More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A9601_00051 on replicon NC_008816
Organism: Prochlorococcus marinus str. AS9601



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008816  A9601_00051  TPR-repeat pilus assembly protein TadD  100 
 
 
287 aa  560  1e-158  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00051  TPR-repeat pilus assembly protein TadD  83.97 
 
 
287 aa  484  1e-136  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.589169  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0006  TPR repeat-containing protein  77 
 
 
287 aa  437  1e-121  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00051  TPR-repeat pilus assembly protein TadD  62.68 
 
 
284 aa  335  5.999999999999999e-91  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.668643  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00051  Flp pilus assembly protein TadD  42.09 
 
 
297 aa  199  6e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000470033 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0006  TPR repeat-containing protein  38.13 
 
 
293 aa  186  4e-46  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.437171  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0006  hypothetical protein  36.56 
 
 
293 aa  183  3e-45  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00051  TPR-repeat pilus assembly protein TadD  38.85 
 
 
297 aa  172  5.999999999999999e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1333  TPR repeat-containing protein  38.06 
 
 
288 aa  165  6.9999999999999995e-40  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.433409  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0531  TPR repeat-containing protein  34.87 
 
 
287 aa  165  1.0000000000000001e-39  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.259397  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00051  TPR-repeat pilus assembly protein TadD  36.82 
 
 
276 aa  164  2.0000000000000002e-39  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2856  TPR repeat-containing protein  32.67 
 
 
297 aa  141  9.999999999999999e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3161  TPR repeat-containing protein  33.6 
 
 
297 aa  134  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2957  TPR repeat-containing protein  33.6 
 
 
297 aa  134  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.338311  normal  0.060469 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2822  tetratricopeptide repeat-containing protein  27.68 
 
 
290 aa  126  5e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0986349  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0927  TPR repeat-containing protein  27.84 
 
 
291 aa  124  1e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4071  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.82 
 
 
291 aa  114  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5036  tetratricopeptide TPR_2  29.18 
 
 
288 aa  114  2.0000000000000002e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0840723  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  30.04 
 
 
1694 aa  94  2e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  24.84 
 
 
4079 aa  73.9  0.000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2318  tetratricopeptide protein  23.55 
 
 
573 aa  73.9  0.000000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4355  TPR repeat-containing protein  24.48 
 
 
1192 aa  70.5  0.00000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.862224  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  29.79 
 
 
927 aa  70.1  0.00000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3363  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.81 
 
 
289 aa  69.7  0.00000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.040769  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  29.19 
 
 
3560 aa  69.3  0.00000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3665  TPR repeat-containing protein  31.21 
 
 
289 aa  68.6  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00516372  normal  0.53352 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0191  TPR repeat-containing protein  27.17 
 
 
250 aa  67.4  0.0000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.641193  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4626  TPR repeat-containing protein  25.13 
 
 
452 aa  67.4  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2439  TPR repeat-containing protein  24.54 
 
 
448 aa  67.8  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0207467  normal  0.980065 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1622  TPR repeat-containing protein  25.29 
 
 
254 aa  67.4  0.0000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0959  hypothetical protein  25.49 
 
 
620 aa  67  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.868556 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2941  hypothetical protein  27.5 
 
 
560 aa  65.5  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000171884  normal  0.0147454 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1653  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.88 
 
 
758 aa  65.5  0.000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3028  TPR repeat-containing protein  24.84 
 
 
620 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.985806  normal  0.0142271 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  25.37 
 
 
1276 aa  65.1  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8213  TPR repeat-containing protein  26.77 
 
 
392 aa  64.7  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0720948  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4726  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  30.08 
 
 
730 aa  64.7  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24071  hypothetical protein  28.14 
 
 
622 aa  64.3  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2383  TPR repeat-containing protein  28.39 
 
 
1421 aa  64.3  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.823331 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0083  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.63 
 
 
2240 aa  63.9  0.000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  24.7 
 
 
3035 aa  63.5  0.000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1260  TPR repeat-containing protein  23.49 
 
 
573 aa  63.2  0.000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.439457 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0157  TPR repeat-containing protein  22.34 
 
 
465 aa  62.4  0.000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1605  tetratricopeptide TPR_2  24.85 
 
 
252 aa  61.6  0.00000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.790082 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0698  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.19 
 
 
784 aa  61.2  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013163  Cyan8802_4605  TPR repeat-containing protein  35.71 
 
 
279 aa  61.2  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1356  beta-lactamase domain-containing protein  28.66 
 
 
833 aa  60.5  0.00000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1449  tetratricopeptide TPR_2  23.84 
 
 
1067 aa  60.1  0.00000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0930  TPR repeat-containing protein  30 
 
 
329 aa  60.1  0.00000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24081  hypothetical protein  28.83 
 
 
764 aa  59.7  0.00000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1552  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  26.72 
 
 
707 aa  59.7  0.00000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0225548 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1187  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.58 
 
 
293 aa  59.7  0.00000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0548059  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2417  TPR repeat-containing protein  24.71 
 
 
762 aa  59.7  0.00000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  25.79 
 
 
810 aa  59.7  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  26.4 
 
 
3145 aa  59.7  0.00000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2680  peptidase S41  25.82 
 
 
745 aa  59.3  0.00000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.20871  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3201  TPR repeat-containing protein  26.82 
 
 
955 aa  59.3  0.00000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0757905 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2005  TPR repeat-containing protein  25.12 
 
 
512 aa  59.3  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.915591 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2406  tetratricopeptide TPR_2  21.97 
 
 
436 aa  58.9  0.00000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24161  hypothetical protein  28 
 
 
661 aa  58.5  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0114  TPR repeat-containing protein  23.81 
 
 
602 aa  58.2  0.0000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.606428  normal  0.312557 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2953  TPR repeat-containing protein  26.62 
 
 
711 aa  58.5  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0781794 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5176  family 2 glycosyl transferase  32.94 
 
 
434 aa  57.4  0.0000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.634801  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0087  TPR repeat-containing protein  18.42 
 
 
366 aa  57.4  0.0000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0774  tetratricopeptide TPR_2  27.45 
 
 
519 aa  57.8  0.0000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.169881  normal  0.452711 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2135  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.23 
 
 
373 aa  57.4  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.204203  normal  0.945333 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1399  TPR repeat-containing protein  23.27 
 
 
450 aa  57.4  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28481  hypothetical protein  29.92 
 
 
462 aa  57.8  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3102  TPR repeat-containing protein  27.45 
 
 
313 aa  57  0.0000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000142669  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  25.18 
 
 
4489 aa  57  0.0000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6369  TPR repeat-containing protein  22.78 
 
 
607 aa  57  0.0000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  26.13 
 
 
878 aa  57  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7855  TPR domain-containing protein  19.28 
 
 
648 aa  56.6  0.0000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.126864 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0602  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.97 
 
 
586 aa  56.6  0.0000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0722  TPR repeat-containing protein  23.53 
 
 
615 aa  56.2  0.0000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.434562 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3199  TPR repeat-containing protein  24.6 
 
 
565 aa  56.6  0.0000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.714786  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0329  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.03 
 
 
297 aa  56.2  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0336  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.03 
 
 
297 aa  56.2  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0060  TPR repeat-containing protein  23.26 
 
 
562 aa  56.2  0.0000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2708  tetratricopeptide TPR_2  26.29 
 
 
979 aa  56.2  0.0000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.169437 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2212  TPR repeat-containing protein  24.56 
 
 
1276 aa  55.8  0.0000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.524691  normal 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0233  TPR repeat-containing protein  23.97 
 
 
421 aa  55.8  0.0000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.683027 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1825  TPR repeat-containing protein  28 
 
 
523 aa  55.8  0.0000007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.578572  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13011  hypothetical protein  27.69 
 
 
737 aa  55.8  0.0000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.113459 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3209  tetratricopeptide repeat-containing protein  23.83 
 
 
743 aa  55.8  0.0000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3643  TPR domain-containing protein  23.38 
 
 
1979 aa  55.5  0.0000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  23.57 
 
 
543 aa  55.5  0.0000009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28691  hypothetical protein  27.49 
 
 
306 aa  55.8  0.0000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0641  TPR repeat-containing protein  29.06 
 
 
1094 aa  55.5  0.0000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.230386  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  23.87 
 
 
725 aa  55.5  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0990  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.63 
 
 
410 aa  55.1  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.113297  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0301  TPR repeat-containing protein  26.67 
 
 
1827 aa  55.5  0.000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1934  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.83 
 
 
413 aa  55.5  0.000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0911  tetratricopeptide TPR_4  25 
 
 
875 aa  55.1  0.000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.379762  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0200  TPR repeat-containing protein  27.19 
 
 
505 aa  55.1  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2994  TPR repeat-containing protein  30.33 
 
 
317 aa  55.5  0.000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0858  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  23.48 
 
 
479 aa  55.1  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0453  TPR domain-containing protein  22.58 
 
 
626 aa  54.7  0.000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.311085  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0177  TPR repeat-containing protein  22.58 
 
 
614 aa  54.7  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2599  TPR domain-containing protein  22.58 
 
 
614 aa  54.7  0.000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0734298  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>