More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_3972 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011891  A2cp1_3972  soluble pyridine nucleotide transhydrogenase  100 
 
 
476 aa  957    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0781763  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3945  soluble pyridine nucleotide transhydrogenase  75.89 
 
 
481 aa  747    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.332023  normal  0.0692288 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3894  soluble pyridine nucleotide transhydrogenase  99.79 
 
 
476 aa  956    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.199328  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3831  soluble pyridine nucleotide transhydrogenase  98.95 
 
 
476 aa  948    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3883  soluble pyridine nucleotide transhydrogenase  44.28 
 
 
470 aa  390  1e-107  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.616657  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5462  soluble pyridine nucleotide transhydrogenase  44.37 
 
 
471 aa  386  1e-106  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0855714  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0843  soluble pyridine nucleotide transhydrogenase  43.72 
 
 
472 aa  382  1e-105  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2047  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerization region  43.38 
 
 
467 aa  377  1e-103  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.154966  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2448  soluble pyridine nucleotide transhydrogenase  42.3 
 
 
471 aa  365  1e-99  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.518866 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6317  soluble pyridine nucleotide transhydrogenase  43.82 
 
 
467 aa  363  4e-99  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0419159  normal  0.418244 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3223  soluble pyridine nucleotide transhydrogenase  42.73 
 
 
463 aa  361  2e-98  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.199008 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1462  soluble pyridine nucleotide transhydrogenase  44.03 
 
 
502 aa  358  9.999999999999999e-98  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0372006 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2476  soluble pyridine nucleotide transhydrogenase  42.8 
 
 
474 aa  358  9.999999999999999e-98  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0212  soluble pyridine nucleotide transhydrogenase  42.08 
 
 
476 aa  357  1.9999999999999998e-97  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0128  soluble pyridine nucleotide transhydrogenase  42.55 
 
 
468 aa  357  1.9999999999999998e-97  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.964966  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0188  soluble pyridine nucleotide transhydrogenase  41.9 
 
 
468 aa  358  1.9999999999999998e-97  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0194  soluble pyridine nucleotide transhydrogenase  41.9 
 
 
468 aa  357  1.9999999999999998e-97  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5306  soluble pyridine nucleotide transhydrogenase  42.95 
 
 
477 aa  357  2.9999999999999997e-97  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1509  soluble pyridine nucleotide transhydrogenase  43.84 
 
 
469 aa  356  3.9999999999999996e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12727  soluble pyridine nucleotide transhydrogenase  41.59 
 
 
468 aa  356  5e-97  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3787  soluble pyridine nucleotide transhydrogenase  42.33 
 
 
468 aa  354  2e-96  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1707  soluble pyridine nucleotide transhydrogenase  44.42 
 
 
469 aa  352  7e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0334  soluble pyridine nucleotide transhydrogenase  41.13 
 
 
466 aa  351  2e-95  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4196  soluble pyridine nucleotide transhydrogenase  41.47 
 
 
466 aa  350  5e-95  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.194644  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4408  soluble pyridine nucleotide transhydrogenase  41.47 
 
 
466 aa  349  5e-95  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0258323  normal  0.0356369 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4054  soluble pyridine nucleotide transhydrogenase  41.47 
 
 
466 aa  350  5e-95  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0478182 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4024  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerization region  41.47 
 
 
466 aa  349  6e-95  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4502  soluble pyridine nucleotide transhydrogenase  41.47 
 
 
466 aa  349  6e-95  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0108138  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5422  soluble pyridine nucleotide transhydrogenase  41.47 
 
 
466 aa  349  6e-95  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.349391 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4447  soluble pyridine nucleotide transhydrogenase  41.47 
 
 
466 aa  349  7e-95  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4531  soluble pyridine nucleotide transhydrogenase  41.47 
 
 
470 aa  347  2e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.455944  hitchhiker  0.00000533814 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4336  soluble pyridine nucleotide transhydrogenase  41.47 
 
 
470 aa  347  2e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4457  soluble pyridine nucleotide transhydrogenase  41.47 
 
 
470 aa  347  2e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000163377 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4367  soluble pyridine nucleotide transhydrogenase  41.47 
 
 
470 aa  347  2e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03582  soluble pyridine nucleotide transhydrogenase  42.27 
 
 
473 aa  348  2e-94  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.747985  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4454  soluble pyridine nucleotide transhydrogenase  41.47 
 
 
470 aa  347  2e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000116536 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5091  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerization region  41.68 
 
 
466 aa  347  4e-94  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.412969  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0118  soluble pyridine nucleotide transhydrogenase  41.08 
 
 
466 aa  345  7e-94  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.483779  normal  0.676164 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0137  soluble pyridine nucleotide transhydrogenase  41.08 
 
 
466 aa  345  7e-94  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.647839  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4078  soluble pyridine nucleotide transhydrogenase  41.08 
 
 
466 aa  345  7e-94  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4024  soluble pyridine nucleotide transhydrogenase  40.82 
 
 
466 aa  345  7e-94  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.257057  normal  0.0391743 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0118  soluble pyridine nucleotide transhydrogenase  39.57 
 
 
476 aa  345  8e-94  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0589234  normal  0.30721 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1577  soluble pyridine nucleotide transhydrogenase  41.77 
 
 
463 aa  345  8e-94  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00876863  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03847  soluble pyridine nucleotide transhydrogenase  41.25 
 
 
466 aa  345  8.999999999999999e-94  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0805855  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03796  hypothetical protein  41.25 
 
 
466 aa  345  8.999999999999999e-94  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0623556  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4774  soluble pyridine nucleotide transhydrogenase  40.56 
 
 
465 aa  345  1e-93  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.125317  hitchhiker  0.00386206 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2890  soluble pyridine nucleotide transhydrogenase  41 
 
 
471 aa  344  2e-93  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.784387  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1668  soluble pyridine nucleotide transhydrogenase  40.13 
 
 
464 aa  341  1e-92  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2151  soluble pyridine nucleotide transhydrogenase  40.13 
 
 
464 aa  341  2e-92  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.148708  decreased coverage  0.00883462 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2370  soluble pyridine nucleotide transhydrogenase  41 
 
 
466 aa  340  2e-92  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000113082  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3591  soluble pyridine nucleotide transhydrogenase  40.13 
 
 
464 aa  341  2e-92  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.343336 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002152  soluble pyridine nucleotide transhydrogenase  40.39 
 
 
466 aa  340  4e-92  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0102006  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1692  soluble pyridine nucleotide transhydrogenase  39.91 
 
 
464 aa  339  5.9999999999999996e-92  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.215126 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1901  soluble pyridine nucleotide transhydrogenase  40.13 
 
 
477 aa  338  9.999999999999999e-92  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.961651  decreased coverage  0.000428846 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2169  soluble pyridine nucleotide transhydrogenase  39.91 
 
 
464 aa  338  9.999999999999999e-92  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.68656  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25390  soluble pyridine nucleotide transhydrogenase  39.91 
 
 
464 aa  338  9.999999999999999e-92  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00265  soluble pyridine nucleotide transhydrogenase  40.56 
 
 
476 aa  337  3.9999999999999995e-91  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2106  soluble pyridine nucleotide transhydrogenase  39.7 
 
 
464 aa  335  1e-90  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3303  soluble pyridine nucleotide transhydrogenase  40.85 
 
 
462 aa  334  2e-90  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00106265 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3862  soluble pyridine nucleotide transhydrogenase  39.27 
 
 
464 aa  332  1e-89  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3567  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase dimerization region  40.26 
 
 
476 aa  331  2e-89  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.593485  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0914  soluble pyridine nucleotide transhydrogenase  40.56 
 
 
470 aa  330  3e-89  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.75336  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1719  soluble pyridine nucleotide transhydrogenase  41 
 
 
464 aa  330  5.0000000000000004e-89  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0974339  normal  0.028819 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1603  soluble pyridine nucleotide transhydrogenase  39.31 
 
 
464 aa  329  7e-89  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.073582  normal  0.0278892 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14670  soluble pyridine nucleotide transhydrogenase  40.77 
 
 
464 aa  328  1.0000000000000001e-88  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0951  soluble pyridine nucleotide transhydrogenase  40.73 
 
 
546 aa  323  4e-87  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000560958  hitchhiker  0.00448412 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3447  soluble pyridine nucleotide transhydrogenase  38.7 
 
 
501 aa  320  3.9999999999999996e-86  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.587426 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1923  soluble pyridine nucleotide transhydrogenase  39.13 
 
 
463 aa  318  2e-85  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1333  soluble pyridine nucleotide transhydrogenase  38.1 
 
 
547 aa  309  8e-83  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.201704  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1036  soluble pyridine nucleotide transhydrogenase  37.66 
 
 
547 aa  306  7e-82  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.746079  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2516  soluble pyridine nucleotide transhydrogenase  40.22 
 
 
465 aa  305  8.000000000000001e-82  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1805  soluble pyridine nucleotide transhydrogenase  37.93 
 
 
466 aa  289  6e-77  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6035  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.76 
 
 
466 aa  259  7e-68  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3360  dihydrolipoyl dehydrogenanse  36.67 
 
 
466 aa  253  5.000000000000001e-66  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0306833 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2179  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.33 
 
 
468 aa  246  9e-64  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3710  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.27 
 
 
467 aa  243  5e-63  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_26432  dihydrolipoyl dehydrogenase  35.12 
 
 
500 aa  243  6e-63  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3609  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.5 
 
 
469 aa  242  1e-62  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.40318  normal  0.0347499 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1030  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.71 
 
 
471 aa  238  1e-61  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.578679  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63850  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.19 
 
 
467 aa  238  2e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3964  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.97 
 
 
468 aa  237  3e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.321391  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3674  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.97 
 
 
468 aa  236  5.0000000000000005e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.974564 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06220  Dihydrolipoyl dehydrogenase  31.97 
 
 
468 aa  236  9e-61  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0347  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.84 
 
 
470 aa  235  1.0000000000000001e-60  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1945  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.13 
 
 
459 aa  234  2.0000000000000002e-60  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.341599  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1847  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.97 
 
 
467 aa  233  8.000000000000001e-60  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0173545  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3687  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.19 
 
 
478 aa  232  9e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.338346  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43970  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.19 
 
 
478 aa  232  9e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0508378  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1264  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.05 
 
 
472 aa  232  9e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.71337  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0027  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.68 
 
 
468 aa  231  2e-59  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0837  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.74 
 
 
462 aa  231  2e-59  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0629808 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2549  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.06 
 
 
471 aa  231  2e-59  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0926  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.13 
 
 
467 aa  231  2e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.566278  normal  0.378334 
 
 
-
 
NC_004310  BR1918  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.97 
 
 
467 aa  231  3e-59  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.646629  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7124  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.55 
 
 
467 aa  230  4e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.650146  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1621  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.84 
 
 
463 aa  230  4e-59  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.785994  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4304  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.7 
 
 
471 aa  230  5e-59  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3549  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.92 
 
 
468 aa  229  7e-59  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2501  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.97 
 
 
478 aa  229  9e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0977203 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0718  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.03 
 
 
470 aa  229  1e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.21952e-17 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>