More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A9601_05621 on replicon NC_008816
Organism: Prochlorococcus marinus str. AS9601



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009091  P9301_05321  carbohydrate kinase  96.4 
 
 
333 aa  648    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0559209  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05621  carbohydrate kinase  100 
 
 
333 aa  671    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0506  carbohydrate kinase-like  86.49 
 
 
334 aa  582  1.0000000000000001e-165  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05691  carbohydrate kinase  75.75 
 
 
338 aa  514  1e-144  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0990225  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1838  carbohydrate kinase  51.25 
 
 
335 aa  342  5e-93  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05631  carbohydrate kinase  50.94 
 
 
335 aa  341  1e-92  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.577343 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07411  carbohydrate kinase  49.39 
 
 
342 aa  339  4e-92  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05061  carbohydrate kinase  50 
 
 
348 aa  337  9.999999999999999e-92  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0313242  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0690  carbohydrate kinase PfkB family  47.35 
 
 
338 aa  325  8.000000000000001e-88  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1668  carbohydrate kinase PfkB family  46.85 
 
 
337 aa  304  1.0000000000000001e-81  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0149  PfkB  42.81 
 
 
407 aa  285  1.0000000000000001e-75  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.029935  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1228  ribokinase-like domain-containing protein  41.19 
 
 
337 aa  280  2e-74  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0251  PfkB  41.8 
 
 
333 aa  276  2e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.214496  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0169  carbohydrate kinase  40.38 
 
 
330 aa  276  3e-73  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0178  ribokinase-like domain-containing protein  41.51 
 
 
331 aa  276  3e-73  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.613115  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0162  carbohydrate kinase  40.38 
 
 
330 aa  276  3e-73  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.98466  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0457  PfkB  39.94 
 
 
333 aa  275  6e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1165  PfkB domain protein  42.06 
 
 
335 aa  275  7e-73  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.188666 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0121  ribokinase-like domain-containing protein  40.75 
 
 
328 aa  274  2.0000000000000002e-72  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.02163  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0036  pfkB family carbohydrate kinase  40.19 
 
 
333 aa  271  2e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.564268  normal  0.540344 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0010  PfkB  39.94 
 
 
333 aa  270  2.9999999999999997e-71  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  decreased coverage  0.00317456  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5046  ribokinase-like domain-containing protein  45.28 
 
 
329 aa  269  5.9999999999999995e-71  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.151131 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0461  PfkB domain protein  39.94 
 
 
333 aa  266  2.9999999999999995e-70  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3378  ribokinase-like domain-containing protein  42.11 
 
 
330 aa  263  2e-69  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.463525  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4021  PfkB  40.94 
 
 
330 aa  264  2e-69  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.737193  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4407  PfkB domain protein  39.01 
 
 
330 aa  260  2e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0218  PfkB  39.01 
 
 
333 aa  260  2e-68  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4087  PfkB domain protein  39.01 
 
 
330 aa  260  2e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3532  ribokinase-like domain-containing protein  38.6 
 
 
337 aa  259  3e-68  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.321565  normal  0.851243 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0316  pfkB family carbohydrate kinase  38.44 
 
 
330 aa  260  3e-68  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.930013  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1639  ribokinase-like domain-containing protein  40 
 
 
331 aa  257  2e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.487738  normal  0.0146751 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4645  ribokinase-like domain-containing protein  39.09 
 
 
337 aa  256  3e-67  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.161745 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5108  PfkB domain protein  39.09 
 
 
337 aa  256  3e-67  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.905931 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0581  PfkB  37.77 
 
 
333 aa  256  3e-67  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.189374  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5186  PfkB domain protein  38.79 
 
 
337 aa  256  3e-67  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.430634  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1260  PfkB domain protein  39.75 
 
 
331 aa  255  9e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2872  PfkB  38.56 
 
 
332 aa  253  4.0000000000000004e-66  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.626247 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0215  ribokinase-like domain-containing protein  40.06 
 
 
333 aa  252  8.000000000000001e-66  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.26013  normal  0.0979989 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2022  ribokinase-like domain-containing protein  41.9 
 
 
330 aa  249  5e-65  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1307  PfkB domain protein  37.35 
 
 
338 aa  247  3e-64  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.887451  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2989  ribokinase-like domain-containing protein  36.65 
 
 
338 aa  244  1.9999999999999999e-63  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2565  ribokinase-like domain-containing protein  37.58 
 
 
333 aa  241  1e-62  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.650274  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1671  PfkB  37.54 
 
 
331 aa  237  3e-61  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.276087  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2452  PfkB  36.42 
 
 
330 aa  233  2.0000000000000002e-60  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.826037  normal  0.155331 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0151  PfkB  38.12 
 
 
331 aa  231  1e-59  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0562  PfkB domain protein  38.22 
 
 
328 aa  229  6e-59  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3022  PfkB domain protein  37.14 
 
 
333 aa  229  7e-59  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.523599  normal  0.417909 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0198  ribokinase-like domain-containing protein  35.69 
 
 
330 aa  224  2e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1030  pfkB family carbohydrate kinase  34.15 
 
 
330 aa  218  1e-55  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.577037  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2691  ribokinase-like domain-containing protein  34.15 
 
 
330 aa  218  1e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.272607  normal  0.270933 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1845  ribokinase-like domain-containing protein  36.14 
 
 
341 aa  211  2e-53  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000273033  unclonable  0.000000000472438 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3284  PfkB  35.76 
 
 
336 aa  209  8e-53  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.469583  normal  0.0441315 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2872  ribokinase-like domain-containing protein  34.36 
 
 
335 aa  208  9e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.417432 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1494  PfkB domain protein  33.97 
 
 
331 aa  196  5.000000000000001e-49  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0243607  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3284  ribokinase-like domain-containing protein  31.96 
 
 
330 aa  190  4e-47  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000189129  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2200  PfkB  35.09 
 
 
339 aa  189  5e-47  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.00000468276  decreased coverage  0.00888496 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1084  PfkB domain protein  34.36 
 
 
327 aa  189  7e-47  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1113  PfkB domain protein  34.36 
 
 
327 aa  188  1e-46  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.941643 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0819  cell division protein FtsA  32.91 
 
 
328 aa  187  3e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000392808  normal  0.759534 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1910  carbohydrate kinase  34.47 
 
 
339 aa  184  1.0000000000000001e-45  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  unclonable  0.0000000000000704659  hitchhiker  0.00127543 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2568  ribokinase-like domain-containing protein  32.52 
 
 
333 aa  177  3e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0234215 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2764  PfkB  31.06 
 
 
370 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.040802  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2854  ribokinase-like domain-containing protein  32.9 
 
 
328 aa  171  2e-41  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000011716  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0494  PfkB domain protein  27.99 
 
 
360 aa  160  4e-38  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.441156  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0055  ribokinase-like domain-containing protein  29.65 
 
 
334 aa  154  2e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.747338  normal  0.368725 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0735  PfkB domain-containing protein  28.78 
 
 
317 aa  113  5e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.263465  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1802  ribokinase family sugar kinase  29.59 
 
 
306 aa  101  2e-20  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00331295  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_18364  predicted protein  29.22 
 
 
273 aa  96.3  7e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.132458 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1736  PfkB domain protein  25.47 
 
 
304 aa  95.9  8e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1755  PfkB domain protein  26.01 
 
 
304 aa  95.5  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7068  PfkB  26.07 
 
 
297 aa  94.7  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0491  PfkB  24.18 
 
 
303 aa  94.7  2e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04580  Ribokinase  28.41 
 
 
306 aa  92  1e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_50659  predicted protein  20.82 
 
 
347 aa  91.3  2e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1117  ribokinase-like domain-containing protein  27.05 
 
 
305 aa  91.3  2e-17  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.145837 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3688  PfkB domain protein  26.39 
 
 
317 aa  90.9  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2333  iolC protein  23.08 
 
 
332 aa  90.1  4e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2512  myo-inositol catabolism protein IolC  23.08 
 
 
332 aa  90.1  4e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1649  ribokinase-like domain-containing protein  27.91 
 
 
308 aa  89.4  7e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0416676  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02272  adenosine kinase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G06390)  25.22 
 
 
352 aa  89  9e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0154807  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2296  myo-inositol catabolism protein  23.69 
 
 
332 aa  89  1e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.192741  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0118  ribokinase  25.46 
 
 
303 aa  88.2  2e-16  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2483  PfkB domain protein  24.84 
 
 
302 aa  88.6  2e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2615  PfkB domain protein  26.24 
 
 
305 aa  87.4  3e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2252  carbohydrate kinase; myo-inositol catabolism protein  22.77 
 
 
332 aa  87  4e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.608064  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1142  PfkB  23.02 
 
 
310 aa  86.3  6e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0676537  normal  0.093061 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2001  PfkB domain protein  26.67 
 
 
321 aa  86.3  7e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1789  ribokinase  25.61 
 
 
297 aa  85.9  9e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000225274  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5895  sugar kinase, putative  26.57 
 
 
304 aa  85.1  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.760771  normal  0.0122717 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2903  cytidine kinase / inosine-guanosine kinase  24.14 
 
 
299 aa  85.1  0.000000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.859362  hitchhiker  0.00094244 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0416  PfkB  23.16 
 
 
320 aa  85.1  0.000000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5137  PfkB domain protein  25.62 
 
 
319 aa  84.3  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1856  PfkB family kinase  25.08 
 
 
315 aa  83.6  0.000000000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0158072  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1627  PfkB domain protein  26.97 
 
 
309 aa  83.2  0.000000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.100578  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1088  PfkB domain protein  25.25 
 
 
315 aa  83.2  0.000000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.332998  normal  0.446333 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01741  predicted kinase  25.08 
 
 
315 aa  81.6  0.00000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01729  hypothetical protein  25.08 
 
 
315 aa  81.6  0.00000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0902  PfkB domain protein  22.14 
 
 
309 aa  81.6  0.00000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0147  ribokinase-like domain-containing protein  23.59 
 
 
318 aa  81.3  0.00000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.719935  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18220  Fructokinase  25.64 
 
 
320 aa  80.9  0.00000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.749798  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>