294 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A9601_07831 on replicon NC_008816
Organism: Prochlorococcus marinus str. AS9601



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007577  PMT9312_0733  ATP-dependent DNA ligase  94.14 
 
 		 546 aa  1004    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.12622  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07831  ATP-dependent DNA ligase  100 
 
 		 546 aa  1088    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08591  ATP-dependent DNA ligase  71.59 
 
 		 545 aa  781    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.267229  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07831  ATP-dependent DNA ligase  97.07 
 
 		 546 aa  1058    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.555428  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1462  ATP-dependent DNA ligase  43.11 
 
 		 551 aa  449  1e-125  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0685513 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1583  ATP dependent DNA ligase  40.4 
 
 		 552 aa  451  1e-125  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3449  ATP dependent DNA ligase  40.4 
 
 		 544 aa  451  1e-125  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.422145 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3135  ATP dependent DNA ligase  41.38 
 
 		 584 aa  447  1.0000000000000001e-124  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.519108  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1040  ATP-dependent DNA ligase  41.68 
 
 		 554 aa  442  9.999999999999999e-123  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.081093  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2413  ATP-dependent DNA ligase  39.63 
 
 		 533 aa  428  1e-118  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2589  ATP-dependent DNA ligase  41.56 
 
 		 534 aa  429  1e-118  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00328254 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3524  ATP-dependent DNA ligase  41.65 
 
 		 538 aa  427  1e-118  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.755693 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1076  ATP-dependent DNA ligase  39.26 
 
 		 533 aa  426  1e-118  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1569  ATP-dependent DNA ligase  38.52 
 
 		 532 aa  424  1e-117  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.583345 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3334  ATP dependent DNA ligase  43.23 
 
 		 532 aa  423  1e-117  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6857  ATP dependent DNA ligase  40.41 
 
 		 530 aa  422  1e-117  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.924337  normal  0.118478 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2667  ATP-dependent DNA ligase  39.71 
 
 		 532 aa  415  9.999999999999999e-116  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.256758 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01736  ATP-dependent DNA ligase  38.03 
 
 		 534 aa  416  9.999999999999999e-116  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1105  ATP-dependent DNA ligase  38.94 
 
 		 552 aa  413  1e-114  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.660067 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1145  ATP-dependent DNA ligase  38.94 
 
 		 552 aa  412  1e-114  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.646236 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5292  ATP-dependent DNA ligase  37.66 
 
 		 558 aa  415  1e-114  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1315  ATP-dependent DNA ligase  37 
 
 		 558 aa  410  1e-113  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0693977  normal  0.128717 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4307  ATP-dependent DNA ligase  38.01 
 
 		 552 aa  411  1e-113  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.66248  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2195  ATP-dependent DNA ligase  38.45 
 
 		 552 aa  411  1e-113  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0151417  hitchhiker  0.0044454 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3895  ATP-dependent DNA ligase  37.52 
 
 		 551 aa  407  1.0000000000000001e-112  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2960  ATP-dependent DNA ligase  37.79 
 
 		 535 aa  403  1e-111  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000075537 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4135  DNA ligase, ATP-dependent  37.11 
 
 		 571 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3873  ATP-dependent DNA ligase  37.2 
 
 		 567 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.537943 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1211  ATP-dependent DNA ligase  37.17 
 
 		 562 aa  401  9.999999999999999e-111  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.837533 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4680  ATP-dependent DNA ligase  36.67 
 
 		 561 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.840786  normal  0.137791 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1134  ATP-dependent DNA ligase  38.12 
 
 		 553 aa  402  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.720613  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1518  ATP-dependent DNA ligase  37.68 
 
 		 542 aa  400  9.999999999999999e-111  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.111157  normal  0.0949052 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4859  ATP-dependent DNA ligase  37.25 
 
 		 551 aa  397  1e-109  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.425556  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2562  ATP dependent DNA ligase  39.67 
 
 		 535 aa  394  1e-108  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1755  ATP dependent DNA ligase  40.48 
 
 		 533 aa  391  1e-107  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0306  ATP-dependent DNA ligase  35.55 
 
 		 559 aa  391  1e-107  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.247281  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02270  DNA ligase  40.7 
 
 		 530 aa  387  1e-106  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0311  ATP-dependent DNA ligase  35.39 
 
 		 559 aa  386  1e-106  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.194095 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0375  ATP-dependent DNA ligase  35.24 
 
 		 566 aa  373  1e-102  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3044  ATP-dependent DNA ligase  35.49 
 
 		 563 aa  370  1e-101  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0164872  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0032  ATP-dependent DNA ligase  32.07 
 
 		 536 aa  291  2e-77  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0412  ATP dependent DNA ligase  32.66 
 
 		 514 aa  290  4e-77  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.900501  normal  0.90981 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0290  ATP-dependent DNA ligase  29.54 
 
 		 550 aa  280  4e-74  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.664954 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1611  ATP dependent DNA ligase  30.87 
 
 		 522 aa  276  7e-73  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1071  ATP dependent DNA ligase  32.21 
 
 		 574 aa  271  2e-71  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.088062 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3979  ATP-dependent DNA ligase  29.14 
 
 		 532 aa  270  4e-71  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.379965  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1541  ATP dependent DNA ligase  29.45 
 
 		 570 aa  268  2e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0068  ATP-dependent DNA ligase  29.3 
 
 		 531 aa  267  2.9999999999999995e-70  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6007  ATP-dependent DNA ligase  31.54 
 
 		 539 aa  266  8e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4898  ATP-dependent DNA ligase  30.5 
 
 		 539 aa  265  2e-69  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0628  ATP dependent DNA ligase  29.13 
 
 		 568 aa  263  8e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.639244  decreased coverage  0.00714589 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0751  ATP-dependent DNA ligase  31.58 
 
 		 578 aa  261  2e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.280099 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1470  ATP dependent DNA ligase  30.11 
 
 		 542 aa  261  2e-68  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.997789  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0462  ATP-dependent DNA ligase  30.27 
 
 		 594 aa  256  7e-67  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0915  ATP-dependent DNA ligase  30.73 
 
 		 541 aa  256  8e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.137062  normal  0.18483 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3691  ATP dependent DNA ligase  29.68 
 
 		 572 aa  255  1.0000000000000001e-66  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0803  ATP-dependent DNA ligase  30.62 
 
 		 541 aa  254  3e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.117454 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4044  ATP-dependent DNA ligase  30.04 
 
 		 539 aa  254  3e-66  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0553  ATP-dependent DNA ligase  30.34 
 
 		 561 aa  252  1e-65  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0870  ATP-dependent DNA ligase  29.81 
 
 		 622 aa  252  2e-65  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.140434  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00668  DNA ligase  30.32 
 
 		 576 aa  249  1e-64  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.60466  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2804  ATP-dependent DNA ligase  30.62 
 
 		 537 aa  247  3e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.414276  normal  0.103238 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0793  ATP-dependent DNA ligase  33.77 
 
 		 630 aa  247  4.9999999999999997e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.758441 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0798  ATP-dependent DNA ligase  34.58 
 
 		 648 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.109452  normal  0.0163574 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4617  ATP-dependent DNA ligase  31.62 
 
 		 622 aa  244  3.9999999999999997e-63  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.656205  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3432  ATP dependent DNA ligase  28.22 
 
 		 576 aa  243  7e-63  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0304262  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3237  ATP dependent DNA ligase  27.47 
 
 		 613 aa  236  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.330095  normal  0.222492 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3561  ATP dependent DNA ligase  27.26 
 
 		 614 aa  232  1e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.147448 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4475  DNA ligase I, ATP-dependent (dnl1)  27.61 
 
 		 576 aa  222  9.999999999999999e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3148  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  33.13 
 
 		 1017 aa  182  2e-44  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.331414  normal  0.459978 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1898  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  26.59 
 
 		 592 aa  150  7e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1899  DNA ligase (ATP)  25.79 
 
 		 568 aa  144  5e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.812103  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0864  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  32.23 
 
 		 562 aa  140  7.999999999999999e-32  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0735643  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2438  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  24.04 
 
 		 509 aa  136  9.999999999999999e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.126191  normal  0.0460021 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0844  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  26.62 
 
 		 552 aa  136  9.999999999999999e-31  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0357397  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0293  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  28.1 
 
 		 573 aa  133  6.999999999999999e-30  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.33298  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2781  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  22.71 
 
 		 556 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.543529 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0793  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  29.83 
 
 		 573 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.027506  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1088  DNA ligase I, ATP-dependent (dnl1)  27.74 
 
 		 567 aa  132  2.0000000000000002e-29  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2723  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  25.5 
 
 		 553 aa  132  2.0000000000000002e-29  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.663376 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0608  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  24.83 
 
 		 610 aa  131  3e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1685  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  28.36 
 
 		 573 aa  131  4.0000000000000003e-29  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4321  ATP-dependent DNA ligase  23.56 
 
 		 511 aa  130  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0215  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  29.34 
 
 		 573 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.21738 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2156  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  23.4 
 
 		 550 aa  129  2.0000000000000002e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.521071  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0620  hypothetical protein  22.56 
 
 		 546 aa  125  2e-27  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1865  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  26.49 
 
 		 548 aa  125  2e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0427  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  26.97 
 
 		 531 aa  125  3e-27  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7176  ATP-dependent DNA ligase  23.21 
 
 		 508 aa  123  9e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.207869 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0878  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  25.78 
 
 		 594 aa  122  9.999999999999999e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0334376  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2882  DNA ligase I, ATP-dependent (dnl1)  23.54 
 
 		 547 aa  122  9.999999999999999e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.812327  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0933  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  22.54 
 
 		 522 aa  119  9.999999999999999e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.399541  normal  0.755434 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4301  ATP-dependent DNA ligase  26.67 
 
 		 519 aa  118  3e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.659287 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4586  ATP-dependent DNA ligase  26.18 
 
 		 517 aa  117  3.9999999999999997e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4312  ATP-dependent DNA ligase  23.65 
 
 		 513 aa  117  6e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1425  ATP-dependent DNA ligase  26.39 
 
 		 527 aa  117  6e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.272318 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4290  ATP-dependent DNA ligase  23.95 
 
 		 513 aa  116  7.999999999999999e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1799  ATP-dependent DNA ligase  22.39 
 
 		 520 aa  116  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.07397  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1846  ATP-dependent DNA ligase  22.39 
 
 		 520 aa  116  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.297739  normal  0.661172 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2025  ATP-dependent DNA ligase  22.65 
 
 		 534 aa  115  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.189008  normal  0.878138 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>