More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_3796 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011145  AnaeK_3713  NADH dehydrogenase (quinone)  98.01 
 
 		 654 aa  1199    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.117424  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3655  NADH dehydrogenase (quinone)  94.95 
 
 		 654 aa  867    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0270969  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3781  NADH dehydrogenase (quinone)  71.31 
 
 		 654 aa  730    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0217094  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3796  NADH dehydrogenase (quinone)  100 
 
 		 654 aa  1222    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.273036  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4066  NADH dehydrogenase (quinone)  48.29 
 
 		 669 aa  506  9.999999999999999e-143  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0619804  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0375  NADH/ubiquinone/plastoquinone (complex I)  50.26 
 
 		 669 aa  484  1e-135  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.044448  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0892  NADH dehydrogenase (quinone)  43.53 
 
 		 669 aa  473  1e-132  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0734  NAD-dependent dehydrogenase subunit  49.83 
 
 		 668 aa  465  1e-129  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0393018  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0070  NADH dehydrogenase (quinone)  48.03 
 
 		 667 aa  459  9.999999999999999e-129  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1065  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  47.26 
 
 		 666 aa  460  9.999999999999999e-129  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.82932e-25 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3197  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  47.53 
 
 		 666 aa  457  1e-127  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2456  NADH dehydrogenase (quinone)  46.35 
 
 		 662 aa  444  1e-123  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0192367  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2601  NADH/ubiquinone/plastoquinone (complex I)  43.07 
 
 		 660 aa  441  9.999999999999999e-123  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2560  NADH dehydrogenase (quinone)  50.72 
 
 		 663 aa  439  9.999999999999999e-123  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0739  NAD-dependent dehydrogenase subunit  44.66 
 
 		 661 aa  432  1e-120  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.188084  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2558  NADH dehydrogenase (quinone)  43.64 
 
 		 666 aa  424  1e-117  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2616  NADH dehydrogenase (quinone)  44.95 
 
 		 577 aa  417  9.999999999999999e-116  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1069  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  44.9 
 
 		 659 aa  392  1e-107  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.7000400000000002e-28 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3193  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  45.07 
 
 		 659 aa  392  1e-107  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.141056  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2618  NADH dehydrogenase (quinone)  42.31 
 
 		 646 aa  386  1e-106  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.430528  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0336  NADH dehydrogenase (quinone)  41.55 
 
 		 665 aa  367  1e-100  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2191  hydrogenase 4 subunit B  39.15 
 
 		 673 aa  356  6.999999999999999e-97  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.660892 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00940  formate hydrogenlyase subunit 3/multisubunit Na+/H+ antiporter, MnhD subunit  37.97 
 
 		 672 aa  345  2e-93  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4575  hydrogenase 4 subunit B  42.57 
 
 		 671 aa  343  5.999999999999999e-93  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0943  NADH dehydrogenase (quinone)  38.45 
 
 		 723 aa  328  1.0000000000000001e-88  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.730208  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2708  hydrogenase 4 subunit B  45.29 
 
 		 679 aa  325  2e-87  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1187  NADH dehydrogenase (quinone)  43.08 
 
 		 672 aa  322  1.9999999999999998e-86  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1194  hydrogenase 4 subunit B  43.3 
 
 		 672 aa  321  3e-86  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3704  hydrogenase 4 subunit B  43.08 
 
 		 672 aa  320  3.9999999999999996e-86  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.726938  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02374  NADH dehydrogenase subunit N  43.08 
 
 		 672 aa  320  5e-86  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02336  hypothetical protein  43.08 
 
 		 672 aa  320  5e-86  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1285  hydrogenase 4 subunit B  46.59 
 
 		 673 aa  320  7e-86  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.488809  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2629  hydrogenase 4 subunit B  42.41 
 
 		 672 aa  317  3e-85  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0929  hydrogenase 4 subunit B  41.61 
 
 		 687 aa  311  2.9999999999999997e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2474  hydrogenase 4 subunit B  39.2 
 
 		 669 aa  310  4e-83  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1142  hydrogenase 4 subunit B  42.03 
 
 		 748 aa  308  1.0000000000000001e-82  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.239539  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3795  NADH dehydrogenase (quinone)  53.42 
 
 		 666 aa  306  8.000000000000001e-82  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.789396  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2460  NADH dehydrogenase (quinone)  38.22 
 
 		 683 aa  306  1.0000000000000001e-81  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0791  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  37.09 
 
 		 661 aa  305  2.0000000000000002e-81  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1321  hydrogenase membrane subunit  35.67 
 
 		 644 aa  304  3.0000000000000004e-81  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0329  hydrogenase 4 subunit B  38.78 
 
 		 669 aa  301  2e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3292  hydrogenase 4 subunit B  37.69 
 
 		 674 aa  300  4e-80  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0166  hydrogenase 4 subunit B  39.3 
 
 		 681 aa  300  7e-80  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.970512  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0778  NADH dehydrogenase (quinone)  39.31 
 
 		 682 aa  298  2e-79  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.590886  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3712  NADH dehydrogenase (quinone)  52.71 
 
 		 666 aa  298  2e-79  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.753561  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1575  hydrogenase membrane subunit  36.31 
 
 		 617 aa  297  3e-79  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1453  hydrogenase subunit, HycC-like protein  35.17 
 
 		 644 aa  296  7e-79  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0703  NADH dehydrogenase (quinone)  30.79 
 
 		 662 aa  295  1e-78  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.20305  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3654  NADH dehydrogenase (quinone)  52.91 
 
 		 665 aa  295  2e-78  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0179  hydrogenase 4 subunit B  40.61 
 
 		 669 aa  293  8e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.987712  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1914  L-alanyl-D-glutamate peptidase  36.61 
 
 		 655 aa  292  1e-77  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1127  hydrogenase membrane subunit  38.55 
 
 		 649 aa  290  5.0000000000000004e-77  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0224903  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1691  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  33.82 
 
 		 688 aa  289  1e-76  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000143823  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0916  hydrogenase 4 subunit B  37.52 
 
 		 674 aa  285  2.0000000000000002e-75  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4671  hydrogenase 4 subunit B  39.26 
 
 		 674 aa  281  2e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.130495 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6065  hydrogenase 4 subunit B  38.25 
 
 		 669 aa  281  2e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.388772  hitchhiker  0.000500664 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3855  hydrogenase 4 subunit B  40.75 
 
 		 672 aa  280  4e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1260  hydrogenase 4 subunit B  42.72 
 
 		 672 aa  280  5e-74  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0751084 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0188  NADH dehydrogenase (quinone)  41.61 
 
 		 737 aa  278  2e-73  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1822  hydrogenase membrane subunit  35.58 
 
 		 643 aa  278  3e-73  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0165692  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1791  ATP-binding protein  33 
 
 		 655 aa  276  1.0000000000000001e-72  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0608774  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4288  NADH dehydrogenase (quinone)  35.09 
 
 		 637 aa  275  2.0000000000000002e-72  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000277072  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0132  hydrogenase 4 membrane subunit  31.49 
 
 		 650 aa  272  2e-71  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.167866  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1261  hydrogenase 4 subunit B  39.5 
 
 		 668 aa  271  2.9999999999999997e-71  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1396  hydrogenase 4 subunit B  38.95 
 
 		 671 aa  271  4e-71  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3276  NADH dehydrogenase (quinone)  34.9 
 
 		 671 aa  267  4e-70  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1532  hydrogenase 4 subunit B  39.73 
 
 		 668 aa  263  6.999999999999999e-69  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1617  hydrogenase 4 subunit B  39.73 
 
 		 668 aa  263  6.999999999999999e-69  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3780  NADH dehydrogenase (quinone)  47.17 
 
 		 670 aa  251  3e-65  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0116247  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4703  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  39.61 
 
 		 662 aa  241  2e-62  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1307  NADH dehydrogenase (quinone)  30.96 
 
 		 633 aa  242  2e-62  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1807  hydrogenase 4 subunit B  45.82 
 
 		 660 aa  239  2e-61  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.370569  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2149  hydrogenase 4 subunit B  45.82 
 
 		 660 aa  239  2e-61  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.33721  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1862  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  31 
 
 		 646 aa  235  2.0000000000000002e-60  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.00000307213  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4469  NADH dehydrogenase (quinone)  41.68 
 
 		 664 aa  232  2e-59  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0315  NADH dehydrogenase (quinone)  33 
 
 		 674 aa  229  1e-58  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.39787  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3974  formate hydrogenlyase subunit 3  37.59 
 
 		 608 aa  229  2e-58  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3011  formate hydrogenlyase subunit 3  37.59 
 
 		 608 aa  228  3e-58  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0966  NADH dehydrogenase (quinone)  37.36 
 
 		 608 aa  228  3e-58  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2848  formate hydrogenlyase subunit 3  37.59 
 
 		 608 aa  228  3e-58  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.264273 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3054  formate hydrogenlyase subunit 3  41.71 
 
 		 608 aa  228  3e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.920212  normal  0.22505 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02573  NADH dehydrogenase subunit N  37.36 
 
 		 608 aa  228  4e-58  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.621394  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2859  formate hydrogenlyase subunit 3  37.36 
 
 		 608 aa  228  4e-58  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0989  formate hydrogenlyase subunit 3  37.36 
 
 		 608 aa  227  4e-58  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.180245 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3196  formate hydrogenlyase subunit 3  41.43 
 
 		 608 aa  225  2e-57  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10084  oxidoreductase  38.65 
 
 		 640 aa  223  9.999999999999999e-57  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00281156  normal  0.170471 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3161  formate hydrogenlyase subunit 3  41.44 
 
 		 608 aa  218  2e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.253093 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2972  formate hydrogenlyase subunit 3  41.71 
 
 		 608 aa  219  2e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3003  formate hydrogenlyase subunit 3  41.71 
 
 		 608 aa  219  2e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00790766 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3038  formate hydrogenlyase subunit 3  41.44 
 
 		 608 aa  217  5e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000419635 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2985  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  38.75 
 
 		 674 aa  204  5e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0690807  hitchhiker  0.0074409 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2432  NADH dehydrogenase (quinone)  42.52 
 
 		 622 aa  199  1.0000000000000001e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.96835  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2787  NADH dehydrogenase (quinone)  31.39 
 
 		 633 aa  195  2e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2795  NADH dehydrogenase (quinone)  31.39 
 
 		 633 aa  195  2e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0107  NADH dehydrogenase (quinone)  33.49 
 
 		 500 aa  193  8e-48  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000249004 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0582  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  35.51 
 
 		 966 aa  186  8e-46  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.041044 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0509  NADH dehydrogenase (quinone)  31.8 
 
 		 748 aa  186  1.0000000000000001e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000352419  hitchhiker  0.0000000405513 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1289  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  33.25 
 
 		 959 aa  186  1.0000000000000001e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3194  NADH dehydrogenase (quinone)  34.95 
 
 		 1264 aa  185  2.0000000000000003e-45  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.466435 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0184  NADH dehydrogenase (quinone)  33.41 
 
 		 487 aa  182  2e-44  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>