More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A9601_01461 on replicon NC_008816
Organism: Prochlorococcus marinus str. AS9601



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008816  A9601_01461  DNA polymerase III subunit delta'  100 
 
 		 320 aa  621  1e-177  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01481  DNA polymerase III subunit delta'  88.75 
 
 		 320 aa  527  1e-149  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0343458  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0131  DNA polymerase III subunit delta'  79.69 
 
 		 319 aa  473  1e-132  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.363524  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01571  DNA polymerase III subunit delta'  56.25 
 
 		 319 aa  323  2e-87  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.499348  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02011  DNA polymerase III subunit delta'  37.54 
 
 		 319 aa  194  2e-48  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.847421 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1495  DNA polymerase III subunit delta'  37.22 
 
 		 319 aa  189  5e-47  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0414246  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01431  DNA polymerase III subunit delta'  32.81 
 
 		 325 aa  171  2e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.519241 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26481  DNA polymerase III subunit delta'  30.03 
 
 		 326 aa  168  1e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.937616 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1963  DNA polymerase III subunit delta'  29.51 
 
 		 320 aa  164  2.0000000000000002e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00141399  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3164  DNA polymerase III subunit delta'  32.69 
 
 		 318 aa  159  6e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0313  DNA polymerase III subunit delta'  28.85 
 
 		 318 aa  153  4e-36  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2379  DNA polymerase III subunit delta'  30.46 
 
 		 314 aa  150  4e-35  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.955046 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1565  DNA polymerase III subunit delta'  29.22 
 
 		 320 aa  147  3e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.257181  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1549  DNA polymerase III subunit delta'  31.65 
 
 		 319 aa  142  5e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1573  DNA polymerase III subunit delta'  31.65 
 
 		 319 aa  142  6e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3025  DNA polymerase III subunit delta'  27.81 
 
 		 317 aa  139  4.999999999999999e-32  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.384123  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0993  DNA polymerase III, delta prime subunit  27.69 
 
 		 325 aa  138  2e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.124546  normal  0.376672 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0084  DNA polymerase III subunit delta'  30.92 
 
 		 307 aa  128  1.0000000000000001e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0094  DNA polymerase III subunit delta'  27.24 
 
 		 311 aa  112  7.000000000000001e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.35794  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3205  DNA polymerase III, delta prime subunit  26.57 
 
 		 320 aa  108  2e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0191854  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1058  DNA polymerase III, delta prime subunit  25.67 
 
 		 320 aa  104  2e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000154633 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5515  DNA polymerase III delta prime subunit  31.46 
 
 		 306 aa  104  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.279148 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3154  DNA polymerase III, delta prime subunit  33.5 
 
 		 320 aa  103  3e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000590012  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1351  DNA-directed DNA polymerase  35.14 
 
 		 365 aa  100  2e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.916733  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2230  DNA polymerase III, delta prime subunit  34.05 
 
 		 323 aa  99.8  6e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.688016  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2319  DNA polymerase III, delta prime subunit  34.81 
 
 		 318 aa  97.8  2e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.247884  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0060  DNA polymerase III, delta prime subunit  23.91 
 
 		 335 aa  97.4  3e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0492451  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1664  DNA polymerase III, delta prime subunit  29.69 
 
 		 327 aa  97.1  3e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.988179  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_476  DNA-directed DNA polymerase, delta prime subunit  35.83 
 
 		 339 aa  97.1  3e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0511  DNA polymerase III, delta prime subunit  35.32 
 
 		 343 aa  97.1  4e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0093  DNA polymerase III subunit delta'  36.76 
 
 		 326 aa  96.7  5e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1801  DNA polymerase III subunit delta'  34.34 
 
 		 342 aa  95.5  1e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.500907  normal  0.955081 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0101  DNA polymerase III, delta prime subunit  29.5 
 
 		 358 aa  95.5  1e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.307739  unclonable  0.000000000342072 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1692  DNA polymerase III, gamma/tau subunits  28.88 
 
 		 321 aa  94.4  2e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000100228  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1947  DNA polymerase III, delta prime subunit  32.32 
 
 		 331 aa  94.4  2e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.497646  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0535  DNA polymerase III, delta prime subunit  35.03 
 
 		 339 aa  93.6  4e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1869  DNA polymerase III, delta prime subunit  25.58 
 
 		 343 aa  93.6  4e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2589  DNA polymerase III, delta prime subunit  28.33 
 
 		 344 aa  93.2  5e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000288191 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5192  DNA polymerase III subunit delta'  34.71 
 
 		 342 aa  93.6  5e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.225605 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1915  DNA polymerase III subunit delta'  34.71 
 
 		 342 aa  92.8  7e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0504294 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6187  DNA polymerase III subunit delta'  34.71 
 
 		 342 aa  92.8  7e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.557746  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1892  DNA polymerase III subunit delta'  34.71 
 
 		 342 aa  92.8  7e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.700458  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1829  DNA polymerase III subunit delta'  34.13 
 
 		 342 aa  91.7  1e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1435  DNA polymerase III subunit delta'  30.92 
 
 		 337 aa  91.7  2e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1382  DNA polymerase III subunit delta'  34.12 
 
 		 342 aa  91.3  2e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4275  DNA polymerase III, delta prime subunit  27.34 
 
 		 354 aa  90.1  5e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0379488 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0789  DNA-directed DNA polymerase  29.09 
 
 		 326 aa  89  9e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16180  DNA polymerase III, gamma/tau subunit  25.1 
 
 		 373 aa  88.6  1e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000014932 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2135  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  28.96 
 
 		 737 aa  89  1e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0056  DNA polymerase III, delta prime subunit  32.88 
 
 		 324 aa  88.2  2e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.907797  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1940  DNA polymerase III subunit delta'  32.14 
 
 		 344 aa  88.2  2e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.990114  normal  0.368252 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0025  DNA polymerase III subunit delta'  31.55 
 
 		 330 aa  87.8  2e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2254  DNA polymerase III, delta prime subunit  26.19 
 
 		 391 aa  88.2  2e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0268836  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0042  DNA polymerase III, delta prime subunit  30.6 
 
 		 320 aa  87  4e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0152578  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0821  DNA polymerase III subunit delta'  31.05 
 
 		 347 aa  86.3  6e-16  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.114263  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0028  DNA-directed DNA polymerase  24.23 
 
 		 323 aa  86.7  6e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0584307 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1827  DNA polymerase III subunit delta'  28.23 
 
 		 337 aa  85.5  0.000000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.112412  normal  0.0140286 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20360  DNA polymerase III, delta prime subunit  35.56 
 
 		 326 aa  84.7  0.000000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2644  DNA polymerase III, delta prime subunit  28.5 
 
 		 363 aa  84.3  0.000000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0692  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  31.19 
 
 		 682 aa  84  0.000000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1091  DNA-directed DNA polymerase  28.24 
 
 		 389 aa  83.6  0.000000000000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2196  DNA polymerase III, delta prime subunit  30.73 
 
 		 339 aa  83.2  0.000000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.71701 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0029  DNA polymerase III subunit delta'  30.65 
 
 		 327 aa  83.2  0.000000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0026  DNA polymerase III subunit delta'  30.99 
 
 		 327 aa  82.8  0.000000000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0040  DNA polymerase III subunit delta'  30.65 
 
 		 327 aa  83.2  0.000000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0043  DNA-directed DNA polymerase  30.25 
 
 		 284 aa  82.8  0.000000000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000856784 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1940  DNA polymerase III, delta prime subunit  28.12 
 
 		 318 aa  82.4  0.00000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.792182  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0036  DNA polymerase III subunit delta'  30.65 
 
 		 327 aa  82  0.00000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.661417  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2548  DNA polymerase III, delta prime subunit  28 
 
 		 363 aa  81.6  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.017144  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0027  DNA polymerase III subunit delta'  30.46 
 
 		 327 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0027  DNA polymerase III subunit delta'  32.18 
 
 		 337 aa  81.3  0.00000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0036  DNA polymerase III subunit delta'  30.46 
 
 		 327 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2506  DNA polymerase III subunits gamma and tau  32.52 
 
 		 553 aa  81.3  0.00000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5280  DNA polymerase III subunit delta'  30.15 
 
 		 327 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1424  DNA polymerase III subunit delta'  30 
 
 		 336 aa  80.9  0.00000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.233005 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0030  DNA polymerase III subunit delta'  30.46 
 
 		 327 aa  80.5  0.00000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.454552  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0027  DNA polymerase III subunit delta'  30.15 
 
 		 327 aa  80.9  0.00000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.637086  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1465  DNA polymerase III subunit delta'  30 
 
 		 336 aa  80.9  0.00000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.186588  normal  0.0136368 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0028  DNA polymerase III subunit delta'  30.46 
 
 		 327 aa  80.5  0.00000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1531  DNA polymerase III subunit delta'  27.88 
 
 		 328 aa  80.5  0.00000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.388173 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1966  DNA polymerase III subunit delta'  26.92 
 
 		 328 aa  80.1  0.00000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.63902  hitchhiker  0.000046762 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1496  DNA polymerase III subunit delta'  28.1 
 
 		 328 aa  80.1  0.00000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.312156  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3794  DNA polymerase III subunit delta'  26.92 
 
 		 328 aa  79.7  0.00000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.425215  normal  0.36128 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1146  DNA polymerase III, delta prime subunit  26.98 
 
 		 383 aa  79.7  0.00000000000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.651472  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3588  DNA polymerase III, delta prime subunit  26.55 
 
 		 351 aa  79.7  0.00000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0026  DNA polymerase III subunit delta'  29.86 
 
 		 327 aa  79.3  0.00000000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0023  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  29.53 
 
 		 664 aa  79  0.00000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0608754  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1785  DNA polymerase III subunit delta'  28.39 
 
 		 336 aa  78.6  0.0000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.193634  normal  0.229083 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0515  DNA-directed DNA polymerase  31.34 
 
 		 320 aa  78.6  0.0000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0983279  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0993  DNA polymerase III subunit delta'  27.03 
 
 		 360 aa  77.8  0.0000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0961  DNA polymerase III subunit delta'  27.03 
 
 		 360 aa  77.8  0.0000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.220444  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1961  DNA polymerase III, delta prime subunit  26.86 
 
 		 359 aa  78.2  0.0000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.617101  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0024  DNA polymerase III subunits gamma and tau  31.14 
 
 		 562 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00112319  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1391  DNA-directed DNA polymerase  28.75 
 
 		 374 aa  77.8  0.0000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000825197 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2130  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  27.62 
 
 		 427 aa  78.2  0.0000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0748227  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0603  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  28.02 
 
 		 735 aa  77.8  0.0000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.705665 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5294  DNA polymerase III subunits gamma and tau  31.14 
 
 		 562 aa  77.4  0.0000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000435365  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2155  DNA polymerase III subunit delta'  33.73 
 
 		 344 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3026  DNA polymerase III subunits gamma and tau  29.95 
 
 		 641 aa  77  0.0000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.196255 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0018  DNA polymerase III subunits gamma and tau  31 
 
 		 562 aa  77  0.0000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0804011  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>