More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_4021 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007760  Adeh_3878  UvrD/REP helicase  94.06 
 
 		 1111 aa  1885    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4021  UvrD/REP helicase  100 
 
 		 1111 aa  2127    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3984  UvrD/REP helicase  95.86 
 
 		 1111 aa  1945    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2985  UvrD/REP helicase  31.27 
 
 		 1131 aa  251  7e-65  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.105436  normal  0.309308 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0841  UvrD/REP helicase  26.36 
 
 		 1161 aa  226  2e-57  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.94071  normal  0.0247795 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3105  UvrD/REP helicase  34.84 
 
 		 1047 aa  191  5.999999999999999e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.224612  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1498  UvrD/REP helicase  30.08 
 
 		 1080 aa  183  2e-44  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1571  UvrD/REP helicase  34.04 
 
 		 1110 aa  178  7e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1286  UvrD/REP helicase  24.78 
 
 		 1074 aa  160  1e-37  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0037  UvrD/REP helicase  27.73 
 
 		 1115 aa  160  2e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4408  UvrD/REP helicase  33.65 
 
 		 1123 aa  155  4e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.471337  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0782  UvrD/REP helicase  29.27 
 
 		 1107 aa  154  7e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.685172  normal  0.12668 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1190  hypothetical protein  29.93 
 
 		 1177 aa  154  1e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5412  UvrD/REP helicase  32.18 
 
 		 1117 aa  151  6e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1377  Exodeoxyribonuclease V  28.64 
 
 		 1226 aa  149  3e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.246845  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1034  UvrD/REP helicase  28.56 
 
 		 1173 aa  148  5e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0891257  normal  0.693052 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1126  UvrD/REP helicase  28.29 
 
 		 1173 aa  147  1e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.443367 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0523  UvrD/REP helicase  22.94 
 
 		 1121 aa  146  3e-33  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1322  hypothetical protein  28.9 
 
 		 1057 aa  144  8e-33  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1997  UvrD/REP helicase  30.99 
 
 		 1110 aa  144  9.999999999999999e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.469294  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1157  hypothetical protein  28.4 
 
 		 1061 aa  143  1.9999999999999998e-32  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1486  recombination helicase AddA  29.53 
 
 		 1242 aa  136  1.9999999999999998e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1805  UvrD/REP helicase  29.74 
 
 		 1184 aa  135  3.9999999999999996e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2124  UvrD/REP helicase  29.34 
 
 		 1147 aa  132  3e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1357  UvrD/REP helicase  32.91 
 
 		 1196 aa  127  1e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2076  UvrD/REP helicase  29.25 
 
 		 1240 aa  117  1.0000000000000001e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.692604  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0860  recombination helicase AddA  22.92 
 
 		 1242 aa  116  2.0000000000000002e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1412  double-strand break repair helicase AddA  27.8 
 
 		 1151 aa  116  3e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1855  recombination helicase AddA  23.61 
 
 		 1282 aa  116  3e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0546193 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2794  UvrD-like DNA helicase domain-containing protein  27.24 
 
 		 1124 aa  115  6e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.370193 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1708  ATP-dependent exoDNAse (exonuclease V) beta subunit  27.49 
 
 		 1118 aa  112  4.0000000000000004e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0309  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit A  25.93 
 
 		 1186 aa  112  5e-23  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1774  recombination helicase AddA  21.5 
 
 		 1248 aa  111  6e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0359  UvrD/Rep/AddA family helicase  22.28 
 
 		 1089 aa  111  8.000000000000001e-23  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1061  ATP-dependent nuclease subunit A  22.08 
 
 		 1241 aa  111  8.000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1041  ATP-dependent nuclease, subunit A  22.07 
 
 		 1241 aa  111  8.000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1142  ATP-dependent nuclease subunit A  22.08 
 
 		 1241 aa  111  8.000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4148  ATP-dependent nuclease, subunit A  22.2 
 
 		 1241 aa  111  8.000000000000001e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1245  ATP-dependent nuclease, subunit A  21.97 
 
 		 1241 aa  110  1e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0202  UvrD/REP helicase  27.89 
 
 		 1159 aa  110  1e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3581  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit A  26.88 
 
 		 1177 aa  110  1e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1039  ATP-dependent nuclease, subunit A  22.17 
 
 		 1241 aa  109  3e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1297  ATP-dependent nuclease, subunit A  21.97 
 
 		 1241 aa  109  3e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1220  ATP-dependent nuclease, subunit A  22.22 
 
 		 1240 aa  109  3e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4879  Exodeoxyribonuclease V  28.09 
 
 		 1284 aa  109  4e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.274715 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1741  UvrD/REP helicase  25.77 
 
 		 1162 aa  108  8e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.616964  hitchhiker  0.00243499 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2114  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit A  26.89 
 
 		 1197 aa  107  9e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1041  recombination helicase AddA  23.14 
 
 		 1241 aa  107  1e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.552246  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2846  UvrD/REP helicase  26.59 
 
 		 1121 aa  107  1e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.347056 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1204  UvrD/REP helicase  27.63 
 
 		 744 aa  107  2e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.948208  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3438  double-strand break repair helicase AddA  27.11 
 
 		 1125 aa  107  2e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1193  ATP-dependent nuclease, subunit A  21.74 
 
 		 1241 aa  105  5e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0085  ATP-dependent DNA helicase UvrD  25.86 
 
 		 1139 aa  105  6e-21  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0546  ATP-dependent DNA helicase UvrD  27.12 
 
 		 713 aa  104  8e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1560  UvrD/REP helicase  24.94 
 
 		 1054 aa  104  1e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.538348  normal  0.490234 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2020  double-strand break repair helicase AddA  27.75 
 
 		 1180 aa  103  1e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.411715  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08490  ATP-dependent exonuclase V beta subunit, helicase and exonuclease domain-containing  25 
 
 		 1251 aa  103  2e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.266931 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0555  exonuclease RexA  22.29 
 
 		 1218 aa  103  2e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0025  ATP-dependent nuclease, subunit A  22.55 
 
 		 1271 aa  103  2e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1031  ATP-dependent exoDNAse (exonuclease V) beta subunit  21.53 
 
 		 1204 aa  103  2e-20  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.655323  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2103  UvrD/Rep family helicase  27.65 
 
 		 1180 aa  103  3e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.664576  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1248  Exodeoxyribonuclease V  30.35 
 
 		 833 aa  102  3e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.637879  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0967  recombination helicase AddA  22.66 
 
 		 1217 aa  102  3e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0986  recombination helicase AddA  22.66 
 
 		 1217 aa  102  3e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0857621  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0551  UvrD/REP helicase  28.35 
 
 		 1149 aa  102  5e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0345301  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0671  recombination helicase AddA  25.16 
 
 		 1244 aa  102  5e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1481  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit A  25.74 
 
 		 1230 aa  102  5e-20  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0050  recombination helicase AddA  23.82 
 
 		 1392 aa  101  7e-20  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.110759  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4954  double-strand break repair helicase AddA  29.19 
 
 		 1147 aa  101  9e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.218744 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3118  UvrD/REP helicase  26.08 
 
 		 1061 aa  100  2e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.674969 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0468  UvrD/REP helicase  30.56 
 
 		 1134 aa  100  2e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0025  recombination helicase AddA  21.93 
 
 		 1270 aa  99.8  2e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0482  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit A  27.08 
 
 		 1405 aa  99.4  3e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0629  UvrD/REP helicase  21.42 
 
 		 854 aa  99.4  4e-19  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0988  UvrD/REP helicase  26.69 
 
 		 1146 aa  99  4e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.181635  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1403  UvrD/REP helicase  30.67 
 
 		 900 aa  99  5e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.405797  normal  0.0281555 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2131  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V subunit A  27.52 
 
 		 1187 aa  97.8  9e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.564437  normal  0.516906 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2352  UvrD/REP helicase  27.13 
 
 		 920 aa  97.8  1e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2039  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit A  24.6 
 
 		 1251 aa  97.4  1e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1474  UvrD/REP helicase  26.16 
 
 		 781 aa  97.4  1e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.517963 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1527  UvrD/Rep family helicase  26.79 
 
 		 1106 aa  97.8  1e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.529663  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2832  recombination helicase AddA  23.72 
 
 		 1392 aa  97.4  1e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0056  ATP-dependant DNA helicase  28.65 
 
 		 1182 aa  97.4  1e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1357  double-strand break repair helicase AddA  21.6 
 
 		 1155 aa  97.1  2e-18  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1610  double-strand break repair helicase AddA  27.74 
 
 		 1157 aa  97.1  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0870  UvrD/REP helicase  26.36 
 
 		 1165 aa  95.9  3e-18  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.129938 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2440  UvrD/REP helicase  24.65 
 
 		 786 aa  96.3  3e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.605331  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1433  UvrD/REP helicase  25.81 
 
 		 788 aa  96.3  3e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.189419 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4066  UvrD/REP helicase  29.31 
 
 		 1120 aa  95.9  4e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.160711 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1375  UvrD/REP helicase family protein  26.3 
 
 		 1110 aa  95.9  4e-18  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.134048  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1142  ATP-dependent DNA helicase UvrD  25.34 
 
 		 788 aa  95.5  5e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.140222 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1315  ATP-dependent nuclease subunit A  26.12 
 
 		 1110 aa  95.5  5e-18  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2047  UvrD/REP helicase  24.96 
 
 		 786 aa  95.5  5e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2967  exonuclease V subunit beta  25.99 
 
 		 1170 aa  95.1  6e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.483472  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0769  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  28.68 
 
 		 1207 aa  95.1  6e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1981  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  29.25 
 
 		 1259 aa  95.1  7e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.335433  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1751  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit A  27.33 
 
 		 1129 aa  95.1  7e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.910924 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0874  exonuclease RexA  23.33 
 
 		 1207 aa  94.7  8e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.149314  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1696  UvrD/REP helicase  26.52 
 
 		 793 aa  94.7  9e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.99054 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1669  ATP-dependent DNA helicase Rep  23.64 
 
 		 805 aa  94.4  1e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>