More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_4289 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007760  Adeh_4136  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  97.75 
 
 
400 aa  733    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4267  extracellular solute-binding protein family 1  97.25 
 
 
400 aa  744    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4289  extracellular solute-binding protein family 1  100 
 
 
400 aa  803    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.53848  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1453  extracellular solute-binding protein  33.16 
 
 
415 aa  181  2.9999999999999997e-44  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0104666  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1511  extracellular solute-binding protein family 1  29.55 
 
 
424 aa  178  2e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1500  extracellular solute-binding protein  33.33 
 
 
393 aa  177  3e-43  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1055  extracellular solute-binding protein  30.33 
 
 
418 aa  177  4e-43  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.404897  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0199  extracellular solute-binding protein  32.71 
 
 
423 aa  175  9.999999999999999e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.136897  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0205  extracellular solute-binding protein  32.71 
 
 
423 aa  175  9.999999999999999e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4119  putative maltosaccharide ABC transporter, maltosaccharide-binding protein  33.33 
 
 
419 aa  161  2e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000674051  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1262  extracellular solute-binding protein  28.38 
 
 
408 aa  161  2e-38  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.953049  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4064  maltosaccharide ABC transporter, maltosaccharide-binding protein, putative  33.03 
 
 
419 aa  160  3e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0421403  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3754  maltose-maltodextrin ABC-related solute binding protein  33.03 
 
 
419 aa  159  6e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000542287  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1120  putative maltosaccharide ABC transporter, maltosaccharide-binding protein  30.85 
 
 
419 aa  159  6e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000383609  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16190  extracellular solute-binding protein family 1  29.16 
 
 
401 aa  159  6e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00305219  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3922  maltosaccharide ABC transporter maltosaccharide-binding protein  33.03 
 
 
419 aa  159  8e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0134813  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3770  maltosaccharide ABC transporter, maltosaccharide-binding protein  33.03 
 
 
419 aa  159  8e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000087749  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4032  putative maltosaccharide ABC transporter, maltosaccharide-binding protein  33.03 
 
 
419 aa  159  8e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4229  maltosaccharide ABC transporter maltosaccharide-binding protein  33.03 
 
 
419 aa  159  8e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.749727  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0712  extracellular solute-binding protein family 1  30.95 
 
 
397 aa  158  1e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.518168  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4138  putative maltosaccharide ABC transporter, maltosaccharide-binding protein  33.03 
 
 
419 aa  159  1e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00348898  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3841  extracellular solute-binding protein  32.73 
 
 
419 aa  157  2e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000013033  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2714  extracellular solute-binding protein  33.03 
 
 
419 aa  158  2e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.182746  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1321  extracellular solute-binding protein family 1  31.41 
 
 
410 aa  155  9e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2574  extracellular solute-binding protein family 1  29.63 
 
 
401 aa  152  1e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000602333  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1181  extracellular solute-binding protein  29.95 
 
 
413 aa  151  2e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000595288  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2958  extracellular solute-binding protein family 1  30.65 
 
 
410 aa  151  2e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.347864  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0854  extracellular solute-binding protein family 1  29.82 
 
 
398 aa  147  4.0000000000000006e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.124504  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0701  extracellular solute-binding protein family 1  31.19 
 
 
432 aa  143  7e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0781  extracellular solute-binding protein  29.1 
 
 
395 aa  142  7e-33  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000729506  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1170  extracellular solute-binding protein family 1  28.82 
 
 
397 aa  140  3.9999999999999997e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.441465  normal  0.43389 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3183  extracellular solute-binding protein family 1  29.78 
 
 
411 aa  140  4.999999999999999e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.641192  normal  0.908857 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0984  extracellular solute-binding protein  28.39 
 
 
392 aa  139  7e-32  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000118485  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1118  extracellular solute-binding protein family 1  27.62 
 
 
400 aa  139  1e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.0000000704817  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3132  maltose ABC transporter periplasmic protein  29.95 
 
 
395 aa  139  1e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0559599  normal  0.0111617 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0966  extracellular solute-binding protein  28.39 
 
 
392 aa  139  1e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000011003  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1614  extracellular solute-binding protein  28.39 
 
 
391 aa  137  4e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000159886  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1552  extracellular solute-binding protein  28.39 
 
 
391 aa  135  9.999999999999999e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000398035  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0596  extracellular solute-binding protein  29.43 
 
 
390 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00439649  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1276  extracellular solute-binding protein family 1  29.47 
 
 
417 aa  134  3e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000485827  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0914  maltose/maltodextrin ABC transporter, periplasmic maltose/maltodextrin-binding protein  28.64 
 
 
411 aa  134  3e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.459005  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0406  extracellular solute-binding protein family 1  29.03 
 
 
428 aa  132  1.0000000000000001e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00219397  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3883  maltose/maltodextrin ABC transporter periplasmic maltose/maltodextrin-binding protein  28.4 
 
 
411 aa  132  1.0000000000000001e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.265603 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0968  extracellular solute-binding protein  28.4 
 
 
411 aa  132  1.0000000000000001e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.155665  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0940  maltose ABC transporter periplasmic protein  30.5 
 
 
409 aa  129  1.0000000000000001e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.69507  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2466  extracellular solute-binding protein family 1  29.28 
 
 
415 aa  120  3e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0930087 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1438  extracellular solute-binding protein  28.25 
 
 
400 aa  119  9.999999999999999e-26  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.000000172655  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0206  extracellular solute-binding protein family 1  27.47 
 
 
433 aa  118  1.9999999999999998e-25  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.568957  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2649  extracellular solute-binding protein family 1  27.01 
 
 
400 aa  118  1.9999999999999998e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0632  extracellular solute-binding protein family 1  25.46 
 
 
434 aa  117  3e-25  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.708501  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1865  extracellular solute-binding protein  29.33 
 
 
454 aa  117  3e-25  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0294  maltose ABC transporter periplasmic protein  28.78 
 
 
406 aa  117  3e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.491527  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1151  extracellular solute-binding protein family 1  27.56 
 
 
400 aa  117  3.9999999999999997e-25  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2873  extracellular solute-binding protein family 1  28.65 
 
 
425 aa  117  3.9999999999999997e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22450  maltose-binding periplasmic protein  28.71 
 
 
439 aa  115  8.999999999999998e-25  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.326435  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20470  extracellular solute-binding protein family 1  25.06 
 
 
406 aa  116  8.999999999999998e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000403753  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20630  extracellular solute-binding protein family 1  26.18 
 
 
414 aa  115  1.0000000000000001e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2338  maltose-binding periplasmic protein precursor  26.7 
 
 
408 aa  115  1.0000000000000001e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1617  extracellular solute-binding protein  29.91 
 
 
460 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0238  maltose ABC transporter periplasmic protein  27.72 
 
 
396 aa  115  1.0000000000000001e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.941451 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0744  extracellular solute-binding protein  29.44 
 
 
432 aa  114  3e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0587531  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5891  extracellular solute-binding protein family 1  30.08 
 
 
402 aa  114  3e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.403986 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4486  maltose ABC transporter periplasmic protein  28.11 
 
 
396 aa  114  4.0000000000000004e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001328  maltose/maltodextrin ABC transporter substrate binding periplasmic protein MalE  28.2 
 
 
392 aa  113  5e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4421  maltose ABC transporter periplasmic protein  28.11 
 
 
396 aa  113  7.000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00100315 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4623  maltose ABC transporter periplasmic protein  28.11 
 
 
396 aa  113  7.000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.108824 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4572  maltose ABC transporter periplasmic protein  28.11 
 
 
396 aa  113  7.000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0168981 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4571  maltose ABC transporter periplasmic protein  28.11 
 
 
396 aa  113  7.000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.552535  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03906  maltose ABC transporter periplasmic protein  27.22 
 
 
396 aa  112  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3962  extracellular solute-binding protein family 1  27.22 
 
 
396 aa  112  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5515  maltose ABC transporter periplasmic protein  27.22 
 
 
396 aa  112  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.241432  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4496  maltose ABC transporter periplasmic protein  27.22 
 
 
396 aa  112  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03866  hypothetical protein  27.22 
 
 
396 aa  112  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4274  maltose ABC transporter periplasmic protein  27.22 
 
 
396 aa  112  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4586  maltose ABC transporter periplasmic protein  27.22 
 
 
396 aa  112  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3995  maltose ABC transporter periplasmic protein  26.61 
 
 
396 aa  112  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0495972  normal  0.57528 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2652  putative maltose/maltodextrin ABC transporter, maltose/maltodextrin-binding protein  26.7 
 
 
408 aa  110  3e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0378  maltose ABC transporter periplasmic protein  27.51 
 
 
403 aa  111  3e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3914  maltose ABC transporter periplasmic protein  27.51 
 
 
403 aa  111  3e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4563  extracellular solute-binding protein  27.27 
 
 
439 aa  111  3e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0306  maltose ABC transporter periplasmic protein  27.51 
 
 
403 aa  111  3e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000110695  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05214  maltose ABC transporter periplasmic protein  27.91 
 
 
416 aa  111  3e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4472  maltose ABC transporter periplasmic protein  26.98 
 
 
397 aa  110  3e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2308  extracellular solute-binding protein  28.52 
 
 
440 aa  110  5e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000253431  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2152  extracellular solute-binding protein family 1  27.3 
 
 
415 aa  108  2e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.410183  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3339  Maltose-binding periplasmic protein/domains- like protein  28.12 
 
 
431 aa  108  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.202326 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2135  maltose/maltodextrin-binding periplasmic protein MalE  26.13 
 
 
410 aa  107  3e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.905565  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2162  extracellular solute-binding protein family 1  27.42 
 
 
415 aa  107  4e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.183799  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5151  extracellular solute-binding protein family 1  27.02 
 
 
400 aa  106  8e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.385349  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0986  extracellular solute-binding protein  26.29 
 
 
449 aa  106  8e-22  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.265801 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1781  extracellular solute-binding protein family 1  30.46 
 
 
413 aa  103  4e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0747  extracellular solute-binding protein  26.46 
 
 
435 aa  102  1e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00118998 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0348  extracellular solute-binding protein family 1  29.75 
 
 
419 aa  102  2e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00780  extracellular solute-binding protein family 1  25.47 
 
 
411 aa  100  4e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0480859  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2174  extracellular solute-binding protein family 1  31.25 
 
 
410 aa  98.6  2e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.128166  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1485  extracellular solute-binding protein family 1  27.03 
 
 
424 aa  97.8  3e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1727  extracellular solute-binding protein family 1  29.74 
 
 
422 aa  96.7  7e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03790  maltose-binding periplasmic protein  27.91 
 
 
467 aa  96.3  9e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.0386362 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1527  extracellular solute-binding protein family 1  30.56 
 
 
412 aa  95.5  2e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.207567  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3895  extracellular solute-binding protein  28.93 
 
 
411 aa  93.6  6e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>