262 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A9601_08211 on replicon NC_008816
Organism: Prochlorococcus marinus str. AS9601



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007577  PMT9312_0767  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  86.81 
 
 
720 aa  1253    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  decreased coverage  0.00745719  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08241  glycyl-tRNA synthetase beta subunit  69.26 
 
 
719 aa  990    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08211  glycyl-tRNA synthetase beta subunit  100 
 
 
720 aa  1427    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.938458  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08191  glycyl-tRNA synthetase beta subunit  94.58 
 
 
720 aa  1356    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10041  glycyl-tRNA synthetase beta subunit  42.58 
 
 
720 aa  610  1e-173  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.215358  normal  0.629602 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0163  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  45 
 
 
720 aa  592  1e-168  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07951  glycyl-tRNA synthetase beta subunit  44.58 
 
 
720 aa  593  1e-168  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.790247 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1241  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  38.81 
 
 
720 aa  546  1e-154  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.232901  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16721  glycyl-tRNA synthetase beta subunit  40.22 
 
 
721 aa  533  1e-150  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1228  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  38.91 
 
 
723 aa  521  1e-146  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.315931 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2337  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  36.86 
 
 
711 aa  463  1e-129  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2388  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  36.86 
 
 
711 aa  463  1e-129  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4481  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  37.47 
 
 
719 aa  455  1.0000000000000001e-126  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.731924  normal  0.0858499 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0018  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  33.84 
 
 
728 aa  452  1e-125  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.606807 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0794  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  35.26 
 
 
716 aa  448  1.0000000000000001e-124  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.934108  normal  0.0595481 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4816  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  34.67 
 
 
717 aa  419  9.999999999999999e-116  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.642859 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2984  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  34.82 
 
 
733 aa  412  1e-114  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4587  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  33.33 
 
 
731 aa  402  9.999999999999999e-111  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12440  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  34.74 
 
 
686 aa  377  1e-103  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0579  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  33.88 
 
 
687 aa  374  1e-102  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2941  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  34.21 
 
 
686 aa  373  1e-102  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.125162  hitchhiker  0.000287233 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0656  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  33.52 
 
 
687 aa  371  1e-101  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.70031e-23 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1022  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  33.84 
 
 
687 aa  370  1e-101  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.208045  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3059  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  33.89 
 
 
687 aa  370  1e-101  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1208  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  32.83 
 
 
693 aa  368  1e-100  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0414092  normal  0.146925 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0604  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  31.26 
 
 
694 aa  366  1e-100  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3672  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  33.65 
 
 
688 aa  362  2e-98  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0142363  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0642  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  33.79 
 
 
687 aa  361  2e-98  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.91532  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0008  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  31.03 
 
 
692 aa  351  3e-95  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2472  glycine--tRNA ligase  30.55 
 
 
695 aa  347  4e-94  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0180526  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3047  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  31.74 
 
 
698 aa  346  8e-94  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.228214  normal  0.0284837 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3255  Glycine--tRNA ligase  29.78 
 
 
696 aa  345  1e-93  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3726  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  32.41 
 
 
688 aa  345  2e-93  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1733  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  32.6 
 
 
690 aa  343  5e-93  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0335  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  33.94 
 
 
687 aa  343  5e-93  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0741  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  33.19 
 
 
691 aa  343  5e-93  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.143146  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0599  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  31.54 
 
 
688 aa  342  1e-92  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000487119  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00008  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  31.9 
 
 
692 aa  340  4e-92  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0555063  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1248  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  33.61 
 
 
664 aa  340  5e-92  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.295288  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0012  glycine--tRNA ligase  30.72 
 
 
690 aa  340  5.9999999999999996e-92  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.948293  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1369  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  33.47 
 
 
664 aa  339  9e-92  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.183834  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0485  glycine--tRNA ligase  30.45 
 
 
688 aa  339  9.999999999999999e-92  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2445  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  30.07 
 
 
694 aa  338  1.9999999999999998e-91  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0491  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  33.47 
 
 
664 aa  337  2.9999999999999997e-91  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.190343  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3935  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  33 
 
 
680 aa  334  4e-90  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000397713  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4254  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  30.2 
 
 
690 aa  334  4e-90  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1441  glycine--tRNA ligase  29.77 
 
 
700 aa  333  6e-90  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.764176  normal  0.147312 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03410  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  31.03 
 
 
689 aa  331  3e-89  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0152  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  31.03 
 
 
689 aa  331  3e-89  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3761  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  31.03 
 
 
689 aa  331  3e-89  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.677293  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03361  hypothetical protein  31.03 
 
 
689 aa  331  3e-89  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0156  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  31.03 
 
 
689 aa  331  3e-89  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3966  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  31.03 
 
 
689 aa  330  4e-89  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4054  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  31.03 
 
 
689 aa  330  4e-89  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3881  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  31.03 
 
 
689 aa  330  5.0000000000000004e-89  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1515  glycine--tRNA ligase  32.36 
 
 
688 aa  330  6e-89  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0038  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  33.01 
 
 
693 aa  330  6e-89  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.903555  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0355  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  30.41 
 
 
690 aa  329  9e-89  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4934  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  30.9 
 
 
689 aa  328  2.0000000000000001e-88  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.711684 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0043  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  29.74 
 
 
694 aa  328  3e-88  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0006  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  30.83 
 
 
689 aa  326  7e-88  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0061  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  30.07 
 
 
689 aa  325  2e-87  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0207  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  32.55 
 
 
692 aa  325  2e-87  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0479  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  30.18 
 
 
688 aa  323  5e-87  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0011  glycine--tRNA ligase  30.1 
 
 
693 aa  323  6e-87  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.466423 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2116  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  32.41 
 
 
689 aa  322  9.999999999999999e-87  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0993  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  29.78 
 
 
693 aa  321  3e-86  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1197  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  30.82 
 
 
673 aa  320  5e-86  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.28917  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0012  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  30.83 
 
 
689 aa  320  7e-86  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000111985 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4167  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  30.34 
 
 
689 aa  320  7.999999999999999e-86  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3372  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  29.69 
 
 
705 aa  319  1e-85  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.173732  normal  0.25449 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0025  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  30.36 
 
 
689 aa  318  2e-85  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0144037 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4449  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  29.93 
 
 
689 aa  318  3e-85  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3782  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  29.9 
 
 
689 aa  317  4e-85  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4130  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  29.9 
 
 
689 aa  317  4e-85  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0006  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  28.3 
 
 
688 aa  317  4e-85  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0023  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  29.9 
 
 
689 aa  317  4e-85  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1061  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  30.45 
 
 
691 aa  317  4e-85  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0006  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  30.39 
 
 
694 aa  317  4e-85  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2210  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  29.07 
 
 
694 aa  317  4e-85  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.237877 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2581  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  29.07 
 
 
694 aa  317  4e-85  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.595681  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0009  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  30.17 
 
 
689 aa  317  6e-85  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00736647 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0070  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  30.18 
 
 
689 aa  317  6e-85  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.118047  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0163  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  30.48 
 
 
689 aa  316  8e-85  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3931  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  29.05 
 
 
689 aa  316  9.999999999999999e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3977  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  29.05 
 
 
689 aa  316  9.999999999999999e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4037  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  29.05 
 
 
689 aa  316  9.999999999999999e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.414013 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0373  glycine--tRNA ligase  28.59 
 
 
691 aa  315  1.9999999999999998e-84  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.87078  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1092  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  33.93 
 
 
689 aa  315  1.9999999999999998e-84  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3849  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  29.05 
 
 
689 aa  315  1.9999999999999998e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3868  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  29.02 
 
 
689 aa  314  2.9999999999999996e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0006  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  29.88 
 
 
688 aa  313  1e-83  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2965  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  31.51 
 
 
688 aa  311  2e-83  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.425514  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1319  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  32.14 
 
 
689 aa  309  9e-83  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0632  glycine--tRNA ligase  32.61 
 
 
661 aa  307  4.0000000000000004e-82  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.563385  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1115  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  30.87 
 
 
690 aa  307  5.0000000000000004e-82  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.217479  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0540  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  31.2 
 
 
678 aa  307  6e-82  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.792152  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2210  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  28.61 
 
 
697 aa  306  8.000000000000001e-82  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0076  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  30.01 
 
 
683 aa  305  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.589695  hitchhiker  0.000000000290731 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2499  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  30.03 
 
 
688 aa  305  2.0000000000000002e-81  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>