25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A9601_00321 on replicon NC_008816
Organism: Prochlorococcus marinus str. AS9601



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008816  A9601_00321  hypothetical protein  100 
 
 
170 aa  320  4e-87  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00321  hypothetical protein  97.65 
 
 
170 aa  315  2e-85  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0537644  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0033  hypothetical protein  93.53 
 
 
170 aa  301  2.0000000000000002e-81  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00321  hypothetical protein  82.35 
 
 
170 aa  271  2.0000000000000002e-72  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0041  hypothetical protein  72.46 
 
 
176 aa  190  1e-47  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0036  hypothetical protein  71.33 
 
 
177 aa  184  4e-46  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14811  hypothetical protein  55.95 
 
 
173 aa  182  1.0000000000000001e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.686917  normal  0.0260683 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12401  hypothetical protein  61.33 
 
 
172 aa  172  1.9999999999999998e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19371  hypothetical protein  59.75 
 
 
170 aa  166  2e-40  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1062  hypothetical protein  59.12 
 
 
170 aa  164  4e-40  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.836162  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00391  hypothetical protein  70.47 
 
 
171 aa  162  2.0000000000000002e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2080  membrane protein AbrB duplication  33.33 
 
 
349 aa  55.5  0.0000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000252209  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2363  Putative ammonia monooxygenase-like protein  25.17 
 
 
383 aa  52.8  0.000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2363  membrane protein AbrB duplication  31.53 
 
 
384 aa  50.8  0.000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1276  membrane protein AbrB duplication  29.11 
 
 
355 aa  49.7  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1964  membrane protein AbrB duplication  25.87 
 
 
368 aa  47  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0784  membrane protein AbrB duplication  28.91 
 
 
162 aa  47  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1757  putative ammonia monooxygenase  26.71 
 
 
357 aa  47  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1723  putative ammonia monooxygenase  26.71 
 
 
357 aa  47  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2088  putative ammonia monooxygenase  28.57 
 
 
338 aa  45.4  0.0004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.813317  normal  0.649237 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2569  hypothetical protein  30.84 
 
 
342 aa  45.1  0.0005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.110832  hitchhiker  0.000000135786 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3407  membrane protein AbrB duplication  29.5 
 
 
358 aa  43.9  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.759463  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4903  putative ammonia monooxygenase  29.2 
 
 
397 aa  43.9  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.080717  normal  0.221223 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2372  membrane protein AbrB duplication  30.88 
 
 
354 aa  42  0.005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2727  putative ammonia monooxygenase  28.85 
 
 
342 aa  40.8  0.01  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>