00000164226 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1096  deoxyribonuclease of TatD family protein  41.25 
 
 
258 aa  192  6e-48  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.664033  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1278  putative metallodependent hydrolase  41.44 
 
 
265 aa  191  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.558923  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1984  putative metallodependent hydrolase  40.38 
 
 
265 aa  189  2.9999999999999997e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.0000140367  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1260  TatD-related deoxyribonuclease  37.11 
 
 
258 aa  188  5.999999999999999e-47  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0762815  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1782  TatD family deoxyribonuclease  37.69 
 
 
260 aa  188  8e-47  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2146  TatD family hydrolase  37.25 
 
 
265 aa  188  9e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3117  hydrolase, TatD family  39.37 
 
 
262 aa  186  3e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0535409  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0964  TatD family hydrolase  37.55 
 
 
263 aa  186  3e-46  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.913879  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2305  TatD family hydrolase  39.77 
 
 
255 aa  186  4e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.352622  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1275  TatD-related deoxyribonuclease  37.16 
 
 
267 aa  186  5e-46  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.417665 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2855  hydrolase, TatD family  37.36 
 
 
269 aa  185  6e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3626  TatD family hydrolase  36.19 
 
 
264 aa  184  1.0000000000000001e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000292684  normal  0.319005 
 
 
-
 
NC_004310  BR0996  TatD family hydrolase  37.65 
 
 
263 aa  183  2.0000000000000003e-45  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02901  deoxyribonuclease  40.86 
 
 
255 aa  184  2.0000000000000003e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1801  hydrolase, TatD family  37.01 
 
 
260 aa  182  3e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.164417  normal  0.0298218 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003003  putative deoxyribonuclease YcfH  41.31 
 
 
255 aa  183  3e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0963  TatD family hydrolase  38.04 
 
 
263 aa  183  3e-45  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0554951  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1485  hypothetical protein  38.85 
 
 
257 aa  182  4.0000000000000006e-45  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.507354  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0246  TatD family hydrolase  39.31 
 
 
258 aa  182  5.0000000000000004e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0068  hydrolase, TatD family  37.89 
 
 
253 aa  182  6e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00105138  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1989  hydrolase, TatD family  38.19 
 
 
260 aa  182  6e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.727306  normal  0.0188315 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0042  TatD family hydrolase  37.5 
 
 
261 aa  182  7e-45  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.804298  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1515  TatD family hydrolase  35.16 
 
 
266 aa  181  7e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1357  hypothetical protein  38.17 
 
 
262 aa  181  1e-44  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0793  TatD family hydrolase  37.8 
 
 
260 aa  181  1e-44  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2080  TatD family hydrolase  36.96 
 
 
264 aa  181  1e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.231197  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0885  hydrolase, TatD family  37.5 
 
 
263 aa  180  2e-44  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.46453  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1657  TatD-related deoxyribonuclease  40.08 
 
 
261 aa  180  2e-44  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000576641  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1695  Mg-dependent DNase  35.43 
 
 
464 aa  180  2e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1600  hypothetical protein  38.52 
 
 
255 aa  180  2e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2718  TatD-related deoxyribonuclease  38.19 
 
 
263 aa  180  2e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.13665  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1289  TatD family hydrolase  37.89 
 
 
259 aa  180  2e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0429  deoxyribonuclease  36.26 
 
 
266 aa  180  2e-44  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1926  TatD family hydrolase  40.38 
 
 
262 aa  179  2.9999999999999997e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02328  putative metallo-dependent hydrolase  39.62 
 
 
263 aa  179  2.9999999999999997e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2237  hydrolase, TatD family protein  40 
 
 
262 aa  179  2.9999999999999997e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0129  hydrolase, TatD family  37.5 
 
 
259 aa  179  4e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0130316  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1913  putative metallodependent hydrolase  36.78 
 
 
258 aa  179  4e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000168502  hitchhiker  0.00000614927 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1938  TatD-related deoxyribonuclease  36.96 
 
 
259 aa  179  4e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2029  TatD-related deoxyribonuclease  39 
 
 
267 aa  179  4e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4330  TatD family hydrolase  38.28 
 
 
273 aa  179  4e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.643835  normal  0.41357 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2682  TatD-related deoxyribonuclease  38.19 
 
 
265 aa  179  4.999999999999999e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.292103  normal  0.560368 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2329  TatD family hydrolase  37.74 
 
 
265 aa  179  5.999999999999999e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.493356  normal  0.509317 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1574  DNase, TatD family  38.91 
 
 
255 aa  178  7e-44  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0443076  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1895  hydrolase, TatD family  39.23 
 
 
262 aa  178  9e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.137454 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2247  putative TatD-related deoxyribonuclease  38.13 
 
 
256 aa  178  9e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.152142  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2211  TatD family hydrolase  39.62 
 
 
280 aa  178  9e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0540  hydrolase, TatD family  38.04 
 
 
267 aa  177  1e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2449  TatD family hydrolase  39.23 
 
 
283 aa  177  1e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.716408  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0675  putative TatD-related deoxyribonuclease  37.35 
 
 
265 aa  178  1e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0191347  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2516  TatD-related deoxyribonuclease  37.16 
 
 
265 aa  177  1e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.11024  normal  0.0103613 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2569  TatD family hydrolase  39.23 
 
 
283 aa  177  1e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.285231  normal  0.0418205 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2115  TatD family hydrolase  40.38 
 
 
257 aa  177  1e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.774766  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2456  TatD family hydrolase  39.23 
 
 
283 aa  177  1e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.347591  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2610  TatD family hydrolase  39.15 
 
 
262 aa  177  2e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1353  hypothetical protein  37.4 
 
 
262 aa  176  2e-43  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0034  TatD family hydrolase  40.16 
 
 
255 aa  177  2e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2464  TatD-related deoxyribonuclease:radical SAM family protein  35.83 
 
 
606 aa  177  2e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1381  TatD-related deoxyribonuclease  38.04 
 
 
254 aa  177  2e-43  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1664  TatD family hydrolase  39.23 
 
 
266 aa  177  2e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>