69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_3683 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011891  A2cp1_3683  hypothetical protein  100 
 
 
137 aa  277  4e-74  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3617  hypothetical protein  97.08 
 
 
137 aa  215  2e-55  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3693  hypothetical protein  54 
 
 
118 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.799168  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0942  hypothetical protein  47.11 
 
 
172 aa  110  9e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1004  hypothetical protein  54.55 
 
 
165 aa  105  2e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3388  hypothetical protein  51 
 
 
116 aa  103  1e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3182  hypothetical protein  51.69 
 
 
118 aa  99  2e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1158  hypothetical protein  51.49 
 
 
114 aa  97.1  7e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2786  hypothetical protein  46.46 
 
 
113 aa  93.2  1e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.12053 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0509  tetraheme cytochrome c  42.71 
 
 
118 aa  72.8  0.000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1444  fumarate reductase flavoprotein subunit precursor  41.94 
 
 
114 aa  66.6  0.0000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000626372 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2097  hypothetical protein  46.94 
 
 
150 aa  65.1  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.206741  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2229  tetraheme cytochrome c  31.54 
 
 
117 aa  64.3  0.0000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.257402 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2152  tetraheme cytochrome c  32.31 
 
 
117 aa  63.9  0.0000000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.738839  normal  0.0741814 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1781  hypothetical protein  41.88 
 
 
221 aa  63.2  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.531778  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0276  tetraheme cytochrome c  32.31 
 
 
117 aa  62.8  0.000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000156346 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1491  tetraheme cytochrome c  36.28 
 
 
127 aa  61.2  0.000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1860  hypothetical protein  47.87 
 
 
221 aa  61.2  0.000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0342  tetraheme cytochrome c  39.29 
 
 
126 aa  60.8  0.000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3623  tetraheme cytochrome c  35.79 
 
 
116 aa  60.8  0.000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0274  tetraheme cytochrome c  40.24 
 
 
117 aa  60.8  0.000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00010475 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3541  flavocytochrome c  34.58 
 
 
589 aa  60.8  0.000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000144139  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3056  tetraheme cytochrome c  37.27 
 
 
127 aa  60.8  0.000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2279  tetraheme cytochrome c  38.1 
 
 
126 aa  60.5  0.000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0855381  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0255  tetraheme cytochrome c  38.3 
 
 
101 aa  60.5  0.000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4179  tetraheme cytochrome c  38.96 
 
 
120 aa  59.7  0.00000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.717177 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3535  tetraheme cytochrome c  40 
 
 
119 aa  58.9  0.00000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3769  hypothetical protein  36.14 
 
 
155 aa  59.3  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3896  tetraheme cytochrome c  37.5 
 
 
117 aa  58.2  0.00000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.486536  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3625  flavocytochrome c  32.67 
 
 
596 aa  57.4  0.00000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3776  flavocytochrome c  33 
 
 
596 aa  57.4  0.00000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00235124 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0257  tetraheme cytochrome c  38.75 
 
 
117 aa  57.4  0.00000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3938  tetraheme cytochrome c  38.75 
 
 
117 aa  57  0.00000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3370  tetraheme cytochrome c  38.1 
 
 
126 aa  57  0.00000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.656549  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2085  flavocytochrome c heme subunit  27.94 
 
 
146 aa  56.6  0.0000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.952774  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0722  flavocytochrome c  32.63 
 
 
596 aa  56.2  0.0000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3690  flavocytochrome c  33.68 
 
 
583 aa  56.6  0.0000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1445  flavocytochrome c heme subunit  30.77 
 
 
153 aa  55.8  0.0000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.390446  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3877  succinate dehydrogenase  31 
 
 
596 aa  54.7  0.0000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000270258  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0887  hypothetical protein  39.76 
 
 
136 aa  55.1  0.0000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.590211  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0808  flavocytochrome c  32.86 
 
 
596 aa  54.7  0.0000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.587828  normal  0.0624147 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3215  flavocytochrome c  32.86 
 
 
596 aa  54.3  0.0000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.57421 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3597  flavocytochrome c  33.67 
 
 
591 aa  54.3  0.0000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0905  flavocytochrome c  30.22 
 
 
597 aa  53.5  0.0000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.604755  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3318  flavocytochrome c  30.22 
 
 
596 aa  53.9  0.0000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.5959  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0611  fumarate reductase flavoprotein subunit precursor  31.37 
 
 
593 aa  53.5  0.0000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.755689 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0970  fumarate reductase flavoprotein subunit precursor  30.22 
 
 
596 aa  53.5  0.0000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2510  tetraheme cytochrome c  30.3 
 
 
122 aa  53.5  0.0000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0137  fumarate reductase flavoprotein subunit  28.35 
 
 
130 aa  53.5  0.0000009  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.100425  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0859  flavocytochrome c  30.22 
 
 
596 aa  53.1  0.000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3628  flavocytochrome c  30.22 
 
 
596 aa  53.1  0.000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3433  flavocytochrome c  30.22 
 
 
596 aa  53.1  0.000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3505  flavocytochrome c  30.22 
 
 
596 aa  53.1  0.000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2430  tetraheme cytochrome c  27.74 
 
 
135 aa  52.4  0.000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.439789  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3112  flavocytochrome c  32.63 
 
 
596 aa  50.8  0.000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000541974 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0946  fumarate reductase flavoprotein subunit precursor  37.14 
 
 
122 aa  50.4  0.000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04270  hypothetical protein  30.69 
 
 
182 aa  50.1  0.000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.379993  normal  0.356103 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2402  tetraheme cytochrome c, putative  34.67 
 
 
122 aa  49.3  0.00002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2586  flavocytochrome c  30.93 
 
 
588 aa  47.8  0.00006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.110511  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4127  flavocytochrome c  35 
 
 
598 aa  47.4  0.00006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.431024 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1830  flavocytochrome c heme subunit  31.87 
 
 
144 aa  47  0.00009  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0297  flavocytochrome c  30.63 
 
 
112 aa  46.2  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000730502 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4036  flavocytochrome c  34 
 
 
598 aa  45.4  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3300  cytochrome c  29.73 
 
 
126 aa  43.5  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0339  cytochrome c  30.38 
 
 
116 aa  43.1  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0810  flavocytochrome c  28.95 
 
 
589 aa  42  0.003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0627  hypothetical protein  27.27 
 
 
125 aa  41.2  0.005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.593343 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2892  hypothetical protein  35.21 
 
 
122 aa  40.8  0.006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04960  hypothetical protein  25.74 
 
 
240 aa  40.4  0.009  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>