More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A9601_01241 on replicon NC_008816
Organism: Prochlorococcus marinus str. AS9601



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008816  A9601_01241  shikimate kinase  100 
 
 		 185 aa  365  1e-100  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01231  shikimate kinase  93.51 
 
 		 185 aa  345  2e-94  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0111  shikimate kinase  91.26 
 
 		 185 aa  333  5.999999999999999e-91  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01201  shikimate kinase  70.27 
 
 		 185 aa  267  8e-71  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01231  shikimate kinase  48.21 
 
 		 197 aa  172  2.9999999999999996e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.428162 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1476  shikimate kinase  49.43 
 
 		 198 aa  171  3.9999999999999995e-42  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01791  shikimate kinase  49.43 
 
 		 198 aa  171  5.999999999999999e-42  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0539701  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02051  shikimate kinase  46.95 
 
 		 192 aa  164  5.9999999999999996e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0346  shikimate kinase  45.45 
 
 		 191 aa  156  2e-37  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1855  shikimate kinase  46.47 
 
 		 181 aa  151  4e-36  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2345  shikimate kinase  43.9 
 
 		 199 aa  149  2e-35  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0553  shikimate kinase  44.05 
 
 		 181 aa  144  6e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.387005  normal  0.100064 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0894  shikimate kinase  42.51 
 
 		 190 aa  143  1e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00120765  hitchhiker  0.000836884 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1899  Shikimate kinase  41.14 
 
 		 184 aa  137  1e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000431404 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1506  shikimate kinase  43.05 
 
 		 184 aa  134  9.999999999999999e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.494789 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0979  Shikimate kinase  41.81 
 
 		 187 aa  129  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0506883 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0952  Shikimate kinase  41.81 
 
 		 187 aa  129  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_49363  predicted protein  39.88 
 
 		 277 aa  123  2e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.130562  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3524  Shikimate kinase  39.87 
 
 		 169 aa  118  3.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.236256  normal  0.835023 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2026  shikimate kinase  37.28 
 
 		 175 aa  118  6e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0091  shikimate kinase  35.98 
 
 		 173 aa  111  5e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.10625 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_10503  predicted protein  37.04 
 
 		 170 aa  110  9e-24  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1529  shikimate kinase  32.12 
 
 		 180 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.140024  normal  0.642585 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2817  shikimate kinase  32.12 
 
 		 181 aa  109  3e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.248239  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1479  shikimate kinase  32.12 
 
 		 193 aa  108  3e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.298287  normal  0.404477 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1819  shikimate kinase  38.1 
 
 		 169 aa  108  4.0000000000000004e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1591  Shikimate kinase  38.69 
 
 		 175 aa  106  2e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1282  shikimate kinase  35.54 
 
 		 178 aa  105  4e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.410778  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2486  Shikimate kinase  34.88 
 
 		 192 aa  104  7e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0977  shikimate kinase  36.02 
 
 		 168 aa  104  7e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.937224  normal  0.13223 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2661  Shikimate kinase  36.81 
 
 		 170 aa  104  8e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000463113 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1804  Shikimate kinase  34.15 
 
 		 172 aa  104  9e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0528  Shikimate kinase  35.33 
 
 		 166 aa  103  1e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.276227  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0528  shikimate kinase  37.35 
 
 		 168 aa  103  1e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.361692  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0859  shikimate kinase II  34.13 
 
 		 174 aa  103  1e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.386804 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2565  shikimate kinase  33.52 
 
 		 192 aa  102  3e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.412267 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1900  shikimate kinase  35.88 
 
 		 216 aa  101  5e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.976916  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0893  shikimate kinase  33.12 
 
 		 165 aa  101  5e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0658  shikimate kinase  35.44 
 
 		 178 aa  100  8e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2258  shikimate kinase  34.73 
 
 		 177 aa  100  1e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3064  shikimate kinase  32.12 
 
 		 195 aa  100  1e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2532  shikimate kinase  35.71 
 
 		 173 aa  100  1e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.884272  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4089  shikimate kinase  32.48 
 
 		 165 aa  100  1e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3987  shikimate kinase  33.12 
 
 		 165 aa  99.8  2e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.585593  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2137  shikimate kinase  34.12 
 
 		 174 aa  99.8  2e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.628527  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3596  shikimate kinase  33.14 
 
 		 196 aa  100  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1555  shikimate kinase  36.2 
 
 		 170 aa  99.8  2e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.436884  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2549  Shikimate kinase  32.56 
 
 		 189 aa  99  4e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0994  shikimate kinase I  36.42 
 
 		 175 aa  99  4e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0963  shikimate kinase I  36.42 
 
 		 175 aa  99  4e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0294  shikimate kinase  31.98 
 
 		 204 aa  98.6  5e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.638845 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0946  shikimate kinase  36.72 
 
 		 199 aa  98.2  6e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.133424  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1878  shikimate kinase  36.17 
 
 		 186 aa  97.8  7e-20  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.190429  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3977  shikimate kinase  33.12 
 
 		 165 aa  97.8  8e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.537604  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0505  shikimate kinase  31.98 
 
 		 200 aa  97.8  8e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0535  shikimate kinase  31.64 
 
 		 205 aa  97.4  9e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.74412  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1457  Shikimate kinase  37.28 
 
 		 172 aa  97.4  9e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1103  shikimate kinase  40.71 
 
 		 165 aa  97.1  1e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.396409  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4313  shikimate kinase  33.33 
 
 		 170 aa  97.4  1e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4255  shikimate kinase  33.12 
 
 		 165 aa  97.4  1e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2745  shikimate kinase  37.2 
 
 		 173 aa  96.3  2e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.164945  normal  0.272805 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0909  shikimate kinase  29.65 
 
 		 206 aa  96.3  2e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1799  shikimate kinase  31.36 
 
 		 191 aa  96.7  2e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.279615  normal  0.998322 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3226  shikimate kinase  37.42 
 
 		 172 aa  96.3  2e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15020  shikimate kinase  34.5 
 
 		 204 aa  96.7  2e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0201152  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4543  shikimate kinase  33.73 
 
 		 176 aa  95.9  3e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.715983  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1517  shikimate kinase  34.55 
 
 		 171 aa  95.9  3e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0490  shikimate kinase  33.52 
 
 		 224 aa  95.9  3e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0400  shikimate kinase  33.33 
 
 		 180 aa  95.9  3e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00240866 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4137  shikimate kinase  33.12 
 
 		 165 aa  95.5  4e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.151576  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4457  shikimate kinase  33.12 
 
 		 165 aa  95.5  4e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.745283  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1556  shikimate kinase  34.76 
 
 		 173 aa  95.5  4e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.367363 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0532  shikimate kinase  30.86 
 
 		 206 aa  95.1  5e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.398364 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2168  shikimate kinase  36.69 
 
 		 186 aa  95.1  5e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.157663  normal  0.699838 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0839  shikimate kinase  35.46 
 
 		 176 aa  94.7  7e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.657447  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2029  shikimate kinase  31.21 
 
 		 200 aa  94.4  8e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1330  Shikimate kinase  33.74 
 
 		 219 aa  94.4  8e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0593402  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1951  shikimate kinase  31.21 
 
 		 217 aa  94.4  9e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0989  shikimate kinase  36.49 
 
 		 189 aa  94  1e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.764928  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1633  shikimate kinase., 3-dehydroquinate synthase  34.09 
 
 		 594 aa  94  1e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.364457  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4366  shikimate kinase  32.48 
 
 		 165 aa  94  1e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2745  Shikimate kinase  33.74 
 
 		 181 aa  92.8  2e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.11158  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0220  Shikimate kinase  36.67 
 
 		 167 aa  92.8  2e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000013813  normal  0.0131612 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0781  shikimate kinase  37.2 
 
 		 170 aa  92.8  2e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.275347  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3889  shikimate kinase  32 
 
 		 196 aa  93.2  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.090563  decreased coverage  0.00239824 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0354  shikimate kinase., 3-dehydroquinate synthase  30.41 
 
 		 593 aa  92.8  2e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0461  Shikimate kinase  34.18 
 
 		 182 aa  93.2  2e-18  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.196484  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1377  Shikimate kinase  33.53 
 
 		 201 aa  92.4  3e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.149071  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1220  shikimate kinase  35.67 
 
 		 190 aa  92.4  3e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.455019  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2092  shikimate kinase II  32.17 
 
 		 175 aa  92.4  3e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.300334  normal  0.0606791 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1923  Shikimate kinase., 3-dehydroquinate synthase  31.4 
 
 		 579 aa  92.4  4e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0886542 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3740  shikimate kinase  28.57 
 
 		 188 aa  92  4e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.695476  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1629  shikimate kinase  42.11 
 
 		 174 aa  92.4  4e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.682402  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1641  shikimate kinase., 3-dehydroquinate synthase  31.4 
 
 		 604 aa  92.4  4e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.124892 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1596  shikimate kinase  42.11 
 
 		 174 aa  92.4  4e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0865399  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0165  Shikimate kinase  39.33 
 
 		 172 aa  92  4e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1020  shikimate kinase  36.73 
 
 		 177 aa  91.7  5e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1467  3-dehydroquinate synthase  33.33 
 
 		 552 aa  91.7  5e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4053  shikimate kinase  30.3 
 
 		 197 aa  91.7  6e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.477248  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4347  shikimate kinase  32.21 
 
 		 156 aa  91.7  6e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>