More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_4176 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011891  A2cp1_4176  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  100 
 
 
158 aa  300  4.0000000000000003e-81  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0919098  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4033  biopolymer transport protein ExbD/TolR  96.2 
 
 
158 aa  256  9e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.439813  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4149  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  97.86 
 
 
159 aa  231  2.0000000000000002e-60  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0136307  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0395  biopolymer transport protein ExbD/TolR  80 
 
 
151 aa  206  1e-52  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.30482  hitchhiker  0.000338676 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2097  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  44.72 
 
 
164 aa  107  5e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0862483  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0840  biopolymer transport protein ExbD/TolR  41.67 
 
 
137 aa  88.2  4e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0352738 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1092  biopolymer transport protein ExbD/TolR  39.37 
 
 
166 aa  87  1e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3580  protein TolR  36.91 
 
 
139 aa  84.7  4e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0219  putative transport-related membrane protein  37.23 
 
 
145 aa  84.3  5e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.748949  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3142  biopolymer transport transmembrane protein, ExbD/TolR like  33.57 
 
 
139 aa  82  0.000000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.421775  normal  0.0460891 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2239  biopolymer transport protein ExbD/TolR  33.57 
 
 
140 aa  81.6  0.000000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0027  TolR protein  38.51 
 
 
139 aa  81.3  0.000000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.200658  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3511  protein TolR  35.97 
 
 
139 aa  80.9  0.000000000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0114553  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2118  biopolymer transport protein ExbD/TolR  33.57 
 
 
142 aa  80.5  0.000000000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1617  protein TolR  32.08 
 
 
153 aa  79.7  0.00000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.776263  hitchhiker  0.0037279 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1076  biopolymer transport protein ExbD/TolR  35.43 
 
 
143 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2477  biopolymer transport protein ExbD/TolR  39.1 
 
 
140 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0883915  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1899  protein TolR  32.08 
 
 
153 aa  79.7  0.00000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.937922 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2024  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  44.96 
 
 
155 aa  79  0.00000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.34025 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2225  biopolymer transport protein ExbD/TolR  33.58 
 
 
142 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.361252  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2200  biopolymer transport protein ExbD/TolR  33.58 
 
 
140 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5877  biopolymer transport protein ExbD/TolR  33.58 
 
 
140 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0506  biopolymer transport protein ExbD/TolR  37.96 
 
 
154 aa  78.6  0.00000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.529067  hitchhiker  0.000695312 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0400  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  34.11 
 
 
131 aa  78.6  0.00000000000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.376121  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1619  protein TolR  31.45 
 
 
153 aa  78.2  0.00000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.1444  normal  0.157176 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0872  biopolymer transport protein ExbD/TolR  44.27 
 
 
141 aa  78.2  0.00000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.532124  normal  0.142279 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5529  biopolymer transport protein ExbD/TolR  32.86 
 
 
140 aa  78.2  0.00000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6111  biopolymer transport protein ExbD/TolR  36.84 
 
 
140 aa  77.8  0.00000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0617  ExbD/TolR family transport energizing protein  34.01 
 
 
142 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.843085  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1803  biopolymer ExbD/TolR family transporter  34.01 
 
 
142 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.831218  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2806  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  40 
 
 
142 aa  76.3  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.0047121  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1930  biopolymer ExbD/TolR family transporter  34.01 
 
 
142 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1092  ExbD/TolR family transport energizing protein  34.01 
 
 
142 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2064  ExbD/TolR family transport energizing protein  34.01 
 
 
142 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.132783  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1114  biopolymer transport protein ExbD/TolR  33.33 
 
 
141 aa  76.3  0.0000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.809728  normal  0.285485 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0800  ExbD/TolR family transport energizing protein  34.29 
 
 
140 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0863  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  33.57 
 
 
138 aa  75.1  0.0000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0638904  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0520  ExbD/TolR family transport energizing protein  33.82 
 
 
142 aa  75.1  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2529  biopolymer transport EXBD-like transmembrane protein  39.23 
 
 
143 aa  74.7  0.0000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.161438  normal  0.0831127 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2135  biopolymer transport, TolR  34.78 
 
 
167 aa  74.7  0.0000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4606  biopolymer transport protein ExbD/TolR  38.1 
 
 
142 aa  74.7  0.0000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1370  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  33.07 
 
 
140 aa  74.3  0.0000000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1805  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  30 
 
 
137 aa  73.9  0.0000000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.654076  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1407  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  36.05 
 
 
139 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.757544  normal  0.100791 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3166  protein TolR  33.87 
 
 
158 aa  73.2  0.000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1947  biopolymer transport protein ExbD/TolR  33.82 
 
 
139 aa  73.6  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.81805  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0594  biopolymer transport protein ExbD/TolR  38.06 
 
 
143 aa  72.4  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.0000000395657  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0573  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  32.81 
 
 
139 aa  72.4  0.000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.234389  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0478  biopolymer transport protein ExbD/TolR  33.09 
 
 
146 aa  72.8  0.000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2901  biopolymer transport protein ExbD/TolR  30.3 
 
 
147 aa  72.4  0.000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00149833  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3520  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  29.45 
 
 
138 aa  72.8  0.000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.127703  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2400  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  39.23 
 
 
142 aa  72  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0584856  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3571  biopolymer transport protein ExbD/TolR  35.07 
 
 
141 aa  72  0.000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.161015  decreased coverage  0.00354496 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1924  biopolymer transport protein ExbD/TolR  33.58 
 
 
144 aa  72  0.000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.645056  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3538  biopolymer transport protein ExbD/TolR  30.82 
 
 
139 aa  72.4  0.000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000031299  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1587  protein TolR  34.56 
 
 
138 aa  72  0.000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.437138  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3381  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  30.88 
 
 
143 aa  71.6  0.000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000113024 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2026  biopolymer ExbD/TolR family transporter  32.88 
 
 
142 aa  71.2  0.000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.597145  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2237  biopolymer ExbD/TolR family transporter  28.57 
 
 
134 aa  71.2  0.000000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.271991  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0575  biopolymer transport protein ExbD/TolR  30.15 
 
 
143 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.523101  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1396  protein TolR  32.43 
 
 
156 aa  70.9  0.000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.60771  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2642  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  32.28 
 
 
147 aa  70.5  0.000000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.333418  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1555  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  35.82 
 
 
141 aa  70.1  0.00000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.304522  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2305  biopolymer transport protein ExbD/TolR  32.03 
 
 
134 aa  70.1  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0856  protein TolR  33.33 
 
 
157 aa  70.1  0.00000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2569  biopolymer transport protein ExbD/TolR  30 
 
 
134 aa  70.1  0.00000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2304  biopolymer transport protein ExbD/TolR  35.82 
 
 
141 aa  70.1  0.00000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0677093  normal  0.134165 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1213  protein TolR  31.34 
 
 
147 aa  69.7  0.00000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1147  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  35.37 
 
 
140 aa  69.7  0.00000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2948  biopolymer transport protein ExbD/TolR  33.09 
 
 
142 aa  70.5  0.00000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0536  biopolymer transport protein ExbD/TolR  37.12 
 
 
143 aa  70.1  0.00000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000196939  hitchhiker  0.000000905807 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2565  biopolymer transport protein ExbD/TolR  36.03 
 
 
141 aa  69.3  0.00000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0403619  hitchhiker  0.00490818 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2977  TolR protein  34.33 
 
 
144 aa  69.3  0.00000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2589  biopolymer transport protein ExbD/TolR  30.16 
 
 
158 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.382062  hitchhiker  0.000000237185 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0753  biopolymer transport protein ExbD/TolR  34.97 
 
 
144 aa  69.7  0.00000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0347505  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1460  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  35.66 
 
 
158 aa  69.3  0.00000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4650  TonB system transport protein ExbD  35.61 
 
 
145 aa  69.3  0.00000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.404384 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0410  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  35.11 
 
 
156 aa  68.6  0.00000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.823092  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0612  ExbD/TolR family protein  31.78 
 
 
143 aa  68.6  0.00000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4434  protein TolR  33.86 
 
 
147 aa  68.2  0.00000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0620039  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3787  biopolymer transport protein ExbD/TolR  35.38 
 
 
148 aa  68.2  0.00000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3136  protein TolR  31.06 
 
 
146 aa  68.2  0.00000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0861  protein TolR  30.28 
 
 
152 aa  68.2  0.00000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.0000417761  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00589  biopolymer transport protein  34.06 
 
 
154 aa  67.8  0.00000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.265658  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0527  protein TolR  32.45 
 
 
155 aa  68.2  0.00000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2987  biopolymer transport protein ExbD/TolR  31.5 
 
 
133 aa  67.8  0.00000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.369399  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0784  protein TolR  31.85 
 
 
138 aa  67.8  0.00000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0363173  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3389  protein TolR  33.07 
 
 
145 aa  67.8  0.00000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.436196  normal  0.250194 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1397  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  32.62 
 
 
140 aa  67.4  0.00000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0825  TonB system transport protein ExbD  36.3 
 
 
153 aa  67.4  0.00000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.027584 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02811  Biopolymer transport protein  31.75 
 
 
132 aa  67.4  0.00000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0477065  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0443  biopolymer ExbD/TolR family transporter  36.5 
 
 
136 aa  67.4  0.00000000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.102103  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0670  biopolymer ExbD/TolR family transporter  36.5 
 
 
136 aa  67.4  0.00000000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.198674  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1308  biopolymer transport exbD protein  31.11 
 
 
151 aa  67  0.00000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.47684  normal  0.431843 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3007  biopolymer transport protein ExbD/TolR  32.09 
 
 
143 aa  67  0.00000000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3209  biopolymer transport protein ExbD/TolR  30.47 
 
 
137 aa  66.6  0.0000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000000537129  normal  0.265512 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0746  protein TolR  31.5 
 
 
148 aa  66.6  0.0000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1143  biopolymer transport protein ExbD/TolR  29.58 
 
 
137 aa  66.6  0.0000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1052  biopolymer transport protein ExbD/TolR  37.23 
 
 
156 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1440  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  28.68 
 
 
136 aa  66.2  0.0000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>