More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_3850 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007760  Adeh_3710  EmrB/QacA family drug resistance transporter  96.33 
 
 
489 aa  826    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3767  major facilitator superfamily MFS_1  98.37 
 
 
491 aa  910    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.952675  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3850  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
491 aa  927    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.330919  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3844  major facilitator transporter  69.79 
 
 
481 aa  565  1e-160  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.50058  normal  0.461173 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0751  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  45.09 
 
 
491 aa  373  1e-102  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2210  EmrB/QacA family drug resistance transporter  47.95 
 
 
502 aa  353  2.9999999999999997e-96  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0884  major facilitator transporter  45.06 
 
 
486 aa  328  9e-89  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2347  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  39.19 
 
 
495 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0698693  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1358  major facilitator superfamily MFS_1  43.03 
 
 
489 aa  325  1e-87  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.5787  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2046  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  39.57 
 
 
495 aa  324  2e-87  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.838973  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2558  major facilitator superfamily MFS_1  44.26 
 
 
548 aa  320  3.9999999999999996e-86  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.573295  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0169  major facilitator superfamily MFS_1  42.23 
 
 
496 aa  317  2e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2286  EmrB/QacA family drug resistance transporter  43.7 
 
 
495 aa  316  5e-85  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.349328  normal  0.456862 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0160  major facilitator superfamily MFS_1  42.65 
 
 
496 aa  313  3.9999999999999997e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0154454 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2747  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.56 
 
 
500 aa  310  5e-83  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3267  major facilitator transporter  38.49 
 
 
487 aa  308  2.0000000000000002e-82  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.309977  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2605  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  39.75 
 
 
506 aa  307  2.0000000000000002e-82  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2939  major facilitator superfamily MFS_1  39.92 
 
 
500 aa  305  1.0000000000000001e-81  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00137  hitchhiker  0.0000457887 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0668  major facilitator transporter  41.83 
 
 
490 aa  305  1.0000000000000001e-81  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0270  major facilitator transporter  40.72 
 
 
497 aa  303  4.0000000000000003e-81  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2504  EmrB/QacA family drug resistance transporter  40.7 
 
 
501 aa  301  2e-80  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.300835 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1959  major facilitator transporter  40.9 
 
 
488 aa  298  1e-79  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.789773  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1815  major facilitator superfamily MFS_1  38.06 
 
 
448 aa  296  4e-79  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.39624  normal  0.935092 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5357  major facilitator superfamily MFS_1  42.27 
 
 
497 aa  291  2e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.987143 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3372  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.35 
 
 
476 aa  290  4e-77  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000356155  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4605  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.59 
 
 
478 aa  289  7e-77  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000135395  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4961  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.59 
 
 
478 aa  289  7e-77  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0262919  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3679  major facilitator superfamily MFS_1  41.51 
 
 
523 aa  289  7e-77  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4441  multidrug resistance protein B  37.59 
 
 
478 aa  288  1e-76  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000526976  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4459  multidrug resistance protein B  37.35 
 
 
478 aa  288  1e-76  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0324211  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0415  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  37.12 
 
 
479 aa  289  1e-76  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00273768  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0326  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.19 
 
 
539 aa  288  1e-76  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4821  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  37.12 
 
 
479 aa  288  2e-76  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4851  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.43 
 
 
478 aa  286  5e-76  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.16573  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4827  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  37.83 
 
 
469 aa  286  7e-76  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1166  major facilitator transporter  39.23 
 
 
500 aa  286  8e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1890  EmrB/QacA family drug resistance transporter  40.24 
 
 
569 aa  285  1.0000000000000001e-75  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4540  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.41 
 
 
480 aa  284  3.0000000000000004e-75  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3147  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.2 
 
 
541 aa  282  9e-75  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0043  EmrB/QacA family drug resistance transporter  40.96 
 
 
504 aa  280  5e-74  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.258133  normal  0.869121 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1252  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  40.58 
 
 
517 aa  278  1e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3298  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.93 
 
 
538 aa  278  2e-73  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4512  EmrB/QacA family drug resistance transporter  41.5 
 
 
504 aa  278  2e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5634  EmrB/QacA family drug resistance transporter  42.54 
 
 
504 aa  277  4e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.327669 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3702  EmrB/QacA family drug resistance transporter  42.21 
 
 
509 aa  276  6e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4666  EmrB/QacA family drug resistance transporter  42.21 
 
 
509 aa  276  6e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.481677  normal  0.435005 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2480  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.4 
 
 
504 aa  274  3e-72  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4024  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.3 
 
 
509 aa  274  3e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.179138  normal  0.623334 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4056  EmrB/QacA family drug resistance transporter  42.5 
 
 
509 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.010273  normal  0.647251 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1157  EmrB/QacA family drug resistance transporter  41.25 
 
 
504 aa  270  4e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.153598  normal  0.545064 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0695  putative multidrug resistance protein  31.93 
 
 
537 aa  269  7e-71  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0299481  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0577  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.95 
 
 
537 aa  269  8.999999999999999e-71  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4643  putative multidrug resistance protein  35.73 
 
 
537 aa  268  1e-70  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00119486  unclonable  1.5256899999999999e-25 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2612  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  39.29 
 
 
565 aa  269  1e-70  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.000000000331464  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1134  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  35.34 
 
 
513 aa  268  2e-70  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000214385  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0792  putative multidrug resistance protein  31.93 
 
 
537 aa  268  2e-70  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000149033  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0558  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.17 
 
 
538 aa  267  2e-70  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000222683  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4051  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.68 
 
 
513 aa  268  2e-70  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000130909  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3910  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.88 
 
 
513 aa  268  2e-70  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000020213  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3758  multidrug-efflux transporter  35.88 
 
 
513 aa  268  2e-70  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000783495  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4216  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.88 
 
 
513 aa  268  2e-70  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000209346  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4018  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  35.88 
 
 
513 aa  268  2e-70  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4105  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  35.24 
 
 
513 aa  268  2e-70  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00176585  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0731  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.97 
 
 
537 aa  267  2.9999999999999995e-70  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0630  multidrug-efflux transporter  35.73 
 
 
476 aa  267  2.9999999999999995e-70  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0118993  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0574  multidrug resistance protein B; sugar (and other) transporter  35.73 
 
 
537 aa  267  2.9999999999999995e-70  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3742  multidrug-efflux transporter  35.88 
 
 
513 aa  267  2.9999999999999995e-70  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000625397  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0573  multidrug-efflux transporter  35.73 
 
 
537 aa  267  2.9999999999999995e-70  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0295676  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0720  putative multidrug resistance protein  35.73 
 
 
537 aa  267  2.9999999999999995e-70  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.55065e-20 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4122  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  35.73 
 
 
513 aa  267  2.9999999999999995e-70  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000107671  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3829  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.36 
 
 
513 aa  265  2e-69  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000236934  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3357  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.82 
 
 
505 aa  264  2e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000299723 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2703  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.44 
 
 
511 aa  261  1e-68  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.445725  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4890  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.55 
 
 
513 aa  260  4e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0326454  normal  0.212856 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0528  major facilitator superfamily MFS_1  37.08 
 
 
484 aa  259  6e-68  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000187583  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1465  EmrB/QacA family drug resistance transporter  41.16 
 
 
504 aa  259  1e-67  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1779  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  37.72 
 
 
520 aa  258  1e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.38448  unclonable  0.00000000116602 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0763  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.88 
 
 
641 aa  258  2e-67  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2150  major facilitator superfamily MFS_1  40.48 
 
 
480 aa  258  2e-67  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.308405  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3777  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.46 
 
 
554 aa  257  3e-67  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3709  EmrB/QacA family drug resistance transporter  41.07 
 
 
522 aa  257  3e-67  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.486595  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2533  EmrB/QacA family drug resistance transporter  41.16 
 
 
519 aa  256  5e-67  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1278  EmrB/QacA family drug resistance transporter  41.16 
 
 
504 aa  256  9e-67  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1314  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  39.95 
 
 
535 aa  255  1.0000000000000001e-66  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  decreased coverage  0.00952843  normal  0.308238 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1299  EmrB/QacA family drug resistance transporter  40.91 
 
 
504 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.144452  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0279  EmrB/QacA family drug resistance transporter  40.91 
 
 
504 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.2584  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7581  putative multidrug transport protein  41.61 
 
 
477 aa  255  1.0000000000000001e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1356  EmrB/QacA family drug resistance transporter  40.91 
 
 
504 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.991135  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0241  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.67 
 
 
523 aa  254  3e-66  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.232516  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0175  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  41.74 
 
 
502 aa  254  3e-66  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000293077  hitchhiker  0.000024964 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4672  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.38 
 
 
593 aa  253  4.0000000000000004e-66  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.349364  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5185  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.22 
 
 
525 aa  253  4.0000000000000004e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.804488  normal  0.490544 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3998  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.56 
 
 
550 aa  253  5.000000000000001e-66  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1016  EmrB/QacA family drug resistance transporter  40.66 
 
 
504 aa  253  6e-66  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.80336  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0550  EmrB/QacA family drug resistance transporter  40.66 
 
 
504 aa  253  6e-66  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.976745  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3291  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  40.64 
 
 
666 aa  251  2e-65  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.47407  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2169  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.67 
 
 
554 aa  251  2e-65  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05770  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  39.76 
 
 
528 aa  250  4e-65  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.148276  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4845  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  35.86 
 
 
431 aa  249  6e-65  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000942514  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2683  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.31 
 
 
511 aa  249  8e-65  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000215764  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>