240 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A9601_16001 on replicon NC_008816
Organism: Prochlorococcus marinus str. AS9601



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009091  P9301_15831  putative permease  90.52 
 
 		 401 aa  727    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0944857  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16001  putative permease  100 
 
 		 401 aa  794    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.245859  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1482  putative permease  76.19 
 
 		 400 aa  621  1e-177  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0253141  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15721  putative permease  57.03 
 
 		 386 aa  448  1e-125  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.868052  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16801  putative permease  55.5 
 
 		 403 aa  427  1e-118  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.636863 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09981  putative permease  52.97 
 
 		 401 aa  423  1e-117  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.341989 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1232  permease  51.81 
 
 		 384 aa  403  1e-111  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0170  putative permease  50.89 
 
 		 395 aa  361  1e-98  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.736703  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08021  putative permease  50.77 
 
 		 395 aa  358  9.999999999999999e-98  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1247  permease  46.25 
 
 		 386 aa  318  1e-85  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0512  hypothetical protein  38.38 
 
 		 394 aa  315  8e-85  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1637  permease YjgP/YjgQ  37.69 
 
 		 391 aa  277  2e-73  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0299198  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3752  permease YjgP/YjgQ family protein  37.47 
 
 		 388 aa  275  8e-73  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.994672 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0538  permease YjgP/YjgQ  35.36 
 
 		 392 aa  261  2e-68  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.914546  decreased coverage  0.0076294 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0138  permease YjgP/YjgQ family protein  37.17 
 
 		 395 aa  259  8e-68  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2122  permease YjgP/YjgQ family protein  38.84 
 
 		 393 aa  257  2e-67  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0135  permease YjgP/YjgQ family protein  37.17 
 
 		 395 aa  257  2e-67  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000106292 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2169  permease YjgP/YjgQ family protein  38.84 
 
 		 393 aa  257  2e-67  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.330163  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4390  permease YjgP/YjgQ family protein  35.73 
 
 		 391 aa  255  1.0000000000000001e-66  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1837  permease YjgP/YjgQ family protein  33.51 
 
 		 434 aa  239  8e-62  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1512  permease YjgP/YjgQ family protein  33.77 
 
 		 374 aa  238  2e-61  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2508  permease YjgP/YjgQ family protein  32.8 
 
 		 389 aa  216  7e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.756055 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17490  permease YjgP/YjgQ family protein  28.46 
 
 		 365 aa  169  7e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1288  permease YjgP/YjgQ family protein  25.2 
 
 		 356 aa  141  1.9999999999999998e-32  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.030814  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3734  permease YjgP/YjgQ family protein  26.91 
 
 		 389 aa  135  1.9999999999999998e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000306059  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3407  permease YjgP/YjgQ family protein  30.26 
 
 		 391 aa  133  6.999999999999999e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.134453  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1249  permease YjgP/YjgQ  26.32 
 
 		 418 aa  131  2.0000000000000002e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000103776  hitchhiker  0.00076385 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1307  permease YjgP/YjgQ family protein  26.13 
 
 		 356 aa  129  8.000000000000001e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3469  permease YjgP/YjgQ family protein  31.25 
 
 		 391 aa  129  1.0000000000000001e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1638  permease YjgP/YjgQ family protein  27.52 
 
 		 382 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000229527  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17610  permease YjgP/YjgQ family protein  27.7 
 
 		 1040 aa  115  1.0000000000000001e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1922  hypothetical protein  25.4 
 
 		 399 aa  113  5e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1431  permease YjgP/YjgQ family protein  24.67 
 
 		 391 aa  106  7e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1432  permease YjgP/YjgQ family protein  24.47 
 
 		 359 aa  105  2e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1030  permease YjgP/YjgQ family protein  24.31 
 
 		 1061 aa  103  5e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1090  permease YjgP/YjgQ family protein  24.03 
 
 		 1061 aa  101  2e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0453768  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1695  permease YjgP/YjgQ family protein  22.89 
 
 		 361 aa  100  4e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1922  hypothetical protein  26.3 
 
 		 418 aa  99.4  1e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.1714400000000003e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0189  permease YjgP/YjgQ family protein  25.07 
 
 		 423 aa  99  1e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.437061  normal  0.771409 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1515  YjgP/YjgQ family protein  24.56 
 
 		 792 aa  97.1  4e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0309  permease YjgP/YjgQ family protein  23.53 
 
 		 417 aa  94.4  3e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2021  permease YjgP/YjgQ family protein  25.58 
 
 		 369 aa  93.6  5e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0466921 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1352  permease YjgP/YjgQ family protein  24.46 
 
 		 1153 aa  93.6  6e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.929762  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1417  permease YjgP/YjgQ family protein  23.06 
 
 		 384 aa  93.2  7e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0409  permease YjgP/YjgQ family protein  23.5 
 
 		 360 aa  92.4  1e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0389  hypothetical protein  21.35 
 
 		 360 aa  91.7  2e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.534497 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1248  permease YjgP/YjgQ  22.32 
 
 		 359 aa  90.1  6e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000476298  hitchhiker  0.00398949 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0824  permease YjgP/YjgQ family protein  22.99 
 
 		 444 aa  90.1  6e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00713526  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2734  permease YjgP/YjgQ family protein  25.14 
 
 		 364 aa  89  2e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.121109  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2588  permease YjgP/YjgQ family protein  25.33 
 
 		 359 aa  88.2  2e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.199105  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1923  hypothetical protein  23.1 
 
 		 358 aa  86.3  8e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.765584  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1923  hypothetical protein  22.54 
 
 		 362 aa  86.3  8e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  6.24425e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2369  permease YjgP/YjgQ family protein  24.3 
 
 		 359 aa  86.3  9e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.792203  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0302  hypothetical protein  22.11 
 
 		 359 aa  85.5  0.000000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0148  permease YjgP/YjgQ family protein  23.34 
 
 		 364 aa  85.5  0.000000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.496142  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3735  permease YjgP/YjgQ family protein  23.69 
 
 		 359 aa  85.5  0.000000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00300614  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2033  permease YjgP/YjgQ family protein  22.51 
 
 		 360 aa  84.3  0.000000000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.971288 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3408  permease YjgP/YjgQ family protein  21.37 
 
 		 360 aa  83.6  0.000000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.328575  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2677  permease YjgP/YjgQ family protein  23.62 
 
 		 392 aa  83.6  0.000000000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00342239  normal  0.643957 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3470  permease YjgP/YjgQ family protein  22.46 
 
 		 360 aa  82.8  0.000000000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2733  permease YjgP/YjgQ family protein  25.68 
 
 		 360 aa  81.6  0.00000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.193527  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0157  permease YjgP/YjgQ family protein  23.55 
 
 		 1111 aa  81.3  0.00000000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.0000684055  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0188  permease YjgP/YjgQ family protein  21.58 
 
 		 360 aa  81.3  0.00000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.258028  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0318  permease YjgP/YjgQ family protein  21.82 
 
 		 363 aa  80.9  0.00000000000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.341931 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1543  permease YjgP/YjgQ family protein  21.75 
 
 		 1096 aa  80.9  0.00000000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00918394  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0220  permease YjgP/YjgQ  22.69 
 
 		 356 aa  80.5  0.00000000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.633981 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2026  permease YjgP/YjgQ family protein  27.53 
 
 		 358 aa  80.1  0.00000000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.507643  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0376  permease YjgP/YjgQ family protein  26.15 
 
 		 379 aa  79.7  0.00000000000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.116859 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1948  permease, putative  25.78 
 
 		 397 aa  77.4  0.0000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00215493  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1425  permease YjgP/YjgQ family protein  23.89 
 
 		 380 aa  77.4  0.0000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.308886  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1831  permease YjgP/YjgQ family protein  24.23 
 
 		 387 aa  77.4  0.0000000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0437  hypothetical protein  21.74 
 
 		 443 aa  76.6  0.0000000000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0112  permease YjgP/YjgQ family protein  23.47 
 
 		 370 aa  75.9  0.000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.378963  hitchhiker  0.000636313 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2512  permease YjgP/YjgQ family protein  21.33 
 
 		 394 aa  74.7  0.000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0501  hypothetical protein  22.81 
 
 		 360 aa  73.6  0.000000000006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.183407 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2589  permease YjgP/YjgQ family protein  26.42 
 
 		 379 aa  73.2  0.000000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00221006  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0723  hypothetical protein  21 
 
 		 442 aa  72.8  0.00000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.20608  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2678  permease YjgP/YjgQ family protein  20.54 
 
 		 371 aa  71.2  0.00000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000197081  normal  0.64085 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0048  permease YjgP/YjgQ  21.71 
 
 		 352 aa  70.9  0.00000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.71316 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1627  permease YjgP/YjgQ family protein  19.57 
 
 		 403 aa  68.6  0.0000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00813484  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1462  permease YjgP/YjgQ family protein  25 
 
 		 495 aa  68.2  0.0000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1323  permease YjgP/YjgQ family protein  23.62 
 
 		 478 aa  65.9  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.976143 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0495  permease YjgP/YjgQ  23.4 
 
 		 366 aa  64.7  0.000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1901  permease YjgP/YjgQ family protein  19.43 
 
 		 441 aa  64.3  0.000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1627  permease YjgP/YjgQ family protein  28.79 
 
 		 441 aa  63.5  0.000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1297  permease YjgP/YjgQ family protein  23.99 
 
 		 358 aa  63.5  0.000000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0266045  normal  0.200906 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1949  permease, putative  20.52 
 
 		 359 aa  63.2  0.000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000528059  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1043  hypothetical protein  23.3 
 
 		 377 aa  62.4  0.00000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0296445  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2176  permease YjgP/YjgQ  21.43 
 
 		 402 aa  62.8  0.00000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.668049 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4236  permease YjgP/YjgQ family protein  23.4 
 
 		 371 aa  62.4  0.00000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.275706  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0940  permease YjgP/YjgQ family protein  20.6 
 
 		 442 aa  62.4  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1044  hypothetical protein  21.96 
 
 		 357 aa  61.2  0.00000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000929765  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1746  permease YjgP/YjgQ  21.87 
 
 		 370 aa  61.2  0.00000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.108168  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1984  permease YjgP/YjgQ family protein  32.26 
 
 		 501 aa  60.8  0.00000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000194355  normal  0.0100498 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0241  permease YjgP/YjgQ family protein  30.11 
 
 		 481 aa  60.5  0.00000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3562  permease YjgP/YjgQ family protein  24.89 
 
 		 480 aa  60.5  0.00000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.326279 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1272  hypothetical protein  23.65 
 
 		 375 aa  60.1  0.00000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1402  permease YjgP/YjgQ family protein  19.05 
 
 		 370 aa  60.5  0.00000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.999053 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1639  permease YjgP/YjgQ family protein  21.37 
 
 		 359 aa  59.7  0.00000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000266176  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1909  permease YjgP/YjgQ  20.84 
 
 		 354 aa  58.9  0.0000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>