138 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_4129 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011891  A2cp1_4129  HNH endonuclease  100 
 
 
386 aa  762    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3987  HNH endonuclease  85.52 
 
 
359 aa  600  1e-170  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4099  HNH endonuclease  80.65 
 
 
384 aa  575  1.0000000000000001e-163  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4281  HNH endonuclease  77.47 
 
 
357 aa  499  1e-140  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4128  HNH endonuclease  78.85 
 
 
334 aa  494  1e-139  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2115  HNH endonuclease  72.18 
 
 
322 aa  481  1e-135  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1760  HNH endonuclease  74.34 
 
 
387 aa  481  1e-135  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4259  HNH nuclease  71.93 
 
 
346 aa  478  1e-134  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0904  HNH nuclease  49.86 
 
 
370 aa  313  3.9999999999999997e-84  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.590201  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0908  HNH nuclease  49.46 
 
 
370 aa  306  3e-82  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000130016  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1150  HNH nuclease  48.79 
 
 
374 aa  303  2.0000000000000002e-81  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1255  HNH nuclease  48.28 
 
 
392 aa  302  6.000000000000001e-81  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000145383  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1468  HNH nuclease  48.1 
 
 
362 aa  299  5e-80  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.09392  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3430  HNH nuclease  48.66 
 
 
379 aa  299  6e-80  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4018  HNH endonuclease  49.05 
 
 
357 aa  298  1e-79  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3349  HNH endonuclease  48.48 
 
 
368 aa  296  5e-79  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.645482  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4185  HNH nuclease  50.13 
 
 
357 aa  295  1e-78  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.169167  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3618  HNH nuclease  49.2 
 
 
368 aa  294  2e-78  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1563  HNH endonuclease  48.78 
 
 
362 aa  293  4e-78  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.010402  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3119  HNH nuclease  48.1 
 
 
357 aa  292  6e-78  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.134297  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4158  HNH nuclease  48.38 
 
 
359 aa  292  8e-78  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.416299  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1371  HNH nuclease  49.18 
 
 
373 aa  291  2e-77  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4160  HNH nuclease  47.08 
 
 
358 aa  289  7e-77  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.874339  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4076  HNH endonuclease  47.15 
 
 
407 aa  288  1e-76  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.39422  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3934  HNH nuclease  47.4 
 
 
420 aa  287  2e-76  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4134  HNH nuclease  49.86 
 
 
361 aa  286  2.9999999999999996e-76  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.276334  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0859  HNH nuclease  48 
 
 
370 aa  284  2.0000000000000002e-75  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0115605  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1342  HNH nuclease  46.29 
 
 
382 aa  283  3.0000000000000004e-75  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.435035  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4042  HNH endonuclease  48.4 
 
 
356 aa  282  7.000000000000001e-75  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00210589  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3494  HNH nuclease  49.42 
 
 
355 aa  282  9e-75  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4239  HNH endonuclease  47.96 
 
 
372 aa  281  1e-74  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4262  HNH endonuclease  47.67 
 
 
372 aa  271  1e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3550  HNH nuclease  46.13 
 
 
416 aa  271  2e-71  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00633328  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0816  HNH endonuclease  44.32 
 
 
355 aa  255  8e-67  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.266631 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2900  HNH endonuclease  45.61 
 
 
336 aa  246  4e-64  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0011728 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4159  HNH endonuclease  47.65 
 
 
334 aa  234  2.0000000000000002e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.114592  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3020  hypothetical protein  54.48 
 
 
160 aa  154  2.9999999999999998e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.765456  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0998  HNH endonuclease  32.81 
 
 
387 aa  139  7.999999999999999e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.638291  normal  0.453877 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3198  HNH endonuclease  33.6 
 
 
388 aa  138  1e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1468  HNH nuclease  55.19 
 
 
179 aa  137  2e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0419266  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1431  HNH endonuclease  34.59 
 
 
388 aa  136  5e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.535031  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3075  HNH endonuclease  33.42 
 
 
391 aa  136  5e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  hitchhiker  0.00244275  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3400  HNH endonuclease  33.87 
 
 
390 aa  136  6.0000000000000005e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00340791  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1700  HNH endonuclease  33.06 
 
 
388 aa  136  7.000000000000001e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  hitchhiker  0.00106635  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1449  HNH endonuclease  32.15 
 
 
391 aa  135  9e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.964003  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1632  HNH endonuclease  32.88 
 
 
388 aa  134  3.9999999999999996e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.437118  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4158  HNH endonuclease  33.6 
 
 
388 aa  129  8.000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0493415 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1516  HNH endonuclease  31.62 
 
 
390 aa  123  4e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000144845  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3791  HNH endonuclease  31.88 
 
 
362 aa  102  1e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.352304 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0450  HNH endonuclease  31.94 
 
 
390 aa  98.2  2e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.480855 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3850  HNH endonuclease  29.78 
 
 
461 aa  95.5  1e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1300  HNH endonuclease  30.19 
 
 
316 aa  92.8  9e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.409984  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1332  HNH endonuclease  36.22 
 
 
264 aa  89  1e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.146487  normal  0.232691 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0411  HNH endonuclease  40.31 
 
 
391 aa  86.7  6e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.732707 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2146  hypothetical protein  28.25 
 
 
414 aa  84  0.000000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.585384  normal  0.0437716 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0344  HNH endonuclease  41.53 
 
 
188 aa  83.6  0.000000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.557879  normal  0.69024 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3039  HNH endonuclease  41.13 
 
 
309 aa  83.6  0.000000000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.572998  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2410  HNH endonuclease  36.8 
 
 
176 aa  74.3  0.000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.618861  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3022  HNH endonuclease  36.8 
 
 
308 aa  73.9  0.000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3738  hypothetical protein  36.11 
 
 
308 aa  68.2  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.381114  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0451  hypothetical protein  33.01 
 
 
249 aa  67  0.0000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.446853 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0461  HNH endonuclease  44.44 
 
 
206 aa  62.4  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0161278  hitchhiker  0.0046419 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6399  stress protein  41.67 
 
 
560 aa  58.9  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.266447  normal  0.175346 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1335  HNH endonuclease  31.43 
 
 
321 aa  57  0.0000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.516631  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2814  HNH endonuclease  38.37 
 
 
177 aa  57  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0623363 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3201  HNH endonuclease  38.55 
 
 
186 aa  56.2  0.0000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.177111  normal  0.769466 
 
 
-
 
NC_002936  DET1269  HNH endonuclease domain-containing protein  40.32 
 
 
232 aa  54.7  0.000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.0000309683  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4081  HNH endonuclease  42.62 
 
 
169 aa  54.7  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3157  HNH endonuclease  25.86 
 
 
441 aa  54.7  0.000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000184807  hitchhiker  0.000205863 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0855  HNH endonuclease  41.94 
 
 
230 aa  54.3  0.000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.000000000164704  hitchhiker  0.000000000578298 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0876  HNH nuclease  52.63 
 
 
218 aa  53.5  0.000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1643  HNH endonuclease family protein  43.55 
 
 
190 aa  53.1  0.000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4001  hypothetical protein  43.08 
 
 
185 aa  53.1  0.000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1591  HNH endonuclease family protein  43.55 
 
 
190 aa  53.1  0.000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.301685  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1080  HNH endonuclease  38.71 
 
 
228 aa  52.8  0.000009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0178518  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2524  HNH endonuclease  41.54 
 
 
216 aa  51.2  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.434338 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1272  HNH endonuclease  43.55 
 
 
190 aa  51.6  0.00003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3843  HNH endonuclease  38.03 
 
 
196 aa  51.2  0.00003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5662  HNH endonuclease  40 
 
 
171 aa  50.8  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3846  HNH endonuclease  41.54 
 
 
185 aa  50.4  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.895408  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3553  HNH endonuclease  41.54 
 
 
185 aa  50.4  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.367592  normal  0.45905 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4460  HNH endonuclease  44.26 
 
 
181 aa  50.1  0.00006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.282325  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4342  HNH endonuclease  38.82 
 
 
182 aa  49.7  0.00009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.64843 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1013  HNH endonuclease  37.5 
 
 
189 aa  48.9  0.0001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0063565 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1583  HNH endonuclease  41.67 
 
 
166 aa  49.3  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23331  HNH endonuclease family protein  42.11 
 
 
189 aa  48.9  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1327  HNH endonuclease  36.61 
 
 
186 aa  48.9  0.0001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.102116  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1686  HNH endonuclease  40.68 
 
 
163 aa  48.9  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0342  HNH endonuclease  35.38 
 
 
185 aa  48.1  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.440485  normal  0.426528 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1633  HNH endonuclease  38.1 
 
 
186 aa  48.9  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1131  putative HNH endonuclease  36.92 
 
 
185 aa  47.8  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3111  HNH endonuclease  41.67 
 
 
188 aa  48.1  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.599577 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3103  HNH endonuclease  38.46 
 
 
189 aa  47.8  0.0003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.220092 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0558  HNH endonuclease  35.38 
 
 
185 aa  48.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3241  HNH endonuclease  40.32 
 
 
186 aa  47.4  0.0004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.118071  normal  0.690575 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3479  HNH endonuclease  40 
 
 
169 aa  47.8  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0281943  normal  0.571859 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0478  HNH endonuclease  33.85 
 
 
185 aa  47.4  0.0005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1582  HNH endonuclease  38.68 
 
 
167 aa  47  0.0005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.485926 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0613  HNH endonuclease  33.85 
 
 
185 aa  46.6  0.0007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4561  HNH endonuclease  40 
 
 
81 aa  46.6  0.0008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>