196 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_4516 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011891  A2cp1_4516  ribonuclease P protein component  100 
 
 		 116 aa  221  2e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4497  ribonuclease P protein component  97.41 
 
 		 116 aa  192  1e-48  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4360  ribonuclease P protein component  95.79 
 
 		 116 aa  179  8.000000000000001e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4508  ribonuclease P protein component  70.97 
 
 		 170 aa  107  6e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3625  ribonuclease P protein component  42.73 
 
 		 135 aa  82.4  0.000000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.284043  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1969  ribonuclease P protein component  43.7 
 
 		 130 aa  75.9  0.0000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.171336  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4151  ribonuclease P  38.32 
 
 		 116 aa  70.9  0.000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4060  ribonuclease P  38.32 
 
 		 116 aa  69.3  0.00000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000000175953  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4431  ribonuclease P  39 
 
 		 113 aa  68.6  0.00000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0167  ribonuclease P  45.88 
 
 		 119 aa  67.4  0.00000000005  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  decreased coverage  0.00183081  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0129  ribonuclease P  32.67 
 
 		 117 aa  67  0.00000000009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4027  ribonuclease P  33.96 
 
 		 115 aa  66.2  0.0000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.246151  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5321  ribonuclease P  36.63 
 
 		 115 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.852432 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5614  ribonuclease P  36.63 
 
 		 115 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.234038  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5674  ribonuclease P  34.65 
 
 		 115 aa  65.5  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0640013  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5597  ribonuclease P  34.65 
 
 		 119 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5638  ribonuclease P  34.65 
 
 		 115 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.108517  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5340  ribonuclease P  34.65 
 
 		 119 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000509102  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5168  ribonuclease P  34.65 
 
 		 119 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000202449  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5184  ribonuclease P  34.65 
 
 		 119 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000560819  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5737  ribonuclease P  34.65 
 
 		 119 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.123315  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0035  ribonuclease P protein component  38.71 
 
 		 116 aa  63.9  0.0000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.816345  normal  0.309207 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0034  ribonuclease P protein component  38.71 
 
 		 116 aa  63.9  0.0000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5280  ribonuclease P  34.65 
 
 		 115 aa  62.8  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00507948  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3561  ribonuclease P  34.65 
 
 		 121 aa  63.2  0.000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0121  ribonuclease P protein component  32.99 
 
 		 119 aa  62  0.000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.406927  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1738  ribonuclease P protein component  32.32 
 
 		 116 aa  62.4  0.000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000204064  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0100  ribonuclease P protein component  38.61 
 
 		 121 aa  62  0.000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3320  ribonuclease P protein component  37.07 
 
 		 120 aa  60.8  0.000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3644  ribonuclease P protein component  42.53 
 
 		 123 aa  61.2  0.000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00220014  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4044  ribonuclease P protein component  39.6 
 
 		 152 aa  60.8  0.000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.534814 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0002  ribonuclease P  33.33 
 
 		 115 aa  59.7  0.00000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00006762  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0219  ribonuclease P protein component  39.6 
 
 		 154 aa  59.7  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1790  ribonuclease P  35.29 
 
 		 111 aa  59.3  0.00000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000000276815  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5949  ribonuclease P protein component  47.25 
 
 		 132 aa  58.9  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2396  ribonuclease P protein component  42.35 
 
 		 125 aa  58.2  0.00000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00000000617506  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1943  ribonuclease P  33.66 
 
 		 117 aa  58.2  0.00000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0018816  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2602  ribonuclease P protein component  53.7 
 
 		 116 aa  57.8  0.00000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.201057  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1897  ribonuclease P  34 
 
 		 122 aa  57.4  0.00000006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  3.53987e-16  hitchhiker  4.71177e-26 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4137  ribonuclease P protein component  31.87 
 
 		 107 aa  57  0.00000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0213874  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2735  ribonuclease P  33.33 
 
 		 117 aa  57.4  0.00000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.178342  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2792  ribonuclease P  33.33 
 
 		 117 aa  57.4  0.00000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.437521  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3868  ribonuclease P  42.65 
 
 		 120 aa  57  0.00000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000277263  unclonable  0.00000245558 
 
 
-
 
NC_006368  lpp3076  hypothetical protein  29.46 
 
 		 114 aa  56.2  0.0000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2932  hypothetical protein  29.46 
 
 		 114 aa  56.6  0.0000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0004  ribonuclease P  32.58 
 
 		 120 aa  56.6  0.0000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000000936038  unclonable  0.0000000000697895 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1542  ribonuclease P protein component  34.96 
 
 		 162 aa  56.2  0.0000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.200332  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2064  ribonuclease P  40.23 
 
 		 116 aa  55.8  0.0000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0143582  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3759  ribonuclease P protein component  40.21 
 
 		 130 aa  55.8  0.0000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0896  ribonuclease P  33.64 
 
 		 129 aa  55.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0604  ribonuclease P protein component  35.29 
 
 		 118 aa  55.5  0.0000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00426381  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3433  ribonuclease P  33.68 
 
 		 116 aa  55.5  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000000048083  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1629  ribonuclease P protein component  33.72 
 
 		 131 aa  55.8  0.0000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.315219  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03587  ribonuclease P  36.89 
 
 		 119 aa  55.5  0.0000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.201936  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4221  ribonuclease P  36.89 
 
 		 119 aa  55.5  0.0000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000102528  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4214  ribonuclease P  36.89 
 
 		 119 aa  55.5  0.0000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000396678  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3917  ribonuclease P  36.89 
 
 		 119 aa  55.5  0.0000003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000273614  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03531  hypothetical protein  36.89 
 
 		 119 aa  55.5  0.0000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.118507  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4071  ribonuclease P  36.89 
 
 		 119 aa  55.5  0.0000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00679811  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5134  ribonuclease P  38.82 
 
 		 119 aa  54.7  0.0000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00130238  normal  0.0222111 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4369  ribonuclease P protein component  30.21 
 
 		 109 aa  54.7  0.0000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.126994  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4314  ribonuclease P protein component  45.9 
 
 		 120 aa  54.7  0.0000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00101008  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2141  ribonuclease P protein component  39.33 
 
 		 130 aa  54.7  0.0000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.154596 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2934  ribonuclease P protein component  31.68 
 
 		 115 aa  55.1  0.0000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000200185  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0890  ribonuclease P protein component  36.67 
 
 		 180 aa  55.1  0.0000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0029715 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0030  ribonuclease P  35.59 
 
 		 119 aa  55.1  0.0000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00687472  normal  0.199191 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4232  ribonuclease P  36.89 
 
 		 119 aa  54.3  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.000722418  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4053  ribonuclease P  36.89 
 
 		 119 aa  54.3  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.000316737  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4175  ribonuclease P  36.89 
 
 		 119 aa  54.3  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.936833  normal  0.955569 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4068  ribonuclease P  36.89 
 
 		 119 aa  54.3  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000599062  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4125  ribonuclease P  36.89 
 
 		 119 aa  54.3  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00333224  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5267  ribonuclease P  39.29 
 
 		 131 aa  53.9  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.115584  normal  0.101846 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6077  ribonuclease P  42.35 
 
 		 119 aa  54.3  0.0000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0418194  normal  0.134211 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1200  ribonuclease P protein component  38.95 
 
 		 150 aa  53.9  0.0000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00390619 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4931  ribonuclease P  38.81 
 
 		 119 aa  53.5  0.0000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000059586  unclonable  0.00000000749508 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2576  RNase P protein component  33.98 
 
 		 119 aa  53.9  0.0000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4262  ribonuclease P protein component  38.04 
 
 		 108 aa  53.5  0.000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.117782  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0408  ribonuclease P  28.28 
 
 		 109 aa  52.8  0.000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4291  ribonuclease P  36.96 
 
 		 108 aa  53.1  0.000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000762  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4037  ribonuclease P  38.82 
 
 		 119 aa  53.5  0.000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.438672  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2949  ribonuclease P protein component  38.1 
 
 		 120 aa  52.8  0.000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000512551  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4259  ribonuclease P  38.81 
 
 		 120 aa  52.4  0.000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000000742435  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4266  ribonuclease P  40 
 
 		 119 aa  52  0.000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000515429  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4151  ribonuclease P protein component  38.04 
 
 		 108 aa  51.6  0.000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000000747963  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4101  ribonuclease P  41.3 
 
 		 127 aa  51.2  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4065  ribonuclease P  34.33 
 
 		 118 aa  51.2  0.000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000140717  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0829  ribonuclease P  42.35 
 
 		 124 aa  51.2  0.000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.861038 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4155  ribonuclease P  33.9 
 
 		 119 aa  51.6  0.000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  4.58759e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0011  ribonuclease P  38.81 
 
 		 118 aa  50.8  0.000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000000676804  hitchhiker  0.000546181 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13958  ribonuclease P  38.96 
 
 		 125 aa  51.2  0.000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2996  ribonuclease P  38.2 
 
 		 125 aa  50.8  0.000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000822394  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2673  ribonuclease P  38.2 
 
 		 125 aa  50.8  0.000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00724132  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3490  ribonuclease P  37.21 
 
 		 121 aa  50.8  0.000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000922016  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3215  ribonuclease P protein component  38.32 
 
 		 114 aa  50.4  0.000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1040  ribonuclease P protein component  26.73 
 
 		 129 aa  50.4  0.000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000299838  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1331  ribonuclease P protein component  37.33 
 
 		 117 aa  50.8  0.000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000271159  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5095  ribonuclease P protein component  40.34 
 
 		 127 aa  50.4  0.000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_4004  ribonuclease P  34.33 
 
 		 118 aa  50.4  0.000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000000119749  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4034  ribonuclease P  34.33 
 
 		 118 aa  50.1  0.000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000319179  hitchhiker  0.000155322 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0008  ribonuclease P  34.33 
 
 		 118 aa  50.1  0.000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000450646  unclonable  0.0000000000397397 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>