37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A9601_16861 on replicon NC_008816
Organism: Prochlorococcus marinus str. AS9601



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008817  P9515_16621  putative high light inducible protein  100 
 
 
50 aa  103  1e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0646927  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16861  putative high light inducible protein  100 
 
 
50 aa  103  1e-21  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16731  putative high light inducible protein  98 
 
 
50 aa  101  3e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1575  putative high light inducible protein  96 
 
 
50 aa  99.8  1e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1013  putative high light inducible protein  72 
 
 
50 aa  75.9  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18831  putative high light inducible protein  72 
 
 
50 aa  75.9  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04401  putative high light inducible protein  64 
 
 
50 aa  75.9  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0608  putative high light inducible protein  66 
 
 
50 aa  73.9  0.0000000000007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.131116  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2064  hypothetical protein  62 
 
 
63 aa  73.2  0.000000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0330706  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16041  putative high light inducible protein  65.31 
 
 
50 aa  70.1  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3583  CAB/ELIP/HLIP-like protein  47.92 
 
 
56 aa  58.5  0.00000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0175  CAB/ELIP/HLIP-related protein  44.9 
 
 
56 aa  57  0.00000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000121153  normal  0.0293662 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1997  high light-inducible protein  55.32 
 
 
72 aa  55.5  0.0000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2720  CAB/ELIP/HLIP-related protein  48 
 
 
54 aa  54.3  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.556008  hitchhiker  0.0000310202 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0672  CAB/ELIP/HLIP-related protein  45.83 
 
 
58 aa  53.9  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0691  HLIP; single helix LHC light protein  45.83 
 
 
58 aa  53.9  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.0000595991  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1910  CAB/ELIP/HLIP-related protein  47.92 
 
 
56 aa  53.5  0.0000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0846233  normal  0.275472 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2057  CAB/ELIP/HLIP-related protein  45.83 
 
 
59 aa  53.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.519028 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1759  CAB/ELIP/HLIP-related protein  44 
 
 
67 aa  52.4  0.000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0155  hypothetical protein  55 
 
 
94 aa  52  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1331  CAB/ELIP/HLIP superfamily protein  47.92 
 
 
58 aa  49.3  0.00002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2542  hypothetical protein  44.9 
 
 
70 aa  47.8  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00751  high light inducible protein  48.65 
 
 
91 aa  46.2  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2916  high light inducible protein  48.94 
 
 
72 aa  45.4  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000194255  normal  0.0166899 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00761  high light inducible protein  48.65 
 
 
91 aa  44.3  0.0005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01281  high light inducible protein  46.34 
 
 
79 aa  44.3  0.0005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0214149  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1411  high light inducible protein  46.81 
 
 
59 aa  44.3  0.0006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1831  high light inducible protein  58.97 
 
 
83 aa  43.9  0.0007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2265  high light inducible protein  40.48 
 
 
66 aa  43.9  0.0008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.594666 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5010  high light inducible protein  44.68 
 
 
71 aa  43.9  0.0009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0824  high light inducible protein  56.41 
 
 
83 aa  43.5  0.001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00721  high light inducible protein  42.5 
 
 
82 aa  43.5  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.624875 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0066  high light inducible protein-like  48.65 
 
 
91 aa  43.5  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1282  hypothetical protein  42 
 
 
66 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0415  high light inducible protein  44.44 
 
 
69 aa  41.6  0.003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2331  CAB/ELIP/HLIP superfamily protein  47.62 
 
 
55 aa  40.4  0.009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.941002  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03161  high light inducible protein  44.74 
 
 
113 aa  40  0.01  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.906124 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>