27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A9601_09551 on replicon NC_008816
Organism: Prochlorococcus marinus str. AS9601



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008816  A9601_09551  photosystem I PsaK protein (subunit X)  100 
 
 
86 aa  175  2e-43  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0409099  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09531  photosystem I PsaK protein (subunit X)  98.84 
 
 
86 aa  173  9e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.437179  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0894  photosystem I PsaK protein (subunit X)  89.53 
 
 
86 aa  159  9e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08541  photosystem I PsaK protein (subunit X)  81.4 
 
 
86 aa  150  5.9999999999999996e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00120568 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0301  photosystem I PsaK protein (subunit X)  77.91 
 
 
86 aa  146  9e-35  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.332819  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09731  photosystem I PsaK protein (subunit X)  77.91 
 
 
86 aa  146  9e-35  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.438982 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09891  photosystem I PsaK protein (subunit X)  77.01 
 
 
87 aa  142  2e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15351  photosystem I PsaK protein (subunit X)  69.77 
 
 
86 aa  131  3.9999999999999996e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.259314 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1071  photosystem I reaction center subunit X  58.14 
 
 
89 aa  108  3e-23  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1428  photosystem I reaction center subunit X  59.3 
 
 
88 aa  105  2e-22  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.967058  normal  0.0588149 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0557  photosystem I reaction center subunit PsaK  46.51 
 
 
86 aa  85.1  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.38078  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0920  photosystem I reaction center  48.1 
 
 
84 aa  75.5  0.0000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2914  photosystem I reaction center subunit X  48.24 
 
 
88 aa  72.8  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.028613  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3207  photosystem I reaction center subunit X  48.24 
 
 
88 aa  72.8  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2445  photosystem I reaction center subunit X  35.71 
 
 
86 aa  65.9  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0288285  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5124  photosystem I reaction center subunit PsaK  35.71 
 
 
86 aa  63.9  0.0000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0293041  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4846  photosystem I reaction center subunit X  45.35 
 
 
86 aa  62.4  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3921  photosystem I psaG/psaK protein  34.07 
 
 
93 aa  55.5  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.682205  normal  0.4632 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0867  photosystem I reaction center subunit X  47.5 
 
 
89 aa  50.4  0.000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0364  photosystem I reaction center subunit PsaK  34.44 
 
 
90 aa  48.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0407  photosystem I reaction center subunit X  32.91 
 
 
80 aa  48.1  0.00004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0741  photosystem I reaction center subunit PsaK  35.21 
 
 
87 aa  43.9  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.167381  normal  0.0747979 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2539  hypothetical protein  35 
 
 
84 aa  43.9  0.0008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0469  photosystem I reaction center subunit PsaK  31.33 
 
 
91 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.141782  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3379  photosystem I reaction center subunit PsaK  33.75 
 
 
84 aa  41.2  0.005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.0000107099  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0456  photosystem I reaction center subunit PsaK  30.12 
 
 
91 aa  40.4  0.008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0875  photosystem I reaction center subunit X-like protein  31.11 
 
 
97 aa  40.4  0.008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000037404 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>