56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_4452 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011145  AnaeK_4431  HNH endonuclease  88.81 
 
 
554 aa  905    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4452  HNH endonuclease  100 
 
 
555 aa  1076    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.673536  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4442  HNH endonuclease  55.46 
 
 
567 aa  510  1e-143  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1738  HNH nuclease  57.65 
 
 
582 aa  498  1e-140  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.425954  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2101  HNH nuclease  57.09 
 
 
576 aa  492  9.999999999999999e-139  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1416  HNH endonuclease  43.84 
 
 
582 aa  314  2.9999999999999996e-84  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2806  HNH endonuclease  44.03 
 
 
582 aa  308  2.0000000000000002e-82  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2991  HNH nuclease  41.72 
 
 
584 aa  307  3e-82  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.76476  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0461  HNH endonuclease  43.04 
 
 
575 aa  298  1e-79  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2447  HNH endonuclease  42.3 
 
 
592 aa  293  5e-78  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.44896  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2722  HNH nuclease  41.78 
 
 
571 aa  292  1e-77  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.265119  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1011  hypothetical protein  41.09 
 
 
564 aa  288  1e-76  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0792  hypothetical protein  42.27 
 
 
553 aa  288  2e-76  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1070  hypothetical protein  42.72 
 
 
554 aa  283  8.000000000000001e-75  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.495852  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1075  hypothetical protein  40.65 
 
 
558 aa  279  9e-74  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.128214  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2531  HNH nuclease  42.94 
 
 
572 aa  271  2e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0795  hypothetical protein  40.85 
 
 
552 aa  269  1e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.125968  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0743  hypothetical protein  39.81 
 
 
553 aa  266  7e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.49119  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0994  HNH nuclease  48.06 
 
 
153 aa  117  5e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.497036  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4861  HNH endonuclease  38.36 
 
 
472 aa  50.1  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.254841 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0436  hypothetical protein  41.18 
 
 
430 aa  48.1  0.0004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.257628  normal  0.0261589 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3400  HNH endonuclease  33.03 
 
 
390 aa  48.1  0.0004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00340791  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0998  HNH endonuclease  32.73 
 
 
387 aa  48.1  0.0004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.638291  normal  0.453877 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0426  hypothetical protein  41.18 
 
 
434 aa  48.1  0.0004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2508  hypothetical protein  41.18 
 
 
441 aa  48.5  0.0004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  hitchhiker  0.0045565  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1187  hypothetical protein  41.18 
 
 
430 aa  48.1  0.0004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.102985  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1214  hypothetical protein  41.18 
 
 
426 aa  48.1  0.0004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0902483 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0413  hypothetical protein  41.18 
 
 
426 aa  48.1  0.0004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0654  HNH endonuclease  46.15 
 
 
111 aa  48.1  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2471  hypothetical protein  41.18 
 
 
445 aa  48.1  0.0004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2516  hypothetical protein  41.18 
 
 
445 aa  48.1  0.0004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1204  hypothetical protein  41.18 
 
 
430 aa  48.1  0.0004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2479  hypothetical protein  41.18 
 
 
430 aa  48.1  0.0005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.82218  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0067  HNH endonuclease  31.33 
 
 
458 aa  47.8  0.0005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1846  hypothetical protein  39.71 
 
 
434 aa  47.4  0.0008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.785639  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4621  hypothetical protein  30.43 
 
 
481 aa  47  0.0008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.957856  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09750  HNH endonuclease  50.91 
 
 
494 aa  46.6  0.001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.00000378313  normal  0.0136835 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1632  HNH endonuclease  31.82 
 
 
388 aa  46.2  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.437118  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1431  HNH endonuclease  33.03 
 
 
388 aa  46.6  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.535031  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1700  HNH endonuclease  32.11 
 
 
388 aa  45.8  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  hitchhiker  0.00106635  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3732  hypothetical protein  39.71 
 
 
438 aa  46.2  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3805  hypothetical protein  39.71 
 
 
438 aa  46.2  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.482154  normal  0.0784296 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2410  HNH endonuclease  31.82 
 
 
176 aa  45.8  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.618861  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5387  hypothetical protein  38.24 
 
 
437 aa  45.4  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0218084  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5006  hypothetical protein  38.24 
 
 
435 aa  45.4  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0237713  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5094  hypothetical protein  38.24 
 
 
435 aa  45.4  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0514803  normal  0.717772 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3744  hypothetical protein  38.24 
 
 
436 aa  44.7  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2373  hypothetical protein  31.19 
 
 
480 aa  45.1  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.022356 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1449  HNH endonuclease  31.19 
 
 
391 aa  45.1  0.004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.964003  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4158  HNH endonuclease  32.11 
 
 
388 aa  44.7  0.004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0493415 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1865  HNH endonuclease  39.39 
 
 
142 aa  45.1  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4558  hypothetical protein  30.28 
 
 
489 aa  44.7  0.005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.361669  normal  0.318534 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3198  HNH endonuclease  31.82 
 
 
388 aa  44.7  0.005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3075  HNH endonuclease  32.11 
 
 
391 aa  44.7  0.005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  hitchhiker  0.00244275  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11790  hypothetical protein  36.36 
 
 
418 aa  43.9  0.008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  4.8127e-48  hitchhiker  0.00000599328 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2442  hypothetical protein  38.24 
 
 
440 aa  43.9  0.008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>