More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A9601_08971 on replicon NC_008816
Organism: Prochlorococcus marinus str. AS9601



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009091  P9301_08951  glycoside hydrolase family protein  94.71 
 
 		 586 aa  1117    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.497034  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0246  alpha amylase domain-containing protein  54.31 
 
 		 583 aa  648    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0838  alpha amylase domain-containing protein  90.44 
 
 		 586 aa  1063    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09141  glycoside hydrolase family protein  53.98 
 
 		 583 aa  649    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000264002 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_06751  glycoside hydrolase family protein  58.82 
 
 		 578 aa  687    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.335085 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10441  glycoside hydrolase family protein  80.03 
 
 		 589 aa  980    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08971  glycoside hydrolase family protein  100 
 
 		 586 aa  1201    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.540308  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2243  alpha amylase domain-containing protein  49.39 
 
 		 575 aa  600  1e-170  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2606  alpha amylase domain-containing protein  50 
 
 		 575 aa  565  1.0000000000000001e-159  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.281377 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2566  alpha amylase, catalytic region  36.76 
 
 		 578 aa  406  1.0000000000000001e-112  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0104089  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2573  alpha amylase, catalytic region  36.76 
 
 		 578 aa  406  1.0000000000000001e-112  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.000337914  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2580  alpha amylase, catalytic region  36.76 
 
 		 578 aa  406  1.0000000000000001e-112  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.008896  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1771  alpha amylase catalytic region  38 
 
 		 585 aa  404  1e-111  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.232326  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3210  sucrose phosphorylase  35.67 
 
 		 596 aa  393  1e-108  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02161  putative sucrose phosphorylase  35.64 
 
 		 584 aa  388  1e-106  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2164  alpha amylase, catalytic region  37.31 
 
 		 586 aa  387  1e-106  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.659302  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1824  putative sucrose phosphorylase  36.22 
 
 		 587 aa  380  1e-104  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.552548  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2600  sucrose phosphorylase  35.48 
 
 		 591 aa  382  1e-104  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0436867 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0418  alpha amylase, catalytic region  35.24 
 
 		 577 aa  375  1e-102  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.537622  normal  0.197095 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2846  alpha amylase, catalytic region  34.96 
 
 		 581 aa  368  1e-100  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.218279  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2588  alpha amylase  34.68 
 
 		 598 aa  358  1.9999999999999998e-97  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0774  Alpha amylase, catalytic region  36.05 
 
 		 589 aa  357  2.9999999999999997e-97  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0506  putative sucrose phosphorylase  36.6 
 
 		 544 aa  353  4e-96  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0665  alpha amylase catalytic region  38.01 
 
 		 555 aa  350  4e-95  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.694695  normal  0.614349 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3029  alpha amylase catalytic subunit  35.8 
 
 		 556 aa  349  1e-94  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.172997 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1523  alpha amylase catalytic region  37.3 
 
 		 561 aa  346  8.999999999999999e-94  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.346384  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1248  alpha amylase catalytic region  32.11 
 
 		 568 aa  331  2e-89  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.55232  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1813  alpha amylase family protein  32.97 
 
 		 559 aa  330  6e-89  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.653374 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1424  alpha amylase family protein  33.03 
 
 		 559 aa  326  8.000000000000001e-88  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2337  alpha amylase catalytic region  32.85 
 
 		 559 aa  325  1e-87  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0459721  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01286  predicted glucosyltransferase  33.83 
 
 		 559 aa  325  2e-87  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2316  alpha amylase catalytic region  33.83 
 
 		 559 aa  325  2e-87  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.278573  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1519  alpha amylase family protein  33.83 
 
 		 559 aa  325  2e-87  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2165  alpha amylase, catalytic region  33.83 
 
 		 565 aa  308  1.0000000000000001e-82  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0993887 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3361  alpha amylase catalytic region  28.67 
 
 		 491 aa  170  9e-41  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00605646 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0232  sucrose phosphorylase  27.31 
 
 		 493 aa  163  8.000000000000001e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.528502  normal  0.696528 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1331  sucrose phosphorylase  25.83 
 
 		 508 aa  163  9e-39  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.00201506  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0066  sucrose phosphorylase  26.46 
 
 		 492 aa  159  1e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.530318  hitchhiker  0.00316152 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0066  sucrose phosphorylase  27.19 
 
 		 494 aa  159  2e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000218626 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0061  sucrose phosphorylase  26.46 
 
 		 492 aa  158  3e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4288  sucrose phosphorylase  26.46 
 
 		 492 aa  157  3e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00965772  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0065  sucrose phosphorylase  26.23 
 
 		 492 aa  157  6e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0064  sucrose phosphorylase  26.74 
 
 		 494 aa  155  2e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000722293 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0062  sucrose phosphorylase  26.68 
 
 		 494 aa  155  2e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0945971  unclonable  0.0000350237 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3990  sucrose phosphorylase  25 
 
 		 493 aa  152  1e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00149762  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0241  Sucrose phosphorylase  25.49 
 
 		 483 aa  150  5e-35  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0972  alpha amylase catalytic region  25.76 
 
 		 644 aa  147  7.0000000000000006e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.216915 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1542  sucrose phosphorylase  24.15 
 
 		 485 aa  140  7.999999999999999e-32  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.296567  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0572  alpha amylase, catalytic region  24.58 
 
 		 650 aa  139  2e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1799  alpha amylase catalytic region  23.92 
 
 		 534 aa  138  3.0000000000000003e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1779  glycosidase  22.69 
 
 		 489 aa  138  3.0000000000000003e-31  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0384  glycosidase  25.63 
 
 		 492 aa  138  3.0000000000000003e-31  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.00983965  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02416  alpha-amlyase  26.02 
 
 		 638 aa  137  4e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0651  sucrose phosphorylase  25.7 
 
 		 482 aa  134  3e-30  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0824794  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01971  sucrose phosphorylase  25.44 
 
 		 498 aa  132  2.0000000000000002e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3605  alpha amylase catalytic region  23.33 
 
 		 643 aa  132  2.0000000000000002e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0324  alpha amylase catalytic region  24.04 
 
 		 641 aa  131  3e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1778  trehalose synthase  30.5 
 
 		 558 aa  127  7e-28  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3514  alpha amylase, catalytic region  23.66 
 
 		 651 aa  122  9.999999999999999e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.482546  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3860  alpha amylase catalytic region  25.41 
 
 		 667 aa  122  1.9999999999999998e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0862  trehalose synthase  26.58 
 
 		 598 aa  122  1.9999999999999998e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0678  trehalose synthase  23.48 
 
 		 556 aa  122  1.9999999999999998e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.026654  normal  0.804097 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0738  trehalose synthase  26.91 
 
 		 598 aa  122  3e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.197847  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0330  trehalose synthase  26.84 
 
 		 551 aa  120  4.9999999999999996e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3684  alpha amylase catalytic region  25.31 
 
 		 663 aa  120  6e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1797  Alpha amylase, catalytic region  30.36 
 
 		 651 aa  119  9.999999999999999e-26  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000126302  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3014  trehalose synthase  28.16 
 
 		 1094 aa  119  9.999999999999999e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.602191 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0308  alpha amylase catalytic subunit  23.57 
 
 		 636 aa  118  1.9999999999999998e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3921  trehalose synthase  28.47 
 
 		 1085 aa  119  1.9999999999999998e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2030  alpha amylase, catalytic region  22.69 
 
 		 638 aa  118  3e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.194844  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2828  trehalose synthase  28.21 
 
 		 548 aa  116  1.0000000000000001e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0305  alpha amylase, catalytic region  25.17 
 
 		 646 aa  116  1.0000000000000001e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1336  trehalose synthase  27.34 
 
 		 567 aa  115  2.0000000000000002e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2968  trehalose synthase  24.28 
 
 		 553 aa  114  4.0000000000000004e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2935  trehalose synthase  29.48 
 
 		 1110 aa  114  5e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.820681  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1598  trehalose synthase  28.17 
 
 		 1092 aa  114  5e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0248685 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3322  alpha amylase catalytic region  23.79 
 
 		 672 aa  112  1.0000000000000001e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3263  trehalose synthase  27.72 
 
 		 1121 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1153  alpha amylase catalytic region  22.46 
 
 		 657 aa  111  3e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00213284  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2160  trehalose synthase-like  26.23 
 
 		 1112 aa  111  3e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1630  trehalose synthase  30.28 
 
 		 562 aa  111  3e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.325402 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2914  alpha amylase catalytic region  27.64 
 
 		 650 aa  111  3e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2611  alpha amylase, catalytic region  28.17 
 
 		 650 aa  111  5e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0874  trehalose synthase  28.17 
 
 		 591 aa  110  5e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.847656  normal  0.214789 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3584  trehalose synthase  27.18 
 
 		 601 aa  110  6e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2859  trehalose synthase  27.18 
 
 		 577 aa  110  7.000000000000001e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2713  trehalose synthase  27.46 
 
 		 1088 aa  109  1e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.352676 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5564  alpha-glucosidase  25.14 
 
 		 1100 aa  110  1e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.657284  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1980  trehalose synthase  26.37 
 
 		 1109 aa  109  1e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0525025  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2378  trehalose synthase  23.55 
 
 		 1099 aa  109  1e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2940  trehalose synthase  27.46 
 
 		 1088 aa  109  1e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00795057 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6322  putative trehalose synthase  29.41 
 
 		 1101 aa  110  1e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.319777  normal  0.483748 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2029  alpha amylase domain-containing protein  24.4 
 
 		 1100 aa  109  2e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.269645 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2716  trehalose synthase  26.13 
 
 		 964 aa  109  2e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3483  trehalose synthase-like  25.58 
 
 		 1100 aa  109  2e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4101  trehalose synthase  27.96 
 
 		 610 aa  109  2e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5098  trehalose synthase  26.12 
 
 		 1093 aa  108  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.436768  decreased coverage  0.00978496 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1106  trehalose synthase  27.13 
 
 		 1123 aa  108  2e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2446  putative trehalose synthase  26.5 
 
 		 1102 aa  108  3e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.500894  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0315  trehalose synthase-like protein  26.1 
 
 		 1121 aa  108  3e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>