More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A9601_05781 on replicon NC_008816
Organism: Prochlorococcus marinus str. AS9601



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008816  A9601_05781  uridylate kinase  100 
 
 
234 aa  476  1e-133  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.155099  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05481  uridylate kinase  96.58 
 
 
234 aa  460  1e-129  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.35761  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05861  uridylate kinase  96.58 
 
 
234 aa  461  1e-129  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0522  uridylate kinase  95.3 
 
 
234 aa  456  1e-127  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07621  uridylate kinase  84.62 
 
 
237 aa  409  1e-113  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0651167 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05791  uridylate kinase  82.48 
 
 
237 aa  404  1.0000000000000001e-112  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1854  uridylate kinase  82.48 
 
 
237 aa  404  1.0000000000000001e-112  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05241  uridylate kinase  81.62 
 
 
237 aa  397  1e-109  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.87702  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0711  uridylate kinase  81.55 
 
 
237 aa  389  1e-107  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1648  uridylate kinase  80.26 
 
 
237 aa  385  1e-106  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0506  uridylate kinase  72.53 
 
 
253 aa  356  9.999999999999999e-98  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0628  uridylate kinase  71.43 
 
 
242 aa  354  5e-97  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.440032 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3779  uridylate kinase  73.16 
 
 
244 aa  354  5.999999999999999e-97  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.591518 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0066  uridylate kinase  71.43 
 
 
242 aa  352  2e-96  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.815822  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2697  uridylate kinase  71.24 
 
 
240 aa  350  1e-95  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4636  uridylate kinase  70.26 
 
 
242 aa  350  2e-95  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.426273  normal  0.860476 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3547  uridylate kinase  69.53 
 
 
240 aa  346  2e-94  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2559  uridylate kinase  69.53 
 
 
240 aa  345  3e-94  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3731  uridylate kinase  62.66 
 
 
239 aa  319  1.9999999999999998e-86  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000303912  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2473  uridylate kinase  63.64 
 
 
240 aa  320  1.9999999999999998e-86  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2754  uridylate kinase  64.5 
 
 
240 aa  318  3.9999999999999996e-86  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1487  uridylate kinase  64.5 
 
 
240 aa  318  3.9999999999999996e-86  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0028883 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23620  uridylate kinase  63.64 
 
 
238 aa  318  5e-86  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.240792 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2710  uridylate kinase  61.21 
 
 
239 aa  316  2e-85  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0334145  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1943  uridylate kinase  60.52 
 
 
239 aa  314  6e-85  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.782338 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1252  uridylate kinase  62.77 
 
 
239 aa  314  8e-85  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000157297  hitchhiker  0.0010531 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3211  uridylate kinase  64.5 
 
 
242 aa  313  1.9999999999999998e-84  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000567635  hitchhiker  0.000000005396 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10930  uridylate kinase  61.64 
 
 
240 aa  311  4.999999999999999e-84  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0253389  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0291  uridylate kinase  61.04 
 
 
251 aa  310  1e-83  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0302  uridylate kinase  61.04 
 
 
251 aa  310  1e-83  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0280  uridylate kinase  61.04 
 
 
251 aa  310  1e-83  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1421  uridylate kinase  64.22 
 
 
244 aa  309  2e-83  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0926362  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0575  uridylate kinase  61.37 
 
 
236 aa  309  2e-83  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000374821  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2035  uridylate kinase  65.09 
 
 
240 aa  309  2.9999999999999997e-83  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1976  uridylate kinase  61.47 
 
 
242 aa  308  5.9999999999999995e-83  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0392494  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07670  uridylate kinase  62.5 
 
 
239 aa  307  6.999999999999999e-83  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000164144  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1919  uridylate kinase  61.9 
 
 
239 aa  307  1.0000000000000001e-82  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0304  uridylate kinase  61.21 
 
 
249 aa  306  2.0000000000000002e-82  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.336367  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1919  uridylate kinase  61.47 
 
 
241 aa  306  2.0000000000000002e-82  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.6242299999999998e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1274  uridylate kinase  59.4 
 
 
239 aa  306  2.0000000000000002e-82  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.315976  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1162  uridylate kinase  62.01 
 
 
241 aa  305  3e-82  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.899352 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1446  uridylate kinase  62.01 
 
 
241 aa  305  3e-82  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0296877  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1429  uridylate kinase  64.07 
 
 
238 aa  304  9.000000000000001e-82  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000438582  normal  0.0570585 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1952  uridylate kinase  63.79 
 
 
237 aa  303  1.0000000000000001e-81  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.771793  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1143  uridylate kinase  63.36 
 
 
240 aa  303  2.0000000000000002e-81  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000986718  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1670  uridylate kinase  63.36 
 
 
237 aa  302  3.0000000000000004e-81  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0149338  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1780  uridylate kinase  60.17 
 
 
245 aa  302  3.0000000000000004e-81  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3707  uridylate kinase  61.04 
 
 
240 aa  301  7.000000000000001e-81  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0190689  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0707  uridylate kinase  60.61 
 
 
274 aa  301  7.000000000000001e-81  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00000695592  unclonable  0.0000000228976 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1659  uridylate kinase  62.23 
 
 
237 aa  300  2e-80  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00747686  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2803  uridylate kinase  58.19 
 
 
245 aa  299  2e-80  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00682301  normal  0.644518 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1129  uridylate kinase  59.23 
 
 
238 aa  298  5e-80  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.168829  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2046  uridylate kinase  59.31 
 
 
239 aa  298  6e-80  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.198854  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1344  uridylate kinase  60.94 
 
 
240 aa  296  1e-79  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0550338  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1318  uridylate kinase  60.94 
 
 
240 aa  296  1e-79  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.730256  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0608  uridylate kinase  61.64 
 
 
253 aa  296  2e-79  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000356345  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0115  uridylate kinase  58.37 
 
 
235 aa  295  4e-79  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1814  uridylate kinase  62.07 
 
 
239 aa  293  2e-78  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000000487081  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2378  uridylate kinase  57.08 
 
 
239 aa  292  3e-78  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1004  uridylate kinase  61.04 
 
 
235 aa  291  4e-78  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000758242  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1958  uridylate kinase  57.39 
 
 
241 aa  291  5e-78  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0803  uridylate kinase  59.91 
 
 
241 aa  291  8e-78  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000000782599  hitchhiker  0.00000000000212773 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0580  uridylate kinase  58.8 
 
 
255 aa  290  1e-77  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0825  uridylate kinase  59.66 
 
 
240 aa  289  2e-77  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.000673854  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1897  uridylate kinase  55.56 
 
 
235 aa  290  2e-77  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.12781  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1161  uridylate kinase  57.14 
 
 
242 aa  290  2e-77  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1528  uridylate kinase  57.21 
 
 
238 aa  290  2e-77  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000286053  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2351  uridylate kinase  56.41 
 
 
236 aa  289  3e-77  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.164432  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0884  hypothetical protein  63.2 
 
 
238 aa  289  3e-77  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000183579  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2111  uridylate kinase  57.94 
 
 
238 aa  288  5.0000000000000004e-77  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.920559  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1034  uridylate kinase  64.07 
 
 
240 aa  288  5.0000000000000004e-77  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000115262  unclonable  0.00000001 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1495  uridylate kinase  55.41 
 
 
245 aa  288  5.0000000000000004e-77  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2920  uridylate kinase  57.94 
 
 
238 aa  288  6e-77  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.402742 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3408  uridylate kinase  58.62 
 
 
279 aa  287  9e-77  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0485222  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1808  uridylate kinase  55.79 
 
 
241 aa  287  1e-76  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0520  uridylate kinase  56.22 
 
 
237 aa  286  2e-76  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0686  uridylate kinase  56.47 
 
 
240 aa  286  2e-76  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000013678  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1163  uridylate kinase  58.87 
 
 
265 aa  285  4e-76  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.221517 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1371  uridylate kinase  56.89 
 
 
244 aa  284  7e-76  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.184523  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1259  uridylate kinase  57.14 
 
 
237 aa  284  7e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.370411  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6060  uridylate kinase  57.14 
 
 
237 aa  284  7e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2037  uridylate kinase  57.14 
 
 
237 aa  284  7e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.865842  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2017  uridylate kinase  57.14 
 
 
237 aa  284  7e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0476  uridylate kinase  56.71 
 
 
245 aa  284  8e-76  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0113998  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0009  uridylate kinase  56.14 
 
 
261 aa  284  8e-76  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.137208  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1744  uridylate kinase  54.98 
 
 
238 aa  284  9e-76  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1782  uridylate kinase  57.87 
 
 
234 aa  284  9e-76  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000038351  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0240  uridylate kinase  57.58 
 
 
251 aa  283  1.0000000000000001e-75  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.428949  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0405  uridylate kinase  55.56 
 
 
235 aa  283  1.0000000000000001e-75  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.899064  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2029  uridylate kinase  57.14 
 
 
237 aa  283  1.0000000000000001e-75  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0078  uridylate kinase  53.65 
 
 
236 aa  283  1.0000000000000001e-75  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000395488  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1326  uridylate kinase  57.14 
 
 
237 aa  283  2.0000000000000002e-75  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.280205  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2491  uridylate kinase  57.14 
 
 
237 aa  283  2.0000000000000002e-75  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1553  uridylate kinase  57.14 
 
 
237 aa  283  2.0000000000000002e-75  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2435  uridylate kinase  57.14 
 
 
237 aa  283  2.0000000000000002e-75  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0771842  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3257  uridylate kinase  57.14 
 
 
237 aa  283  2.0000000000000002e-75  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2581  uridylate kinase  57.14 
 
 
237 aa  283  2.0000000000000002e-75  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5327  uridylate kinase  56.71 
 
 
237 aa  283  2.0000000000000002e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0388616  normal  0.289961 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1336  uridylate kinase  56.71 
 
 
237 aa  283  2.0000000000000002e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.399857  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1684  uridylate kinase  57.14 
 
 
237 aa  283  2.0000000000000002e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.193496 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>