128 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A9601_16561 on replicon NC_008816
Organism: Prochlorococcus marinus str. AS9601



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008816  A9601_16561  F0F1 ATP synthase subunit B'  100 
 
 
153 aa  299  8.000000000000001e-81  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1547  F0F1 ATP synthase subunit B'  98.69 
 
 
153 aa  295  1e-79  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16441  F0F1 ATP synthase subunit B'  98.04 
 
 
153 aa  293  5e-79  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16331  F0F1 ATP synthase subunit B'  93.46 
 
 
153 aa  282  9e-76  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.320116  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18521  F0F1 ATP synthase subunit B'  58.82 
 
 
153 aa  176  8e-44  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0984  F0F1 ATP synthase subunit B'  58.82 
 
 
153 aa  176  1e-43  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15731  F0F1 ATP synthase subunit B'  58.17 
 
 
153 aa  158  2e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.723597  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2191  F0F1 ATP synthase subunit B'  55.94 
 
 
154 aa  152  1e-36  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04801  F0F1 ATP synthase subunit B'  56.21 
 
 
151 aa  149  1e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0485  F0F1 ATP synthase subunit B'  53.85 
 
 
154 aa  147  6e-35  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.383188  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2202  F0F1 ATP synthase subunit B'  37.32 
 
 
161 aa  107  6e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.024698  normal  0.231537 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2614  F0F1 ATP synthase subunit B'  42.25 
 
 
163 aa  104  4e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.434819  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0333  F0F1 ATP synthase subunit B'  40.43 
 
 
158 aa  103  6e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.613666  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3386  F0F1 ATP synthase subunit B'  35.77 
 
 
143 aa  91.7  4e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.0000213894  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2717  F0F1 ATP synthase subunit B'  35.77 
 
 
143 aa  91.7  4e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2848  ATP synthase F0, B subunit  29.55 
 
 
162 aa  65.5  0.0000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.134419 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1489  F0F1 ATP synthase subunit B'  28.89 
 
 
138 aa  64.7  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.212693  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0329  ATP synthase F0, B subunit  31.78 
 
 
161 aa  64.7  0.0000000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2622  F0F1 ATP synthase subunit B'  34.31 
 
 
143 aa  63.9  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1177  ATP synthase F0, B subunit  30.43 
 
 
164 aa  60.8  0.000000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.937871  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1277  ATP synthase F0, B subunit  30.43 
 
 
164 aa  60.8  0.000000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.279271  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2169  F0F1 ATP synthase subunit B  28.99 
 
 
156 aa  56.6  0.0000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000388738  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0079  ATP synthase F0, B subunit  31.65 
 
 
162 aa  55.5  0.0000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17840  ATP synthase F0, B subunit  27.14 
 
 
166 aa  54.7  0.0000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4068  F0F1 ATP synthase subunit B  30.09 
 
 
164 aa  55.1  0.0000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0525312  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3335  H+transporting two-sector ATPase subunit B/B'  35.77 
 
 
143 aa  54.3  0.0000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.843429  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4169  ATP synthase F0, B subunit  26.28 
 
 
165 aa  54.3  0.0000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0813106  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4795  ATP synthase F0, B subunit  27.94 
 
 
164 aa  53.9  0.0000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0163867  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2604  ATP synthase F0, B subunit  33.33 
 
 
181 aa  53.9  0.0000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.811029  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3989  F0F1 ATP synthase subunit B  28.46 
 
 
156 aa  53.9  0.0000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1713  F0F1 ATP synthase subunit B  28.03 
 
 
171 aa  52.8  0.000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2141  ATP synthase F0, B subunit  27.82 
 
 
163 aa  52.4  0.000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0004  F0F1 ATP synthase subunit B  27.64 
 
 
156 aa  52  0.000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000383011  hitchhiker  0.00333744 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0394  ATP synthase F0, B subunit  35.38 
 
 
165 aa  51.6  0.000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.501074 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0989  F0F1 ATP synthase subunit B  28.33 
 
 
164 aa  51.6  0.000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.644569 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4543  F0F1 ATP synthase subunit B  28.46 
 
 
156 aa  51.6  0.000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000204898  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0463  ATP synthase F0, B subunit  29.32 
 
 
172 aa  50.8  0.000007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.018727  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2382  ATP synthase F0, B subunit  29.27 
 
 
168 aa  49.7  0.00001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0499925 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3419  F0F1 ATP synthase subunit B  26.32 
 
 
178 aa  49.3  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2761  ATP synthase F0, B subunit  25.9 
 
 
167 aa  48.9  0.00002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2245  F0F1 ATP synthase subunit B  30.37 
 
 
175 aa  49.3  0.00002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.26161  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3515  F0F1 ATP synthase subunit B  25.78 
 
 
156 aa  48.9  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4128  F0F1 ATP synthase subunit B  26.02 
 
 
156 aa  48.5  0.00003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00062325  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4150  F0F1 ATP synthase subunit B  26.83 
 
 
156 aa  48.5  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.039629  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4200  F0F1 ATP synthase subunit B  26.83 
 
 
156 aa  48.5  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.109353  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4079  F0F1 ATP synthase subunit B  26.83 
 
 
156 aa  48.5  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0615149  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4094  F0F1 ATP synthase subunit B  26.83 
 
 
156 aa  48.5  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000422543  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4259  F0F1 ATP synthase subunit B  26.83 
 
 
156 aa  48.5  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0777142  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2143  F0F1 ATP synthase subunit B  25.87 
 
 
173 aa  48.5  0.00004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.631434  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2181  F0F1 ATP synthase subunit B  25.87 
 
 
173 aa  48.5  0.00004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.273543  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4180  F0F1 ATP synthase subunit B  26.83 
 
 
156 aa  47.8  0.00006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000186765  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4206  F0F1 ATP synthase subunit B  26.83 
 
 
156 aa  47.8  0.00006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.00000301032  normal  0.110777 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4222  F0F1 ATP synthase subunit B  26.83 
 
 
156 aa  47.8  0.00006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000120045  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03109  F0F1 ATP synthase subunit B  26.02 
 
 
156 aa  47.8  0.00006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2587  Fis family transcriptional regulator  22.79 
 
 
141 aa  47.4  0.00007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.325398  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3154  ATP synthase F0, B subunit  28.38 
 
 
189 aa  47.4  0.00007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4474  ATP synthase F0, B subunit  27.86 
 
 
179 aa  47.4  0.00007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03620  F0F1 ATP synthase subunit B  27.64 
 
 
156 aa  47.4  0.00008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00121932  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4231  ATP synthase F0, B subunit  27.64 
 
 
156 aa  47.4  0.00008  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00770304  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2456  F0F1 ATP synthase subunit B  25.47 
 
 
159 aa  47  0.00008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1041  ATP synthase F0, B subunit  28.86 
 
 
206 aa  47.4  0.00008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0637468 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3952  F0F1 ATP synthase subunit B  27.64 
 
 
156 aa  47.4  0.00008  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000175461  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4252  F0F1 ATP synthase subunit B  27.64 
 
 
156 aa  47.4  0.00008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000515942  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03564  hypothetical protein  27.64 
 
 
156 aa  47.4  0.00008  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000629937  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4258  F0F1 ATP synthase subunit B  27.64 
 
 
156 aa  47.4  0.00008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00109237  normal  0.0337156 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4104  F0F1 ATP synthase subunit B  27.64 
 
 
156 aa  47.4  0.00008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000546623  normal  0.0856146 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4190  F0F1 ATP synthase subunit B  28.46 
 
 
156 aa  47  0.00008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000644927  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4185  F0F1 ATP synthase subunit B  27.64 
 
 
156 aa  47.4  0.00008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000709577  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2489  F0F1 ATP synthase subunit B  29.37 
 
 
175 aa  47.4  0.00008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000305387  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5172  F0F1 ATP synthase subunit B  27.64 
 
 
156 aa  47.4  0.00008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000636069  hitchhiker  0.00809624 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0313  ATP synthase F0, B subunit  29.13 
 
 
171 aa  46.6  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.154955  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0066  F0F1 ATP synthase subunit B  29.58 
 
 
175 aa  45.8  0.0002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.391852  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0395  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  25.45 
 
 
189 aa  46.2  0.0002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06108  ATP synthase B chain  21.97 
 
 
156 aa  46.2  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4253  F0F1 ATP synthase subunit B  28.46 
 
 
156 aa  45.8  0.0002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0299011  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0489  F0F1 ATP synthase subunit B  25 
 
 
177 aa  46.2  0.0002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0554467  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2778  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  32.06 
 
 
259 aa  45.4  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.392301 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03050  ATP synthase F0, subunit B  29.13 
 
 
164 aa  45.4  0.0003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4370  F0F1 ATP synthase subunit B  23.48 
 
 
156 aa  45.4  0.0003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000255144  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0803  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  23.91 
 
 
152 aa  45.4  0.0003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0199  ATP synthase F0, B subunit  26.57 
 
 
164 aa  45.1  0.0003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000395488  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5603  ATP synthase F0, B subunit  25.56 
 
 
156 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3207  ATP synthase F0, B subunit  28.24 
 
 
159 aa  45.1  0.0004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0472132  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3307  F0F1 ATP synthase subunit B  29.73 
 
 
179 aa  45.1  0.0004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000544388  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2500  F0F1 ATP synthase subunit B  28.03 
 
 
175 aa  45.1  0.0004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2811  ATP synthase F0, B subunit  28.24 
 
 
159 aa  45.1  0.0004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.182804  normal  0.388372 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3063  F0F1 ATP synthase subunit B  25.9 
 
 
156 aa  44.7  0.0004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4338  ATP synthase F0, B subunit  27.86 
 
 
179 aa  44.7  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.209021  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_13609  F-ATPase family transporter: protons (mitochondrial)  24.65 
 
 
159 aa  44.3  0.0005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21440  ATP synthase, F0 subunit b  29.33 
 
 
203 aa  44.7  0.0005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2701  ATP synthase F1, delta subunit, putative  23.36 
 
 
253 aa  44.3  0.0006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5125  F0F1 ATP synthase subunit B  25.56 
 
 
156 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0727464  normal  0.577364 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0110  F0F1 ATP synthase subunit B  25.78 
 
 
156 aa  44.3  0.0006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.0000261662  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2166  F0F1 ATP synthase subunit B  23.58 
 
 
154 aa  44.3  0.0006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2524  F0F1 ATP synthase subunit B  26.02 
 
 
156 aa  44.3  0.0006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00056725  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5734  F0F1 ATP synthase subunit B  23.58 
 
 
156 aa  44.3  0.0007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0047382  normal  0.395212 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1057  F0F1 ATP synthase subunit B  31.45 
 
 
166 aa  43.9  0.0007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5299  F0F1 ATP synthase subunit B  25 
 
 
156 aa  44.3  0.0007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.329705  normal  0.143004 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4493  ATP synthase F0, B subunit  27.86 
 
 
179 aa  43.9  0.0007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4902  F0F1 ATP synthase subunit B  22.66 
 
 
156 aa  43.9  0.0007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000735989  normal  0.257522 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>