More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A9601_07431 on replicon NC_008816
Organism: Prochlorococcus marinus str. AS9601



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008816  A9601_07431  NAD-dependent DNA ligase N-terminus  100 
 
 
249 aa  506  9.999999999999999e-143  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  decreased coverage  0.000724415  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07411  NAD-dependent DNA ligase  95.98 
 
 
249 aa  492  9.999999999999999e-139  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0694  NAD-dependent DNA ligase  90.73 
 
 
249 aa  469  1.0000000000000001e-131  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12471  NAD-dependent DNA ligase N-terminus  61.85 
 
 
251 aa  316  3e-85  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15231  NAD-dependent DNA ligase N-terminus  59.84 
 
 
249 aa  306  3e-82  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.303288  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15631  NAD-dependent DNA ligase N-terminus  49 
 
 
249 aa  251  6e-66  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.637267  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15481  NAD-dependent DNA ligase N-terminus  49.4 
 
 
249 aa  251  8.000000000000001e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.264953  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_11221  NAD-dependent DNA ligase N-terminus  38.57 
 
 
228 aa  146  3e-34  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.587962  hitchhiker  0.00568947 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0424  NAD-dependent DNA ligase N-terminus  38.12 
 
 
228 aa  144  2e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.609704  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_11091  hypothetical protein  30.85 
 
 
200 aa  95.1  1e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00240586 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0413  NAD-dependent DNA ligase  30.85 
 
 
210 aa  93.6  3e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5270  NAD-dependent DNA ligase LigB  27.47 
 
 
558 aa  80.1  0.00000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.27312  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0996  DNA ligase, NAD-dependent  28.52 
 
 
668 aa  73.2  0.000000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4796  NAD-dependent DNA ligase LigB  27.24 
 
 
561 aa  73.2  0.000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0176642 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4148  NAD-dependent DNA ligase LigB  28 
 
 
562 aa  73.2  0.000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.969555  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0683  DNA ligase, NAD-dependent  25.42 
 
 
684 aa  73.2  0.000000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.992096  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4126  NAD-dependent DNA ligase LigB  25.48 
 
 
561 aa  72.8  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3947  NAD-dependent DNA ligase LigB  25.4 
 
 
561 aa  72.8  0.000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00109468 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3956  NAD-dependent DNA ligase LigB  25.81 
 
 
561 aa  72.4  0.000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04740  DNA ligase, NAD-dependent  28.57 
 
 
725 aa  72  0.000000000008  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.113755  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5017  NAD-dependent DNA ligase LigB  28 
 
 
577 aa  72  0.000000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4065  NAD-dependent DNA ligase LigB  25.81 
 
 
561 aa  72  0.000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03504  NAD-dependent DNA ligase LigB  27.6 
 
 
560 aa  71.6  0.00000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0058  DNA ligase (NAD(+))  27.6 
 
 
560 aa  71.6  0.00000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0382  DNA ligase, NAD-dependent, putative  26.5 
 
 
561 aa  71.6  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0064  NAD-dependent DNA ligase LigB  27.6 
 
 
560 aa  71.6  0.00000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.199825  hitchhiker  0.000414581 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4019  NAD-dependent DNA ligase LigB  25.78 
 
 
561 aa  71.6  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03456  hypothetical protein  27.6 
 
 
560 aa  71.6  0.00000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3981  NAD-dependent DNA ligase LigB  27.34 
 
 
560 aa  70.9  0.00000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0453  NAD-dependent DNA ligase LigB  25.18 
 
 
562 aa  70.5  0.00000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1518  NAD-dependent DNA ligase LigB  25.87 
 
 
629 aa  70.5  0.00000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.0000466124  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0313  NAD-dependent DNA ligase LigA  30.33 
 
 
676 aa  69.3  0.00000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0498  NAD-dependent DNA ligase LigB  25.83 
 
 
567 aa  69.3  0.00000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.436093  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3858  NAD-dependent DNA ligase LigB  27.6 
 
 
562 aa  69.3  0.00000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0092  NAD-dependent DNA ligase LigB  27.76 
 
 
556 aa  68.9  0.00000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0335  NAD-dependent DNA ligase LigA  28.99 
 
 
669 aa  68.6  0.00000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21501  NAD-dependent DNA ligase  28.7 
 
 
690 aa  67.4  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.786913 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1279  NAD-dependent DNA ligase  29.17 
 
 
690 aa  67.8  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.880494  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0182  DNA ligase, NAD-dependent  26.32 
 
 
681 aa  67  0.0000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0378  NAD-dependent DNA ligase LigA  28.5 
 
 
669 aa  67  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1508  DNA ligase, NAD-dependent  28.91 
 
 
690 aa  67.4  0.0000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000647513  hitchhiker  0.000000119836 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0275  NAD-dependent DNA ligase  28.08 
 
 
667 aa  66.6  0.0000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3950  DNA ligase, NAD-dependent  27.78 
 
 
684 aa  67  0.0000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1227  DNA ligase, NAD-dependent  29.41 
 
 
656 aa  66.6  0.0000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0810  DNA ligase, NAD-dependent  29.81 
 
 
673 aa  66.2  0.0000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4968  NAD-dependent DNA ligase LigB  23.99 
 
 
566 aa  65.9  0.0000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0712  DNA ligase, NAD-dependent  31.19 
 
 
668 aa  65.9  0.0000000006  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1554  DNA ligase, NAD-dependent  25.91 
 
 
664 aa  65.5  0.0000000007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.344764  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3660  DNA ligase, NAD-dependent  28.39 
 
 
681 aa  65.5  0.0000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0589668  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03590  NAD-dependent DNA ligase LigB  25.37 
 
 
560 aa  65.5  0.0000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.145228  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4248  NAD-dependent DNA ligase LigA  29.28 
 
 
712 aa  65.5  0.0000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0769437  normal  0.764514 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5017  NAD-dependent DNA ligase LigB  23.6 
 
 
566 aa  65.5  0.0000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.581367 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1511  DNA ligase, NAD-dependent  27.15 
 
 
662 aa  65.5  0.0000000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0217425  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1575  DNA ligase, NAD-dependent  28.91 
 
 
690 aa  65.5  0.0000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0209027  unclonable  0.0000429666 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0286  NAD-dependent DNA ligase LigA  28.99 
 
 
669 aa  65.5  0.0000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1569  DNA ligase, NAD-dependent  28.91 
 
 
691 aa  65.5  0.0000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0515781  unclonable  0.000000000191104 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3418  DNA ligase, NAD-dependent  29.41 
 
 
674 aa  65.1  0.0000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1117  DNA ligase, NAD-dependent  26.87 
 
 
673 aa  65.1  0.000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.62969  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2883  DNA ligase, NAD-dependent  27.54 
 
 
678 aa  65.1  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.745192 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0562  NAD-dependent DNA ligase LigA  30.15 
 
 
660 aa  65.1  0.000000001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0449275  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3071  DNA ligase, NAD-dependent  28.51 
 
 
704 aa  65.1  0.000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.678716  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0352  NAD-dependent DNA ligase LigA  28.02 
 
 
669 aa  63.9  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0292  NAD-dependent DNA ligase LigA  28.02 
 
 
669 aa  64.3  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0276  NAD-dependent DNA ligase LigA  28.02 
 
 
669 aa  64.3  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0279  NAD-dependent DNA ligase LigA  28.02 
 
 
669 aa  63.9  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0271  NAD-dependent DNA ligase LigA  29.27 
 
 
670 aa  64.3  0.000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29061  NAD-dependent DNA ligase LigA  29.36 
 
 
696 aa  64.3  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0306  NAD-dependent DNA ligase LigA  28.02 
 
 
669 aa  64.3  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4968  NAD-dependent DNA ligase LigA  28.02 
 
 
669 aa  63.9  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2316  NAD-dependent DNA ligase LigA  30.33 
 
 
774 aa  64.3  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.444372  normal  0.080689 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0337  NAD-dependent DNA ligase LigA  28.02 
 
 
669 aa  64.3  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2896  DNA ligase, NAD-dependent  29.11 
 
 
689 aa  63.2  0.000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0693  DNA ligase, NAD-dependent  28.77 
 
 
687 aa  63.5  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.600829  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4841  NAD-dependent DNA ligase LigB  23.62 
 
 
566 aa  63.5  0.000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.596764  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1111  DNA ligase, NAD-dependent  28.57 
 
 
705 aa  63.2  0.000000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.878311  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2205  DNA ligase, NAD-dependent  28.84 
 
 
708 aa  63.2  0.000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2552  NAD-dependent DNA ligase LigA  28.44 
 
 
680 aa  63.2  0.000000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0877  DNA ligase, NAD-dependent  26.65 
 
 
718 aa  62.8  0.000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00627604  hitchhiker  0.0000000262982 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2205  NAD-dependent DNA ligase LigA  28.37 
 
 
680 aa  62.8  0.000000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0824  DNA ligase, NAD-dependent  24.01 
 
 
688 aa  62.8  0.000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0847  DNA ligase, NAD-dependent  24.01 
 
 
688 aa  62.8  0.000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl160  DNA ligase, polydeoxyribonucleotide synthase NAD+  25.74 
 
 
666 aa  62.4  0.000000006  Mesoplasma florum L1  Bacteria  decreased coverage  0.0025564  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0287  NAD-dependent DNA ligase LigA  27.54 
 
 
669 aa  62.4  0.000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf373  DNA ligase  26.24 
 
 
665 aa  62.4  0.000000007  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000122507  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2364  DNA ligase, NAD-dependent  29.11 
 
 
685 aa  62.4  0.000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0084265  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0776  DNA ligase, NAD-dependent  27.01 
 
 
662 aa  62  0.000000008  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1689  DNA ligase, NAD-dependent  26.82 
 
 
668 aa  61.2  0.00000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000649064  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0277  NAD-dependent DNA ligase LigA  28.77 
 
 
679 aa  61.6  0.00000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0728  DNA ligase, NAD-dependent  28.84 
 
 
687 aa  61.2  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2112  NAD-dependent DNA ligase LigA  27.6 
 
 
707 aa  61.2  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2698  DNA ligase, NAD-dependent  28.92 
 
 
674 aa  60.8  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1094  DNA ligase, NAD-dependent  29.47 
 
 
672 aa  60.8  0.00000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.878392  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09423  DNA ligase  26.19 
 
 
664 aa  60.8  0.00000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.624424  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2679  DNA ligase, NAD-dependent  28.64 
 
 
685 aa  60.5  0.00000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000018832  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4515  DNA ligase, NAD-dependent  25.55 
 
 
726 aa  60.5  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2758  DNA ligase, NAD-dependent  28.64 
 
 
685 aa  60.5  0.00000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00554758  hitchhiker  0.000696981 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0694  DNA ligase, NAD-dependent  27.27 
 
 
695 aa  61.2  0.00000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4208  NAD-dependent DNA ligase LigB  26 
 
 
562 aa  60.1  0.00000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2964  DNA ligase, NAD-dependent  25.56 
 
 
674 aa  60.1  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00282496  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26670  DNA ligase, NAD-dependent  28.57 
 
 
708 aa  60.5  0.00000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000046682  normal  0.968488 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>