More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A9601_15501 on replicon NC_008816
Organism: Prochlorococcus marinus str. AS9601



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008816  A9601_15501  metallo-beta-lactamase superfamily protein  100 
 
 
312 aa  642    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15351  metallo-beta-lactamase superfamily protein  94.87 
 
 
312 aa  610  9.999999999999999e-175  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1447  RNAse Z  92.63 
 
 
312 aa  582  1.0000000000000001e-165  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15101  metallo-beta-lactamase superfamily protein  83.01 
 
 
312 aa  543  1e-153  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0920  RNAse Z  61.09 
 
 
314 aa  416  9.999999999999999e-116  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17761  metallo-beta-lactamase superfamily protein  60.45 
 
 
314 aa  411  1e-114  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.529395  normal  0.726567 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14031  metallo-beta-lactamase superfamily protein  55.77 
 
 
327 aa  398  9.999999999999999e-111  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.694516  normal  0.113121 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0532  ribonuclease Z  55.91 
 
 
319 aa  398  9.999999999999999e-111  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.145075  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2145  RNAse Z  53.04 
 
 
319 aa  382  1e-105  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.131519 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2011  ribonuclease Z  52.73 
 
 
393 aa  382  1e-105  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05331  beta-lactamase superfamily hydrolase  55.31 
 
 
318 aa  383  1e-105  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2503  ribonuclease Z  54.98 
 
 
314 aa  380  1e-104  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.638997 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3611  ribonuclease Z  54.98 
 
 
314 aa  380  1e-104  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0641  ribonuclease Z  54.34 
 
 
321 aa  375  1e-103  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.56652  decreased coverage  0.00172895 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4523  ribonuclease Z  52.09 
 
 
315 aa  369  1e-101  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0967083  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2403  ribonuclease Z  51.77 
 
 
345 aa  366  1e-100  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.335232  hitchhiker  0.0000263844 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1179  ribonuclease Z  51.28 
 
 
318 aa  355  5e-97  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.777962 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5044  ribonuclease Z  50.16 
 
 
320 aa  343  2e-93  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.574405  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0349  ribonuclease Z  43.91 
 
 
307 aa  296  2e-79  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2276  ribonuclease Z  45.28 
 
 
308 aa  293  4e-78  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000139422  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3973  ribonuclease Z  43.65 
 
 
307 aa  280  3e-74  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0659  ribonuclease Z  42.63 
 
 
309 aa  279  4e-74  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.089983  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4250  ribonuclease Z  43.65 
 
 
307 aa  278  8e-74  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3895  ribonuclease Z  43 
 
 
307 aa  275  5e-73  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4210  ribonuclease Z  43 
 
 
307 aa  275  6e-73  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4274  ribonuclease Z  43 
 
 
307 aa  275  6e-73  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0985  ribonuclease Z  43.32 
 
 
307 aa  275  6e-73  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4049  ribonuclease Z  42.67 
 
 
307 aa  273  2.0000000000000002e-72  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3887  ribonuclease Z  42.67 
 
 
307 aa  273  2.0000000000000002e-72  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4364  ribonuclease Z  42.67 
 
 
307 aa  273  2.0000000000000002e-72  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4164  ribonuclease Z  42.67 
 
 
307 aa  273  2.0000000000000002e-72  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2837  ribonuclease Z  43 
 
 
307 aa  273  4.0000000000000004e-72  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0874  beta-lactamase superfamily hydrolase  42.63 
 
 
309 aa  267  2e-70  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00519626 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1475  beta-lactamase superfamily hydrolase  41.51 
 
 
318 aa  262  6e-69  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1210  ribonuclease Z  41.99 
 
 
309 aa  253  2.0000000000000002e-66  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1193  ribonuclease Z  40.69 
 
 
309 aa  253  3e-66  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2647  ribonuclease Z  40.58 
 
 
305 aa  249  3e-65  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.313305  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02195  ribonuclease Z  40.58 
 
 
305 aa  249  4e-65  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1389  ribonuclease BN  40.58 
 
 
311 aa  249  4e-65  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.471365  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1380  ribonuclease Z  40.58 
 
 
305 aa  249  4e-65  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.867836 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02154  hypothetical protein  40.58 
 
 
305 aa  249  4e-65  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.871793  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2414  ribonuclease Z  40.58 
 
 
305 aa  249  4e-65  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.36621  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2565  ribonuclease Z  40.26 
 
 
305 aa  247  1e-64  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.848275  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2424  ribonuclease Z  39.61 
 
 
311 aa  248  1e-64  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.94801  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2818  ribonuclease Z  40.45 
 
 
305 aa  247  2e-64  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.99083 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3410  ribonuclease Z  39.94 
 
 
311 aa  246  3e-64  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.109803  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2542  ribonuclease Z  38.64 
 
 
341 aa  244  9.999999999999999e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.144505  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2553  ribonuclease Z  38.64 
 
 
305 aa  243  1.9999999999999999e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2657  ribonuclease Z  38.64 
 
 
305 aa  243  1.9999999999999999e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2449  ribonuclease Z  38.64 
 
 
305 aa  243  1.9999999999999999e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2497  ribonuclease Z  38.64 
 
 
341 aa  243  3e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.883053  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0010  ribonuclease Z  40.06 
 
 
304 aa  243  3.9999999999999997e-63  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1071  beta-lactamase superfamily hydrolase  38.85 
 
 
325 aa  233  2.0000000000000002e-60  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.116207  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0654  ribonuclease Z  39.49 
 
 
307 aa  233  4.0000000000000004e-60  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.296839  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0647  ribonuclease Z  39.1 
 
 
313 aa  232  6e-60  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.834913  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_12268  predicted protein  41.33 
 
 
311 aa  224  1e-57  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.812865  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0417  ribonuclease Z  36.21 
 
 
326 aa  212  7e-54  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2102  ribonuclease Z  35.05 
 
 
305 aa  202  8e-51  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2169  ribonuclease Z  34.18 
 
 
323 aa  200  3e-50  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0974694  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2187  ribonuclease Z  36.58 
 
 
307 aa  198  1.0000000000000001e-49  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0679584  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1066  AtsA/ElaC family protein  34.5 
 
 
306 aa  197  2.0000000000000003e-49  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.583999  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4033  ribonuclease Z  34.84 
 
 
319 aa  196  3e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.299532  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1789  ribonuclease Z  34.73 
 
 
305 aa  194  2e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.785437 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3634  ribonuclease Z  35.19 
 
 
319 aa  194  2e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1805  ribonuclease Z  34.15 
 
 
319 aa  193  4e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.426345  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1067  ribonuclease Z  36.58 
 
 
306 aa  193  4e-48  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.222642 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4543  ribonuclease Z  34.41 
 
 
301 aa  192  8e-48  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1592  ribonuclease Z  32.47 
 
 
306 aa  191  1e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.359546  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1561  ribonuclease Z  32.47 
 
 
306 aa  191  1e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1870  ribonuclease Z  33.33 
 
 
309 aa  185  9e-46  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6632  beta-lactamase domain protein  35.31 
 
 
302 aa  184  1.0000000000000001e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1866  beta-lactamase domain protein  34.32 
 
 
303 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0927  ribonuclease Z  32.48 
 
 
305 aa  183  3e-45  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1839  ribonuclease Z  32.26 
 
 
321 aa  181  1e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.885199  normal  0.0537997 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0053  ribonuclease Z  32.32 
 
 
314 aa  181  1e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4169  ribonuclease Z  31.73 
 
 
314 aa  181  1e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.406356  normal  0.0568624 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1776  ribonuclease Z  33.65 
 
 
299 aa  180  2e-44  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0430  ribonuclease Z  32.81 
 
 
318 aa  181  2e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0076  ribonuclease Z  33.11 
 
 
310 aa  181  2e-44  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.887393  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0401  ribonuclease Z  32.49 
 
 
305 aa  180  2.9999999999999997e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1951  ribonuclease Z  32.9 
 
 
308 aa  179  4.999999999999999e-44  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00782694  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1424  ribonuclease Z  35.29 
 
 
308 aa  179  5.999999999999999e-44  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0429  ribonuclease Z  33.12 
 
 
318 aa  179  8e-44  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0738  ribonuclease Z  33.77 
 
 
304 aa  178  9e-44  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0727  ribonuclease Z  35.56 
 
 
322 aa  176  3e-43  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.176511  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0015  ribonuclease Z  33.75 
 
 
315 aa  175  8e-43  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.134703  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3197  ribonuclease Z  33.12 
 
 
328 aa  173  3.9999999999999995e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1716  ribonuclease Z  34.38 
 
 
316 aa  172  9e-42  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10313  ribonuclease Z  35.08 
 
 
301 aa  172  1e-41  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1591  ribonuclease Z  35.66 
 
 
312 aa  171  1e-41  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.125239 
 
 
-
 
NC_002950  PG0739  ribonuclease Z  33.01 
 
 
304 aa  171  2e-41  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1749  ribonuclease Z  35.36 
 
 
308 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0713  ribonuclease Z  34.64 
 
 
314 aa  164  3e-39  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1973  ribonuclease Z  33.23 
 
 
313 aa  163  3e-39  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.32417 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0153  ribonuclease Z  32.28 
 
 
310 aa  163  4.0000000000000004e-39  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.585164  normal  0.015686 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1720  beta-lactamase-like  29.71 
 
 
373 aa  163  4.0000000000000004e-39  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.869413  normal  0.797394 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1365  hypothetical protein  33.65 
 
 
312 aa  159  6e-38  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00000739768  hitchhiker  0.0000000312864 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2014  ribonuclease Z  34.62 
 
 
291 aa  159  8e-38  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.426384  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1554  ribonuclease Z  31.8 
 
 
317 aa  155  6e-37  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1914  ribonuclease Z  33.55 
 
 
313 aa  154  1e-36  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.552811  normal  0.18224 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>