More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_4498 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007760  Adeh_4343  selenocysteine lyase  94.78 
 
 		 384 aa  690    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4498  aminotransferase class V  100 
 
 		 384 aa  746    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4479  aminotransferase class V  98.17 
 
 		 384 aa  731    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4490  aminotransferase class V  76.13 
 
 		 389 aa  552  1e-156  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0650155 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3040  aminotransferase, class V  35.19 
 
 		 381 aa  158  2e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.130075  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2207  aminotransferase, class V  35.98 
 
 		 381 aa  157  4e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02090  hypothetical protein  29.33 
 
 		 380 aa  154  4e-36  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.468544  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0554  aminotransferase, class V  34.25 
 
 		 355 aa  150  5e-35  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.721131  hitchhiker  0.00373299 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1341  aminotransferase class V  34.06 
 
 		 377 aa  149  7e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.365478 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2438  aminotransferase class V  29.58 
 
 		 398 aa  144  4e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.359117 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2373  aminotransferase, class V  30.87 
 
 		 378 aa  143  4e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1413  aminotransferase, class V  31.59 
 
 		 381 aa  135  9.999999999999999e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.354567  normal  0.630226 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1280  hypothetical protein  30.75 
 
 		 411 aa  132  6.999999999999999e-30  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.586224  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7397  Selenocysteine lyase  30.95 
 
 		 382 aa  130  5.0000000000000004e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.354097  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1785  aminotransferase class V  36.04 
 
 		 347 aa  122  9.999999999999999e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00235645 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15030  cysteine desulfurase protein  30.03 
 
 		 377 aa  120  3.9999999999999996e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1866  aminotransferase class V  28.46 
 
 		 387 aa  119  6e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.733686  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03589  aminotransferase, class V superfamily  30.26 
 
 		 393 aa  119  7.999999999999999e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.301675  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4796  aminotransferase class V  33.06 
 
 		 362 aa  118  1.9999999999999998e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.688685 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1656  aminotransferase, class V  26.95 
 
 		 377 aa  117  3.9999999999999997e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000223228  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25790  hypothetical protein  31.41 
 
 		 377 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.226944 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0737  aminotransferase, class V  26.77 
 
 		 368 aa  113  6e-24  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1637  aminotransferase, class V  28.57 
 
 		 377 aa  112  8.000000000000001e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.681858  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0911  aminotransferase, class V  30.65 
 
 		 379 aa  112  1.0000000000000001e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2203  hypothetical protein  30.72 
 
 		 377 aa  109  8.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0034  aminotransferase class V  23.87 
 
 		 376 aa  108  2e-22  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.163206  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2765  aminotransferase class V  32.52 
 
 		 379 aa  108  2e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1864  aminotransferase class V  33.42 
 
 		 352 aa  108  2e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.126544  normal  0.578311 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1984  aminotransferase class V  31.32 
 
 		 345 aa  108  2e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.817831  hitchhiker  0.0000368323 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5353  aminotransferase class V  32.97 
 
 		 380 aa  107  4e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.11849 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3723  aminotransferase class V  29.82 
 
 		 372 aa  106  8e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.15701  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5082  aminotransferase class V  30.16 
 
 		 402 aa  105  9e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.0000086974  normal  0.0923906 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1720  hypothetical protein  29.92 
 
 		 401 aa  105  9e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0138813  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3088  aminotransferase class V  30.67 
 
 		 374 aa  103  4e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4459  aminotransferase class V  30.43 
 
 		 341 aa  103  4e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  unclonable  0.0000000253677  hitchhiker  0.00260881 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4955  aminotransferase class V  27.2 
 
 		 387 aa  103  6e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.38029  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1756  aminotransferase class V  24.77 
 
 		 438 aa  103  7e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.60376  normal  0.594036 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4777  aminotransferase, class V  29.4 
 
 		 391 aa  102  1e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0469336 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2068  aminotransferase, class V  27.72 
 
 		 392 aa  102  1e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6148  aminotransferase class V  27.59 
 
 		 416 aa  101  2e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.922128  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2309  aminotransferase, class V  32.88 
 
 		 287 aa  101  2e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.422271  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1799  aminotransferase, class V  34.42 
 
 		 347 aa  101  2e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.365692  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1533  aminotransferase class V  28.8 
 
 		 377 aa  99.4  1e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.172669  normal  0.519626 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0934  cysteine desulfurase family protein  31.58 
 
 		 395 aa  98.2  2e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.114652  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1250  aminotransferase class V  29.35 
 
 		 372 aa  97.8  3e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2385  aminotransferase class V  33.06 
 
 		 357 aa  97.1  4e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00212379  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1623  cysteine desulfurase  36.75 
 
 		 406 aa  97.1  5e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0344832 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0729  NifS protein  26.56 
 
 		 393 aa  96.3  8e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0788  aminotransferase class V  28.01 
 
 		 367 aa  96.3  8e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1984  aminotransferase, class V  25.69 
 
 		 394 aa  96.3  8e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.278859  normal  0.836735 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5541  aminotransferase, class V  28.24 
 
 		 394 aa  95.5  1e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1255  L-cysteine/cystine lyase  31.3 
 
 		 387 aa  95.9  1e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0542203  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2203  aminotransferase, class V  23.47 
 
 		 393 aa  94.4  3e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.697874  normal  0.788418 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1692  cysteine desulfurase family protein  28.81 
 
 		 385 aa  94.4  3e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2316  cysteine desulfurase family protein  30.33 
 
 		 383 aa  94.4  3e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.996652  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3297  aminotransferase, class V  31.47 
 
 		 393 aa  94.4  3e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.245647 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3970  SufS subfamily cysteine desulfurase  31.62 
 
 		 403 aa  94  4e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.615432  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5012  aminotransferase class V  30.09 
 
 		 407 aa  94  4e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1932  cysteine desulfurase family protein  30 
 
 		 380 aa  93.6  5e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2088  SufS subfamily cysteine desulfurase  28.12 
 
 		 406 aa  93.2  8e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.519115 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2356  SufS subfamily cysteine desulfurase  29.03 
 
 		 406 aa  92.8  8e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3773  aminotransferase class V  31.61 
 
 		 391 aa  92  2e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.460998  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2318  aminotransferase, class V  29.43 
 
 		 394 aa  92  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.698487  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1300  cysteine desulphurase-like protein  28.46 
 
 		 381 aa  91.7  2e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0145428  hitchhiker  0.00325394 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1071  aminotransferase, class V  28.2 
 
 		 382 aa  91.3  2e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5290  aminotransferase class V  30.85 
 
 		 380 aa  91.7  2e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00731204  normal  0.0470255 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1811  aminotransferase class V  28.52 
 
 		 395 aa  90.9  3e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0747034  hitchhiker  0.00000000219699 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0008  aminotransferase, class V  28.86 
 
 		 376 aa  90.9  3e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0672811  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0431  putative selenocysteine lyase  27.83 
 
 		 406 aa  90.5  4e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2273  cysteine desulfurase, SufS subfamily  35.43 
 
 		 442 aa  90.5  5e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3782  aminotransferase class V  25.27 
 
 		 384 aa  90.1  6e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0665  aminotransferase class V  32.93 
 
 		 393 aa  89.4  1e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17260  selenocysteine lyase  32.46 
 
 		 413 aa  88.6  2e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.118877  normal  0.0290981 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0028  hypothetical protein  28.84 
 
 		 368 aa  88.2  2e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0845  SufS subfamily cysteine desulfurase  23.71 
 
 		 413 aa  88.2  2e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0861  SufS subfamily cysteine desulfurase  23.71 
 
 		 413 aa  88.2  2e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.762782  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2355  SufS subfamily cysteine desulfurase  35.58 
 
 		 407 aa  87.8  3e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.331891  normal  0.378457 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3128  cysteine desulfurase family protein  35.81 
 
 		 414 aa  87  4e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000597393  normal  0.0761383 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1941  aminotransferase class V  23.81 
 
 		 394 aa  87  4e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0312599  normal  0.253942 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21910  cysteine desulfurase  35.96 
 
 		 435 aa  87.4  4e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17050  selenocysteine lyase  29.33 
 
 		 403 aa  87  5e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1293  cysteine desulfurase, SufS subfamily  28.47 
 
 		 441 aa  86.7  6e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000571182 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01976  cysteine desulfurase  26.55 
 
 		 414 aa  85.1  0.000000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.315198  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1472  putative pyridoxal-phosphate dependent enzyme  29.11 
 
 		 401 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0498  cysteine desulfurase SufS  23.45 
 
 		 413 aa  84.7  0.000000000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1295  aminotransferase class V  26.84 
 
 		 430 aa  84.3  0.000000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.35338  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2313  cysteine desulfurase family protein  27.89 
 
 		 380 aa  84.3  0.000000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2502  aminotransferase class V  24.25 
 
 		 399 aa  84.3  0.000000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.207929  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3484  cysteine desulfurase, SufS subfamily  35.19 
 
 		 442 aa  83.6  0.000000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.615799  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1319  SufS subfamily cysteine desulfurase  34.71 
 
 		 413 aa  83.6  0.000000000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0340803  normal  0.349427 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3060  aminotransferase, class V  29.74 
 
 		 407 aa  84  0.000000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.349128  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28070  cysteine desulfurase-like protein  34.43 
 
 		 442 aa  83.2  0.000000000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.622503  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8515  aminotransferase class V  25.36 
 
 		 401 aa  82.8  0.000000000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.372361  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2054  aminotransferase, class V  28.46 
 
 		 880 aa  82.8  0.00000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.754406 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1728  cysteine desulfurase family protein  29.71 
 
 		 410 aa  82.4  0.00000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0576314  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1896  cysteine desulfurase, SufS subfamily  32.95 
 
 		 427 aa  82.4  0.00000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3075  cysteine desulfurase family protein  29.24 
 
 		 381 aa  82.4  0.00000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000209414 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2291  cysteine desulfurase family protein  28.53 
 
 		 380 aa  81.6  0.00000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2495  cysteine desulfurase family protein  34.93 
 
 		 385 aa  82  0.00000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.123711  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2945  aminotransferase, class V  29.65 
 
 		 381 aa  81.6  0.00000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.119234  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>