More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_4334 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011891  A2cp1_4334  50S ribosomal protein L27  100 
 
 		 85 aa  170  6.999999999999999e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4181  50S ribosomal protein L27  100 
 
 		 85 aa  170  6.999999999999999e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.186505  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4312  50S ribosomal protein L27  100 
 
 		 85 aa  170  6.999999999999999e-42  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4327  50S ribosomal protein L27  91.76 
 
 		 85 aa  160  6e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.520915 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2237  ribosomal protein L27  65.06 
 
 		 91 aa  114  3.9999999999999997e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.140821  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1379  50S ribosomal protein L27  65.12 
 
 		 89 aa  113  8.999999999999998e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0163  50S ribosomal protein L27  67.47 
 
 		 85 aa  113  8.999999999999998e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000000390958  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0146  50S ribosomal protein L27  67.47 
 
 		 85 aa  112  1.0000000000000001e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2057  50S ribosomal protein L27  65 
 
 		 87 aa  111  3e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.976216  normal  0.840982 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3196  50S ribosomal protein L27  64.71 
 
 		 85 aa  110  5e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000840306  unclonable  7.875010000000001e-24 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3589  50S ribosomal protein L27  67.47 
 
 		 84 aa  110  5e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000197888  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3640  50S ribosomal protein L27  65.06 
 
 		 88 aa  110  6e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.320466  normal  0.463755 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0305  50S ribosomal protein L27  65.06 
 
 		 85 aa  110  7.000000000000001e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000393871  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2249  50S ribosomal protein L27  66.25 
 
 		 89 aa  108  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0281332  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3235  50S ribosomal protein L27  65.06 
 
 		 85 aa  108  2.0000000000000002e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.000158281  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05970  LSU ribosomal protein L27P  67.47 
 
 		 84 aa  108  2.0000000000000002e-23  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.0000567704  hitchhiker  0.000000000000675699 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0348  50S ribosomal protein L27  65.06 
 
 		 84 aa  108  3e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000453633  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2181  50S ribosomal protein L27  63.64 
 
 		 88 aa  107  4.0000000000000004e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.128983  normal  0.935252 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0454  50S ribosomal protein L27  62.35 
 
 		 89 aa  107  4.0000000000000004e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1537  50S ribosomal protein L27  61.18 
 
 		 85 aa  107  4.0000000000000004e-23  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2691  50S ribosomal protein L27  63.95 
 
 		 89 aa  107  5e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0303281  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0130  50S ribosomal protein L27  63.86 
 
 		 84 aa  107  6e-23  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0090  50S ribosomal protein L27  63.86 
 
 		 84 aa  107  6e-23  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0327893  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0099  50S ribosomal protein L27  63.86 
 
 		 84 aa  107  6e-23  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0087  50S ribosomal protein L27  66.27 
 
 		 83 aa  107  7.000000000000001e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000279495  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3418  50S ribosomal protein L27  63.95 
 
 		 88 aa  106  8.000000000000001e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1415  50S ribosomal protein L27  58.82 
 
 		 85 aa  106  1e-22  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1625  ribosomal protein L27  60 
 
 		 143 aa  105  1e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.388698 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1725  50S ribosomal protein L27  61.18 
 
 		 85 aa  105  2e-22  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0184  50S ribosomal protein L27  62.65 
 
 		 84 aa  105  2e-22  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2143  50S ribosomal protein L27  62.35 
 
 		 90 aa  105  3e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.672881 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0996  50S ribosomal protein L27  60 
 
 		 85 aa  104  3e-22  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0310  50S ribosomal protein L27  58.82 
 
 		 89 aa  104  4e-22  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4921  50S ribosomal protein L27  63.53 
 
 		 88 aa  103  5e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0271507  normal  0.71556 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1617  50S ribosomal protein L27  67.07 
 
 		 82 aa  103  6e-22  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.000121175  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0647  50S ribosomal protein L27  65.06 
 
 		 89 aa  103  6e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.908873 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4102  50S ribosomal protein L27  62.65 
 
 		 90 aa  103  6e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.500877 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2480  ribosomal protein L27  59.04 
 
 		 100 aa  103  7e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.782187  normal  0.22295 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1515  50S ribosomal protein L27  62.65 
 
 		 93 aa  103  8e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0090282  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2582  50S ribosomal protein L27  59.04 
 
 		 84 aa  103  8e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.6027199999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0232  50S ribosomal protein L27  62.65 
 
 		 89 aa  103  8e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2046  ribosomal protein L27  56.79 
 
 		 90 aa  103  1e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4413  50S ribosomal protein L27  63.53 
 
 		 88 aa  103  1e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4876  50S ribosomal protein L27  63.53 
 
 		 88 aa  103  1e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.387156 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0154  50S ribosomal protein L27  61.45 
 
 		 90 aa  102  1e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0315  50S ribosomal protein L27  61.73 
 
 		 85 aa  102  2e-21  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.385897 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4211  50S ribosomal protein L27  61.45 
 
 		 93 aa  102  2e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.121619 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0424  50S ribosomal protein L27  60.24 
 
 		 92 aa  102  2e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.85685  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3471  50S ribosomal protein L27  61.63 
 
 		 87 aa  102  2e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00282639  normal  0.386116 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0515  50S ribosomal protein L27  60.24 
 
 		 90 aa  102  2e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3242  50S ribosomal protein L27  61.18 
 
 		 95 aa  102  2e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2785  50S ribosomal protein L27  61.45 
 
 		 89 aa  102  2e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0242571  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0247  50S ribosomal protein L27  61.45 
 
 		 89 aa  101  3e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3870  50S ribosomal protein L27  62.79 
 
 		 89 aa  101  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.403314  normal  0.0137956 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0588  50S ribosomal protein L27  61.45 
 
 		 90 aa  101  3e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4724  50S ribosomal protein L27  61.45 
 
 		 88 aa  101  3e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0668122  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4194  50S ribosomal protein L27  62.79 
 
 		 89 aa  101  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3667  50S ribosomal protein L27  59.3 
 
 		 87 aa  101  4e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000345306  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2651  50S ribosomal protein L27  59.52 
 
 		 86 aa  101  4e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0231869  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0510  50S ribosomal protein L27  59.3 
 
 		 87 aa  101  4e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0309377  normal  0.755964 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0508  50S ribosomal protein L27  60.92 
 
 		 87 aa  101  4e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.868007  normal  0.531544 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0552  50S ribosomal protein L27  59.3 
 
 		 87 aa  101  4e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000367957  normal  0.045539 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1112  ribosomal protein L27  63.86 
 
 		 86 aa  101  4e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.55245  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0100  50S ribosomal protein L27  59.3 
 
 		 87 aa  101  4e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00352754  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1223  ribosomal protein L27  62.65 
 
 		 83 aa  101  4e-21  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000141785 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0485  50S ribosomal protein L27  59.3 
 
 		 87 aa  101  4e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0162621  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0582  50S ribosomal protein L27  59.3 
 
 		 87 aa  101  4e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00040366  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0440  50S ribosomal protein L27  61.45 
 
 		 90 aa  100  5e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.944777  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0107  50S ribosomal protein L27  62.65 
 
 		 88 aa  100  5e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.176189 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2801  50S ribosomal protein L27  59.3 
 
 		 87 aa  100  6e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000884705  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1341  50S ribosomal protein L27  60.24 
 
 		 85 aa  100  7e-21  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.00883743  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3073  50S ribosomal protein L27  58.82 
 
 		 91 aa  100  7e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000209952  unclonable  0.0000000174741 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3460  50S ribosomal protein L27  60.24 
 
 		 89 aa  100  7e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.159862  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0426  50S ribosomal protein L27  60.24 
 
 		 89 aa  100  8e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.449955  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3006  50S ribosomal protein L27  58.82 
 
 		 89 aa  100  8e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.549132 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3448  50S ribosomal protein L27  59.77 
 
 		 87 aa  99.4  1e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0232252  hitchhiker  0.00744788 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3465  50S ribosomal protein L27  62.65 
 
 		 94 aa  99.4  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.360708 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0193  50S ribosomal protein L27  60.49 
 
 		 90 aa  99.4  1e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.451706 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0162  50S ribosomal protein L27  62.65 
 
 		 92 aa  99.8  1e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000470304  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3489  50S ribosomal protein L27  59.77 
 
 		 87 aa  99.4  2e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.562103  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2522  50S ribosomal protein L27  59.77 
 
 		 87 aa  99.4  2e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.587643  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0764  50S ribosomal protein L27  61.45 
 
 		 85 aa  98.6  2e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000191049  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0108  50S ribosomal protein L27  60.24 
 
 		 87 aa  99  2e-20  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3523  50S ribosomal protein L27  59.77 
 
 		 87 aa  99.4  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.122565  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0152  50S ribosomal protein L27  59.04 
 
 		 90 aa  99  2e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.670785  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1141  50S ribosomal protein L27  59.77 
 
 		 87 aa  99.4  2e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0445  50S ribosomal protein L27  59.77 
 
 		 87 aa  99.4  2e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1304  50S ribosomal protein L27  59.77 
 
 		 87 aa  99.4  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0269  50S ribosomal protein L27  58.82 
 
 		 85 aa  99  2e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.876975  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4287  50S ribosomal protein L27  63.1 
 
 		 90 aa  99  2e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.835773  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3525  50S ribosomal protein L27  59.77 
 
 		 87 aa  99.4  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.986116  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1611  50S ribosomal protein L27  61.45 
 
 		 97 aa  98.6  2e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000833239  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3259  50S ribosomal protein L27  59.77 
 
 		 87 aa  99.4  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3066  50S ribosomal protein L27  59.3 
 
 		 86 aa  98.2  3e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.447038  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1548  ribosomal protein L27  62.35 
 
 		 85 aa  98.6  3e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0104993  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1461  50S ribosomal protein L27  59.04 
 
 		 89 aa  98.2  3e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0317862 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3282  50S ribosomal protein L27  62.2 
 
 		 91 aa  98.2  3e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0455195 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2656  50S ribosomal protein L27  59.3 
 
 		 86 aa  98.2  3e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0134308  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1137  50S ribosomal protein L27  56.1 
 
 		 84 aa  98.2  3e-20  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.00024272  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0930  50S ribosomal protein L27  60.49 
 
 		 89 aa  97.8  4e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>