More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_4275 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007760  Adeh_4121  multi-sensor signal transduction histidine kinase  94.1 
 
 
712 aa  1235  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.6651  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4275  multi-sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
712 aa  1382  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4252  multi-sensor signal transduction histidine kinase  98.31 
 
 
712 aa  1363  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.374039  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2235  multi-sensor signal transduction histidine kinase  48.76 
 
 
716 aa  560  1e-158  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.530022  normal  0.014643 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3765  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.34 
 
 
562 aa  230  6e-59  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.13531 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1788  GAF sensor signal transduction histidine kinase  36.93 
 
 
763 aa  212  2e-53  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1867  GAF sensor signal transduction histidine kinase  36.72 
 
 
763 aa  211  4e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2090  GAF sensor signal transduction histidine kinase  37.5 
 
 
763 aa  209  1e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.163656  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1722  GAF sensor signal transduction histidine kinase  39.87 
 
 
763 aa  207  4e-52  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.418059 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1498  GAF sensor signal transduction histidine kinase  44.82 
 
 
1070 aa  199  1e-49  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.308131  normal  0.537019 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3853  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.32 
 
 
591 aa  194  3e-48  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3864  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.82 
 
 
592 aa  185  2e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.130733  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3781  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.57 
 
 
592 aa  184  4e-45  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.233259  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2142  histidine kinase  44.53 
 
 
502 aa  180  7e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.000590991  normal  0.0793761 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3724  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.08 
 
 
592 aa  178  3e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3758  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  37.42 
 
 
408 aa  178  3e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.734482 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6442  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.52 
 
 
688 aa  177  7e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.381857  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2005  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  37.1 
 
 
408 aa  177  7e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.343751 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2075  response regulator receiver sensor hybrid histidine kinase  50.56 
 
 
572 aa  171  5e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2145  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  38.27 
 
 
408 aa  170  7e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.001377 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4211  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  44 
 
 
403 aa  165  3e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.108613  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2590  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  33.89 
 
 
405 aa  165  3e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.413696 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0362  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.36 
 
 
1184 aa  162  1e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.656273  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2325  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  42.56 
 
 
381 aa  162  2e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.830525  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1623  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  41.25 
 
 
377 aa  162  2e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.632325  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0535  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  43.16 
 
 
383 aa  162  2e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.175177  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2237  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  42.56 
 
 
381 aa  162  2e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.5102  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0539  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  43.16 
 
 
383 aa  162  2e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.143908  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2109  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  36.44 
 
 
408 aa  162  2e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0792  GAF sensor signal transduction histidine kinase  39.49 
 
 
592 aa  162  3e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.389456  hitchhiker  0.00398352 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2448  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  33.67 
 
 
393 aa  162  3e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.760608  hitchhiker  0.00120668 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2805  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.59 
 
 
1070 aa  161  3e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2991  GAF sensor signal transduction histidine kinase  37.87 
 
 
1069 aa  161  5e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2802  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  38.4 
 
 
406 aa  160  9e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0806  GAF sensor signal transduction histidine kinase  36.93 
 
 
587 aa  159  1e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2188  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  42.26 
 
 
413 aa  159  1e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.925316 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1111  GAF sensor signal transduction histidine kinase  35.59 
 
 
463 aa  159  1e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2900  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.07 
 
 
1069 aa  159  1e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.095908  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4783  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.88 
 
 
680 aa  159  1e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.302794  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0802  GAF sensor signal transduction histidine kinase  36.93 
 
 
587 aa  159  2e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.773486  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1990  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.24 
 
 
695 aa  157  5e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2715  sensor histidine kinase/response regulator  35.62 
 
 
393 aa  157  6e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.615592  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1171  GAF sensor signal transduction histidine kinase  35.19 
 
 
601 aa  157  8e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.764922  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0506  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  41.88 
 
 
383 aa  157  9e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3783  histidine kinase  50.99 
 
 
544 aa  156  1e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.401083  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1191  GAF sensor signal transduction histidine kinase  34.44 
 
 
431 aa  156  1e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.105208  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1672  PAS sensor protein  37.91 
 
 
695 aa  155  2e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.487392  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3211  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.6 
 
 
696 aa  156  2e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.7085  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1239  GAF sensor signal transduction histidine kinase  34.94 
 
 
601 aa  155  2e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0172  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  37.27 
 
 
395 aa  155  3e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0143  response regulator receiver protein  57.35 
 
 
206 aa  152  1e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0019  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  48.43 
 
 
341 aa  152  3e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0416556  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2649  response regulator receiver Signal transduction histidine kinase  33.91 
 
 
404 aa  150  7e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.699737 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3365  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.21 
 
 
733 aa  149  2e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2092  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.14 
 
 
882 aa  149  2e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.112279  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1269  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  33.59 
 
 
509 aa  148  4e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0755  GAF sensor signal transduction histidine kinase  38.28 
 
 
588 aa  147  5e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.452305  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1070  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  35.1 
 
 
402 aa  147  6e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.947697  normal  0.86399 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3767  response regulator receiver sensor hybrid histidine kinase  55.47 
 
 
587 aa  147  7e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.634012  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0395  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.92 
 
 
509 aa  147  8e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2560  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  41.18 
 
 
518 aa  146  1e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.315276 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0324  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  48.53 
 
 
424 aa  146  1e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.046409  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0932  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.25 
 
 
827 aa  146  1e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.202098 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2563  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.89 
 
 
543 aa  146  1e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2823  histidine kinase  41.38 
 
 
501 aa  146  2e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1944  signal transduction histidine kinase  50 
 
 
507 aa  145  2e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0183597  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2645  response regulator receiver protein  54.81 
 
 
215 aa  145  3e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.492308  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2010  GAF sensor signal transduction histidine kinase  40.34 
 
 
454 aa  144  8e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3007  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  39.44 
 
 
507 aa  142  2e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.738719  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2775  GAF sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
431 aa  142  2e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.163384  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5170  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.72 
 
 
688 aa  142  2e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0500187 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2680  GAF sensor signal transduction histidine kinase  33.16 
 
 
431 aa  141  5e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0421491  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4207  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  52.17 
 
 
370 aa  139  1e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.728065 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1135  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  49.06 
 
 
716 aa  139  1e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.749109 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2095  GAF sensor signal transduction histidine kinase  39.5 
 
 
454 aa  138  3e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6354  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.82 
 
 
699 aa  139  3e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1217  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.29 
 
 
803 aa  138  3e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.503931  normal  0.0882093 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0285  response regulator receiver  51.85 
 
 
206 aa  137  7e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.102424  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3549  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.16 
 
 
702 aa  137  9e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5203  response regulator receiver protein  49.28 
 
 
212 aa  137  1e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.372482 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1035  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  25.82 
 
 
1041 aa  135  2e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.73134 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2054  two component transcriptional regulator, AraC family  35.54 
 
 
1201 aa  136  2e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.695732  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0539  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.04 
 
 
816 aa  135  2e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.146269  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4061  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.52 
 
 
885 aa  135  3e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.193403  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1740  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  50.77 
 
 
377 aa  135  4e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.129887 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4432  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.19 
 
 
1002 aa  134  4e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1219  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  49.62 
 
 
375 aa  134  5e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.745377  normal  0.599724 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5387  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  49.62 
 
 
375 aa  134  6e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0971839 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3005  GAF sensor signal transduction histidine kinase  33.25 
 
 
549 aa  134  7e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.303527  normal  0.898724 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0400  response regulator receiver protein  52.59 
 
 
210 aa  134  8e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0667  response regulator receiver protein  51.13 
 
 
214 aa  134  8e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0467725  normal  0.629252 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1885  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.77 
 
 
792 aa  134  8e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2209  GAF sensor signal transduction histidine kinase  36.52 
 
 
399 aa  133  1e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3396  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  46.48 
 
 
927 aa  132  1e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2639  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  44.68 
 
 
396 aa  133  1e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.136447  normal  0.717158 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0184  response regulator receiver protein  51.11 
 
 
210 aa  133  1e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.186811  normal  0.929424 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3993  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  46.5 
 
 
390 aa  133  1e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.967169  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4422  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  32.31 
 
 
1274 aa  132  2e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.381764  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2260  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  48.32 
 
 
361 aa  132  2e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.208609  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4611  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  33.22 
 
 
1002 aa  132  2e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.367657 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>