184 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A9601_00081 on replicon NC_008816
Organism: Prochlorococcus marinus str. AS9601



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008816  A9601_00081  transcription antitermination protein NusB  100 
 
 		 208 aa  412  1e-114  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00081  transcription antitermination protein NusB  94.63 
 
 		 205 aa  390  1e-108  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.874807  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0009  transcription antitermination protein NusB  84.06 
 
 		 208 aa  363  1e-99  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00081  transcription antitermination protein NusB  75.85 
 
 		 208 aa  327  1.0000000000000001e-88  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.339041  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00081  transcription antitermination protein NusB  50.74 
 
 		 211 aa  214  9e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000149068 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00091  transcription antitermination protein NusB  49.76 
 
 		 211 aa  203  1e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0010  transcription antitermination protein NusB  51.23 
 
 		 211 aa  201  5e-51  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.728804  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00081  transcription antitermination protein NusB  50.96 
 
 		 208 aa  194  6e-49  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1336  transcription antitermination protein NusB  50.48 
 
 		 208 aa  190  1e-47  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0010  transcription antitermination protein NusB  46.8 
 
 		 211 aa  188  5.999999999999999e-47  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2471  transcription antitermination protein NusB  36.41 
 
 		 213 aa  129  2.0000000000000002e-29  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.526539  hitchhiker  0.00000000554853 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5041  transcription antitermination protein NusB  33.83 
 
 		 212 aa  128  6e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.264759 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1452  transcription antitermination protein NusB  36.14 
 
 		 211 aa  125  6e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1478  transcription antitermination protein NusB  36.5 
 
 		 235 aa  124  8.000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.705133 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4342  transcription antitermination protein NusB  31.84 
 
 		 209 aa  115  5e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0276  transcription antitermination protein NusB  32.5 
 
 		 211 aa  109  3e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0737  transcription antitermination protein NusB  31 
 
 		 207 aa  108  4.0000000000000004e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.783199 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1589  NusB antitermination factor  31.37 
 
 		 213 aa  108  6e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1714  NusB antitermination factor  41.25 
 
 		 145 aa  65.9  0.0000000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2325  transcription antitermination protein NusB  31.91 
 
 		 133 aa  64.3  0.000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000000736737  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1534  transcription antitermination protein NusB  36.14 
 
 		 140 aa  64.3  0.000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.276167  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0246  transcription antitermination protein NusB  32.63 
 
 		 130 aa  63.5  0.000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2727  NusB antitermination factor  35.29 
 
 		 143 aa  63.9  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1059  transcription antitermination protein NusB  37.93 
 
 		 142 aa  63.5  0.000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1713  transcription antitermination protein NusB  35.78 
 
 		 144 aa  62.8  0.000000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1053  transcription antitermination protein NusB  36.78 
 
 		 142 aa  62  0.000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2598  NusB antitermination factor  30.85 
 
 		 156 aa  61.6  0.000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.292091  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2515  NusB antitermination factor  36.78 
 
 		 132 aa  60.8  0.00000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.797905  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1279  NusB antitermination factor  35.71 
 
 		 155 aa  60.8  0.00000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0274165  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4292  transcription antitermination protein NusB  35.06 
 
 		 130 aa  60.1  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2589  NusB antitermination factor  35.87 
 
 		 165 aa  60.8  0.00000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1032  NusB antitermination factor  41.25 
 
 		 127 aa  60.5  0.00000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0942  transcription antitermination protein NusB  35.06 
 
 		 130 aa  60.1  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0063504 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2738  NusB antitermination factor  34.21 
 
 		 142 aa  59.7  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0276393  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2922  NusB antitermination factor  34.21 
 
 		 142 aa  59.7  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.179752  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2830  NusB antitermination factor  34.21 
 
 		 142 aa  59.7  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0145632  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4034  transcription antitermination protein NusB  32 
 
 		 130 aa  59.7  0.00000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0834  NusB antitermination factor  34 
 
 		 145 aa  59.3  0.00000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000205834  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12640  NusB antitermination factor  33.7 
 
 		 137 aa  58.9  0.00000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0537288 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4255  transcription antitermination protein NusB  32 
 
 		 130 aa  58.9  0.00000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4086  transcription antitermination protein NusB  35.06 
 
 		 130 aa  58.9  0.00000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0398427  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3924  transcription antitermination protein NusB  35.06 
 
 		 130 aa  58.9  0.00000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3935  transcription antitermination protein NusB  35.06 
 
 		 130 aa  58.9  0.00000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0242683  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4406  transcription antitermination protein NusB  35.06 
 
 		 130 aa  58.9  0.00000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4312  transcription antitermination protein NusB  35.06 
 
 		 130 aa  58.9  0.00000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4202  transcription antitermination protein NusB  35.06 
 
 		 130 aa  58.9  0.00000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000627912 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2032  NusB antitermination factor  32.38 
 
 		 153 aa  58.5  0.00000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0272583 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1702  NusB antitermination factor  41.67 
 
 		 139 aa  58.5  0.00000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.285646 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1333  transcription antitermination protein NusB  37.84 
 
 		 131 aa  58.5  0.00000007  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0522  NusB antitermination factor  38.96 
 
 		 154 aa  58.5  0.00000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.518761  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1001  NusB antitermination factor  35.56 
 
 		 134 aa  58.5  0.00000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000103946  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2875  transcription antitermination protein NusB  32 
 
 		 130 aa  58.5  0.00000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0967797  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1449  transcription antitermination factor NusB  33.71 
 
 		 156 aa  58.2  0.00000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.393092  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3504  NusB antitermination factor  30.53 
 
 		 148 aa  58.2  0.00000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000202631  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0722  transcription termination factor  27.97 
 
 		 325 aa  58.2  0.00000009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1521  NusB antitermination factor  39.71 
 
 		 145 aa  57.8  0.0000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000719098  normal  0.286205 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2942  NusB antitermination factor  34.02 
 
 		 138 aa  57.8  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000122519  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5248  NusB antitermination factor  33 
 
 		 139 aa  57.4  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1703  NusB antitermination factor  37.18 
 
 		 135 aa  57.8  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.747293  normal  0.0502801 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3205  NusB antitermination factor  37.18 
 
 		 135 aa  57  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.073957  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1457  NusB antitermination factor  36.47 
 
 		 139 aa  57.4  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0617192  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1304  NusB antitermination factor  40 
 
 		 145 aa  56.6  0.0000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.592114  normal  0.0232631 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12640  transcription antitermination factor NusB  36.78 
 
 		 150 aa  57  0.0000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0196868  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1215  NusB antitermination factor  31.46 
 
 		 142 aa  57  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06300  NusB antitermination factor  40.79 
 
 		 134 aa  57  0.0000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000202636  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1061  transcription antitermination factor NusB  34.38 
 
 		 143 aa  56.6  0.0000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000379385  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1693  transcription antitermination protein NusB  33.33 
 
 		 144 aa  56.6  0.0000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2006  NusB antitermination factor  34.88 
 
 		 136 aa  56.6  0.0000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000909018 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1616  NusB antitermination factor  33.01 
 
 		 137 aa  55.8  0.0000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.686883  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2269  NusB antitermination factor  36.17 
 
 		 136 aa  55.8  0.0000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.190221  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3751  transcription antitermination protein NusB  35.37 
 
 		 164 aa  55.8  0.0000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.110762 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1069  NusB antitermination factor  31.4 
 
 		 143 aa  55.5  0.0000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000269454  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1185  transcription antitermination protein NusB  42.42 
 
 		 138 aa  55.5  0.0000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0066267  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2394  NusB antitermination factor  32.53 
 
 		 145 aa  55.5  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15520  transcription antitermination factor NusB  33.33 
 
 		 153 aa  55.8  0.0000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.332818  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0096  transcription antitermination protein NusB  29.55 
 
 		 141 aa  55.5  0.0000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1020  NusB antitermination factor  34.67 
 
 		 138 aa  55.5  0.0000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000376334  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1228  NusB antitermination factor  40.28 
 
 		 140 aa  55.8  0.0000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1278  N utilization substance protein B  35.42 
 
 		 143 aa  55.5  0.0000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.279513  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0422  hypothetical protein  37.66 
 
 		 378 aa  55.1  0.0000007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1089  NusB antitermination factor  40.51 
 
 		 143 aa  55.1  0.0000008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.441067  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1583  transcription antitermination protein NusB  33.72 
 
 		 129 aa  54.7  0.0000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00456723  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1616  transcription antitermination protein NusB  33.72 
 
 		 129 aa  54.7  0.0000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000103725  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1780  NusB antitermination factor  36.49 
 
 		 166 aa  54.3  0.000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.97176  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2652  transcription antitermination protein NusB  36.59 
 
 		 163 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0058  NusB antitermination factor  36 
 
 		 154 aa  54.3  0.000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.233824  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1706  NusB antitermination factor  35.23 
 
 		 138 aa  53.9  0.000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.188231  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2372  NusB antitermination factor  32.39 
 
 		 152 aa  53.5  0.000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1642  NusB antitermination factor  37.33 
 
 		 153 aa  53.9  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3481  NusB antitermination factor  31.07 
 
 		 150 aa  53.5  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0412156  normal  0.48077 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2359  transcription antitermination protein NusB  36.59 
 
 		 162 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.600142  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1839  NusB antitermination factor  36.25 
 
 		 138 aa  53.5  0.000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.156187  normal  0.178844 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1905  NusB antitermination factor  31.03 
 
 		 145 aa  53.5  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2406  transcription antitermination protein NusB  36.59 
 
 		 162 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.798177  normal  0.0506261 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2400  transcription antitermination protein NusB  36.59 
 
 		 162 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.199761 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1576  transcription antitermination protein NusB  35.53 
 
 		 132 aa  53.9  0.000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1043  NusB antitermination factor  37.68 
 
 		 144 aa  53.1  0.000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.310425  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1215  NusB antitermination factor  37.31 
 
 		 146 aa  52.8  0.000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.291418 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0405  transcription antitermination protein NusB  35.53 
 
 		 132 aa  52.8  0.000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0431  transcription antitermination protein NusB  35.53 
 
 		 132 aa  52.8  0.000004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.232136  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>